Protein–RNA interactions for Protein: Q9ULT6

ZNRF3, E3 ubiquitin-protein ligase ZNRF3, humanhuman

Predictions only

Length 936 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNRF3Q9ULT6 AP000547.3-201ENST00000592918 1576 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
ZNRF3Q9ULT6 VPS29-206ENST00000549578 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
ZNRF3Q9ULT6 ESRRAP1-201ENST00000400596 1257 ntBASIC26■■□□□ 1.75
ZNRF3Q9ULT6 AC021660.2-201ENST00000502999 388 ntTSL 3 BASIC26■■□□□ 1.75
ZNRF3Q9ULT6 PTGER2-202ENST00000557436 643 ntTSL 3 BASIC26■■□□□ 1.75
ZNRF3Q9ULT6 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
ZNRF3Q9ULT6 TRABD2A-203ENST00000409520 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
ZNRF3Q9ULT6 SLC22A31-201ENST00000562855 1909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
ZNRF3Q9ULT6 TPM1-204ENST00000334895 1637 ntTSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
ZNRF3Q9ULT6 CSNK1G3-206ENST00000511130 1356 ntTSL 2 BASIC25.99■■□□□ 1.75
ZNRF3Q9ULT6 PGF-206ENST00000555567 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
ZNRF3Q9ULT6 GCSHP5-201ENST00000443090 522 ntBASIC25.99■■□□□ 1.75
ZNRF3Q9ULT6 RHEB-204ENST00000472642 900 ntTSL 3 BASIC25.99■■□□□ 1.75
ZNRF3Q9ULT6 Z97653.1-201ENST00000567096 446 ntTSL 3 BASIC25.99■■□□□ 1.75
ZNRF3Q9ULT6 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
ZNRF3Q9ULT6 IFNGR2-203ENST00000405436 1684 ntTSL 5 BASIC25.99■■□□□ 1.75
ZNRF3Q9ULT6 FASTK-217ENST00000540185 1609 ntTSL 5 BASIC25.99■■□□□ 1.75
ZNRF3Q9ULT6 MFSD3-201ENST00000301327 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
ZNRF3Q9ULT6 ADRM1-204ENST00000491935 1530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.98■■□□□ 1.75
ZNRF3Q9ULT6 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.98■■□□□ 1.75
ZNRF3Q9ULT6 OR7E47P-201ENST00000546390 1422 ntBASIC25.98■■□□□ 1.75
ZNRF3Q9ULT6 RNPS1-201ENST00000301730 1276 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.98■■□□□ 1.75
ZNRF3Q9ULT6 SSNA1-201ENST00000322310 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
ZNRF3Q9ULT6 AC097658.1-201ENST00000475555 843 ntBASIC25.98■■□□□ 1.75
ZNRF3Q9ULT6 UNC93B6-201ENST00000525262 1143 ntTSL 5 BASIC25.98■■□□□ 1.75
ZNRF3Q9ULT6 ZNF324-202ENST00000535298 1006 ntTSL 5 BASIC25.98■■□□□ 1.75
ZNRF3Q9ULT6 BEX2-204ENST00000536889 1077 ntTSL 2 BASIC25.98■■□□□ 1.75
ZNRF3Q9ULT6 IRX5-204ENST00000560154 879 ntTSL 5 BASIC25.98■■□□□ 1.75
ZNRF3Q9ULT6 CLN6-207ENST00000566347 981 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
ZNRF3Q9ULT6 AL034346.1-201ENST00000568244 1277 ntBASIC25.98■■□□□ 1.75
ZNRF3Q9ULT6 IRX5-205ENST00000620085 881 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
ZNRF3Q9ULT6 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
ZNRF3Q9ULT6 NPY4R-201ENST00000374312 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
ZNRF3Q9ULT6 NPY4R2-201ENST00000576178 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
ZNRF3Q9ULT6 DIXDC1-205ENST00000529225 1945 ntTSL 5 BASIC25.98■■□□□ 1.75
ZNRF3Q9ULT6 CDCA4-202ENST00000392590 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
ZNRF3Q9ULT6 EGR3-203ENST00000519492 1500 ntTSL 5 BASIC25.98■■□□□ 1.75
ZNRF3Q9ULT6 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC25.98■■□□□ 1.75
ZNRF3Q9ULT6 TUSC3-203ENST00000503731 1498 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
ZNRF3Q9ULT6 SERTAD3-201ENST00000322354 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
ZNRF3Q9ULT6 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.97■■□□□ 1.75
ZNRF3Q9ULT6 TRA2B-203ENST00000382191 976 ntTSL 2 BASIC25.97■■□□□ 1.75
ZNRF3Q9ULT6 TMEM240-202ENST00000425828 717 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.97■■□□□ 1.75
ZNRF3Q9ULT6 DNAJA4-210ENST00000489435 947 ntTSL 3 BASIC25.97■■□□□ 1.75
ZNRF3Q9ULT6 CTBP1-AS2-203ENST00000507044 739 ntTSL 3 BASIC25.97■■□□□ 1.75
ZNRF3Q9ULT6 C12orf43-208ENST00000539736 1033 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.97■■□□□ 1.75
ZNRF3Q9ULT6 C14orf28-204ENST00000557112 1097 ntTSL 5 BASIC25.97■■□□□ 1.75
ZNRF3Q9ULT6 SEC23A-213ENST00000557280 561 ntTSL 4 BASIC25.97■■□□□ 1.75
ZNRF3Q9ULT6 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
ZNRF3Q9ULT6 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
ZNRF3Q9ULT6 SPR-201ENST00000234454 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
ZNRF3Q9ULT6 TPD52L1-203ENST00000368402 1308 ntTSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
ZNRF3Q9ULT6 CLN3-240ENST00000631023 1586 ntTSL 5 BASIC25.96■■□□□ 1.75
ZNRF3Q9ULT6 ASIP-201ENST00000374954 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
ZNRF3Q9ULT6 PTGIR-205ENST00000597185 775 ntTSL 3 BASIC25.96■■□□□ 1.75
ZNRF3Q9ULT6 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
ZNRF3Q9ULT6 C22orf34-203ENST00000405854 1593 ntTSL 5 BASIC25.95■■□□□ 1.75
ZNRF3Q9ULT6 IGSF21-201ENST00000251296 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
ZNRF3Q9ULT6 C16orf74-201ENST00000284245 906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
ZNRF3Q9ULT6 NAA20-202ENST00000334982 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
ZNRF3Q9ULT6 ASMTL-AS1-203ENST00000425740 840 ntTSL 2 BASIC25.95■■□□□ 1.74
ZNRF3Q9ULT6 AC025754.1-201ENST00000507566 407 ntTSL 3 BASIC25.95■■□□□ 1.74
ZNRF3Q9ULT6 TXNL4A-203ENST00000585474 1185 ntTSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
ZNRF3Q9ULT6 DPP7-201ENST00000371579 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
ZNRF3Q9ULT6 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
ZNRF3Q9ULT6 KCNA2-206ENST00000638477 1524 ntTSL 5 BASIC25.94■■□□□ 1.74
ZNRF3Q9ULT6 PRR7-202ENST00000502922 1345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.94■■□□□ 1.74
ZNRF3Q9ULT6 SEPT5-210ENST00000455784 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
ZNRF3Q9ULT6 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
ZNRF3Q9ULT6 AC007285.1-201ENST00000422239 893 ntTSL 5 BASIC25.94■■□□□ 1.74
ZNRF3Q9ULT6 CALM1-202ENST00000447653 1104 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.94■■□□□ 1.74
ZNRF3Q9ULT6 AC105001.1-201ENST00000506149 821 ntTSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
ZNRF3Q9ULT6 SCARA5-203ENST00000518030 1074 ntTSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
ZNRF3Q9ULT6 CAVIN3-203ENST00000530979 957 ntTSL 2 BASIC25.94■■□□□ 1.74
ZNRF3Q9ULT6 AC106738.2-202ENST00000558156 533 ntTSL 4 BASIC25.94■■□□□ 1.74
ZNRF3Q9ULT6 AC138028.5-201ENST00000566114 558 ntTSL 5 BASIC25.94■■□□□ 1.74
ZNRF3Q9ULT6 ZNF263-205ENST00000574253 1139 ntTSL 2 BASIC25.94■■□□□ 1.74
ZNRF3Q9ULT6 FP565260.3-201ENST00000612610 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
ZNRF3Q9ULT6 NOXO1-201ENST00000354249 1618 ntTSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
ZNRF3Q9ULT6 ZNF837-202ENST00000597582 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.94■■□□□ 1.74
ZNRF3Q9ULT6 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
ZNRF3Q9ULT6 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
ZNRF3Q9ULT6 ALDH6A1-201ENST00000350259 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.94■■□□□ 1.74
ZNRF3Q9ULT6 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC25.93■■□□□ 1.74
ZNRF3Q9ULT6 AP006587.3-201ENST00000525742 1516 ntBASIC25.93■■□□□ 1.74
ZNRF3Q9ULT6 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
ZNRF3Q9ULT6 FHL3-201ENST00000373016 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
ZNRF3Q9ULT6 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
ZNRF3Q9ULT6 GTF2A2-203ENST00000396061 758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.93■■□□□ 1.74
ZNRF3Q9ULT6 SSUH2-217ENST00000544814 1636 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.92■■□□□ 1.74
ZNRF3Q9ULT6 TMEM176B-203ENST00000434545 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
ZNRF3Q9ULT6 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC25.92■■□□□ 1.74
ZNRF3Q9ULT6 LINC00526-201ENST00000581067 1875 ntBASIC25.92■■□□□ 1.74
ZNRF3Q9ULT6 PRR16-202ENST00000407149 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
ZNRF3Q9ULT6 MAPK9-206ENST00000425491 2266 ntTSL 5 BASIC25.92■■□□□ 1.74
ZNRF3Q9ULT6 CFC1-201ENST00000259216 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
ZNRF3Q9ULT6 CFC1B-201ENST00000281882 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
ZNRF3Q9ULT6 CBY3-201ENST00000376974 785 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.92■■□□□ 1.74
ZNRF3Q9ULT6 ATPIF1-203ENST00000468425 539 ntTSL 2 BASIC25.92■■□□□ 1.74
ZNRF3Q9ULT6 BET1L-207ENST00000529614 560 ntTSL 5 BASIC25.92■■□□□ 1.74
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.4 ms