Protein–RNA interactions for Protein: Q9P2K6

KLHL42, Kelch-like protein 42, humanhuman

Predictions only

Length 505 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KLHL42Q9P2K6 ATG4D-201ENST00000309469 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
KLHL42Q9P2K6 ABHD12B-201ENST00000337334 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
KLHL42Q9P2K6 RAB24-201ENST00000303251 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
KLHL42Q9P2K6 TTC9-201ENST00000256367 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
KLHL42Q9P2K6 AC055733.4-201ENST00000638462 1354 ntBASIC20.97■□□□□ 0.95
KLHL42Q9P2K6 P2RY2-203ENST00000393597 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
KLHL42Q9P2K6 SH2B2-202ENST00000536178 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
KLHL42Q9P2K6 ZFAND6-224ENST00000618205 1659 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
KLHL42Q9P2K6 GRM6-202ENST00000517717 2673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
KLHL42Q9P2K6 TBR1-202ENST00000410035 1454 ntTSL 2 BASIC20.96■□□□□ 0.95
KLHL42Q9P2K6 SLC35F5-203ENST00000409342 2284 ntTSL 2 BASIC20.96■□□□□ 0.95
KLHL42Q9P2K6 FAM66D-201ENST00000434078 918 ntTSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
KLHL42Q9P2K6 CALM1-202ENST00000447653 1104 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.96■□□□□ 0.95
KLHL42Q9P2K6 RHOF-204ENST00000537265 699 ntTSL 2 BASIC20.96■□□□□ 0.95
KLHL42Q9P2K6 PTGDR-202ENST00000553372 1216 ntTSL 3 BASIC20.96■□□□□ 0.95
KLHL42Q9P2K6 CDKN1C-204ENST00000440480 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
KLHL42Q9P2K6 VDAC1-203ENST00000395047 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
KLHL42Q9P2K6 MTX2-201ENST00000249442 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
KLHL42Q9P2K6 SDR39U1-208ENST00000554698 1364 ntTSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
KLHL42Q9P2K6 PAQR6-212ENST00000540423 1729 ntTSL 3 BASIC20.95■□□□□ 0.94
KLHL42Q9P2K6 MEIS3-202ENST00000441740 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
KLHL42Q9P2K6 AC003102.1-202ENST00000563394 1796 ntBASIC20.95■□□□□ 0.94
KLHL42Q9P2K6 MESP1-201ENST00000300057 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
KLHL42Q9P2K6 SSX2IP-203ENST00000437941 5843 ntTSL 2 BASIC20.95■□□□□ 0.94
KLHL42Q9P2K6 RNF149-201ENST00000295317 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
KLHL42Q9P2K6 HLA-DPB1-211ENST00000418931 1560 ntAPPRIS P2 BASIC20.95■□□□□ 0.94
KLHL42Q9P2K6 VGLL4-208ENST00000424529 1025 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
KLHL42Q9P2K6 ANKRD63-201ENST00000434396 1143 ntAPPRIS P1 BASIC20.95■□□□□ 0.94
KLHL42Q9P2K6 TRAPPC6A-205ENST00000592647 514 ntTSL 2 BASIC20.95■□□□□ 0.94
KLHL42Q9P2K6 CDIPT-210ENST00000570016 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
KLHL42Q9P2K6 AUTS2-203ENST00000406775 5950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
KLHL42Q9P2K6 GUSB-201ENST00000304895 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
KLHL42Q9P2K6 AC005224.4-201ENST00000583262 1652 ntBASIC20.95■□□□□ 0.94
KLHL42Q9P2K6 AC079328.2-202ENST00000560903 1410 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
KLHL42Q9P2K6 CUEDC1-202ENST00000407144 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
KLHL42Q9P2K6 CENPS-CORT-201ENST00000400900 1469 ntTSL 2 BASIC20.94■□□□□ 0.94
KLHL42Q9P2K6 NELFCD-213ENST00000602795 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
KLHL42Q9P2K6 POTEC-204ENST00000620346 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
KLHL42Q9P2K6 UNC119-201ENST00000301032 1653 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
KLHL42Q9P2K6 IRS3P-201ENST00000223076 1006 ntBASIC20.94■□□□□ 0.94
KLHL42Q9P2K6 GLTPD2-201ENST00000331264 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
KLHL42Q9P2K6 FAIM-203ENST00000393034 927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.94■□□□□ 0.94
KLHL42Q9P2K6 PRKCQ-AS1-204ENST00000455810 920 ntTSL 2 BASIC20.94■□□□□ 0.94
KLHL42Q9P2K6 AES-207ENST00000586839 942 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
KLHL42Q9P2K6 AC005775.1-201ENST00000592413 850 ntTSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
KLHL42Q9P2K6 IRX2-202ENST00000382611 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
KLHL42Q9P2K6 AC084757.3-201ENST00000558061 1943 ntTSL 3 BASIC20.94■□□□□ 0.94
KLHL42Q9P2K6 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
KLHL42Q9P2K6 ELOA3B-201ENST00000611323 1641 ntAPPRIS P1 BASIC20.93■□□□□ 0.94
KLHL42Q9P2K6 ELOA3D-201ENST00000620881 1641 ntAPPRIS P1 BASIC20.93■□□□□ 0.94
KLHL42Q9P2K6 RASGRP2-210ENST00000394430 2174 ntTSL 2 BASIC20.93■□□□□ 0.94
KLHL42Q9P2K6 MGAT4D-208ENST00000515354 1806 ntTSL 3 BASIC20.93■□□□□ 0.94
KLHL42Q9P2K6 C1QL1-201ENST00000253407 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
KLHL42Q9P2K6 JARID2-AS1-201ENST00000441978 455 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
KLHL42Q9P2K6 AC105265.2-201ENST00000467189 838 ntBASIC20.93■□□□□ 0.94
KLHL42Q9P2K6 KRT18P55-201ENST00000577198 1950 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
KLHL42Q9P2K6 ZSCAN18-217ENST00000601144 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
KLHL42Q9P2K6 RIOX1-201ENST00000304061 2429 ntAPPRIS P1 BASIC20.93■□□□□ 0.94
KLHL42Q9P2K6 PRKACA-201ENST00000308677 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
KLHL42Q9P2K6 GSX2-201ENST00000326902 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
KLHL42Q9P2K6 OXCT2-201ENST00000327582 1826 ntAPPRIS P1 BASIC20.92■□□□□ 0.94
KLHL42Q9P2K6 PRPSAP2-201ENST00000268835 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
KLHL42Q9P2K6 PAQR6-202ENST00000335852 2117 ntTSL 2 BASIC20.92■□□□□ 0.94
KLHL42Q9P2K6 CBLN3-201ENST00000267406 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
KLHL42Q9P2K6 HBM-201ENST00000356815 506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
KLHL42Q9P2K6 FXN-202ENST00000396364 980 ntTSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
KLHL42Q9P2K6 AC092675.2-201ENST00000413274 541 ntTSL 4 BASIC20.92■□□□□ 0.94
KLHL42Q9P2K6 RORB-AS1-201ENST00000417576 1178 ntTSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
KLHL42Q9P2K6 AP2S1-203ENST00000593442 636 ntTSL 2 BASIC20.92■□□□□ 0.94
KLHL42Q9P2K6 AC135048.1-201ENST00000566056 1318 ntTSL 2 BASIC20.92■□□□□ 0.94
KLHL42Q9P2K6 NABP2-202ENST00000341463 1411 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.92■□□□□ 0.94
KLHL42Q9P2K6 LGALS9C-201ENST00000328114 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
KLHL42Q9P2K6 COL8A2-203ENST00000481785 2036 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
KLHL42Q9P2K6 FADS6-204ENST00000614223 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
KLHL42Q9P2K6 SARDH-203ENST00000371868 2266 ntTSL 2 BASIC20.92■□□□□ 0.94
KLHL42Q9P2K6 PPP1R12C-201ENST00000263433 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
KLHL42Q9P2K6 MAGI2-217ENST00000629359 6704 ntTSL 5 BASIC20.91■□□□□ 0.94
KLHL42Q9P2K6 MFF-203ENST00000349901 1716 ntTSL 2 BASIC20.91■□□□□ 0.94
KLHL42Q9P2K6 CLPSL2-201ENST00000360454 488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
KLHL42Q9P2K6 TSPY4-201ENST00000383008 1143 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.91■□□□□ 0.94
KLHL42Q9P2K6 NUDT14-202ENST00000392568 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
KLHL42Q9P2K6 SLC29A1-207ENST00000393841 2485 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.91■□□□□ 0.94
KLHL42Q9P2K6 IFNGR2-203ENST00000405436 1684 ntTSL 5 BASIC20.91■□□□□ 0.94
KLHL42Q9P2K6 ZFAND2B-202ENST00000409097 1765 ntTSL 2 BASIC20.91■□□□□ 0.94
KLHL42Q9P2K6 TPTEP1-205ENST00000558085 1738 ntTSL 2 BASIC20.91■□□□□ 0.94
KLHL42Q9P2K6 TPRG1LP1-201ENST00000598702 760 ntBASIC20.91■□□□□ 0.94
KLHL42Q9P2K6 MRM1-203ENST00000612760 1284 ntTSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
KLHL42Q9P2K6 SGMS1-210ENST00000619438 1680 ntTSL 5 BASIC20.91■□□□□ 0.94
KLHL42Q9P2K6 AC010999.2-201ENST00000621974 596 ntTSL 2 BASIC20.91■□□□□ 0.94
KLHL42Q9P2K6 FZD8-201ENST00000374694 4030 ntAPPRIS P1 BASIC20.91■□□□□ 0.94
KLHL42Q9P2K6 DTNB-207ENST00000405222 2273 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
KLHL42Q9P2K6 CDC14B-202ENST00000375241 5589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
KLHL42Q9P2K6 SNX7-201ENST00000306121 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
KLHL42Q9P2K6 SPRTN-201ENST00000008440 1667 ntTSL 2 BASIC20.9■□□□□ 0.94
KLHL42Q9P2K6 COMMD5-207ENST00000543949 1571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.9■□□□□ 0.94
KLHL42Q9P2K6 LINC01167-201ENST00000423232 604 ntTSL 3 BASIC20.9■□□□□ 0.94
KLHL42Q9P2K6 PRKCQ-AS1-202ENST00000445427 1133 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
KLHL42Q9P2K6 AL390816.2-201ENST00000554252 737 ntTSL 3 BASIC20.9■□□□□ 0.94
KLHL42Q9P2K6 AC127029.2-201ENST00000577329 502 ntTSL 3 BASIC20.9■□□□□ 0.94
KLHL42Q9P2K6 PRMT1-221ENST00000610806 1192 ntTSL 3 BASIC20.9■□□□□ 0.94
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.5 ms