Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y2K6

USP20, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 20, humanhuman

Predictions only

Length 914 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP20Q9Y2K6 AL355102.2-201ENST00000553811 600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
USP20Q9Y2K6 DUSP26-201ENST00000256261 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
USP20Q9Y2K6 FIZ1-201ENST00000221665 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
USP20Q9Y2K6 AP004607.4-201ENST00000530158 1459 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
USP20Q9Y2K6 CAMKK2-208ENST00000412367 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
USP20Q9Y2K6 ANKRD44-204ENST00000409919 1622 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
USP20Q9Y2K6 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
USP20Q9Y2K6 TLX2-201ENST00000233638 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
USP20Q9Y2K6 ACYP2-201ENST00000303536 789 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
USP20Q9Y2K6 AC012414.4-201ENST00000560839 1074 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
USP20Q9Y2K6 AP003071.3-201ENST00000562506 366 ntTSL 3 BASIC23.55■■□□□ 1.36
USP20Q9Y2K6 AC127029.2-201ENST00000577329 502 ntTSL 3 BASIC23.55■■□□□ 1.36
USP20Q9Y2K6 PDCD5-204ENST00000586035 601 ntTSL 3 BASIC23.55■■□□□ 1.36
USP20Q9Y2K6 AC004528.2-201ENST00000610701 440 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
USP20Q9Y2K6 AC060814.5-201ENST00000630916 1074 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
USP20Q9Y2K6 AC138649.1-201ENST00000619611 1449 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
USP20Q9Y2K6 SEPT8-207ENST00000378719 2889 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
USP20Q9Y2K6 MIR222HG-202ENST00000602507 1758 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
USP20Q9Y2K6 ZGPAT-201ENST00000328969 1945 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
USP20Q9Y2K6 AC026471.6-201ENST00000622954 1905 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
USP20Q9Y2K6 CERS5-201ENST00000317551 2051 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
USP20Q9Y2K6 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
USP20Q9Y2K6 MIR210HG-201ENST00000500447 1965 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
USP20Q9Y2K6 POTED-202ENST00000620442 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
USP20Q9Y2K6 AC092053.2-201ENST00000640557 1818 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
USP20Q9Y2K6 TMEM121-201ENST00000392519 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
USP20Q9Y2K6 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
USP20Q9Y2K6 QPCT-201ENST00000338415 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
USP20Q9Y2K6 DPP7-201ENST00000371579 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
USP20Q9Y2K6 ANKRD19P-205ENST00000473204 2370 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
USP20Q9Y2K6 ENTPD5-206ENST00000556242 1437 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
USP20Q9Y2K6 COX20-201ENST00000366528 568 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
USP20Q9Y2K6 BCKDHB-203ENST00000369760 743 ntTSL 3 BASIC23.54■■□□□ 1.36
USP20Q9Y2K6 GLI4-210ENST00000523522 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
USP20Q9Y2K6 MCMBP-202ENST00000369077 2465 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
USP20Q9Y2K6 TMEM51-203ENST00000400796 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
USP20Q9Y2K6 ALDH5A1-204ENST00000491546 1699 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
USP20Q9Y2K6 SPRTN-201ENST00000008440 1667 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
USP20Q9Y2K6 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
USP20Q9Y2K6 AC055733.4-201ENST00000638462 1354 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
USP20Q9Y2K6 MEIS3-212ENST00000561293 1918 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
USP20Q9Y2K6 ELOA3B-201ENST00000611323 1641 ntAPPRIS P1 BASIC23.53■■□□□ 1.36
USP20Q9Y2K6 ELOA3D-201ENST00000620881 1641 ntAPPRIS P1 BASIC23.53■■□□□ 1.36
USP20Q9Y2K6 LTC4S-202ENST00000401985 486 ntTSL 3 BASIC23.53■■□□□ 1.36
USP20Q9Y2K6 GLI3-203ENST00000437480 451 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
USP20Q9Y2K6 AC092437.1-201ENST00000624794 1048 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
USP20Q9Y2K6 TRADD-202ENST00000486556 1833 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
USP20Q9Y2K6 CBWD6-213ENST00000613716 1820 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
USP20Q9Y2K6 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
USP20Q9Y2K6 RAB28-208ENST00000630951 1679 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
USP20Q9Y2K6 GAS1-201ENST00000298743 2827 ntAPPRIS P1 BASIC23.53■■□□□ 1.36
USP20Q9Y2K6 ANTXR2-202ENST00000346652 1343 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
USP20Q9Y2K6 AC135048.1-201ENST00000566056 1318 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
USP20Q9Y2K6 PRKAA1-202ENST00000354209 1918 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
USP20Q9Y2K6 PPP5C-201ENST00000012443 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
USP20Q9Y2K6 TUB-201ENST00000299506 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
USP20Q9Y2K6 RALGPS1-207ENST00000394022 1672 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
USP20Q9Y2K6 SPATA2L-201ENST00000289805 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
USP20Q9Y2K6 NFKBIB-201ENST00000313582 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
USP20Q9Y2K6 TMEM54-202ENST00000373463 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
USP20Q9Y2K6 CTNNAL1-202ENST00000374593 761 ntTSL 3 BASIC23.52■■□□□ 1.36
USP20Q9Y2K6 IL15RA-201ENST00000379971 588 ntTSL 3 BASIC23.52■■□□□ 1.36
USP20Q9Y2K6 GXYLT1P2-201ENST00000433312 1230 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
USP20Q9Y2K6 CHTF8-210ENST00000523421 766 ntTSL 3 BASIC23.52■■□□□ 1.36
USP20Q9Y2K6 AC068385.1-201ENST00000533218 409 ntTSL 3 BASIC23.52■■□□□ 1.36
USP20Q9Y2K6 CFAP99-206ENST00000616117 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
USP20Q9Y2K6 DUX4-203ENST00000565211 1710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
USP20Q9Y2K6 RAB1A-202ENST00000409751 1333 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
USP20Q9Y2K6 AC009237.3-201ENST00000393279 1427 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
USP20Q9Y2K6 ZFAND6-224ENST00000618205 1659 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
USP20Q9Y2K6 ZNF568-208ENST00000586353 1902 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
USP20Q9Y2K6 KCTD13-202ENST00000561540 1773 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
USP20Q9Y2K6 GZMM-201ENST00000264553 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
USP20Q9Y2K6 MPRIP-203ENST00000395806 527 ntTSL 3 BASIC23.51■■□□□ 1.35
USP20Q9Y2K6 AKR7A2-201ENST00000235835 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
USP20Q9Y2K6 RNF149-201ENST00000295317 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
USP20Q9Y2K6 SHMT1-201ENST00000316694 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
USP20Q9Y2K6 TANGO2-202ENST00000398042 2011 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
USP20Q9Y2K6 NRG3-201ENST00000372141 2158 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
USP20Q9Y2K6 HOXA10-201ENST00000283921 2541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
USP20Q9Y2K6 AC079140.4-201ENST00000507448 529 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
USP20Q9Y2K6 DISC1-224ENST00000639374 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
USP20Q9Y2K6 ZNF410-206ENST00000540593 1722 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
USP20Q9Y2K6 SHMT1-202ENST00000352886 2437 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
USP20Q9Y2K6 TRAM2-AS1-204ENST00000606714 2453 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
USP20Q9Y2K6 SLC26A5-209ENST00000393735 1947 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
USP20Q9Y2K6 RNF39-202ENST00000376751 1970 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
USP20Q9Y2K6 AL512625.3-202ENST00000591993 1091 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
USP20Q9Y2K6 CPT2-209ENST00000636935 803 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
USP20Q9Y2K6 A1BG-201ENST00000263100 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
USP20Q9Y2K6 NOX4-209ENST00000527626 1774 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
USP20Q9Y2K6 CERKL-204ENST00000374970 1392 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
USP20Q9Y2K6 B4GALNT1-202ENST00000418555 1861 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
USP20Q9Y2K6 GPR137B-202ENST00000366592 2042 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
USP20Q9Y2K6 NEIL1-206ENST00000564784 2019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
USP20Q9Y2K6 SEPT5-210ENST00000455784 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
USP20Q9Y2K6 ZNF584-203ENST00000593920 2187 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
USP20Q9Y2K6 AC093323.1-201ENST00000307533 2311 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
USP20Q9Y2K6 NABP2-203ENST00000380198 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
USP20Q9Y2K6 SOCS7-202ENST00000613678 1827 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.5 ms