Protein–RNA interactions for Protein: Q9UPU9

SAMD4A, Protein Smaug homolog 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 718 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SAMD4AQ9UPU9 AC110285.2-201ENST00000571724 1565 ntTSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
SAMD4AQ9UPU9 SPOP-206ENST00000504102 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
SAMD4AQ9UPU9 TANGO2-212ENST00000434570 2180 ntTSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
SAMD4AQ9UPU9 OAZ2-201ENST00000326005 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
SAMD4AQ9UPU9 CLK3-202ENST00000395066 2621 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
SAMD4AQ9UPU9 DUSP7-202ENST00000495880 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
SAMD4AQ9UPU9 SEPT5-209ENST00000438754 2241 ntTSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
SAMD4AQ9UPU9 DLG3-201ENST00000194900 6112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
SAMD4AQ9UPU9 WDR86-203ENST00000469830 1691 ntTSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
SAMD4AQ9UPU9 NOS3-204ENST00000467517 2377 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
SAMD4AQ9UPU9 SYCE1-204ENST00000432597 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
SAMD4AQ9UPU9 FAM66C-205ENST00000456135 1216 ntTSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
SAMD4AQ9UPU9 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
SAMD4AQ9UPU9 MIR4787-201ENST00000607364 84 ntBASIC19.98■□□□□ 0.79
SAMD4AQ9UPU9 IKBKG-206ENST00000594239 2299 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
SAMD4AQ9UPU9 JDP2-201ENST00000267569 1700 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
SAMD4AQ9UPU9 SAXO1-201ENST00000380530 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
SAMD4AQ9UPU9 ST3GAL4-213ENST00000530591 1459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
SAMD4AQ9UPU9 FGFR1-214ENST00000447712 5900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
SAMD4AQ9UPU9 CPNE9-203ENST00000383832 2068 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
SAMD4AQ9UPU9 AC133637.1-201ENST00000624115 1537 ntBASIC19.97■□□□□ 0.79
SAMD4AQ9UPU9 SMIM10L2A-201ENST00000417443 5230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
SAMD4AQ9UPU9 DISC1-213ENST00000537876 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
SAMD4AQ9UPU9 FIP1L1-201ENST00000306932 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
SAMD4AQ9UPU9 AC084116.4-201ENST00000524320 484 ntTSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
SAMD4AQ9UPU9 AC068587.7-201ENST00000641602 218 ntBASIC19.97■□□□□ 0.79
SAMD4AQ9UPU9 RARA-201ENST00000254066 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
SAMD4AQ9UPU9 FAM118B-209ENST00000533050 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
SAMD4AQ9UPU9 SLC9A3R1-201ENST00000262613 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
SAMD4AQ9UPU9 SHMT1-203ENST00000354098 1656 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
SAMD4AQ9UPU9 OTOP1-201ENST00000296358 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
SAMD4AQ9UPU9 CLDN15-201ENST00000308344 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
SAMD4AQ9UPU9 OAS3-205ENST00000548514 1392 ntTSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
SAMD4AQ9UPU9 CCKBR-206ENST00000532715 1734 ntTSL 3 BASIC19.96■□□□□ 0.79
SAMD4AQ9UPU9 RBM34-201ENST00000408888 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
SAMD4AQ9UPU9 NYAP1-202ENST00000454988 2777 ntTSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
SAMD4AQ9UPU9 TLE3-216ENST00000559191 1575 ntTSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
SAMD4AQ9UPU9 FAM3A-208ENST00000419205 1763 ntTSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
SAMD4AQ9UPU9 XBP1-207ENST00000611155 1794 ntTSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
SAMD4AQ9UPU9 RBKS-201ENST00000302188 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
SAMD4AQ9UPU9 BAD-203ENST00000394532 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
SAMD4AQ9UPU9 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
SAMD4AQ9UPU9 AL117332.1-201ENST00000622628 974 ntBASIC19.96■□□□□ 0.79
SAMD4AQ9UPU9 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
SAMD4AQ9UPU9 AC018553.2-201ENST00000637770 1064 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
SAMD4AQ9UPU9 FAM3A-202ENST00000359889 1712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
SAMD4AQ9UPU9 HTATIP2-204ENST00000451739 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
SAMD4AQ9UPU9 MPZL1-201ENST00000359523 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
SAMD4AQ9UPU9 NR2F1-AS1-210ENST00000606739 1431 ntTSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
SAMD4AQ9UPU9 AL157384.1-201ENST00000445995 2473 ntBASIC19.95■□□□□ 0.78
SAMD4AQ9UPU9 PDLIM3-203ENST00000284771 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
SAMD4AQ9UPU9 HSD17B14-201ENST00000263278 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
SAMD4AQ9UPU9 HFE2-202ENST00000357836 2123 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
SAMD4AQ9UPU9 IPO9-AS1-201ENST00000413035 839 ntTSL 3 BASIC19.95■□□□□ 0.78
SAMD4AQ9UPU9 AC092343.1-201ENST00000500224 729 ntTSL 3 BASIC19.95■□□□□ 0.78
SAMD4AQ9UPU9 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC19.95■□□□□ 0.78
SAMD4AQ9UPU9 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
SAMD4AQ9UPU9 GTSE1-AS1-202ENST00000623117 1518 ntBASIC19.95■□□□□ 0.78
SAMD4AQ9UPU9 TMEFF1-201ENST00000374879 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
SAMD4AQ9UPU9 CHST8-202ENST00000434302 2225 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
SAMD4AQ9UPU9 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
SAMD4AQ9UPU9 HLA-C-203ENST00000383329 1554 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
SAMD4AQ9UPU9 SYNGR2-203ENST00000588282 1553 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
SAMD4AQ9UPU9 VRK2-201ENST00000340157 1888 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
SAMD4AQ9UPU9 RASSF1-203ENST00000359365 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
SAMD4AQ9UPU9 PMS1-222ENST00000639501 2506 ntTSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
SAMD4AQ9UPU9 CRYAA-201ENST00000291554 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
SAMD4AQ9UPU9 MYD88-205ENST00000424893 1279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
SAMD4AQ9UPU9 EPDR1-201ENST00000199448 2599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
SAMD4AQ9UPU9 MAG-203ENST00000537831 2341 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
SAMD4AQ9UPU9 SPRN-201ENST00000414069 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
SAMD4AQ9UPU9 SBK1-201ENST00000341901 4992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
SAMD4AQ9UPU9 MIS18A-201ENST00000290130 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
SAMD4AQ9UPU9 HES5-201ENST00000378453 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
SAMD4AQ9UPU9 BASP1-201ENST00000322611 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
SAMD4AQ9UPU9 ZNF48-201ENST00000320159 3234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
SAMD4AQ9UPU9 MAG-201ENST00000361922 2426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
SAMD4AQ9UPU9 DLX2-201ENST00000234198 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
SAMD4AQ9UPU9 ARRDC1-AS1-201ENST00000371417 1409 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
SAMD4AQ9UPU9 ZNF467-201ENST00000302017 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
SAMD4AQ9UPU9 NDUFAF3-202ENST00000326925 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
SAMD4AQ9UPU9 P2RX4-202ENST00000337233 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
SAMD4AQ9UPU9 RFXAP-201ENST00000255476 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
SAMD4AQ9UPU9 METTL1-202ENST00000324871 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
SAMD4AQ9UPU9 CTNND2-201ENST00000304623 5481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
SAMD4AQ9UPU9 NAPEPLD-208ENST00000427257 1822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
SAMD4AQ9UPU9 SAV1-201ENST00000324679 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
SAMD4AQ9UPU9 FGFR2-224ENST00000613048 4369 ntTSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
SAMD4AQ9UPU9 BX005266.2-202ENST00000446626 2245 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
SAMD4AQ9UPU9 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.93■□□□□ 0.78
SAMD4AQ9UPU9 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
SAMD4AQ9UPU9 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
SAMD4AQ9UPU9 TMEM218-209ENST00000529583 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.93■□□□□ 0.78
SAMD4AQ9UPU9 AC136475.3-202ENST00000534742 812 ntTSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
SAMD4AQ9UPU9 MEF2A-202ENST00000354410 5824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
SAMD4AQ9UPU9 TMUB1-201ENST00000297533 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
SAMD4AQ9UPU9 SNX3-201ENST00000230085 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
SAMD4AQ9UPU9 C10orf91-202ENST00000392630 1846 ntTSL 2 BASIC19.92■□□□□ 0.78
SAMD4AQ9UPU9 RMI2-201ENST00000312499 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
SAMD4AQ9UPU9 MTMR9LP-204ENST00000441044 2624 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.2 ms