Protein–RNA interactions for Protein: Q9UPZ3

HPS5, Hermansky-Pudlak syndrome 5 protein, humanhuman

Predictions only

Length 1,129 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HPS5Q9UPZ3 CELF5-201ENST00000292672 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
HPS5Q9UPZ3 CCDC74B-205ENST00000409943 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
HPS5Q9UPZ3 AC073343.2-201ENST00000413182 548 ntTSL 4 BASIC25.62■■□□□ 1.69
HPS5Q9UPZ3 COX6C-208ENST00000522940 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.62■■□□□ 1.69
HPS5Q9UPZ3 LITAF-205ENST00000570904 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
HPS5Q9UPZ3 AL121832.2-201ENST00000610979 668 ntBASIC25.62■■□□□ 1.69
HPS5Q9UPZ3 UHRF1BP1L-202ENST00000356828 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
HPS5Q9UPZ3 HEXB-201ENST00000261416 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
HPS5Q9UPZ3 AC137767.1-201ENST00000602918 1920 ntBASIC25.62■■□□□ 1.69
HPS5Q9UPZ3 NBL1-202ENST00000375136 2172 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
HPS5Q9UPZ3 USP21-202ENST00000368001 2095 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
HPS5Q9UPZ3 PLEKHO1-201ENST00000369124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
HPS5Q9UPZ3 AC139530.1-201ENST00000575312 1977 ntBASIC25.62■■□□□ 1.69
HPS5Q9UPZ3 LSM14B-201ENST00000279068 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.62■■□□□ 1.69
HPS5Q9UPZ3 GAS2L1-206ENST00000610653 2238 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
HPS5Q9UPZ3 PRKCZ-AS1-201ENST00000333854 1253 ntTSL 2 BASIC25.61■■□□□ 1.69
HPS5Q9UPZ3 AURKAIP1-204ENST00000378853 875 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.61■■□□□ 1.69
HPS5Q9UPZ3 AC092675.2-201ENST00000413274 541 ntTSL 4 BASIC25.61■■□□□ 1.69
HPS5Q9UPZ3 LTB-211ENST00000446745 853 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
HPS5Q9UPZ3 TSPY6P-201ENST00000448518 926 ntBASIC25.61■■□□□ 1.69
HPS5Q9UPZ3 MDK-213ENST00000617138 635 ntTSL 2 BASIC25.61■■□□□ 1.69
HPS5Q9UPZ3 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.61■■□□□ 1.69
HPS5Q9UPZ3 AP004608.1-202ENST00000533390 1863 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
HPS5Q9UPZ3 ADAD2-201ENST00000268624 2283 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.61■■□□□ 1.69
HPS5Q9UPZ3 HADH-201ENST00000309522 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
HPS5Q9UPZ3 RHCE-204ENST00000349320 1810 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
HPS5Q9UPZ3 MPST-205ENST00000404802 1453 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.6■■□□□ 1.69
HPS5Q9UPZ3 HOXA4-201ENST00000360046 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
HPS5Q9UPZ3 ECEL1P1-201ENST00000373592 1742 ntBASIC25.6■■□□□ 1.69
HPS5Q9UPZ3 DMRT1-201ENST00000382276 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
HPS5Q9UPZ3 RITA1-202ENST00000549621 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
HPS5Q9UPZ3 ADA-201ENST00000372874 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
HPS5Q9UPZ3 TMPO-201ENST00000261210 820 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
HPS5Q9UPZ3 UBE2J2-203ENST00000360466 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
HPS5Q9UPZ3 CT47A12-201ENST00000419982 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
HPS5Q9UPZ3 DEUP1-206ENST00000530273 410 ntTSL 3 BASIC25.6■■□□□ 1.69
HPS5Q9UPZ3 C5AR2-202ENST00000600626 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
HPS5Q9UPZ3 ANKHD1-221ENST00000616482 2064 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
HPS5Q9UPZ3 MIS18A-201ENST00000290130 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
HPS5Q9UPZ3 TRH-201ENST00000302649 1978 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
HPS5Q9UPZ3 AC135048.1-201ENST00000566056 1318 ntTSL 2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
HPS5Q9UPZ3 SETD9-211ENST00000628593 1306 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
HPS5Q9UPZ3 LMF1-202ENST00000543238 2103 ntTSL 2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
HPS5Q9UPZ3 EYA2-203ENST00000357410 2465 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
HPS5Q9UPZ3 IMPA2-201ENST00000269159 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
HPS5Q9UPZ3 UCHL5-201ENST00000367448 1534 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
HPS5Q9UPZ3 TMEM218-201ENST00000279968 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
HPS5Q9UPZ3 AC084116.4-201ENST00000524320 484 ntTSL 2 BASIC25.59■■□□□ 1.69
HPS5Q9UPZ3 ACYP1-205ENST00000555463 789 ntTSL 2 BASIC25.59■■□□□ 1.69
HPS5Q9UPZ3 SHMT1-201ENST00000316694 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
HPS5Q9UPZ3 TSSK1B-201ENST00000390666 2478 ntAPPRIS P1 BASIC25.59■■□□□ 1.69
HPS5Q9UPZ3 CD58-203ENST00000457047 1328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
HPS5Q9UPZ3 GPRC5B-210ENST00000569847 1830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.58■■□□□ 1.69
HPS5Q9UPZ3 CASP9-203ENST00000375890 1351 ntTSL 2 BASIC25.58■■□□□ 1.69
HPS5Q9UPZ3 MCMBP-202ENST00000369077 2465 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
HPS5Q9UPZ3 ZNF717-203ENST00000477374 1169 ntTSL 2 BASIC25.58■■□□□ 1.69
HPS5Q9UPZ3 AC083906.2-201ENST00000511578 360 ntBASIC25.58■■□□□ 1.69
HPS5Q9UPZ3 RAB6A-204ENST00000536566 1267 ntTSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.69
HPS5Q9UPZ3 JADE2-211ENST00000612830 1251 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
HPS5Q9UPZ3 RAB24-201ENST00000303251 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
HPS5Q9UPZ3 FBXL22-201ENST00000360587 1526 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.68
HPS5Q9UPZ3 EI24-211ENST00000534546 1544 ntTSL 2 BASIC25.58■■□□□ 1.68
HPS5Q9UPZ3 TOX2-201ENST00000341197 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.57■■□□□ 1.68
HPS5Q9UPZ3 LINC00969-219ENST00000453324 1439 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
HPS5Q9UPZ3 LIN7B-201ENST00000221459 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
HPS5Q9UPZ3 GUK1-201ENST00000312726 1084 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
HPS5Q9UPZ3 ZFAS1-206ENST00000450535 1075 ntTSL 3 BASIC25.57■■□□□ 1.68
HPS5Q9UPZ3 PACRGL-206ENST00000502374 1034 ntTSL 2 BASIC25.57■■□□□ 1.68
HPS5Q9UPZ3 FADS3-204ENST00000525588 1254 ntTSL 5 BASIC25.57■■□□□ 1.68
HPS5Q9UPZ3 AC007216.1-201ENST00000570197 601 ntTSL 4 BASIC25.57■■□□□ 1.68
HPS5Q9UPZ3 AL161421.1-201ENST00000619666 1101 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
HPS5Q9UPZ3 RNF114-202ENST00000622920 1284 ntTSL 5 BASIC25.57■■□□□ 1.68
HPS5Q9UPZ3 AC242852.2-201ENST00000615738 1807 ntBASIC25.57■■□□□ 1.68
HPS5Q9UPZ3 PHACTR2-208ENST00000440869 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.57■■□□□ 1.68
HPS5Q9UPZ3 SLC25A29-202ENST00000392908 2242 ntTSL 2 BASIC25.57■■□□□ 1.68
HPS5Q9UPZ3 KREMEN2-203ENST00000571007 1877 ntTSL 2 BASIC25.57■■□□□ 1.68
HPS5Q9UPZ3 CNEP1R1-202ENST00000427478 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
HPS5Q9UPZ3 TMEM198B-205ENST00000487582 1581 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
HPS5Q9UPZ3 KDELR1-203ENST00000597017 1594 ntTSL 2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
HPS5Q9UPZ3 GPR143-203ENST00000467482 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
HPS5Q9UPZ3 G6PD-202ENST00000393562 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
HPS5Q9UPZ3 G6PD-211ENST00000621232 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
HPS5Q9UPZ3 PWWP2A-205ENST00000523662 1819 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
HPS5Q9UPZ3 CLN3-207ENST00000395653 1430 ntTSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
HPS5Q9UPZ3 SEPT8-207ENST00000378719 2889 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
HPS5Q9UPZ3 BIN1-207ENST00000357970 2497 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
HPS5Q9UPZ3 DOC2A-218ENST00000616445 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
HPS5Q9UPZ3 PRMT2-204ENST00000397628 954 ntTSL 2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
HPS5Q9UPZ3 AC069152.1-201ENST00000438030 544 ntBASIC25.56■■□□□ 1.68
HPS5Q9UPZ3 AP000282.1-201ENST00000454622 682 ntTSL 2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
HPS5Q9UPZ3 AL138781.1-201ENST00000566567 1274 ntBASIC25.56■■□□□ 1.68
HPS5Q9UPZ3 AL050303.2-201ENST00000619798 666 ntBASIC25.56■■□□□ 1.68
HPS5Q9UPZ3 MMEL1-206ENST00000502556 1943 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
HPS5Q9UPZ3 NHLRC4-202ENST00000540585 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
HPS5Q9UPZ3 ARRDC1-AS1-201ENST00000371417 1409 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
HPS5Q9UPZ3 PDLIM3-203ENST00000284771 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
HPS5Q9UPZ3 ANKHD1-204ENST00000394722 2035 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
HPS5Q9UPZ3 PPCS-202ENST00000372560 793 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
HPS5Q9UPZ3 KRT19P1-201ENST00000405746 1186 ntBASIC25.55■■□□□ 1.68
HPS5Q9UPZ3 FNDC3B-204ENST00000421757 946 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.7 ms