Protein–RNA interactions for Protein: Q9UHI6

DDX20, Probable ATP-dependent RNA helicase DDX20, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 824 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DDX20Q9UHI6 PSME3-210ENST00000590720 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
DDX20Q9UHI6 MFSD7-209ENST00000515118 1556 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
DDX20Q9UHI6 AL137002.2-201ENST00000639766 2238 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
DDX20Q9UHI6 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
DDX20Q9UHI6 CEBPD-201ENST00000408965 2178 ntAPPRIS P1 BASIC24.26■■□□□ 1.47
DDX20Q9UHI6 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
DDX20Q9UHI6 EFCAB6-202ENST00000356087 1129 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
DDX20Q9UHI6 KRT18P29-201ENST00000397031 1267 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
DDX20Q9UHI6 NAA60-204ENST00000421765 1045 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
DDX20Q9UHI6 RNA5SP413-201ENST00000516373 109 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
DDX20Q9UHI6 GGTLC3-201ENST00000619998 968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
DDX20Q9UHI6 SAXO1-201ENST00000380530 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
DDX20Q9UHI6 DUSP8P5-201ENST00000422884 1815 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
DDX20Q9UHI6 AC025164.2-201ENST00000501008 1898 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
DDX20Q9UHI6 FNDC11-204ENST00000615526 2954 ntAPPRIS P1 BASIC24.25■■□□□ 1.47
DDX20Q9UHI6 PCSK6-220ENST00000622483 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
DDX20Q9UHI6 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
DDX20Q9UHI6 ANKRD10-202ENST00000310847 1193 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
DDX20Q9UHI6 LINC01816-201ENST00000414141 662 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
DDX20Q9UHI6 PET100-202ENST00000594797 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
DDX20Q9UHI6 AC013268.1-206ENST00000638368 961 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
DDX20Q9UHI6 AC112229.1-201ENST00000639295 961 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
DDX20Q9UHI6 KLHDC9-201ENST00000368011 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
DDX20Q9UHI6 KCNQ2-201ENST00000344425 1426 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
DDX20Q9UHI6 AC090377.1-201ENST00000585691 1762 ntTSL 3 BASIC24.24■■□□□ 1.47
DDX20Q9UHI6 AC096541.1-201ENST00000445070 1807 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
DDX20Q9UHI6 ZPBP2-201ENST00000348931 1543 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
DDX20Q9UHI6 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
DDX20Q9UHI6 CUEDC2-201ENST00000369937 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
DDX20Q9UHI6 MIPEPP3-201ENST00000412105 444 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
DDX20Q9UHI6 UQCRFS1P1-201ENST00000435169 820 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
DDX20Q9UHI6 HTATIP2-208ENST00000532505 595 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
DDX20Q9UHI6 MYO19-221ENST00000620640 1186 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
DDX20Q9UHI6 UBE2E3-201ENST00000392415 1347 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.23■■□□□ 1.47
DDX20Q9UHI6 PLAGL1-207ENST00000417959 1645 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
DDX20Q9UHI6 GOLGA6L9-202ENST00000618348 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
DDX20Q9UHI6 NPHS2-201ENST00000367615 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
DDX20Q9UHI6 C18orf65-201ENST00000622985 2076 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
DDX20Q9UHI6 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
DDX20Q9UHI6 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
DDX20Q9UHI6 FLOT1-201ENST00000376389 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
DDX20Q9UHI6 CACTIN-AS1-201ENST00000592274 1913 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
DDX20Q9UHI6 CNTD2-202ENST00000430325 1817 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
DDX20Q9UHI6 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
DDX20Q9UHI6 TYMP-202ENST00000395678 1614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
DDX20Q9UHI6 MSRB1-201ENST00000361871 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
DDX20Q9UHI6 PRORSD1P-201ENST00000295112 541 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
DDX20Q9UHI6 MGST3-205ENST00000367889 1015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
DDX20Q9UHI6 COL19A1-203ENST00000478620 589 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
DDX20Q9UHI6 PRORSD1P-203ENST00000579162 626 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
DDX20Q9UHI6 MARS-234ENST00000630571 216 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
DDX20Q9UHI6 MARS-235ENST00000630803 183 ntTSL 3 BASIC24.22■■□□□ 1.47
DDX20Q9UHI6 STRBP-202ENST00000360998 2990 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
DDX20Q9UHI6 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
DDX20Q9UHI6 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
DDX20Q9UHI6 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
DDX20Q9UHI6 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
DDX20Q9UHI6 HOXA4-201ENST00000360046 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
DDX20Q9UHI6 SNX24-211ENST00000513881 1563 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
DDX20Q9UHI6 HMBS-201ENST00000278715 1501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
DDX20Q9UHI6 MTAP-204ENST00000460874 1434 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
DDX20Q9UHI6 FAM207A-201ENST00000291634 927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
DDX20Q9UHI6 BMP1-204ENST00000397814 836 ntTSL 4 BASIC24.21■■□□□ 1.47
DDX20Q9UHI6 PPP1R14BP2-201ENST00000426284 444 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
DDX20Q9UHI6 INTS11-205ENST00000429572 1104 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
DDX20Q9UHI6 CYP2T1P-201ENST00000432607 1285 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
DDX20Q9UHI6 TERF1P5-201ENST00000477545 1207 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
DDX20Q9UHI6 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
DDX20Q9UHI6 MRGBP-201ENST00000370487 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
DDX20Q9UHI6 LACTBL1-201ENST00000426928 1641 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
DDX20Q9UHI6 MKRN4P-201ENST00000444706 1521 ntBASIC24.2■■□□□ 1.47
DDX20Q9UHI6 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
DDX20Q9UHI6 AC068338.2-201ENST00000563278 1430 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
DDX20Q9UHI6 INPP1-201ENST00000322522 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
DDX20Q9UHI6 GRTP1-203ENST00000375431 1384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
DDX20Q9UHI6 EMC6-202ENST00000397133 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
DDX20Q9UHI6 EIF4E3-203ENST00000421769 777 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
DDX20Q9UHI6 AC108693.2-201ENST00000492981 303 ntTSL 3 BASIC24.2■■□□□ 1.46
DDX20Q9UHI6 ZNF346-203ENST00000503425 1191 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
DDX20Q9UHI6 C19orf25-213ENST00000592872 1287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
DDX20Q9UHI6 F2RL3-202ENST00000599210 613 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
DDX20Q9UHI6 ALDH3A2-224ENST00000626500 995 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
DDX20Q9UHI6 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
DDX20Q9UHI6 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC24.2■■□□□ 1.46
DDX20Q9UHI6 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
DDX20Q9UHI6 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC24.2■■□□□ 1.46
DDX20Q9UHI6 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
DDX20Q9UHI6 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
DDX20Q9UHI6 MRPL12-201ENST00000333676 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
DDX20Q9UHI6 CPED1-202ENST00000340646 1056 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
DDX20Q9UHI6 ZNF644-203ENST00000361321 1253 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
DDX20Q9UHI6 FXN-202ENST00000396364 980 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
DDX20Q9UHI6 BET1L-204ENST00000410108 637 ntTSL 3 BASIC24.19■■□□□ 1.46
DDX20Q9UHI6 WIPF1-207ENST00000410117 777 ntTSL 3 BASIC24.19■■□□□ 1.46
DDX20Q9UHI6 LINC01637-201ENST00000444039 684 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
DDX20Q9UHI6 ALKBH6-212ENST00000485128 959 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
DDX20Q9UHI6 SLC7A5P1-201ENST00000568957 537 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
DDX20Q9UHI6 MCRIP1-204ENST00000570507 765 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
DDX20Q9UHI6 MCRIP1-208ENST00000575061 618 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
DDX20Q9UHI6 AP005205.2-201ENST00000577327 491 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.5 ms