Protein–RNA interactions for Protein: Q9UJQ7

SCP2D1, SCP2 sterol-binding domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 156 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCP2D1Q9UJQ7 OSR2-203ENST00000457907 2126 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
SCP2D1Q9UJQ7 UBFD1-208ENST00000567264 642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
SCP2D1Q9UJQ7 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
SCP2D1Q9UJQ7 FAHD1-201ENST00000382666 1964 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
SCP2D1Q9UJQ7 FAM3A-208ENST00000419205 1763 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.51
SCP2D1Q9UJQ7 POLE2-202ENST00000539565 1792 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
SCP2D1Q9UJQ7 NAB2-201ENST00000300131 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
SCP2D1Q9UJQ7 FHL3-201ENST00000373016 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
SCP2D1Q9UJQ7 LACTB-202ENST00000413507 2978 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
SCP2D1Q9UJQ7 IGFBP3-210ENST00000613132 2412 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.51
SCP2D1Q9UJQ7 YTHDF3-213ENST00000621820 2363 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
SCP2D1Q9UJQ7 IRX4-208ENST00000622814 2398 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
SCP2D1Q9UJQ7 MARK2-202ENST00000361128 3004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
SCP2D1Q9UJQ7 CAMK2B-216ENST00000440254 2097 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
SCP2D1Q9UJQ7 POLD2-207ENST00000452185 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
SCP2D1Q9UJQ7 NR1D2-201ENST00000312521 5258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
SCP2D1Q9UJQ7 CDAN1-201ENST00000356231 4637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
SCP2D1Q9UJQ7 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC18.26■□□□□ 0.51
SCP2D1Q9UJQ7 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
SCP2D1Q9UJQ7 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
SCP2D1Q9UJQ7 ACOT2-201ENST00000238651 1774 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
SCP2D1Q9UJQ7 IL15RA-206ENST00000397248 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
SCP2D1Q9UJQ7 SHB-201ENST00000377707 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
SCP2D1Q9UJQ7 BLCAP-208ENST00000414542 2205 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.26■□□□□ 0.51
SCP2D1Q9UJQ7 NEURL3-201ENST00000310865 1710 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
SCP2D1Q9UJQ7 COMT-206ENST00000407537 1457 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
SCP2D1Q9UJQ7 JAKMIP1-203ENST00000409371 2420 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
SCP2D1Q9UJQ7 DPP7-201ENST00000371579 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
SCP2D1Q9UJQ7 MSANTD1-204ENST00000510580 2039 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
SCP2D1Q9UJQ7 TMEM235-202ENST00000421688 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
SCP2D1Q9UJQ7 HSF4-225ENST00000584272 1549 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
SCP2D1Q9UJQ7 ESR2-212ENST00000556275 2695 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
SCP2D1Q9UJQ7 NPY4R-201ENST00000374312 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
SCP2D1Q9UJQ7 NPY4R2-201ENST00000576178 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
SCP2D1Q9UJQ7 ARL6IP4-201ENST00000315580 1644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
SCP2D1Q9UJQ7 TSPAN3-202ENST00000346495 1647 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
SCP2D1Q9UJQ7 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
SCP2D1Q9UJQ7 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
SCP2D1Q9UJQ7 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
SCP2D1Q9UJQ7 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
SCP2D1Q9UJQ7 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
SCP2D1Q9UJQ7 GNS-208ENST00000543646 2164 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
SCP2D1Q9UJQ7 SYNC-201ENST00000373484 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
SCP2D1Q9UJQ7 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
SCP2D1Q9UJQ7 BRSK2-208ENST00000528841 3586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
SCP2D1Q9UJQ7 TPCN2-208ENST00000637342 2856 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
SCP2D1Q9UJQ7 CHST1-201ENST00000308064 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
SCP2D1Q9UJQ7 DNAAF3-201ENST00000391720 2169 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
SCP2D1Q9UJQ7 WNT7B-202ENST00000409496 2285 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
SCP2D1Q9UJQ7 ME2-206ENST00000638410 2289 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
SCP2D1Q9UJQ7 ME2-210ENST00000639255 2262 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
SCP2D1Q9UJQ7 FBXL19-207ENST00000565690 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
SCP2D1Q9UJQ7 NDUFAF3-202ENST00000326925 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
SCP2D1Q9UJQ7 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
SCP2D1Q9UJQ7 MCRIP1-210ENST00000576431 577 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
SCP2D1Q9UJQ7 CA15P2-201ENST00000611168 834 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
SCP2D1Q9UJQ7 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
SCP2D1Q9UJQ7 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
SCP2D1Q9UJQ7 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
SCP2D1Q9UJQ7 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
SCP2D1Q9UJQ7 AC110285.2-201ENST00000571724 1565 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
SCP2D1Q9UJQ7 USP21-202ENST00000368001 2095 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
SCP2D1Q9UJQ7 LAYN-203ENST00000436913 2590 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
SCP2D1Q9UJQ7 AC011498.4-201ENST00000586020 1803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
SCP2D1Q9UJQ7 CFAP99-206ENST00000616117 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
SCP2D1Q9UJQ7 ADGRG2-210ENST00000379878 4803 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
SCP2D1Q9UJQ7 ATRN-201ENST00000262919 8633 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
SCP2D1Q9UJQ7 PLEKHH3-204ENST00000591022 2983 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
SCP2D1Q9UJQ7 CNTNAP3B-202ENST00000341990 2666 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
SCP2D1Q9UJQ7 DOC2A-218ENST00000616445 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
SCP2D1Q9UJQ7 TRH-201ENST00000302649 1978 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
SCP2D1Q9UJQ7 IRF7-205ENST00000397574 1968 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
SCP2D1Q9UJQ7 FEM1AP1-201ENST00000431297 1995 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
SCP2D1Q9UJQ7 C1orf174-201ENST00000361605 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
SCP2D1Q9UJQ7 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
SCP2D1Q9UJQ7 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
SCP2D1Q9UJQ7 EPS8L1-201ENST00000201647 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
SCP2D1Q9UJQ7 CPEB1-AS1-201ENST00000560650 2138 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
SCP2D1Q9UJQ7 SNX7-201ENST00000306121 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
SCP2D1Q9UJQ7 PTPRJ-207ENST00000613246 7851 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
SCP2D1Q9UJQ7 PRSS33-202ENST00000570702 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
SCP2D1Q9UJQ7 PITX2-201ENST00000306732 2320 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
SCP2D1Q9UJQ7 NKX2-1-202ENST00000498187 2338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
SCP2D1Q9UJQ7 NAT8L-201ENST00000331662 5571 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
SCP2D1Q9UJQ7 UAP1-201ENST00000271469 2377 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
SCP2D1Q9UJQ7 MAPRE3-203ENST00000405074 1801 ntTSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
SCP2D1Q9UJQ7 BACE2-201ENST00000328735 2824 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
SCP2D1Q9UJQ7 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
SCP2D1Q9UJQ7 NYX-202ENST00000378220 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
SCP2D1Q9UJQ7 LGI2-201ENST00000382114 6428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
SCP2D1Q9UJQ7 DTNBP1-201ENST00000338950 1880 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
SCP2D1Q9UJQ7 SIMC1-203ENST00000429602 2694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
SCP2D1Q9UJQ7 KCTD13-202ENST00000561540 1773 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
SCP2D1Q9UJQ7 KRTAP5-AS1-201ENST00000424148 2265 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
SCP2D1Q9UJQ7 C16orf70-201ENST00000219139 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
SCP2D1Q9UJQ7 SOX2-201ENST00000325404 2513 ntAPPRIS P1 BASIC18.21■□□□□ 0.51
SCP2D1Q9UJQ7 RLBP1-201ENST00000268125 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
SCP2D1Q9UJQ7 PRMT5-204ENST00000397441 2418 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
SCP2D1Q9UJQ7 MAPK9-208ENST00000455781 4336 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
SCP2D1Q9UJQ7 CDKN2C-203ENST00000396148 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.3 ms