Protein–RNA interactions for Protein: Q9UNY4

TTF2, Transcription termination factor 2, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,162 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TTF2Q9UNY4 MAP1LC3A-202ENST00000374837 961 ntTSL 3 BASIC25.83■■□□□ 1.73
TTF2Q9UNY4 HTATIP2-208ENST00000532505 595 ntTSL 2 BASIC25.83■■□□□ 1.73
TTF2Q9UNY4 KRT18P20-201ENST00000548986 1279 ntBASIC25.83■■□□□ 1.73
TTF2Q9UNY4 AL034346.1-201ENST00000568244 1277 ntBASIC25.83■■□□□ 1.73
TTF2Q9UNY4 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
TTF2Q9UNY4 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.83■■□□□ 1.73
TTF2Q9UNY4 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.82■■□□□ 1.72
TTF2Q9UNY4 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC25.82■■□□□ 1.72
TTF2Q9UNY4 NFS1-201ENST00000306750 738 ntTSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
TTF2Q9UNY4 LINC01816-201ENST00000414141 662 ntTSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
TTF2Q9UNY4 AC010536.3-201ENST00000620306 533 ntBASIC25.82■■□□□ 1.72
TTF2Q9UNY4 LRRC34-201ENST00000446859 1718 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.82■■□□□ 1.72
TTF2Q9UNY4 RNF166-202ENST00000537718 1525 ntTSL 2 BASIC25.82■■□□□ 1.72
TTF2Q9UNY4 TADA2B-204ENST00000512388 1343 ntTSL 5 BASIC25.82■■□□□ 1.72
TTF2Q9UNY4 SLC41A3-201ENST00000315891 1797 ntTSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
TTF2Q9UNY4 NOC4L-201ENST00000330579 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
TTF2Q9UNY4 TYMP-202ENST00000395678 1614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
TTF2Q9UNY4 TGIF1-206ENST00000405385 1689 ntTSL 2 BASIC25.81■■□□□ 1.72
TTF2Q9UNY4 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
TTF2Q9UNY4 UBE2C-203ENST00000352551 665 ntTSL 2 BASIC25.81■■□□□ 1.72
TTF2Q9UNY4 AL138781.1-201ENST00000566567 1274 ntBASIC25.81■■□□□ 1.72
TTF2Q9UNY4 CD99-212ENST00000624481 1089 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.81■■□□□ 1.72
TTF2Q9UNY4 AL359710.1-201ENST00000427039 1544 ntTSL 2 BASIC25.81■■□□□ 1.72
TTF2Q9UNY4 UNC119-202ENST00000335765 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
TTF2Q9UNY4 TRH-201ENST00000302649 1978 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
TTF2Q9UNY4 AVPI1-201ENST00000370626 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
TTF2Q9UNY4 AP006587.3-201ENST00000525742 1516 ntBASIC25.8■■□□□ 1.72
TTF2Q9UNY4 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
TTF2Q9UNY4 MRPL39-201ENST00000307301 1199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.8■■□□□ 1.72
TTF2Q9UNY4 MRPL39-202ENST00000352957 1110 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
TTF2Q9UNY4 CD8B-205ENST00000393761 932 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
TTF2Q9UNY4 CD8B-206ENST00000431506 692 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.8■■□□□ 1.72
TTF2Q9UNY4 ZPBP-201ENST00000046087 1213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
TTF2Q9UNY4 PACRGL-206ENST00000502374 1034 ntTSL 2 BASIC25.8■■□□□ 1.72
TTF2Q9UNY4 PSMC3IP-208ENST00000590760 664 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
TTF2Q9UNY4 PROSER2-205ENST00000622831 1646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
TTF2Q9UNY4 SRPK3-202ENST00000370101 1958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
TTF2Q9UNY4 AKR7A2-201ENST00000235835 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
TTF2Q9UNY4 QPCT-201ENST00000338415 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
TTF2Q9UNY4 PNLIPRP2-204ENST00000591655 1456 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
TTF2Q9UNY4 NCAPD3-204ENST00000526422 1060 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.79■■□□□ 1.72
TTF2Q9UNY4 CD99P1-205ENST00000527459 561 ntBASIC25.79■■□□□ 1.72
TTF2Q9UNY4 C12orf43-208ENST00000539736 1033 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.79■■□□□ 1.72
TTF2Q9UNY4 AC007216.1-201ENST00000570197 601 ntTSL 4 BASIC25.79■■□□□ 1.72
TTF2Q9UNY4 TRAPPC5-203ENST00000595985 411 ntTSL 3 BASIC25.79■■□□□ 1.72
TTF2Q9UNY4 ARL6IP4-204ENST00000392435 1339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
TTF2Q9UNY4 PACRGL-227ENST00000513459 1773 ntTSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
TTF2Q9UNY4 CCDC7-201ENST00000277657 1899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
TTF2Q9UNY4 ADRM1-204ENST00000491935 1530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
TTF2Q9UNY4 USP21-202ENST00000368001 2095 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
TTF2Q9UNY4 SLC22A17-201ENST00000206544 2284 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
TTF2Q9UNY4 SLC29A4P1-201ENST00000398760 971 ntBASIC25.78■■□□□ 1.72
TTF2Q9UNY4 C19orf81-201ENST00000425202 765 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
TTF2Q9UNY4 EEF1DP3-203ENST00000566025 782 ntBASIC25.78■■□□□ 1.72
TTF2Q9UNY4 DCTPP1-205ENST00000568973 878 ntTSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
TTF2Q9UNY4 HMGA2-203ENST00000393578 1993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
TTF2Q9UNY4 STK32C-201ENST00000298630 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
TTF2Q9UNY4 RASGRP2-207ENST00000377497 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
TTF2Q9UNY4 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
TTF2Q9UNY4 IFNGR2-203ENST00000405436 1684 ntTSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
TTF2Q9UNY4 FGFRL1-203ENST00000504138 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
TTF2Q9UNY4 KRT7-201ENST00000331817 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
TTF2Q9UNY4 SEPT5-210ENST00000455784 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
TTF2Q9UNY4 FAM207A-201ENST00000291634 927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
TTF2Q9UNY4 NAA20-201ENST00000310450 920 ntTSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
TTF2Q9UNY4 COL19A1-203ENST00000478620 589 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
TTF2Q9UNY4 TP53I11-215ENST00000531928 1078 ntTSL 3 BASIC25.77■■□□□ 1.72
TTF2Q9UNY4 TSPAN11-202ENST00000535215 988 ntTSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
TTF2Q9UNY4 SCO2-203ENST00000535425 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
TTF2Q9UNY4 SNAP23-210ENST00000564153 775 ntTSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
TTF2Q9UNY4 F2RL3-202ENST00000599210 613 ntTSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
TTF2Q9UNY4 FPGS-204ENST00000393706 2230 ntTSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
TTF2Q9UNY4 MRPL37-206ENST00000605337 1582 ntTSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
TTF2Q9UNY4 NABP2-203ENST00000380198 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
TTF2Q9UNY4 PTP4A3-203ENST00000520105 1866 ntTSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
TTF2Q9UNY4 SLC35F4-206ENST00000556826 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.72
TTF2Q9UNY4 OSCAR-201ENST00000284648 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
TTF2Q9UNY4 INTS11-205ENST00000429572 1104 ntTSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.71
TTF2Q9UNY4 AF201337.1-201ENST00000520239 748 ntBASIC25.76■■□□□ 1.71
TTF2Q9UNY4 DHRS4-207ENST00000559632 1003 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
TTF2Q9UNY4 KLF13-207ENST00000560473 489 ntTSL 3 BASIC25.76■■□□□ 1.71
TTF2Q9UNY4 AC018730.2-201ENST00000598623 443 ntTSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.71
TTF2Q9UNY4 PFKL-212ENST00000628044 129 ntTSL 3 BASIC25.76■■□□□ 1.71
TTF2Q9UNY4 VPS29-206ENST00000549578 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
TTF2Q9UNY4 PLAGL1-207ENST00000417959 1645 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
TTF2Q9UNY4 REPIN1-214ENST00000489432 2058 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.71
TTF2Q9UNY4 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
TTF2Q9UNY4 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
TTF2Q9UNY4 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
TTF2Q9UNY4 PLEKHO1-201ENST00000369124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
TTF2Q9UNY4 LHPP-202ENST00000368842 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
TTF2Q9UNY4 HSF4-215ENST00000521374 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
TTF2Q9UNY4 CSNK1G3-206ENST00000511130 1356 ntTSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
TTF2Q9UNY4 SIRT3-202ENST00000524564 1395 ntTSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
TTF2Q9UNY4 MT3-201ENST00000200691 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
TTF2Q9UNY4 DTYMK-201ENST00000305784 1232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
TTF2Q9UNY4 YBEY-204ENST00000397692 433 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
TTF2Q9UNY4 APTR-203ENST00000430801 583 ntTSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
TTF2Q9UNY4 UQCRFS1P1-201ENST00000435169 820 ntBASIC25.75■■□□□ 1.71
TTF2Q9UNY4 CALM1-202ENST00000447653 1104 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37 ms