Protein–RNA interactions for Protein: Q9UPU3

SORCS3, VPS10 domain-containing receptor SorCS3, humanhuman

Predictions only

Length 1,222 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SORCS3Q9UPU3 ANKRD10-202ENST00000310847 1193 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
SORCS3Q9UPU3 SBK2-201ENST00000344158 1056 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
SORCS3Q9UPU3 PARP1-202ENST00000366792 553 ntTSL 3 BASIC22.57■■□□□ 1.2
SORCS3Q9UPU3 SBK2-202ENST00000413299 1085 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
SORCS3Q9UPU3 AL355102.2-201ENST00000553811 600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
SORCS3Q9UPU3 C19orf84-201ENST00000570516 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
SORCS3Q9UPU3 AC104187.1-201ENST00000607510 612 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
SORCS3Q9UPU3 PTMS-207ENST00000619580 1150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
SORCS3Q9UPU3 SPAG7-205ENST00000573366 1668 ntTSL 3 BASIC22.57■■□□□ 1.2
SORCS3Q9UPU3 SPSB3-208ENST00000566339 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
SORCS3Q9UPU3 KAT5-201ENST00000341318 2296 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
SORCS3Q9UPU3 AKT1-201ENST00000349310 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
SORCS3Q9UPU3 ANXA8-204ENST00000583911 1874 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
SORCS3Q9UPU3 UCK2-201ENST00000367879 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
SORCS3Q9UPU3 EEF1D-256ENST00000618139 2238 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
SORCS3Q9UPU3 EFNA2-201ENST00000215368 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
SORCS3Q9UPU3 XXYLT1-202ENST00000356740 564 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
SORCS3Q9UPU3 AC099522.1-201ENST00000505955 881 ntTSL 3 BASIC22.56■■□□□ 1.2
SORCS3Q9UPU3 ULK4P1-204ENST00000565949 721 ntTSL 4 BASIC22.56■■□□□ 1.2
SORCS3Q9UPU3 AKT1S1-204ENST00000391832 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
SORCS3Q9UPU3 BTBD17-201ENST00000375366 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
SORCS3Q9UPU3 FAM83D-202ENST00000619850 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
SORCS3Q9UPU3 TANGO2-201ENST00000327374 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
SORCS3Q9UPU3 PKM-201ENST00000319622 2717 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
SORCS3Q9UPU3 ADGRA2-202ENST00000412232 5651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
SORCS3Q9UPU3 SLC35B2-201ENST00000393810 1898 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
SORCS3Q9UPU3 SLC25A42-201ENST00000318596 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
SORCS3Q9UPU3 POLD2-207ENST00000452185 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
SORCS3Q9UPU3 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
SORCS3Q9UPU3 VIL1-204ENST00000440053 1454 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
SORCS3Q9UPU3 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
SORCS3Q9UPU3 PTP4A3-204ENST00000521578 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
SORCS3Q9UPU3 ABHD14A-204ENST00000491470 674 ntTSL 3 BASIC22.55■■□□□ 1.2
SORCS3Q9UPU3 SNHG6-203ENST00000520944 638 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
SORCS3Q9UPU3 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
SORCS3Q9UPU3 ZBTB42-202ENST00000555360 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
SORCS3Q9UPU3 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
SORCS3Q9UPU3 KCTD8-201ENST00000360029 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
SORCS3Q9UPU3 KRT87P-202ENST00000534226 1464 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
SORCS3Q9UPU3 EHBP1L1-201ENST00000309295 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
SORCS3Q9UPU3 POU5F1P3-201ENST00000428824 1078 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
SORCS3Q9UPU3 AF201337.1-201ENST00000520239 748 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
SORCS3Q9UPU3 UBE2DNL-204ENST00000602536 740 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
SORCS3Q9UPU3 ITM2C-210ENST00000620962 501 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
SORCS3Q9UPU3 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
SORCS3Q9UPU3 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
SORCS3Q9UPU3 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
SORCS3Q9UPU3 SNHG7-201ENST00000414282 2357 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
SORCS3Q9UPU3 AUTS2-203ENST00000406775 5950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
SORCS3Q9UPU3 NCK2-201ENST00000233154 2683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
SORCS3Q9UPU3 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
SORCS3Q9UPU3 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
SORCS3Q9UPU3 P2RX4-211ENST00000543171 1777 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
SORCS3Q9UPU3 FAM120B-204ENST00000625626 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
SORCS3Q9UPU3 CENPN-201ENST00000299572 1398 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
SORCS3Q9UPU3 ELOA-201ENST00000418390 5154 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
SORCS3Q9UPU3 MAL-201ENST00000309988 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
SORCS3Q9UPU3 LYRM9-201ENST00000379102 501 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
SORCS3Q9UPU3 LYRM9-206ENST00000508862 807 ntTSL 3 BASIC22.53■■□□□ 1.2
SORCS3Q9UPU3 AC027451.1-201ENST00000530667 553 ntTSL 4 BASIC22.53■■□□□ 1.2
SORCS3Q9UPU3 ARL16-209ENST00000573715 763 ntTSL 3 BASIC22.53■■□□□ 1.2
SORCS3Q9UPU3 ARL16-211ENST00000576135 694 ntTSL 3 BASIC22.53■■□□□ 1.2
SORCS3Q9UPU3 AC005697.1-201ENST00000582441 582 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.53■■□□□ 1.2
SORCS3Q9UPU3 ARRDC1-AS1-201ENST00000371417 1409 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
SORCS3Q9UPU3 CNN3-201ENST00000370206 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
SORCS3Q9UPU3 AC009506.1-201ENST00000418474 1494 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
SORCS3Q9UPU3 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
SORCS3Q9UPU3 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
SORCS3Q9UPU3 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
SORCS3Q9UPU3 NRG2-201ENST00000289409 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
SORCS3Q9UPU3 PITX1-201ENST00000265340 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
SORCS3Q9UPU3 CORO1A-201ENST00000219150 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
SORCS3Q9UPU3 SMUG1-215ENST00000508394 1697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
SORCS3Q9UPU3 SNRNP25-202ENST00000383018 1085 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
SORCS3Q9UPU3 KRT18P29-201ENST00000397031 1267 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
SORCS3Q9UPU3 AL731577.2-201ENST00000508096 555 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
SORCS3Q9UPU3 MVB12A-212ENST00000543795 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
SORCS3Q9UPU3 RYK-208ENST00000620660 2942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
SORCS3Q9UPU3 DENND1A-201ENST00000373618 3003 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.19
SORCS3Q9UPU3 B3GALNT2-202ENST00000366600 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.19
SORCS3Q9UPU3 H1FX-201ENST00000333762 1507 ntAPPRIS P1 BASIC22.52■■□□□ 1.19
SORCS3Q9UPU3 GUK1-209ENST00000366730 937 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.51■■□□□ 1.19
SORCS3Q9UPU3 LINC02531-201ENST00000404689 593 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
SORCS3Q9UPU3 EDA-210ENST00000527388 927 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
SORCS3Q9UPU3 NMRAL1-212ENST00000574425 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
SORCS3Q9UPU3 MAGIX-202ENST00000595224 1238 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
SORCS3Q9UPU3 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
SORCS3Q9UPU3 MIS18A-201ENST00000290130 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
SORCS3Q9UPU3 C6orf136-201ENST00000293604 1978 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
SORCS3Q9UPU3 PFKFB3-201ENST00000317350 1999 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
SORCS3Q9UPU3 DONSON-202ENST00000303113 2028 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
SORCS3Q9UPU3 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
SORCS3Q9UPU3 ZNF295-AS1-201ENST00000412906 952 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
SORCS3Q9UPU3 COX6C-208ENST00000522940 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.5■■□□□ 1.19
SORCS3Q9UPU3 MYCNOS-205ENST00000641950 531 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
SORCS3Q9UPU3 AC068987.5-201ENST00000642069 987 ntAPPRIS P1 BASIC22.5■■□□□ 1.19
SORCS3Q9UPU3 DALRD3-206ENST00000441576 1706 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
SORCS3Q9UPU3 EPCAM-202ENST00000405271 1530 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
SORCS3Q9UPU3 AC004687.1-201ENST00000579003 1625 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
SORCS3Q9UPU3 KCNQ2-201ENST00000344425 1426 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.5 ms