Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y2M5

KLHL20, Kelch-like protein 20, humanhuman

Predictions only

Length 609 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KLHL20Q9Y2M5 STEAP2-204ENST00000394626 2456 ntTSL 2 BASIC20.77■□□□□ 0.92
KLHL20Q9Y2M5 KCNQ5-213ENST00000629977 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
KLHL20Q9Y2M5 MFSD14C-201ENST00000375223 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.92
KLHL20Q9Y2M5 C16orf86-201ENST00000403458 1267 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
KLHL20Q9Y2M5 FAM222B-208ENST00000581381 556 ntTSL 4 BASIC20.77■□□□□ 0.92
KLHL20Q9Y2M5 RAB43-208ENST00000615093 783 ntTSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.92
KLHL20Q9Y2M5 LTB4R-201ENST00000345363 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
KLHL20Q9Y2M5 PLEKHG4-201ENST00000360461 6782 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.77■□□□□ 0.91
KLHL20Q9Y2M5 IER5L-201ENST00000372491 2711 ntAPPRIS P1 BASIC20.77■□□□□ 0.91
KLHL20Q9Y2M5 TMEM5-201ENST00000261234 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
KLHL20Q9Y2M5 EFCAB1-202ENST00000433756 2286 ntTSL 2 BASIC20.76■□□□□ 0.91
KLHL20Q9Y2M5 TMEM198B-205ENST00000487582 1581 ntTSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
KLHL20Q9Y2M5 ZDHHC14-203ENST00000359775 7380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
KLHL20Q9Y2M5 REPIN1-214ENST00000489432 2058 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.76■□□□□ 0.91
KLHL20Q9Y2M5 URAD-201ENST00000332715 931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
KLHL20Q9Y2M5 PPCS-202ENST00000372560 793 ntTSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
KLHL20Q9Y2M5 ATP6V0B-204ENST00000471859 865 ntTSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
KLHL20Q9Y2M5 STX5-201ENST00000294179 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
KLHL20Q9Y2M5 DUSP9-202ENST00000370167 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
KLHL20Q9Y2M5 TBC1D22A-206ENST00000407381 1949 ntTSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
KLHL20Q9Y2M5 SLC25A29-202ENST00000392908 2242 ntTSL 2 BASIC20.76■□□□□ 0.91
KLHL20Q9Y2M5 ZDHHC7-203ENST00000564466 1488 ntTSL 5 BASIC20.75■□□□□ 0.91
KLHL20Q9Y2M5 CNEP1R1-202ENST00000427478 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
KLHL20Q9Y2M5 NISCH-201ENST00000345716 5238 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
KLHL20Q9Y2M5 IDI1-201ENST00000381344 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
KLHL20Q9Y2M5 C1QL1-201ENST00000253407 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
KLHL20Q9Y2M5 NXT1-201ENST00000254998 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
KLHL20Q9Y2M5 CDKN2AIPNL-201ENST00000395009 800 ntTSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
KLHL20Q9Y2M5 FRMD8-208ENST00000531296 366 ntTSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
KLHL20Q9Y2M5 PYCARD-AS1-201ENST00000561916 1095 ntTSL 2 BASIC20.75■□□□□ 0.91
KLHL20Q9Y2M5 CCDC92B-201ENST00000575506 885 ntBASIC20.75■□□□□ 0.91
KLHL20Q9Y2M5 AC145207.2-202ENST00000576554 565 ntTSL 5 BASIC20.75■□□□□ 0.91
KLHL20Q9Y2M5 SLC12A5-217ENST00000626937 1224 ntTSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
KLHL20Q9Y2M5 RHCE-204ENST00000349320 1810 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.75■□□□□ 0.91
KLHL20Q9Y2M5 C22orf34-203ENST00000405854 1593 ntTSL 5 BASIC20.75■□□□□ 0.91
KLHL20Q9Y2M5 LMF1-202ENST00000543238 2103 ntTSL 2 BASIC20.75■□□□□ 0.91
KLHL20Q9Y2M5 ESYT2-201ENST00000251527 5960 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
KLHL20Q9Y2M5 P4HTM-201ENST00000343546 2268 ntTSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
KLHL20Q9Y2M5 SMOX-212ENST00000621355 2322 ntTSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
KLHL20Q9Y2M5 MBNL3-202ENST00000370844 1643 ntTSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
KLHL20Q9Y2M5 IKBKG-212ENST00000617207 1949 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC20.74■□□□□ 0.91
KLHL20Q9Y2M5 ELL3-201ENST00000319359 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
KLHL20Q9Y2M5 ZNF511-202ENST00000361518 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
KLHL20Q9Y2M5 HAS1-202ENST00000540069 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
KLHL20Q9Y2M5 CNN3-201ENST00000370206 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
KLHL20Q9Y2M5 EIF6-203ENST00000374450 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
KLHL20Q9Y2M5 EIF3J-202ENST00000424492 1550 ntTSL 4 BASIC20.74■□□□□ 0.91
KLHL20Q9Y2M5 CDCP1-202ENST00000425231 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
KLHL20Q9Y2M5 AC093817.1-201ENST00000507296 812 ntTSL 3 BASIC20.74■□□□□ 0.91
KLHL20Q9Y2M5 TSEN15-207ENST00000533373 618 ntTSL 2 BASIC20.74■□□□□ 0.91
KLHL20Q9Y2M5 ELANE-202ENST00000590230 1028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.74■□□□□ 0.91
KLHL20Q9Y2M5 TPRG1LP1-201ENST00000598702 760 ntBASIC20.74■□□□□ 0.91
KLHL20Q9Y2M5 ANKRD20A6P-201ENST00000618763 204 ntBASIC20.74■□□□□ 0.91
KLHL20Q9Y2M5 AL133516.1-201ENST00000633012 540 ntTSL 5 BASIC20.74■□□□□ 0.91
KLHL20Q9Y2M5 AC005906.2-202ENST00000638821 2168 ntTSL 5 BASIC20.74■□□□□ 0.91
KLHL20Q9Y2M5 IER2-201ENST00000292433 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
KLHL20Q9Y2M5 AC127496.7-201ENST00000625110 1798 ntBASIC20.74■□□□□ 0.91
KLHL20Q9Y2M5 IGFBP1-202ENST00000457280 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.74■□□□□ 0.91
KLHL20Q9Y2M5 CXCL14-201ENST00000337225 1971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
KLHL20Q9Y2M5 SMARCD2-201ENST00000225742 1800 ntTSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
KLHL20Q9Y2M5 AP004607.7-201ENST00000527152 1677 ntBASIC20.73■□□□□ 0.91
KLHL20Q9Y2M5 AC138028.2-201ENST00000440406 1539 ntTSL 2 BASIC20.73■□□□□ 0.91
KLHL20Q9Y2M5 PPP2R3B-202ENST00000390665 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
KLHL20Q9Y2M5 ANKHD1-204ENST00000394722 2035 ntTSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
KLHL20Q9Y2M5 GAS2L1-206ENST00000610653 2238 ntTSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
KLHL20Q9Y2M5 ING1-201ENST00000333219 5119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
KLHL20Q9Y2M5 KRTAP17-1-201ENST00000334202 779 ntAPPRIS P1 BASIC20.73■□□□□ 0.91
KLHL20Q9Y2M5 CRB3-202ENST00000356762 733 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
KLHL20Q9Y2M5 GADD45A-201ENST00000370985 803 ntTSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
KLHL20Q9Y2M5 TMEM61-201ENST00000371268 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
KLHL20Q9Y2M5 NUDT14-202ENST00000392568 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
KLHL20Q9Y2M5 AC123595.1-201ENST00000440769 1046 ntBASIC20.73■□□□□ 0.91
KLHL20Q9Y2M5 DUX4L2-201ENST00000561772 1275 ntBASIC20.73■□□□□ 0.91
KLHL20Q9Y2M5 MIR5787-201ENST00000611784 55 ntBASIC20.73■□□□□ 0.91
KLHL20Q9Y2M5 DUX4-206ENST00000616166 1275 ntAPPRIS P2 BASIC20.73■□□□□ 0.91
KLHL20Q9Y2M5 DUX4L6-201ENST00000626483 1275 ntBASIC20.73■□□□□ 0.91
KLHL20Q9Y2M5 DUX4L1-201ENST00000627662 1275 ntBASIC20.73■□□□□ 0.91
KLHL20Q9Y2M5 DUX4L8-201ENST00000629013 1275 ntBASIC20.73■□□□□ 0.91
KLHL20Q9Y2M5 DUX4L3-201ENST00000630187 1275 ntBASIC20.73■□□□□ 0.91
KLHL20Q9Y2M5 DUX4L7-201ENST00000630678 1275 ntBASIC20.73■□□□□ 0.91
KLHL20Q9Y2M5 DUX4L5-201ENST00000630834 1275 ntBASIC20.73■□□□□ 0.91
KLHL20Q9Y2M5 C8orf82-202ENST00000524821 2476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
KLHL20Q9Y2M5 ITPKC-201ENST00000263370 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
KLHL20Q9Y2M5 PRR7-201ENST00000323249 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
KLHL20Q9Y2M5 PDK3-201ENST00000379162 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
KLHL20Q9Y2M5 GPRC5B-210ENST00000569847 1830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.73■□□□□ 0.91
KLHL20Q9Y2M5 RBM38-203ENST00000356208 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
KLHL20Q9Y2M5 FMR1-201ENST00000218200 4333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
KLHL20Q9Y2M5 HSPB2-201ENST00000304298 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
KLHL20Q9Y2M5 ST3GAL5-222ENST00000638572 4431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
KLHL20Q9Y2M5 PRR16-202ENST00000407149 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
KLHL20Q9Y2M5 RAB24-202ENST00000303270 1385 ntTSL 2 BASIC20.72■□□□□ 0.91
KLHL20Q9Y2M5 LINC02228-203ENST00000641970 1355 ntBASIC20.72■□□□□ 0.91
KLHL20Q9Y2M5 NFIX-203ENST00000397661 3143 ntTSL 5 BASIC20.72■□□□□ 0.91
KLHL20Q9Y2M5 AOC3-207ENST00000617500 2392 ntTSL 4 BASIC20.72■□□□□ 0.91
KLHL20Q9Y2M5 SERBP1-202ENST00000370990 1621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
KLHL20Q9Y2M5 OXCT2-201ENST00000327582 1826 ntAPPRIS P1 BASIC20.72■□□□□ 0.91
KLHL20Q9Y2M5 RITA1-202ENST00000549621 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.72■□□□□ 0.91
KLHL20Q9Y2M5 PYY-201ENST00000360085 1053 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
KLHL20Q9Y2M5 CENPVL3-201ENST00000417339 864 ntAPPRIS P1 BASIC20.72■□□□□ 0.91
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.8 ms