Protein–RNA interactions for Protein: Q9ULQ1

TPCN1, Two pore calcium channel protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 816 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TPCN1Q9ULQ1 E2F1-201ENST00000343380 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
TPCN1Q9ULQ1 PRSS22-201ENST00000161006 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
TPCN1Q9ULQ1 PRSS33-202ENST00000570702 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
TPCN1Q9ULQ1 GCH1-202ENST00000395514 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
TPCN1Q9ULQ1 IRX2-201ENST00000302057 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
TPCN1Q9ULQ1 CDC14A-203ENST00000370124 1883 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
TPCN1Q9ULQ1 MRPL41-201ENST00000371443 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
TPCN1Q9ULQ1 RNF208-201ENST00000391553 1077 ntAPPRIS P1 BASIC25.16■■□□□ 1.62
TPCN1Q9ULQ1 RAP1B-204ENST00000393436 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
TPCN1Q9ULQ1 KRTAP5-7-201ENST00000398536 1408 ntAPPRIS P1 BASIC25.16■■□□□ 1.62
TPCN1Q9ULQ1 NDUFS3-206ENST00000528192 561 ntTSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
TPCN1Q9ULQ1 AL359317.1-201ENST00000556316 578 ntTSL 4 BASIC25.16■■□□□ 1.62
TPCN1Q9ULQ1 ZNF846-212ENST00000592859 1206 ntTSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
TPCN1Q9ULQ1 AC008764.7-201ENST00000593779 1081 ntBASIC25.16■■□□□ 1.62
TPCN1Q9ULQ1 AC106739.1-201ENST00000617035 715 ntBASIC25.16■■□□□ 1.62
TPCN1Q9ULQ1 TMEM259-202ENST00000356663 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
TPCN1Q9ULQ1 HERC2P8-204ENST00000567073 1988 ntTSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
TPCN1Q9ULQ1 SOCS7-202ENST00000613678 1827 ntTSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
TPCN1Q9ULQ1 RAB3A-201ENST00000222256 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
TPCN1Q9ULQ1 MCAT-201ENST00000290429 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
TPCN1Q9ULQ1 TMCC2-209ENST00000637895 1455 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
TPCN1Q9ULQ1 TEAD2-201ENST00000311227 2164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
TPCN1Q9ULQ1 GGA2-211ENST00000567468 1713 ntTSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
TPCN1Q9ULQ1 YIF1B-202ENST00000337679 1257 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
TPCN1Q9ULQ1 CCDC107-203ENST00000378407 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
TPCN1Q9ULQ1 POLR2F-211ENST00000488684 564 ntTSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
TPCN1Q9ULQ1 CDKN3-207ENST00000543789 610 ntTSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
TPCN1Q9ULQ1 APLP1-203ENST00000586861 2052 ntTSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
TPCN1Q9ULQ1 AC003102.1-202ENST00000563394 1796 ntBASIC25.15■■□□□ 1.62
TPCN1Q9ULQ1 PAQR6-212ENST00000540423 1729 ntTSL 3 BASIC25.15■■□□□ 1.62
TPCN1Q9ULQ1 RFXAP-201ENST00000255476 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
TPCN1Q9ULQ1 MEIS3-202ENST00000441740 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
TPCN1Q9ULQ1 UPF3A-202ENST00000375299 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
TPCN1Q9ULQ1 CAMTA1-208ENST00000473578 567 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
TPCN1Q9ULQ1 FAM174B-207ENST00000555748 866 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.14■■□□□ 1.62
TPCN1Q9ULQ1 MCRIP1-205ENST00000572645 1038 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
TPCN1Q9ULQ1 AC126544.1-201ENST00000580842 1059 ntBASIC25.14■■□□□ 1.62
TPCN1Q9ULQ1 ST3GAL3-207ENST00000353126 1969 ntTSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.61
TPCN1Q9ULQ1 MFF-203ENST00000349901 1716 ntTSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.61
TPCN1Q9ULQ1 CKMT1B-207ENST00000441322 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
TPCN1Q9ULQ1 SCRN2-212ENST00000584123 1745 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
TPCN1Q9ULQ1 ZNF419-203ENST00000354197 1569 ntTSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.61
TPCN1Q9ULQ1 CTCF-202ENST00000401394 2978 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
TPCN1Q9ULQ1 SLC35A3-210ENST00000638371 2298 ntTSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.61
TPCN1Q9ULQ1 MSANTD1-204ENST00000510580 2039 ntTSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
TPCN1Q9ULQ1 EXOG-203ENST00000422077 1317 ntTSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
TPCN1Q9ULQ1 FAM193B-217ENST00000514747 2913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
TPCN1Q9ULQ1 GADD45G-202ENST00000375769 977 ntTSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
TPCN1Q9ULQ1 AC099791.1-201ENST00000416440 715 ntBASIC25.13■■□□□ 1.61
TPCN1Q9ULQ1 MAG-206ENST00000597035 542 ntTSL 4 BASIC25.13■■□□□ 1.61
TPCN1Q9ULQ1 GRAMD4P4-201ENST00000613563 1115 ntBASIC25.13■■□□□ 1.61
TPCN1Q9ULQ1 NEDD4L-237ENST00000617539 728 ntTSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
TPCN1Q9ULQ1 UBE2J2-201ENST00000347370 2387 ntTSL 3 BASIC25.13■■□□□ 1.61
TPCN1Q9ULQ1 AF106564.1-201ENST00000607058 2553 ntBASIC25.13■■□□□ 1.61
TPCN1Q9ULQ1 TERF1-202ENST00000276603 1677 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
TPCN1Q9ULQ1 FOSL1-201ENST00000312562 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
TPCN1Q9ULQ1 HABP4-201ENST00000375249 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
TPCN1Q9ULQ1 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
TPCN1Q9ULQ1 C18orf8-214ENST00000615148 1958 ntTSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
TPCN1Q9ULQ1 RELL2-205ENST00000518856 1419 ntTSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
TPCN1Q9ULQ1 ANAPC4-201ENST00000315368 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
TPCN1Q9ULQ1 SCN1B-206ENST00000638536 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
TPCN1Q9ULQ1 PHF7-201ENST00000327906 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
TPCN1Q9ULQ1 PCGF3-202ENST00000400151 1175 ntTSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
TPCN1Q9ULQ1 CCDC115-202ENST00000409127 1247 ntTSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
TPCN1Q9ULQ1 IGHV3-19-201ENST00000521488 291 ntBASIC25.12■■□□□ 1.61
TPCN1Q9ULQ1 AL034346.1-201ENST00000568244 1277 ntBASIC25.12■■□□□ 1.61
TPCN1Q9ULQ1 EFHD1-201ENST00000264059 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
TPCN1Q9ULQ1 DRD2-202ENST00000362072 2789 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
TPCN1Q9ULQ1 TRIM3-214ENST00000536344 2704 ntTSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
TPCN1Q9ULQ1 NEU4-204ENST00000405370 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
TPCN1Q9ULQ1 GRTP1-202ENST00000375430 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
TPCN1Q9ULQ1 PPP1R12B-212ENST00000480184 1808 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
TPCN1Q9ULQ1 LRP5L-203ENST00000444995 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
TPCN1Q9ULQ1 ZNF668-209ENST00000539836 2469 ntTSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
TPCN1Q9ULQ1 TMC6-212ENST00000589553 2389 ntTSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
TPCN1Q9ULQ1 PALM-208ENST00000592155 2272 ntTSL 4 BASIC25.11■■□□□ 1.61
TPCN1Q9ULQ1 PPP1R3F-203ENST00000466508 1885 ntTSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
TPCN1Q9ULQ1 SEC22C-207ENST00000423701 1458 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
TPCN1Q9ULQ1 CBR3-201ENST00000290354 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
TPCN1Q9ULQ1 C20orf144-201ENST00000375222 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
TPCN1Q9ULQ1 AP001330.3-201ENST00000520123 633 ntBASIC25.11■■□□□ 1.61
TPCN1Q9ULQ1 LINC02136-201ENST00000567469 530 ntTSL 4 BASIC25.11■■□□□ 1.61
TPCN1Q9ULQ1 AC093249.6-202ENST00000568500 1142 ntTSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
TPCN1Q9ULQ1 CTAG1A-201ENST00000593606 993 ntTSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
TPCN1Q9ULQ1 AL031432.3-201ENST00000607698 485 ntBASIC25.11■■□□□ 1.61
TPCN1Q9ULQ1 FBXL22-201ENST00000360587 1526 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
TPCN1Q9ULQ1 FEM1AP4-201ENST00000443167 1987 ntBASIC25.11■■□□□ 1.61
TPCN1Q9ULQ1 SPOP-206ENST00000504102 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
TPCN1Q9ULQ1 ASL-203ENST00000380839 1765 ntTSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
TPCN1Q9ULQ1 ANKRD11-217ENST00000613312 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
TPCN1Q9ULQ1 CENPS-CORT-201ENST00000400900 1469 ntTSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
TPCN1Q9ULQ1 EML2-201ENST00000245925 2264 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
TPCN1Q9ULQ1 SLC25A27-202ENST00000411689 2526 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
TPCN1Q9ULQ1 C16orf95-201ENST00000253461 953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
TPCN1Q9ULQ1 TESC-201ENST00000335209 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
TPCN1Q9ULQ1 ZEB1-AS1-201ENST00000423714 456 ntTSL 3 BASIC25.1■■□□□ 1.61
TPCN1Q9ULQ1 MXRA8-201ENST00000309212 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
TPCN1Q9ULQ1 OSR1-201ENST00000272223 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
TPCN1Q9ULQ1 DOCK5-208ENST00000481100 2166 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
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