Protein–RNA interactions for Protein: Q9UI47

CTNNA3, Catenin alpha-3, humanhuman

Predictions only

Length 895 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTNNA3Q9UI47 LMLN-210ENST00000482695 2010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
CTNNA3Q9UI47 C16orf58-209ENST00000567994 1845 ntTSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
CTNNA3Q9UI47 KCNQ5-208ENST00000414165 6236 ntTSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
CTNNA3Q9UI47 ADCK2-203ENST00000476491 2092 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
CTNNA3Q9UI47 MBNL3-202ENST00000370844 1643 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
CTNNA3Q9UI47 P4HA2-202ENST00000360568 2313 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
CTNNA3Q9UI47 PHLDB2-210ENST00000478922 1861 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
CTNNA3Q9UI47 CYC1-201ENST00000318911 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
CTNNA3Q9UI47 AC027612.3-201ENST00000413684 1047 ntBASIC25.55■■□□□ 1.68
CTNNA3Q9UI47 SELENOO-201ENST00000380903 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
CTNNA3Q9UI47 SELENOO-203ENST00000611222 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
CTNNA3Q9UI47 SEPT8-207ENST00000378719 2889 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
CTNNA3Q9UI47 STK25-234ENST00000535007 2459 ntTSL 2 BASIC25.55■■□□□ 1.68
CTNNA3Q9UI47 CHRAC1-203ENST00000519533 1678 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
CTNNA3Q9UI47 REXO1-201ENST00000170168 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
CTNNA3Q9UI47 HLA-C-203ENST00000383329 1554 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
CTNNA3Q9UI47 CCDC28B-201ENST00000373602 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
CTNNA3Q9UI47 NMRAL1-202ENST00000404295 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
CTNNA3Q9UI47 AL138963.3-201ENST00000610057 588 ntTSL 4 BASIC25.54■■□□□ 1.68
CTNNA3Q9UI47 SERBP1-202ENST00000370990 1621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
CTNNA3Q9UI47 AC135048.1-201ENST00000566056 1318 ntTSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
CTNNA3Q9UI47 CBWD6-201ENST00000377391 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
CTNNA3Q9UI47 DNAJC25-201ENST00000313525 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
CTNNA3Q9UI47 TDRKH-206ENST00000440583 2296 ntTSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
CTNNA3Q9UI47 C6orf136-201ENST00000293604 1978 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
CTNNA3Q9UI47 TMEM25-205ENST00000411589 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
CTNNA3Q9UI47 HAUS4-201ENST00000206474 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
CTNNA3Q9UI47 CRB3-202ENST00000356762 733 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
CTNNA3Q9UI47 RPUSD3-206ENST00000433535 1178 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
CTNNA3Q9UI47 FAM66D-201ENST00000434078 918 ntTSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
CTNNA3Q9UI47 ANKRD63-201ENST00000434396 1143 ntAPPRIS P1 BASIC25.53■■□□□ 1.68
CTNNA3Q9UI47 PPM1N-207ENST00000451287 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
CTNNA3Q9UI47 LGR4-203ENST00000480977 492 ntTSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
CTNNA3Q9UI47 C12orf43-208ENST00000539736 1033 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
CTNNA3Q9UI47 TUNAR-203ENST00000554321 767 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC25.53■■□□□ 1.68
CTNNA3Q9UI47 TRAPPC6A-205ENST00000592647 514 ntTSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
CTNNA3Q9UI47 DYRK1B-204ENST00000593685 2724 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
CTNNA3Q9UI47 DMPK-220ENST00000618091 2503 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
CTNNA3Q9UI47 PPT2-244ENST00000324816 2053 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
CTNNA3Q9UI47 MPST-202ENST00000397225 2116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
CTNNA3Q9UI47 AC005224.4-201ENST00000583262 1652 ntBASIC25.52■■□□□ 1.68
CTNNA3Q9UI47 ZFAND6-224ENST00000618205 1659 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
CTNNA3Q9UI47 CITED2-202ENST00000536159 1797 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.52■■□□□ 1.68
CTNNA3Q9UI47 CITED2-203ENST00000537332 1780 ntTSL 3 BASIC25.52■■□□□ 1.68
CTNNA3Q9UI47 MYB-221ENST00000527615 2381 ntTSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
CTNNA3Q9UI47 AMER2-202ENST00000515384 3197 ntAPPRIS P1 BASIC25.52■■□□□ 1.68
CTNNA3Q9UI47 P2RX2-202ENST00000348800 1222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
CTNNA3Q9UI47 P2RX2-204ENST00000351222 1140 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
CTNNA3Q9UI47 MOSPD3-202ENST00000379527 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
CTNNA3Q9UI47 VGLL4-208ENST00000424529 1025 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
CTNNA3Q9UI47 P2RX2-207ENST00000449132 1113 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
CTNNA3Q9UI47 PEX10-202ENST00000447513 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
CTNNA3Q9UI47 B3GALT6-201ENST00000379198 2777 ntAPPRIS P1 BASIC25.52■■□□□ 1.68
CTNNA3Q9UI47 NARF-202ENST00000345415 1487 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
CTNNA3Q9UI47 CHST7-201ENST00000276055 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
CTNNA3Q9UI47 AP006587.3-201ENST00000525742 1516 ntBASIC25.52■■□□□ 1.68
CTNNA3Q9UI47 AC093323.1-201ENST00000307533 2311 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
CTNNA3Q9UI47 SYNGR2-203ENST00000588282 1553 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
CTNNA3Q9UI47 DLEU2-208ENST00000621282 3068 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
CTNNA3Q9UI47 ELL3-201ENST00000319359 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
CTNNA3Q9UI47 NUDT14-202ENST00000392568 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
CTNNA3Q9UI47 TPRG1LP1-201ENST00000598702 760 ntBASIC25.51■■□□□ 1.67
CTNNA3Q9UI47 IER5L-201ENST00000372491 2711 ntAPPRIS P1 BASIC25.51■■□□□ 1.67
CTNNA3Q9UI47 TRIM3-201ENST00000345851 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
CTNNA3Q9UI47 LTK-202ENST00000355166 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
CTNNA3Q9UI47 PXK-203ENST00000383715 1756 ntTSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
CTNNA3Q9UI47 SOCS7-202ENST00000613678 1827 ntTSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
CTNNA3Q9UI47 GCH1-206ENST00000543643 1897 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
CTNNA3Q9UI47 CAMKK2-208ENST00000412367 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
CTNNA3Q9UI47 IDI1-201ENST00000381344 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
CTNNA3Q9UI47 HBM-201ENST00000356815 506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
CTNNA3Q9UI47 CCDC160-201ENST00000370809 1299 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.5■■□□□ 1.67
CTNNA3Q9UI47 RBBP7-202ENST00000380084 2036 ntTSL 2 BASIC25.5■■□□□ 1.67
CTNNA3Q9UI47 CDKN2AIPNL-201ENST00000395009 800 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
CTNNA3Q9UI47 LINC00969-219ENST00000453324 1439 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
CTNNA3Q9UI47 OSBPL5-208ENST00000478260 2653 ntTSL 2 BASIC25.5■■□□□ 1.67
CTNNA3Q9UI47 SDR39U1-208ENST00000554698 1364 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
CTNNA3Q9UI47 DAZAP1-211ENST00000592522 2157 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.5■■□□□ 1.67
CTNNA3Q9UI47 GSX2-205ENST00000611459 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
CTNNA3Q9UI47 AKT2-210ENST00000424901 5170 ntTSL 5 BASIC25.5■■□□□ 1.67
CTNNA3Q9UI47 STEAP2-204ENST00000394626 2456 ntTSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
CTNNA3Q9UI47 LSR-202ENST00000354900 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
CTNNA3Q9UI47 NDUFB2-212ENST00000476279 1666 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
CTNNA3Q9UI47 TMEM259-202ENST00000356663 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
CTNNA3Q9UI47 AC092666.2-201ENST00000613287 246 ntBASIC25.49■■□□□ 1.67
CTNNA3Q9UI47 SOAT2-201ENST00000301466 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
CTNNA3Q9UI47 SLC12A5-AS1-202ENST00000535913 1957 ntTSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
CTNNA3Q9UI47 CADPS-219ENST00000612439 5455 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
CTNNA3Q9UI47 NKX6-2-201ENST00000368592 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
CTNNA3Q9UI47 PFKFB3-216ENST00000625260 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
CTNNA3Q9UI47 NIPA2-203ENST00000398013 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
CTNNA3Q9UI47 PDE5A-201ENST00000264805 3020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
CTNNA3Q9UI47 RAB24-202ENST00000303270 1385 ntTSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
CTNNA3Q9UI47 AC055733.4-201ENST00000638462 1354 ntBASIC25.48■■□□□ 1.67
CTNNA3Q9UI47 AC123595.1-201ENST00000440769 1046 ntBASIC25.48■■□□□ 1.67
CTNNA3Q9UI47 AC116614.1-201ENST00000456949 539 ntTSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
CTNNA3Q9UI47 AC127029.2-201ENST00000577329 502 ntTSL 3 BASIC25.48■■□□□ 1.67
CTNNA3Q9UI47 ACAA1-202ENST00000333167 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
CTNNA3Q9UI47 KHDRBS2-201ENST00000281156 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
CTNNA3Q9UI47 DISC1-205ENST00000366636 2224 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.5 ms