Protein–RNA interactions for Protein: Q9UHL9

GTF2IRD1, General transcription factor II-I repeat domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 959 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GTF2IRD1Q9UHL9 RCN2-201ENST00000320963 1750 ntTSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.39
GTF2IRD1Q9UHL9 SH3YL1-201ENST00000356150 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
GTF2IRD1Q9UHL9 PACRGL-227ENST00000513459 1773 ntTSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.39
GTF2IRD1Q9UHL9 MRPL37-206ENST00000605337 1582 ntTSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
GTF2IRD1Q9UHL9 FITM1-201ENST00000267426 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
GTF2IRD1Q9UHL9 DTYMK-201ENST00000305784 1232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
GTF2IRD1Q9UHL9 NAA20-201ENST00000310450 920 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
GTF2IRD1Q9UHL9 XXYLT1-202ENST00000356740 564 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
GTF2IRD1Q9UHL9 HIST1H2AM-201ENST00000359611 393 ntAPPRIS P1 BASIC23.7■■□□□ 1.38
GTF2IRD1Q9UHL9 CT47A12-201ENST00000419982 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
GTF2IRD1Q9UHL9 AC069152.1-201ENST00000438030 544 ntBASIC23.7■■□□□ 1.38
GTF2IRD1Q9UHL9 TSPY20P-201ENST00000450910 630 ntBASIC23.7■■□□□ 1.38
GTF2IRD1Q9UHL9 RGMA-211ENST00000557420 989 ntTSL 3 BASIC23.7■■□□□ 1.38
GTF2IRD1Q9UHL9 AC105036.2-201ENST00000569468 176 ntBASIC23.7■■□□□ 1.38
GTF2IRD1Q9UHL9 AC053503.5-201ENST00000601508 636 ntBASIC23.7■■□□□ 1.38
GTF2IRD1Q9UHL9 KRT7-201ENST00000331817 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
GTF2IRD1Q9UHL9 IFNGR2-203ENST00000405436 1684 ntTSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
GTF2IRD1Q9UHL9 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
GTF2IRD1Q9UHL9 ADRM1-204ENST00000491935 1530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
GTF2IRD1Q9UHL9 TSEN15-201ENST00000361641 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
GTF2IRD1Q9UHL9 INTS11-205ENST00000429572 1104 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
GTF2IRD1Q9UHL9 COL19A1-203ENST00000478620 589 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
GTF2IRD1Q9UHL9 CDH18-AS1-201ENST00000513573 424 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
GTF2IRD1Q9UHL9 AC013268.1-206ENST00000638368 961 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
GTF2IRD1Q9UHL9 AC112229.1-201ENST00000639295 961 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
GTF2IRD1Q9UHL9 TGIF1-206ENST00000405385 1689 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
GTF2IRD1Q9UHL9 TANGO2-210ENST00000432883 2084 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
GTF2IRD1Q9UHL9 HSF4-215ENST00000521374 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
GTF2IRD1Q9UHL9 VPS29-206ENST00000549578 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
GTF2IRD1Q9UHL9 QPCT-201ENST00000338415 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
GTF2IRD1Q9UHL9 LRRC34-201ENST00000446859 1718 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
GTF2IRD1Q9UHL9 SBK2-201ENST00000344158 1056 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
GTF2IRD1Q9UHL9 NOXO1-203ENST00000397280 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
GTF2IRD1Q9UHL9 SBK2-202ENST00000413299 1085 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
GTF2IRD1Q9UHL9 CALM1-202ENST00000447653 1104 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
GTF2IRD1Q9UHL9 ULK4P1-204ENST00000565949 721 ntTSL 4 BASIC23.68■■□□□ 1.38
GTF2IRD1Q9UHL9 IL34-204ENST00000566361 1001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
GTF2IRD1Q9UHL9 LIMD2-202ENST00000578061 756 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
GTF2IRD1Q9UHL9 AL136982.7-201ENST00000609363 465 ntTSL 4 BASIC23.68■■□□□ 1.38
GTF2IRD1Q9UHL9 GGTLC3-201ENST00000619998 968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
GTF2IRD1Q9UHL9 SLC35A3-218ENST00000639994 1114 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
GTF2IRD1Q9UHL9 AL359710.1-201ENST00000427039 1544 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
GTF2IRD1Q9UHL9 GPR137-201ENST00000313074 1485 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
GTF2IRD1Q9UHL9 GPR137-203ENST00000411458 1495 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
GTF2IRD1Q9UHL9 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
GTF2IRD1Q9UHL9 CBWD3-202ENST00000377342 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
GTF2IRD1Q9UHL9 SPAG7-205ENST00000573366 1668 ntTSL 3 BASIC23.67■■□□□ 1.38
GTF2IRD1Q9UHL9 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
GTF2IRD1Q9UHL9 CYB5R4-201ENST00000369679 768 ntTSL 3 BASIC23.67■■□□□ 1.38
GTF2IRD1Q9UHL9 AC073210.2-201ENST00000430369 194 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
GTF2IRD1Q9UHL9 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
GTF2IRD1Q9UHL9 TERF1P5-201ENST00000477545 1207 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
GTF2IRD1Q9UHL9 PET100-202ENST00000594797 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
GTF2IRD1Q9UHL9 AC133041.1-202ENST00000642053 222 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
GTF2IRD1Q9UHL9 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
GTF2IRD1Q9UHL9 NABP2-203ENST00000380198 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
GTF2IRD1Q9UHL9 CLDN5-203ENST00000413119 1760 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
GTF2IRD1Q9UHL9 TRH-201ENST00000302649 1978 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
GTF2IRD1Q9UHL9 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
GTF2IRD1Q9UHL9 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
GTF2IRD1Q9UHL9 SRPK3-204ENST00000370108 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
GTF2IRD1Q9UHL9 CSNK1G3-206ENST00000511130 1356 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
GTF2IRD1Q9UHL9 RWDD4-206ENST00000512740 1393 ntTSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
GTF2IRD1Q9UHL9 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
GTF2IRD1Q9UHL9 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
GTF2IRD1Q9UHL9 MANBAL-202ENST00000373606 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
GTF2IRD1Q9UHL9 IL15RA-208ENST00000397251 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
GTF2IRD1Q9UHL9 WWTR1-AS1-203ENST00000495094 975 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
GTF2IRD1Q9UHL9 CIRBP-214ENST00000587896 1081 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
GTF2IRD1Q9UHL9 IL15RA-221ENST00000620865 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
GTF2IRD1Q9UHL9 IL15RA-222ENST00000622442 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
GTF2IRD1Q9UHL9 LHPP-202ENST00000368842 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
GTF2IRD1Q9UHL9 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
GTF2IRD1Q9UHL9 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
GTF2IRD1Q9UHL9 MFSD3-201ENST00000301327 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
GTF2IRD1Q9UHL9 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
GTF2IRD1Q9UHL9 REPIN1-214ENST00000489432 2058 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
GTF2IRD1Q9UHL9 CASTOR1-201ENST00000404953 1460 ntTSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
GTF2IRD1Q9UHL9 AC009086.2-201ENST00000449759 610 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.65■■□□□ 1.38
GTF2IRD1Q9UHL9 SNHG6-203ENST00000520944 638 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
GTF2IRD1Q9UHL9 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
GTF2IRD1Q9UHL9 ATG101-201ENST00000336854 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
GTF2IRD1Q9UHL9 AC068338.2-201ENST00000563278 1430 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
GTF2IRD1Q9UHL9 NAA10-208ENST00000464845 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
GTF2IRD1Q9UHL9 SPINT2-202ENST00000454580 1367 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
GTF2IRD1Q9UHL9 PTP4A3-203ENST00000520105 1866 ntTSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.38
GTF2IRD1Q9UHL9 NAT16-204ENST00000455377 1492 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
GTF2IRD1Q9UHL9 AC074143.1-203ENST00000518227 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
GTF2IRD1Q9UHL9 TRAPPC5-201ENST00000317378 790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
GTF2IRD1Q9UHL9 FDX2-202ENST00000393708 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
GTF2IRD1Q9UHL9 BMP1-204ENST00000397814 836 ntTSL 4 BASIC23.64■■□□□ 1.37
GTF2IRD1Q9UHL9 AC008443.6-201ENST00000512508 500 ntTSL 4 BASIC23.64■■□□□ 1.37
GTF2IRD1Q9UHL9 TARDBP-228ENST00000629725 1031 ntTSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
GTF2IRD1Q9UHL9 SEPT5-210ENST00000455784 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
GTF2IRD1Q9UHL9 SNX24-211ENST00000513881 1563 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
GTF2IRD1Q9UHL9 CCDC7-201ENST00000277657 1899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
GTF2IRD1Q9UHL9 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
GTF2IRD1Q9UHL9 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
GTF2IRD1Q9UHL9 SRPK3-202ENST00000370101 1958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
GTF2IRD1Q9UHL9 USP21-202ENST00000368001 2095 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.7 ms