Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y2S0

POLR1D, DNA-directed RNA polymerases I and III subunit RPAC2, humanhuman

Predictions only

Length 133 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POLR1DQ9Y2S0 ARHGAP23-222ENST00000622683 5964 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
POLR1DQ9Y2S0 RASGRP2-207ENST00000377497 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
POLR1DQ9Y2S0 TLE3-201ENST00000317509 5207 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
POLR1DQ9Y2S0 STOX1-202ENST00000399162 935 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
POLR1DQ9Y2S0 STOX1-203ENST00000399165 1135 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
POLR1DQ9Y2S0 MAST4-205ENST00000406039 717 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
POLR1DQ9Y2S0 AC010141.3-201ENST00000456659 717 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
POLR1DQ9Y2S0 TGFBR3L-202ENST00000565886 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
POLR1DQ9Y2S0 ZNF264-206ENST00000600531 774 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
POLR1DQ9Y2S0 NEURL3-201ENST00000310865 1710 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
POLR1DQ9Y2S0 DLGAP4-201ENST00000339266 5016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
POLR1DQ9Y2S0 TMEM200B-202ENST00000521452 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
POLR1DQ9Y2S0 HMGA2-205ENST00000425208 1444 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
POLR1DQ9Y2S0 AC092384.1-201ENST00000378347 1812 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
POLR1DQ9Y2S0 CENPH-201ENST00000283006 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
POLR1DQ9Y2S0 FAM102B-202ENST00000405454 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
POLR1DQ9Y2S0 PSPH-202ENST00000395471 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
POLR1DQ9Y2S0 NAT8L-201ENST00000331662 5571 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
POLR1DQ9Y2S0 SH2B1-204ENST00000395532 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
POLR1DQ9Y2S0 ZDHHC5-201ENST00000287169 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
POLR1DQ9Y2S0 AURKAIP1-204ENST00000378853 875 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
POLR1DQ9Y2S0 PTMA-205ENST00000410064 814 ntTSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
POLR1DQ9Y2S0 AC007448.3-201ENST00000585193 689 ntTSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
POLR1DQ9Y2S0 AQP6-201ENST00000315520 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
POLR1DQ9Y2S0 TSKS-202ENST00000358830 1367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
POLR1DQ9Y2S0 TMEM255B-202ENST00000375353 6100 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
POLR1DQ9Y2S0 RNF180-201ENST00000296615 1727 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
POLR1DQ9Y2S0 SPAST-204ENST00000621856 1715 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
POLR1DQ9Y2S0 SOX18-201ENST00000340356 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
POLR1DQ9Y2S0 STX6-204ENST00000542060 4809 ntTSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
POLR1DQ9Y2S0 BICDL2-201ENST00000389347 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
POLR1DQ9Y2S0 AC009506.1-201ENST00000418474 1494 ntTSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
POLR1DQ9Y2S0 GNA12-201ENST00000275364 4378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
POLR1DQ9Y2S0 TSPAN17-207ENST00000508164 2457 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
POLR1DQ9Y2S0 C19orf60-201ENST00000358607 839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
POLR1DQ9Y2S0 S100A6-201ENST00000368719 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
POLR1DQ9Y2S0 C19orf60-202ENST00000450195 702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
POLR1DQ9Y2S0 ORAI1-202ENST00000617316 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
POLR1DQ9Y2S0 SNCB-206ENST00000614675 1407 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
POLR1DQ9Y2S0 GRK3-203ENST00000619906 2873 ntTSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
POLR1DQ9Y2S0 AKT2-234ENST00000579047 2029 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
POLR1DQ9Y2S0 AC008406.3-201ENST00000620001 1374 ntBASIC19.05■□□□□ 0.64
POLR1DQ9Y2S0 RASGRP2-210ENST00000394430 2174 ntTSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
POLR1DQ9Y2S0 ZNF37BP-201ENST00000435805 1695 ntTSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
POLR1DQ9Y2S0 ALDH5A1-204ENST00000491546 1699 ntTSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
POLR1DQ9Y2S0 DUSP26-201ENST00000256261 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
POLR1DQ9Y2S0 FAM99A-202ENST00000538190 1989 ntBASIC19.04■□□□□ 0.64
POLR1DQ9Y2S0 DNPH1-201ENST00000230431 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
POLR1DQ9Y2S0 DCTPP1-201ENST00000319285 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
POLR1DQ9Y2S0 SLC47A1P1-202ENST00000449666 945 ntBASIC19.04■□□□□ 0.64
POLR1DQ9Y2S0 MEF2A-207ENST00000558812 2186 ntTSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
POLR1DQ9Y2S0 SAP25-203ENST00000614631 987 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
POLR1DQ9Y2S0 NBPF9-209ENST00000621645 5632 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
POLR1DQ9Y2S0 MARCH8-201ENST00000319836 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
POLR1DQ9Y2S0 SLC35F5-203ENST00000409342 2284 ntTSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
POLR1DQ9Y2S0 SH2B3-201ENST00000341259 5406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
POLR1DQ9Y2S0 CLDN5-201ENST00000403084 2357 ntBASIC19.04■□□□□ 0.64
POLR1DQ9Y2S0 CNTFR-202ENST00000378980 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
POLR1DQ9Y2S0 PTGER3-204ENST00000356595 1943 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
POLR1DQ9Y2S0 PTGER3-207ENST00000370931 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
POLR1DQ9Y2S0 IKBKG-212ENST00000617207 1949 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC19.04■□□□□ 0.64
POLR1DQ9Y2S0 SPSB3-208ENST00000566339 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
POLR1DQ9Y2S0 CBLN3-201ENST00000267406 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
POLR1DQ9Y2S0 CHST7-201ENST00000276055 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
POLR1DQ9Y2S0 PHLDA1-202ENST00000602540 5741 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
POLR1DQ9Y2S0 SRM-201ENST00000376957 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
POLR1DQ9Y2S0 UBE2E2-203ENST00000425792 1248 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
POLR1DQ9Y2S0 MYL5-208ENST00000511290 781 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
POLR1DQ9Y2S0 AC004707.1-201ENST00000511627 715 ntTSL 3 BASIC19.03■□□□□ 0.64
POLR1DQ9Y2S0 TYROBP-203ENST00000544690 522 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
POLR1DQ9Y2S0 C15orf61-202ENST00000557807 769 ntTSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
POLR1DQ9Y2S0 PDLIM3-203ENST00000284771 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
POLR1DQ9Y2S0 C1orf174-201ENST00000361605 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
POLR1DQ9Y2S0 GMDS-202ENST00000380815 1752 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
POLR1DQ9Y2S0 SLC18A3-201ENST00000374115 2420 ntAPPRIS P1 BASIC19.03■□□□□ 0.64
POLR1DQ9Y2S0 PLEKHM2-202ENST00000375799 4122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
POLR1DQ9Y2S0 TUB-201ENST00000299506 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
POLR1DQ9Y2S0 LHFPL3-202ENST00000424859 1852 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
POLR1DQ9Y2S0 MESP1-201ENST00000300057 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
POLR1DQ9Y2S0 KANSL1-218ENST00000638275 5352 ntTSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
POLR1DQ9Y2S0 CD6-203ENST00000352009 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
POLR1DQ9Y2S0 FGFR1-203ENST00000341462 6054 ntTSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
POLR1DQ9Y2S0 GXYLT1-202ENST00000398675 7497 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
POLR1DQ9Y2S0 PCSK6-220ENST00000622483 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
POLR1DQ9Y2S0 FASTK-212ENST00000482571 1764 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
POLR1DQ9Y2S0 SLC35D3-201ENST00000331858 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
POLR1DQ9Y2S0 TRIR-201ENST00000242784 970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
POLR1DQ9Y2S0 LIMS2-201ENST00000324938 2111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
POLR1DQ9Y2S0 TOLLIP-208ENST00000527938 549 ntTSL 4 BASIC19.02■□□□□ 0.64
POLR1DQ9Y2S0 AC093762.1-201ENST00000641981 837 ntAPPRIS P1 BASIC19.02■□□□□ 0.64
POLR1DQ9Y2S0 C22orf34-203ENST00000405854 1593 ntTSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.63
POLR1DQ9Y2S0 ACP4-201ENST00000270593 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
POLR1DQ9Y2S0 GCH1-206ENST00000543643 1897 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
POLR1DQ9Y2S0 MIR210HG-201ENST00000500447 1965 ntTSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
POLR1DQ9Y2S0 TSPAN3-202ENST00000346495 1647 ntTSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
POLR1DQ9Y2S0 IGFBP1-202ENST00000457280 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
POLR1DQ9Y2S0 YY1AP1-214ENST00000407221 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
POLR1DQ9Y2S0 SLCO3A1-202ENST00000424469 2705 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
POLR1DQ9Y2S0 UNC93B3-201ENST00000308076 687 ntBASIC19.01■□□□□ 0.63
POLR1DQ9Y2S0 PLEKHJ1-213ENST00000591099 1092 ntTSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.1 ms