Protein–RNA interactions for Protein: Q9UFF9

CNOT8, CCR4-NOT transcription complex subunit 8, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 292 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNOT8Q9UFF9 GPSM1-201ENST00000291775 2114 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CNOT8Q9UFF9 FBXO25-202ENST00000350302 2229 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CNOT8Q9UFF9 CITED2-202ENST00000536159 1797 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
CNOT8Q9UFF9 CITED2-203ENST00000537332 1780 ntTSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
CNOT8Q9UFF9 LYPD2-201ENST00000359228 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CNOT8Q9UFF9 KRTAP5-1-201ENST00000382171 942 ntAPPRIS P1 BASIC22.72■■□□□ 1.23
CNOT8Q9UFF9 NRIP3-203ENST00000531090 980 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
CNOT8Q9UFF9 GALNS-211ENST00000568311 703 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CNOT8Q9UFF9 PHF7-201ENST00000327906 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CNOT8Q9UFF9 FBXO27-202ENST00000509137 2130 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CNOT8Q9UFF9 CMTM4-201ENST00000330687 3414 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CNOT8Q9UFF9 LHPP-202ENST00000368842 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CNOT8Q9UFF9 GPSM1-206ENST00000616132 2270 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CNOT8Q9UFF9 GJB6-203ENST00000400065 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CNOT8Q9UFF9 PUF60-203ENST00000453551 1842 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CNOT8Q9UFF9 CENPB-201ENST00000379751 2840 ntAPPRIS P1 BASIC22.71■■□□□ 1.23
CNOT8Q9UFF9 LAYN-201ENST00000375614 2066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CNOT8Q9UFF9 MYL5-208ENST00000511290 781 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CNOT8Q9UFF9 TOLLIP-208ENST00000527938 549 ntTSL 4 BASIC22.71■■□□□ 1.23
CNOT8Q9UFF9 ZNF584-205ENST00000596281 575 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
CNOT8Q9UFF9 CBWD3-212ENST00000616550 721 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
CNOT8Q9UFF9 CBWD6-216ENST00000617933 721 ntTSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
CNOT8Q9UFF9 XPA-201ENST00000375128 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CNOT8Q9UFF9 FOXK2-201ENST00000335255 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CNOT8Q9UFF9 TEX22-201ENST00000451127 2571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
CNOT8Q9UFF9 DACT1-204ENST00000541264 2610 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
CNOT8Q9UFF9 TLE3-216ENST00000559191 1575 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
CNOT8Q9UFF9 LAMP5-AS1-201ENST00000443469 1928 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.23
CNOT8Q9UFF9 TFG-201ENST00000240851 1978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
CNOT8Q9UFF9 TMEM151B-202ENST00000451188 4895 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
CNOT8Q9UFF9 AC091230.1-202ENST00000564823 5356 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
CNOT8Q9UFF9 ZNF32-202ENST00000395797 1201 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
CNOT8Q9UFF9 AP001107.5-202ENST00000533759 948 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
CNOT8Q9UFF9 AC024257.2-201ENST00000549699 147 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
CNOT8Q9UFF9 AL136162.1-201ENST00000607711 1078 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
CNOT8Q9UFF9 WT1-210ENST00000639563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
CNOT8Q9UFF9 HMBS-201ENST00000278715 1501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
CNOT8Q9UFF9 MAGI2-212ENST00000626691 4599 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
CNOT8Q9UFF9 PTP4A3-203ENST00000520105 1866 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
CNOT8Q9UFF9 MAPK9-206ENST00000425491 2266 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
CNOT8Q9UFF9 TBL1Y-202ENST00000355162 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
CNOT8Q9UFF9 PTDSS2-201ENST00000308020 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
CNOT8Q9UFF9 KCNQ5-205ENST00000370398 6345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CNOT8Q9UFF9 CCSAP-201ENST00000284617 5121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CNOT8Q9UFF9 TTYH1-201ENST00000301194 2088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CNOT8Q9UFF9 CHRNA7-203ENST00000454250 2093 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
CNOT8Q9UFF9 GNS-207ENST00000542058 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
CNOT8Q9UFF9 ZNF669-201ENST00000343381 1951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CNOT8Q9UFF9 MFSD14C-208ENST00000637864 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
CNOT8Q9UFF9 ACP1-201ENST00000272065 1549 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CNOT8Q9UFF9 NAA38-201ENST00000333775 999 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CNOT8Q9UFF9 IGHV3-20-201ENST00000390606 415 ntAPPRIS P1 BASIC22.69■■□□□ 1.22
CNOT8Q9UFF9 BX842568.3-201ENST00000418104 571 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
CNOT8Q9UFF9 SERTAD4-AS1-202ENST00000475406 591 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
CNOT8Q9UFF9 ZNF331-202ENST00000411977 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CNOT8Q9UFF9 CAMKK2-208ENST00000412367 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CNOT8Q9UFF9 KCTD13-202ENST00000561540 1773 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CNOT8Q9UFF9 AKR7A2-201ENST00000235835 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CNOT8Q9UFF9 AC008406.3-201ENST00000620001 1374 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
CNOT8Q9UFF9 SRM-201ENST00000376957 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CNOT8Q9UFF9 ZIM2-201ENST00000593711 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CNOT8Q9UFF9 CCDC189-206ENST00000543610 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CNOT8Q9UFF9 FBXL19-205ENST00000562319 2462 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
CNOT8Q9UFF9 FAM102B-201ENST00000370035 5600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CNOT8Q9UFF9 TPM1-204ENST00000334895 1637 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CNOT8Q9UFF9 MDFI-203ENST00000373051 1622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
CNOT8Q9UFF9 ANO8-201ENST00000159087 4152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CNOT8Q9UFF9 FAH-202ENST00000407106 2152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
CNOT8Q9UFF9 DOCK5-208ENST00000481100 2166 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CNOT8Q9UFF9 AZIN2-204ENST00000373443 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CNOT8Q9UFF9 MAG-202ENST00000392213 2390 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CNOT8Q9UFF9 PHPT1-201ENST00000247665 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CNOT8Q9UFF9 PRMT2-204ENST00000397628 954 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
CNOT8Q9UFF9 AL357078.1-201ENST00000448344 310 ntTSL 4 BASIC22.67■■□□□ 1.22
CNOT8Q9UFF9 GJD3-201ENST00000578689 885 ntAPPRIS P1 BASIC22.67■■□□□ 1.22
CNOT8Q9UFF9 TATDN2-201ENST00000287652 5342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CNOT8Q9UFF9 NAA35-202ENST00000376040 1797 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
CNOT8Q9UFF9 TUB-203ENST00000534099 1759 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
CNOT8Q9UFF9 SYNGR2-203ENST00000588282 1553 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CNOT8Q9UFF9 CCDC106-207ENST00000591578 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CNOT8Q9UFF9 OLFM1-204ENST00000371793 2444 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.67■■□□□ 1.22
CNOT8Q9UFF9 CPEB1-218ENST00000620182 2422 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
CNOT8Q9UFF9 NARF-202ENST00000345415 1487 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
CNOT8Q9UFF9 MRPL37-202ENST00000360840 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
CNOT8Q9UFF9 LPCAT4-201ENST00000314891 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
CNOT8Q9UFF9 CDKN1C-204ENST00000440480 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
CNOT8Q9UFF9 TPST1-201ENST00000304842 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
CNOT8Q9UFF9 AC135279.3-201ENST00000610945 1311 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
CNOT8Q9UFF9 PABPC1L-202ENST00000217074 1263 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
CNOT8Q9UFF9 PRADC1-201ENST00000258083 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
CNOT8Q9UFF9 AC061979.1-201ENST00000532061 434 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
CNOT8Q9UFF9 NRL-205ENST00000560550 788 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
CNOT8Q9UFF9 AC018553.2-201ENST00000637770 1064 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
CNOT8Q9UFF9 ZNF517-207ENST00000531720 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
CNOT8Q9UFF9 THEM6-201ENST00000336138 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
CNOT8Q9UFF9 DAPK3-202ENST00000545797 2257 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
CNOT8Q9UFF9 ZXDC-201ENST00000336332 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
CNOT8Q9UFF9 FBXL14-201ENST00000339235 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
CNOT8Q9UFF9 AP004607.7-201ENST00000527152 1677 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
CNOT8Q9UFF9 TRABD2A-203ENST00000409520 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.8 ms