Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y228

TRAF3IP3, TRAF3-interacting JNK-activating modulator, humanhuman

Predictions only

Length 551 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAF3IP3Q9Y228 FBXO33-202ENST00000554190 534 ntTSL 3 BASIC23.47■■□□□ 1.35
TRAF3IP3Q9Y228 AC006538.2-201ENST00000586572 543 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.47■■□□□ 1.35
TRAF3IP3Q9Y228 AC005837.3-201ENST00000612163 286 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
TRAF3IP3Q9Y228 AC105233.4-201ENST00000642045 216 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
TRAF3IP3Q9Y228 LRRC75A-203ENST00000470794 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
TRAF3IP3Q9Y228 AP006587.3-201ENST00000525742 1516 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
TRAF3IP3Q9Y228 B4GALNT1-203ENST00000449184 1633 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
TRAF3IP3Q9Y228 RNPEP-201ENST00000295640 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
TRAF3IP3Q9Y228 DENND5A-201ENST00000328194 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
TRAF3IP3Q9Y228 PELI3-201ENST00000320740 2740 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
TRAF3IP3Q9Y228 C16orf59-201ENST00000361837 1662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
TRAF3IP3Q9Y228 C2orf72-201ENST00000373640 3657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
TRAF3IP3Q9Y228 NINJ1-201ENST00000375446 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
TRAF3IP3Q9Y228 SPIRE2-202ENST00000393062 2172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
TRAF3IP3Q9Y228 PDXK-205ENST00000398081 2251 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
TRAF3IP3Q9Y228 WDR86-203ENST00000469830 1691 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
TRAF3IP3Q9Y228 LINC01574-201ENST00000512115 560 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
TRAF3IP3Q9Y228 STEAP2-204ENST00000394626 2456 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.35
TRAF3IP3Q9Y228 ILDR2-206ENST00000528703 2446 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.35
TRAF3IP3Q9Y228 IRX4-207ENST00000613726 2403 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
TRAF3IP3Q9Y228 PPP2R5E-204ENST00000555899 2164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
TRAF3IP3Q9Y228 TPST1-201ENST00000304842 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
TRAF3IP3Q9Y228 LAYN-201ENST00000375614 2066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
TRAF3IP3Q9Y228 LCK-214ENST00000619559 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
TRAF3IP3Q9Y228 COL8A2-203ENST00000481785 2036 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
TRAF3IP3Q9Y228 UBALD1-201ENST00000283474 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
TRAF3IP3Q9Y228 RAB24-201ENST00000303251 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
TRAF3IP3Q9Y228 PCSK1N-201ENST00000218230 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
TRAF3IP3Q9Y228 C12orf43-208ENST00000539736 1033 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
TRAF3IP3Q9Y228 PABPC1L2A-201ENST00000373519 2237 ntAPPRIS P1 BASIC23.45■■□□□ 1.34
TRAF3IP3Q9Y228 P4HTM-202ENST00000383729 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
TRAF3IP3Q9Y228 SLCO3A1-202ENST00000424469 2705 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
TRAF3IP3Q9Y228 AC003102.1-202ENST00000563394 1796 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
TRAF3IP3Q9Y228 LRP5L-203ENST00000444995 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
TRAF3IP3Q9Y228 ZNF511-202ENST00000361518 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
TRAF3IP3Q9Y228 SERPINB5-201ENST00000382771 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
TRAF3IP3Q9Y228 YY1AP1-214ENST00000407221 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
TRAF3IP3Q9Y228 CDKN2D-201ENST00000335766 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
TRAF3IP3Q9Y228 ZFAS1-206ENST00000450535 1075 ntTSL 3 BASIC23.44■■□□□ 1.34
TRAF3IP3Q9Y228 AC142381.2-201ENST00000566120 298 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
TRAF3IP3Q9Y228 VDAC1-203ENST00000395047 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
TRAF3IP3Q9Y228 OXCT2-201ENST00000327582 1826 ntAPPRIS P1 BASIC23.44■■□□□ 1.34
TRAF3IP3Q9Y228 AC007375.3-201ENST00000600936 2314 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
TRAF3IP3Q9Y228 PRSS33-202ENST00000570702 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
TRAF3IP3Q9Y228 CENPB-201ENST00000379751 2840 ntAPPRIS P1 BASIC23.43■■□□□ 1.34
TRAF3IP3Q9Y228 MEIS3-202ENST00000441740 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
TRAF3IP3Q9Y228 SCRN2-212ENST00000584123 1745 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
TRAF3IP3Q9Y228 FXYD7-201ENST00000270310 712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
TRAF3IP3Q9Y228 MIR638-201ENST00000385237 100 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
TRAF3IP3Q9Y228 ORMDL1-202ENST00000392349 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
TRAF3IP3Q9Y228 NKX2-2-AS1-201ENST00000549659 638 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
TRAF3IP3Q9Y228 AC104564.3-201ENST00000582367 638 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
TRAF3IP3Q9Y228 SLC35D3-201ENST00000331858 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
TRAF3IP3Q9Y228 NFKBIL1-203ENST00000376148 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
TRAF3IP3Q9Y228 GSX2-201ENST00000326902 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
TRAF3IP3Q9Y228 CBWD6-201ENST00000377391 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
TRAF3IP3Q9Y228 FBXL14-201ENST00000339235 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
TRAF3IP3Q9Y228 ABHD12B-201ENST00000337334 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
TRAF3IP3Q9Y228 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
TRAF3IP3Q9Y228 GRK4-201ENST00000345167 2013 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
TRAF3IP3Q9Y228 SERBP1-202ENST00000370990 1621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
TRAF3IP3Q9Y228 GRK3-203ENST00000619906 2873 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
TRAF3IP3Q9Y228 STOML2-201ENST00000356493 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
TRAF3IP3Q9Y228 MFF-208ENST00000409616 1247 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
TRAF3IP3Q9Y228 TMEM268-202ENST00000374049 4578 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
TRAF3IP3Q9Y228 AC009237.3-201ENST00000393279 1427 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
TRAF3IP3Q9Y228 PSIP1-201ENST00000380715 1966 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
TRAF3IP3Q9Y228 CCNL1-203ENST00000461804 1998 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
TRAF3IP3Q9Y228 ILDR2-204ENST00000525740 2242 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
TRAF3IP3Q9Y228 LTK-202ENST00000355166 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
TRAF3IP3Q9Y228 PUF60-203ENST00000453551 1842 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
TRAF3IP3Q9Y228 ARHGEF25-201ENST00000286494 2552 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
TRAF3IP3Q9Y228 NAT8L-202ENST00000423729 5870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
TRAF3IP3Q9Y228 PRKCZ-AS1-201ENST00000333854 1253 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
TRAF3IP3Q9Y228 FAM219A-202ENST00000379078 770 ntTSL 3 BASIC23.41■■□□□ 1.34
TRAF3IP3Q9Y228 SIRT3-215ENST00000532956 1235 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
TRAF3IP3Q9Y228 AC010203.1-202ENST00000550096 695 ntTSL 3 BASIC23.41■■□□□ 1.34
TRAF3IP3Q9Y228 AC012313.1-203ENST00000597980 570 ntTSL 4 BASIC23.41■■□□□ 1.34
TRAF3IP3Q9Y228 PXK-203ENST00000383715 1756 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
TRAF3IP3Q9Y228 NR5A1-204ENST00000620110 2975 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
TRAF3IP3Q9Y228 GCH1-202ENST00000395514 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
TRAF3IP3Q9Y228 MAPK8IP1P2-201ENST00000580257 1472 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
TRAF3IP3Q9Y228 AC026310.3-201ENST00000625186 2373 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
TRAF3IP3Q9Y228 VRK2-201ENST00000340157 1888 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
TRAF3IP3Q9Y228 MBNL3-202ENST00000370844 1643 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
TRAF3IP3Q9Y228 CDKN1C-204ENST00000440480 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
TRAF3IP3Q9Y228 BX005040.4-201ENST00000637145 1518 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
TRAF3IP3Q9Y228 GGA2-211ENST00000567468 1713 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
TRAF3IP3Q9Y228 POLR2H-204ENST00000438240 994 ntTSL 3 BASIC23.4■■□□□ 1.34
TRAF3IP3Q9Y228 FBXO27-202ENST00000509137 2130 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
TRAF3IP3Q9Y228 AC012414.1-201ENST00000556676 535 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
TRAF3IP3Q9Y228 PRR7-201ENST00000323249 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
TRAF3IP3Q9Y228 CENPS-CORT-201ENST00000400900 1469 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
TRAF3IP3Q9Y228 SGMS1-210ENST00000619438 1680 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
TRAF3IP3Q9Y228 RUNDC3B-207ENST00000493037 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
TRAF3IP3Q9Y228 TBL1Y-202ENST00000355162 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
TRAF3IP3Q9Y228 SNX7-201ENST00000306121 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
TRAF3IP3Q9Y228 PAQR6-212ENST00000540423 1729 ntTSL 3 BASIC23.39■■□□□ 1.34
TRAF3IP3Q9Y228 TMEM64-203ENST00000458549 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
TRAF3IP3Q9Y228 TTYH1-201ENST00000301194 2088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.2 ms