Protein–RNA interactions for Protein: Q9ULC3

RAB23, Ras-related protein Rab-23, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB23Q9ULC3 CCDC154-201ENST00000389176 2212 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
RAB23Q9ULC3 TTC9B-201ENST00000311308 843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
RAB23Q9ULC3 PLPP7-201ENST00000372261 972 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
RAB23Q9ULC3 BET1L-204ENST00000410108 637 ntTSL 3 BASIC21.59■■□□□ 1.05
RAB23Q9ULC3 FAM219B-212ENST00000565772 1249 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
RAB23Q9ULC3 AC010536.3-201ENST00000620306 533 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
RAB23Q9ULC3 ADD3-AS1-204ENST00000627565 388 ntTSL 3 BASIC21.59■■□□□ 1.05
RAB23Q9ULC3 ST3GAL5-268ENST00000640982 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
RAB23Q9ULC3 MAL2-204ENST00000614891 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
RAB23Q9ULC3 RAX-201ENST00000256852 2935 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
RAB23Q9ULC3 KLHDC9-201ENST00000368011 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
RAB23Q9ULC3 MGST3-205ENST00000367889 1015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
RAB23Q9ULC3 EIF4E3-203ENST00000421769 777 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
RAB23Q9ULC3 TMEM240-202ENST00000425828 717 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
RAB23Q9ULC3 DUSP5P2-201ENST00000426873 1033 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
RAB23Q9ULC3 CNN2P6-201ENST00000439038 900 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
RAB23Q9ULC3 LINC01637-201ENST00000444039 684 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
RAB23Q9ULC3 AC106738.1-201ENST00000560487 359 ntTSL 3 BASIC21.58■■□□□ 1.05
RAB23Q9ULC3 AL772284.2-201ENST00000620151 1147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
RAB23Q9ULC3 AL160396.2-202ENST00000636692 566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
RAB23Q9ULC3 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
RAB23Q9ULC3 HOXA10-206ENST00000613671 2175 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.04
RAB23Q9ULC3 AMZ2-202ENST00000359904 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.04
RAB23Q9ULC3 KLC1-201ENST00000246489 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.04
RAB23Q9ULC3 KLC1-224ENST00000557450 2265 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.04
RAB23Q9ULC3 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
RAB23Q9ULC3 EPS8L1-205ENST00000586329 2130 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.04
RAB23Q9ULC3 AVPI1-201ENST00000370626 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
RAB23Q9ULC3 PACRGL-201ENST00000295290 1937 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
RAB23Q9ULC3 MKRN4P-201ENST00000444706 1521 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
RAB23Q9ULC3 BAALC-201ENST00000297574 801 ntTSL 3 BASIC21.57■■□□□ 1.04
RAB23Q9ULC3 APTR-203ENST00000430801 583 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
RAB23Q9ULC3 ZNF148-203ENST00000468369 1025 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
RAB23Q9ULC3 SCARA5-203ENST00000518030 1074 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
RAB23Q9ULC3 AL390816.2-201ENST00000554252 737 ntTSL 3 BASIC21.57■■□□□ 1.04
RAB23Q9ULC3 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
RAB23Q9ULC3 PARD3-209ENST00000374790 5825 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
RAB23Q9ULC3 EXOSC6-201ENST00000435634 5153 ntAPPRIS P1 BASIC21.57■■□□□ 1.04
RAB23Q9ULC3 C18orf65-201ENST00000622985 2076 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
RAB23Q9ULC3 AP004608.1-201ENST00000531319 1402 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
RAB23Q9ULC3 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
RAB23Q9ULC3 UBA5-208ENST00000473651 1513 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
RAB23Q9ULC3 MEA1-201ENST00000244711 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
RAB23Q9ULC3 SEC61A2-206ENST00000379051 707 ntTSL 3 BASIC21.56■■□□□ 1.04
RAB23Q9ULC3 INS-203ENST00000397262 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
RAB23Q9ULC3 PPP1R14BP2-201ENST00000426284 444 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
RAB23Q9ULC3 CRIP2-202ENST00000483017 1176 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
RAB23Q9ULC3 SLC7A5P1-201ENST00000568957 537 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
RAB23Q9ULC3 PYURF-201ENST00000273968 1361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
RAB23Q9ULC3 CASP9-203ENST00000375890 1351 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
RAB23Q9ULC3 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
RAB23Q9ULC3 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
RAB23Q9ULC3 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
RAB23Q9ULC3 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
RAB23Q9ULC3 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
RAB23Q9ULC3 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
RAB23Q9ULC3 ELOA-201ENST00000418390 5154 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
RAB23Q9ULC3 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
RAB23Q9ULC3 DUSP8P5-201ENST00000422884 1815 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
RAB23Q9ULC3 AUTS2-203ENST00000406775 5950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
RAB23Q9ULC3 BMP1-204ENST00000397814 836 ntTSL 4 BASIC21.55■■□□□ 1.04
RAB23Q9ULC3 EP300-AS1-201ENST00000420537 457 ntTSL 3 BASIC21.55■■□□□ 1.04
RAB23Q9ULC3 DLEU2-203ENST00000425586 1267 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
RAB23Q9ULC3 AC013268.1-206ENST00000638368 961 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
RAB23Q9ULC3 AC112229.1-201ENST00000639295 961 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
RAB23Q9ULC3 PNLIPRP2-204ENST00000591655 1456 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
RAB23Q9ULC3 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
RAB23Q9ULC3 PUS1-203ENST00000443358 1664 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
RAB23Q9ULC3 HYAL2-207ENST00000442581 2318 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
RAB23Q9ULC3 MFF-207ENST00000409565 1548 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
RAB23Q9ULC3 ZNF76-203ENST00000373953 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
RAB23Q9ULC3 GSEC-202ENST00000629441 1572 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
RAB23Q9ULC3 DACT3-201ENST00000300875 2526 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
RAB23Q9ULC3 USP12-201ENST00000282344 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
RAB23Q9ULC3 BX322557.1-202ENST00000400362 1460 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
RAB23Q9ULC3 HRASLS5-201ENST00000301790 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
RAB23Q9ULC3 ZNF580-201ENST00000325333 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
RAB23Q9ULC3 EMC6-202ENST00000397133 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
RAB23Q9ULC3 MIPEPP3-201ENST00000412105 444 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
RAB23Q9ULC3 AL365295.1-202ENST00000456100 562 ntTSL 4 BASIC21.54■■□□□ 1.04
RAB23Q9ULC3 SERP1-208ENST00000491660 830 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
RAB23Q9ULC3 RARRES2P4-201ENST00000514074 484 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
RAB23Q9ULC3 ZNF580-203ENST00000545125 1025 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.54■■□□□ 1.04
RAB23Q9ULC3 FAM71E1-204ENST00000600100 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
RAB23Q9ULC3 GGTLC3-201ENST00000619998 968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
RAB23Q9ULC3 CD99-212ENST00000624481 1089 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
RAB23Q9ULC3 AC008694.1-202ENST00000636953 945 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
RAB23Q9ULC3 CACTIN-AS1-201ENST00000592274 1913 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
RAB23Q9ULC3 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
RAB23Q9ULC3 CUEDC1-202ENST00000407144 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
RAB23Q9ULC3 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
RAB23Q9ULC3 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
RAB23Q9ULC3 UBE2E3-201ENST00000392415 1347 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.54■■□□□ 1.04
RAB23Q9ULC3 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
RAB23Q9ULC3 ZSCAN18-212ENST00000600404 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
RAB23Q9ULC3 RWDD4-206ENST00000512740 1393 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
RAB23Q9ULC3 ABHD12B-201ENST00000337334 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
RAB23Q9ULC3 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
RAB23Q9ULC3 DCTN3-202ENST00000341694 899 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
RAB23Q9ULC3 PPP1CA-202ENST00000358239 1054 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
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