Protein–RNA interactions for Protein: Q9UHC9

NPC1L1, Niemann-Pick C1-like protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,359 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NPC1L1Q9UHC9 AL162430.1-201ENST00000480705 870 ntBASIC29.03■■■□□ 2.24
NPC1L1Q9UHC9 MIF4GD-211ENST00000580571 952 ntTSL 2 BASIC29.03■■■□□ 2.24
NPC1L1Q9UHC9 PSMD7-201ENST00000219313 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
NPC1L1Q9UHC9 ZNF784-201ENST00000325351 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
NPC1L1Q9UHC9 CCDC106-207ENST00000591578 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
NPC1L1Q9UHC9 LRP5L-203ENST00000444995 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.03■■■□□ 2.24
NPC1L1Q9UHC9 TPSG1-201ENST00000234798 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
NPC1L1Q9UHC9 TCTEX1D4-201ENST00000339355 763 ntAPPRIS P1 BASIC29.02■■■□□ 2.24
NPC1L1Q9UHC9 CPED1-202ENST00000340646 1056 ntTSL 5 BASIC29.02■■■□□ 2.24
NPC1L1Q9UHC9 CENPVL3-201ENST00000417339 864 ntAPPRIS P1 BASIC29.02■■■□□ 2.24
NPC1L1Q9UHC9 FAXDC2-211ENST00000520968 558 ntTSL 4 BASIC29.02■■■□□ 2.24
NPC1L1Q9UHC9 TNFRSF11A-207ENST00000639222 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.02■■■□□ 2.24
NPC1L1Q9UHC9 C6orf136-201ENST00000293604 1978 ntTSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
NPC1L1Q9UHC9 SLC2A11-202ENST00000316185 1555 ntTSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
NPC1L1Q9UHC9 MME-202ENST00000382989 1319 ntTSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
NPC1L1Q9UHC9 MGAT4D-208ENST00000515354 1806 ntTSL 3 BASIC29.02■■■□□ 2.24
NPC1L1Q9UHC9 FMR1-AS1-202ENST00000596112 1845 ntTSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
NPC1L1Q9UHC9 MIR31HG-201ENST00000304425 745 ntTSL 2 BASIC29.01■■■□□ 2.24
NPC1L1Q9UHC9 RAMP1-203ENST00000404910 857 ntTSL 2 BASIC29.01■■■□□ 2.24
NPC1L1Q9UHC9 ATOX1-207ENST00000524142 749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.01■■■□□ 2.24
NPC1L1Q9UHC9 CTU2-202ENST00000453996 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.24
NPC1L1Q9UHC9 UBE2S-201ENST00000264552 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
NPC1L1Q9UHC9 ZBTB46-202ENST00000302995 2335 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.01■■■□□ 2.23
NPC1L1Q9UHC9 DACT2-203ENST00000607983 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
NPC1L1Q9UHC9 CITED2-202ENST00000536159 1797 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.01■■■□□ 2.23
NPC1L1Q9UHC9 CITED2-203ENST00000537332 1780 ntTSL 3 BASIC29.01■■■□□ 2.23
NPC1L1Q9UHC9 GOLGA2P6-201ENST00000340929 2049 ntBASIC29.01■■■□□ 2.23
NPC1L1Q9UHC9 AC108002.2-201ENST00000519782 340 ntTSL 4 BASIC29.01■■■□□ 2.23
NPC1L1Q9UHC9 AL512625.3-202ENST00000591993 1091 ntTSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
NPC1L1Q9UHC9 AC004854.2-201ENST00000608450 1441 ntBASIC29.01■■■□□ 2.23
NPC1L1Q9UHC9 FAM129C-211ENST00000600871 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29■■■□□ 2.23
NPC1L1Q9UHC9 WDR86-203ENST00000469830 1691 ntTSL 2 BASIC29■■■□□ 2.23
NPC1L1Q9UHC9 SPATA2L-201ENST00000289805 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
NPC1L1Q9UHC9 GADD45A-201ENST00000370985 803 ntTSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
NPC1L1Q9UHC9 C19orf12-205ENST00000392278 895 ntTSL 2 BASIC29■■■□□ 2.23
NPC1L1Q9UHC9 LINC01678-201ENST00000411694 863 ntTSL 5 BASIC29■■■□□ 2.23
NPC1L1Q9UHC9 AC019068.1-201ENST00000415226 552 ntTSL 4 BASIC29■■■□□ 2.23
NPC1L1Q9UHC9 YJEFN3-203ENST00000514277 995 ntTSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
NPC1L1Q9UHC9 HSD17B14-204ENST00000599157 991 ntTSL 3 BASIC29■■■□□ 2.23
NPC1L1Q9UHC9 AP001160.5-201ENST00000636508 485 ntAPPRIS P1 BASIC29■■■□□ 2.23
NPC1L1Q9UHC9 IL17RE-201ENST00000383814 2704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
NPC1L1Q9UHC9 ADRM1-204ENST00000491935 1530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.99■■■□□ 2.23
NPC1L1Q9UHC9 MEIS3-202ENST00000441740 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
NPC1L1Q9UHC9 NOC4L-201ENST00000330579 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
NPC1L1Q9UHC9 CHST7-201ENST00000276055 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
NPC1L1Q9UHC9 CAPN12-212ENST00000601953 2381 ntTSL 5 BASIC28.99■■■□□ 2.23
NPC1L1Q9UHC9 AL390816.2-201ENST00000554252 737 ntTSL 3 BASIC28.99■■■□□ 2.23
NPC1L1Q9UHC9 TRAPPC2L-213ENST00000567895 854 ntTSL 3 BASIC28.99■■■□□ 2.23
NPC1L1Q9UHC9 AP001005.4-202ENST00000575325 560 ntTSL 4 BASIC28.99■■■□□ 2.23
NPC1L1Q9UHC9 GCH1-202ENST00000395514 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
NPC1L1Q9UHC9 KCNH6-203ENST00000580652 1703 ntTSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
NPC1L1Q9UHC9 SPN-202ENST00000395389 1935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
NPC1L1Q9UHC9 PLPP5-203ENST00000424479 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
NPC1L1Q9UHC9 PACRGL-227ENST00000513459 1773 ntTSL 5 BASIC28.98■■■□□ 2.23
NPC1L1Q9UHC9 HNF4A-205ENST00000443598 1603 ntTSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
NPC1L1Q9UHC9 FDFT1-201ENST00000220584 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
NPC1L1Q9UHC9 SPOCK2-203ENST00000412663 1284 ntTSL 5 BASIC28.98■■■□□ 2.23
NPC1L1Q9UHC9 AC012414.4-201ENST00000560839 1074 ntTSL 5 BASIC28.98■■■□□ 2.23
NPC1L1Q9UHC9 GABARAPL2-205ENST00000568455 646 ntTSL 3 BASIC28.98■■■□□ 2.23
NPC1L1Q9UHC9 AC110285.4-201ENST00000572590 424 ntTSL 3 BASIC28.98■■■□□ 2.23
NPC1L1Q9UHC9 AC053503.5-201ENST00000601508 636 ntBASIC28.98■■■□□ 2.23
NPC1L1Q9UHC9 AC060814.5-201ENST00000630916 1074 ntTSL 2 BASIC28.98■■■□□ 2.23
NPC1L1Q9UHC9 AL133516.1-201ENST00000633012 540 ntTSL 5 BASIC28.98■■■□□ 2.23
NPC1L1Q9UHC9 EPHA8-202ENST00000374644 1802 ntTSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
NPC1L1Q9UHC9 TPM4-201ENST00000300933 2666 ntTSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
NPC1L1Q9UHC9 AGAP3-201ENST00000335367 2675 ntTSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
NPC1L1Q9UHC9 BMP6-201ENST00000283147 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
NPC1L1Q9UHC9 PIAS2-203ENST00000545673 1590 ntTSL 2 BASIC28.98■■■□□ 2.23
NPC1L1Q9UHC9 SPHK1-202ENST00000392496 1779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
NPC1L1Q9UHC9 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
NPC1L1Q9UHC9 PML-217ENST00000567543 1404 ntTSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
NPC1L1Q9UHC9 AC106738.1-201ENST00000560487 359 ntTSL 3 BASIC28.97■■■□□ 2.23
NPC1L1Q9UHC9 AC011825.4-201ENST00000582233 473 ntTSL 2 BASIC28.97■■■□□ 2.23
NPC1L1Q9UHC9 SPATA22-214ENST00000575375 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
NPC1L1Q9UHC9 EPO-201ENST00000252723 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
NPC1L1Q9UHC9 PIP5KL1-202ENST00000388747 2198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.96■■■□□ 2.23
NPC1L1Q9UHC9 C5orf38-201ENST00000334000 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
NPC1L1Q9UHC9 RAP1B-202ENST00000341355 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.96■■■□□ 2.23
NPC1L1Q9UHC9 CAPNS1-205ENST00000588780 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.96■■■□□ 2.23
NPC1L1Q9UHC9 NEU4-204ENST00000405370 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
NPC1L1Q9UHC9 LAMP5-AS1-201ENST00000443469 1928 ntTSL 2 BASIC28.96■■■□□ 2.23
NPC1L1Q9UHC9 ADCK2-203ENST00000476491 2092 ntTSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
NPC1L1Q9UHC9 ENTPD5-206ENST00000556242 1437 ntTSL 5 BASIC28.96■■■□□ 2.23
NPC1L1Q9UHC9 CPE-201ENST00000402744 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.23
NPC1L1Q9UHC9 GFRA3-201ENST00000274721 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.23
NPC1L1Q9UHC9 SLC35A3-204ENST00000427993 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.95■■■□□ 2.22
NPC1L1Q9UHC9 UCN-201ENST00000296099 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.22
NPC1L1Q9UHC9 COX20-201ENST00000366528 568 ntTSL 2 BASIC28.95■■■□□ 2.22
NPC1L1Q9UHC9 PCMT1-201ENST00000367378 1293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.22
NPC1L1Q9UHC9 NTF6G-201ENST00000591094 616 ntBASIC28.95■■■□□ 2.22
NPC1L1Q9UHC9 SLC35A2-212ENST00000634665 486 ntTSL 4 BASIC28.95■■■□□ 2.22
NPC1L1Q9UHC9 PEX10-202ENST00000447513 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.22
NPC1L1Q9UHC9 MFSD3-201ENST00000301327 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.22
NPC1L1Q9UHC9 TMEM121-201ENST00000392519 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.22
NPC1L1Q9UHC9 MSRB1-201ENST00000361871 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.22
NPC1L1Q9UHC9 DNAJC25-201ENST00000313525 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.22
NPC1L1Q9UHC9 AC010542.4-201ENST00000563151 1910 ntBASIC28.95■■■□□ 2.22
NPC1L1Q9UHC9 SHMT1-202ENST00000352886 2437 ntTSL 2 BASIC28.95■■■□□ 2.22
NPC1L1Q9UHC9 EP400NL-214ENST00000641289 2402 ntBASIC28.95■■■□□ 2.22
NPC1L1Q9UHC9 FAHD1-202ENST00000382668 1845 ntTSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.5 ms