Protein–RNA interactions for Protein: Q9UH17

APOBEC3B, DNA dC->dU-editing enzyme APOBEC-3B, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 382 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APOBEC3BQ9UH17 MAF-202ENST00000393350 6384 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
APOBEC3BQ9UH17 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
APOBEC3BQ9UH17 PLEKHO1-201ENST00000369124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
APOBEC3BQ9UH17 SPNS1-207ENST00000565975 1979 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
APOBEC3BQ9UH17 TBXA2R-202ENST00000411851 1494 ntTSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
APOBEC3BQ9UH17 AL845552.2-201ENST00000553301 553 ntTSL 4 BASIC21.03■□□□□ 0.96
APOBEC3BQ9UH17 FAM71E1-204ENST00000600100 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
APOBEC3BQ9UH17 DUSP9-202ENST00000370167 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
APOBEC3BQ9UH17 STOML1-201ENST00000316900 2169 ntTSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
APOBEC3BQ9UH17 ADA-201ENST00000372874 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
APOBEC3BQ9UH17 RNF166-202ENST00000537718 1525 ntTSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
APOBEC3BQ9UH17 HAS1-201ENST00000222115 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
APOBEC3BQ9UH17 COMT-203ENST00000403184 2217 ntTSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.96
APOBEC3BQ9UH17 ASPSCR1-201ENST00000306729 2123 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.96
APOBEC3BQ9UH17 SLC22A31-201ENST00000562855 1909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
APOBEC3BQ9UH17 CFD-201ENST00000327726 1201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
APOBEC3BQ9UH17 LYRM9-201ENST00000379102 501 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.96
APOBEC3BQ9UH17 AL645608.9-201ENST00000442292 829 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
APOBEC3BQ9UH17 AC093833.1-201ENST00000442821 553 ntTSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
APOBEC3BQ9UH17 ABHD14A-204ENST00000491470 674 ntTSL 3 BASIC21.02■□□□□ 0.96
APOBEC3BQ9UH17 LYRM9-206ENST00000508862 807 ntTSL 3 BASIC21.02■□□□□ 0.96
APOBEC3BQ9UH17 DENND3-207ENST00000518347 850 ntTSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.96
APOBEC3BQ9UH17 Z97653.1-201ENST00000567096 446 ntTSL 3 BASIC21.02■□□□□ 0.96
APOBEC3BQ9UH17 ZNF561-AS1-205ENST00000588765 579 ntTSL 4 BASIC21.02■□□□□ 0.96
APOBEC3BQ9UH17 GRK4-206ENST00000504933 1971 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
APOBEC3BQ9UH17 ZNF76-203ENST00000373953 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
APOBEC3BQ9UH17 NDUFB2-212ENST00000476279 1666 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.95
APOBEC3BQ9UH17 NRG2-201ENST00000289409 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.95
APOBEC3BQ9UH17 LHX2-201ENST00000373615 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
APOBEC3BQ9UH17 CITED1-201ENST00000246139 1231 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
APOBEC3BQ9UH17 AC104771.1-201ENST00000603335 964 ntBASIC21.01■□□□□ 0.95
APOBEC3BQ9UH17 MYCNOS-205ENST00000641950 531 ntBASIC21.01■□□□□ 0.95
APOBEC3BQ9UH17 AC068473.5-201ENST00000616428 2072 ntBASIC21.01■□□□□ 0.95
APOBEC3BQ9UH17 TRH-201ENST00000302649 1978 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
APOBEC3BQ9UH17 MAL2-204ENST00000614891 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
APOBEC3BQ9UH17 KCNIP1-201ENST00000328939 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
APOBEC3BQ9UH17 RAB28-203ENST00000338176 1787 ntTSL 3 BASIC21■□□□□ 0.95
APOBEC3BQ9UH17 USP21-202ENST00000368001 2095 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
APOBEC3BQ9UH17 KANSL1-AS1-201ENST00000398275 517 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
APOBEC3BQ9UH17 MAP2K4P1-201ENST00000438453 1195 ntBASIC21■□□□□ 0.95
APOBEC3BQ9UH17 AC092171.1-201ENST00000455866 753 ntTSL 2 BASIC21■□□□□ 0.95
APOBEC3BQ9UH17 CMTM8-202ENST00000458535 996 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
APOBEC3BQ9UH17 BX890604.1-207ENST00000486571 904 ntTSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
APOBEC3BQ9UH17 FNDC5-207ENST00000640867 639 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21■□□□□ 0.95
APOBEC3BQ9UH17 TOX2-201ENST00000341197 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21■□□□□ 0.95
APOBEC3BQ9UH17 DMRT2-209ENST00000635183 2190 ntTSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
APOBEC3BQ9UH17 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
APOBEC3BQ9UH17 CERKL-203ENST00000374969 1330 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
APOBEC3BQ9UH17 SGMS1-210ENST00000619438 1680 ntTSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
APOBEC3BQ9UH17 AP006587.3-201ENST00000525742 1516 ntBASIC20.99■□□□□ 0.95
APOBEC3BQ9UH17 AKR7A2-201ENST00000235835 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
APOBEC3BQ9UH17 QPCT-201ENST00000338415 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
APOBEC3BQ9UH17 AC087742.1-201ENST00000575880 1738 ntBASIC20.99■□□□□ 0.95
APOBEC3BQ9UH17 ABHD6-201ENST00000295962 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
APOBEC3BQ9UH17 NT5C-201ENST00000245552 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
APOBEC3BQ9UH17 GGTLC1-202ENST00000286890 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
APOBEC3BQ9UH17 TNFRSF18-201ENST00000328596 851 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
APOBEC3BQ9UH17 AC010141.2-201ENST00000452426 721 ntBASIC20.99■□□□□ 0.95
APOBEC3BQ9UH17 AC037459.4-201ENST00000517384 585 ntTSL 4 BASIC20.99■□□□□ 0.95
APOBEC3BQ9UH17 C12orf75-205ENST00000549893 719 ntTSL 3 BASIC20.99■□□□□ 0.95
APOBEC3BQ9UH17 AC138907.5-202ENST00000569484 235 ntBASIC20.99■□□□□ 0.95
APOBEC3BQ9UH17 AC016888.1-201ENST00000585285 565 ntTSL 3 BASIC20.99■□□□□ 0.95
APOBEC3BQ9UH17 MBD3L1-202ENST00000595891 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.99■□□□□ 0.95
APOBEC3BQ9UH17 AC137767.1-201ENST00000602918 1920 ntBASIC20.99■□□□□ 0.95
APOBEC3BQ9UH17 CD58-203ENST00000457047 1328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
APOBEC3BQ9UH17 SUMF1-201ENST00000272902 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
APOBEC3BQ9UH17 C1orf229-201ENST00000623686 2258 ntBASIC20.98■□□□□ 0.95
APOBEC3BQ9UH17 PRELID2-201ENST00000334744 2140 ntTSL 2 BASIC20.98■□□□□ 0.95
APOBEC3BQ9UH17 SLC52A2-211ENST00000532887 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
APOBEC3BQ9UH17 KDF1-201ENST00000320567 1793 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.98■□□□□ 0.95
APOBEC3BQ9UH17 USP45-202ENST00000329966 1444 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
APOBEC3BQ9UH17 HRASLS-201ENST00000264735 1066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
APOBEC3BQ9UH17 HRASLS5-201ENST00000301790 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
APOBEC3BQ9UH17 SNRNP25-202ENST00000383018 1085 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
APOBEC3BQ9UH17 PIGP-203ENST00000399098 972 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
APOBEC3BQ9UH17 C19orf73-201ENST00000408991 744 ntAPPRIS P1 BASIC20.98■□□□□ 0.95
APOBEC3BQ9UH17 ZNF696-204ENST00000520333 605 ntTSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
APOBEC3BQ9UH17 ABCC6P2-202ENST00000542005 706 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
APOBEC3BQ9UH17 ABCC6-204ENST00000575728 714 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
APOBEC3BQ9UH17 AL109923.1-201ENST00000618799 583 ntBASIC20.98■□□□□ 0.95
APOBEC3BQ9UH17 AC231657.2-201ENST00000624556 255 ntBASIC20.98■□□□□ 0.95
APOBEC3BQ9UH17 ARHGAP27-207ENST00000528273 2319 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
APOBEC3BQ9UH17 DONSON-202ENST00000303113 2028 ntTSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
APOBEC3BQ9UH17 EFCC1-201ENST00000436022 2691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
APOBEC3BQ9UH17 PNRC1-201ENST00000336032 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
APOBEC3BQ9UH17 TARBP2-201ENST00000266987 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
APOBEC3BQ9UH17 WRAP73-201ENST00000270708 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
APOBEC3BQ9UH17 RBM4B-203ENST00000525754 2339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.97■□□□□ 0.95
APOBEC3BQ9UH17 MOB2-201ENST00000329957 1207 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.97■□□□□ 0.95
APOBEC3BQ9UH17 KHDC3L-201ENST00000370367 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
APOBEC3BQ9UH17 TRNT1-207ENST00000420393 854 ntTSL 3 BASIC20.97■□□□□ 0.95
APOBEC3BQ9UH17 NCF1B-203ENST00000435988 1254 ntBASIC20.97■□□□□ 0.95
APOBEC3BQ9UH17 BRI3-207ENST00000539286 699 ntTSL 2 BASIC20.97■□□□□ 0.95
APOBEC3BQ9UH17 C12orf43-208ENST00000539736 1033 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.97■□□□□ 0.95
APOBEC3BQ9UH17 MVB12A-212ENST00000543795 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
APOBEC3BQ9UH17 AC110285.4-201ENST00000572590 424 ntTSL 3 BASIC20.97■□□□□ 0.95
APOBEC3BQ9UH17 NMRAL1-212ENST00000574425 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.97■□□□□ 0.95
APOBEC3BQ9UH17 ARFRP1-202ENST00000607873 1061 ntTSL 2 BASIC20.97■□□□□ 0.95
APOBEC3BQ9UH17 WT1-AS_3.1-201ENST00000613262 234 ntBASIC20.97■□□□□ 0.95
APOBEC3BQ9UH17 MAZ-216ENST00000616501 991 ntTSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.9 ms