Protein–RNA interactions for Protein: Q9UMS0

NFU1, NFU1 iron-sulfur cluster scaffold homolog, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 254 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NFU1Q9UMS0 MAIP1-201ENST00000295079 1495 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
NFU1Q9UMS0 NPW-201ENST00000329610 498 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
NFU1Q9UMS0 CLTA-206ENST00000466396 695 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
NFU1Q9UMS0 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
NFU1Q9UMS0 B4GALT5-201ENST00000371711 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
NFU1Q9UMS0 EPHX3-201ENST00000221730 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
NFU1Q9UMS0 RASGRP1-201ENST00000310803 5023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
NFU1Q9UMS0 RASGRP1-204ENST00000539159 5021 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
NFU1Q9UMS0 CHST1-201ENST00000308064 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
NFU1Q9UMS0 KCNS3-201ENST00000304101 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
NFU1Q9UMS0 ALG1-201ENST00000262374 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
NFU1Q9UMS0 CXCR3-201ENST00000373691 1861 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
NFU1Q9UMS0 ZNF773-204ENST00000598770 2019 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
NFU1Q9UMS0 B4GALNT1-203ENST00000449184 1633 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
NFU1Q9UMS0 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
NFU1Q9UMS0 CHAC1-201ENST00000444189 1204 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
NFU1Q9UMS0 CYP27A1-201ENST00000258415 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
NFU1Q9UMS0 ZDHHC17-201ENST00000426126 5259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
NFU1Q9UMS0 HDAC2-201ENST00000368632 2084 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
NFU1Q9UMS0 CCKBR-206ENST00000532715 1734 ntTSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
NFU1Q9UMS0 MEDAG-201ENST00000380482 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
NFU1Q9UMS0 FIP1L1-201ENST00000306932 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
NFU1Q9UMS0 FOXD4L3-201ENST00000342833 2039 ntAPPRIS P1 BASIC22.11■■□□□ 1.13
NFU1Q9UMS0 TUBGCP3-204ENST00000464139 2461 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
NFU1Q9UMS0 WDR86-203ENST00000469830 1691 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
NFU1Q9UMS0 NARF-202ENST00000345415 1487 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
NFU1Q9UMS0 PCID2-203ENST00000375457 2372 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
NFU1Q9UMS0 ADAMTS2-202ENST00000274609 2044 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
NFU1Q9UMS0 UBL7-202ENST00000395081 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
NFU1Q9UMS0 IGFBP7-203ENST00000514062 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
NFU1Q9UMS0 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
NFU1Q9UMS0 ALDOA-221ENST00000566897 2448 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
NFU1Q9UMS0 NTRK3-206ENST00000540489 2145 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
NFU1Q9UMS0 PGF-201ENST00000238607 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
NFU1Q9UMS0 C17orf82-201ENST00000623772 1530 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
NFU1Q9UMS0 OAZ2-201ENST00000326005 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
NFU1Q9UMS0 EGLN2-202ENST00000406058 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
NFU1Q9UMS0 CRTAC1-203ENST00000370597 2890 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
NFU1Q9UMS0 DET1-201ENST00000268148 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
NFU1Q9UMS0 COL15A1-205ENST00000610452 5422 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
NFU1Q9UMS0 SDC3-202ENST00000339394 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
NFU1Q9UMS0 GRINA-201ENST00000313269 1968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
NFU1Q9UMS0 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC22.09■■□□□ 1.13
NFU1Q9UMS0 NANOS2-201ENST00000341294 1657 ntAPPRIS P1 BASIC22.09■■□□□ 1.13
NFU1Q9UMS0 INPP1-201ENST00000322522 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
NFU1Q9UMS0 NNT-AS1-206ENST00000606697 1945 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
NFU1Q9UMS0 FADS6-203ENST00000612771 2154 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
NFU1Q9UMS0 USP39-203ENST00000409470 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
NFU1Q9UMS0 SHCBP1L-201ENST00000367547 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
NFU1Q9UMS0 ARFRP1-210ENST00000614942 2554 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
NFU1Q9UMS0 AC009041.2-204ENST00000568394 3343 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
NFU1Q9UMS0 SAMD10-201ENST00000369886 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
NFU1Q9UMS0 TXNRD3-204ENST00000640433 1932 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
NFU1Q9UMS0 NDOR1-201ENST00000344894 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
NFU1Q9UMS0 PRELID3B-201ENST00000355937 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
NFU1Q9UMS0 MUS81-201ENST00000308110 2392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
NFU1Q9UMS0 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.13
NFU1Q9UMS0 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
NFU1Q9UMS0 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
NFU1Q9UMS0 MLST8-202ENST00000382450 1861 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
NFU1Q9UMS0 MLST8-215ENST00000564088 1861 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
NFU1Q9UMS0 ME3-212ENST00000543262 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
NFU1Q9UMS0 GOLGA6L9-202ENST00000618348 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.12
NFU1Q9UMS0 NKX1-2-201ENST00000451024 3364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.12
NFU1Q9UMS0 C10orf91-202ENST00000392630 1846 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.12
NFU1Q9UMS0 DMRTB1-201ENST00000371445 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
NFU1Q9UMS0 HDGFL2-208ENST00000616600 2281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
NFU1Q9UMS0 AP1S1-201ENST00000337619 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
NFU1Q9UMS0 DAPK3-201ENST00000301264 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
NFU1Q9UMS0 VGF-201ENST00000249330 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
NFU1Q9UMS0 GATA5-201ENST00000252997 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
NFU1Q9UMS0 NKIRAS2-204ENST00000393880 1644 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
NFU1Q9UMS0 PANK1-201ENST00000307534 6976 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
NFU1Q9UMS0 CADPS-202ENST00000357948 5190 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
NFU1Q9UMS0 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
NFU1Q9UMS0 AC079089.2-201ENST00000531211 1277 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
NFU1Q9UMS0 MIR663AHG-227ENST00000608084 765 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
NFU1Q9UMS0 CREB3-201ENST00000353704 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
NFU1Q9UMS0 ZNF821-202ENST00000425432 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
NFU1Q9UMS0 E4F1-206ENST00000565090 2028 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
NFU1Q9UMS0 PFKFB4-202ENST00000383734 1491 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
NFU1Q9UMS0 FUS-210ENST00000568685 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
NFU1Q9UMS0 C7orf43-201ENST00000316937 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
NFU1Q9UMS0 SUMF2-208ENST00000434526 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
NFU1Q9UMS0 FAM3A-202ENST00000359889 1712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
NFU1Q9UMS0 FAM129C-203ENST00000449408 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
NFU1Q9UMS0 EPS8L1-201ENST00000201647 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
NFU1Q9UMS0 EPDR1-202ENST00000423717 638 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
NFU1Q9UMS0 AC092849.1-201ENST00000475250 303 ntTSL 4 BASIC22.06■■□□□ 1.12
NFU1Q9UMS0 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
NFU1Q9UMS0 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
NFU1Q9UMS0 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
NFU1Q9UMS0 NUDT18-201ENST00000611621 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
NFU1Q9UMS0 ZC3HAV1L-201ENST00000275766 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
NFU1Q9UMS0 ERLEC1-203ENST00000405123 1756 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
NFU1Q9UMS0 TPBGL-201ENST00000562197 2793 ntAPPRIS P1 BASIC22.06■■□□□ 1.12
NFU1Q9UMS0 AR-204ENST00000504326 3615 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
NFU1Q9UMS0 PCED1A-202ENST00000360652 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
NFU1Q9UMS0 TANGO2-202ENST00000398042 2011 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
NFU1Q9UMS0 RLBP1-201ENST00000268125 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.6 ms