Protein–RNA interactions for Protein: Q9P2K3

RCOR3, REST corepressor 3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 495 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RCOR3Q9P2K3 WDR86-203ENST00000469830 1691 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
RCOR3Q9P2K3 PHACTR3-202ENST00000359926 2252 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
RCOR3Q9P2K3 MIR638-201ENST00000385237 100 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
RCOR3Q9P2K3 FBXO33-202ENST00000554190 534 ntTSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.13
RCOR3Q9P2K3 B4GALNT1-203ENST00000449184 1633 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
RCOR3Q9P2K3 LRP5L-203ENST00000444995 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.12
RCOR3Q9P2K3 SCRN2-212ENST00000584123 1745 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
RCOR3Q9P2K3 ZSCAN18-217ENST00000601144 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
RCOR3Q9P2K3 PRSS33-202ENST00000570702 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
RCOR3Q9P2K3 PAQR6-202ENST00000335852 2117 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
RCOR3Q9P2K3 ORMDL1-202ENST00000392349 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
RCOR3Q9P2K3 PARD6B-202ENST00000396039 522 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
RCOR3Q9P2K3 SIRT3-215ENST00000532956 1235 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
RCOR3Q9P2K3 AC010203.1-202ENST00000550096 695 ntTSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
RCOR3Q9P2K3 AC012414.1-201ENST00000556676 535 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
RCOR3Q9P2K3 ABCG4-204ENST00000615496 2459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
RCOR3Q9P2K3 PRR7-201ENST00000323249 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
RCOR3Q9P2K3 MEIS3-202ENST00000441740 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
RCOR3Q9P2K3 KRT18P55-201ENST00000577198 1950 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
RCOR3Q9P2K3 RAB24-201ENST00000303251 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
RCOR3Q9P2K3 VGLL3-201ENST00000383698 2475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
RCOR3Q9P2K3 BX005040.4-201ENST00000637145 1518 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
RCOR3Q9P2K3 WRNIP1-203ENST00000380771 2595 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
RCOR3Q9P2K3 AC084757.3-201ENST00000558061 1943 ntTSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
RCOR3Q9P2K3 UBTF-213ENST00000533177 3011 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
RCOR3Q9P2K3 NXT1-201ENST00000254998 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
RCOR3Q9P2K3 KRTAP17-1-201ENST00000334202 779 ntAPPRIS P1 BASIC22.06■■□□□ 1.12
RCOR3Q9P2K3 PRDX4-202ENST00000379341 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
RCOR3Q9P2K3 POLR2H-204ENST00000438240 994 ntTSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
RCOR3Q9P2K3 STOML2-202ENST00000452248 1296 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
RCOR3Q9P2K3 AL355102.2-201ENST00000553811 600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
RCOR3Q9P2K3 STOML2-205ENST00000619795 1293 ntTSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
RCOR3Q9P2K3 MAPK8IP1P2-201ENST00000580257 1472 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
RCOR3Q9P2K3 VDAC1-203ENST00000395047 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
RCOR3Q9P2K3 DENND5A-201ENST00000328194 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
RCOR3Q9P2K3 FADS6-204ENST00000614223 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
RCOR3Q9P2K3 ME2-206ENST00000638410 2289 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
RCOR3Q9P2K3 ME2-210ENST00000639255 2262 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
RCOR3Q9P2K3 AC003102.1-202ENST00000563394 1796 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
RCOR3Q9P2K3 NDUFB2-212ENST00000476279 1666 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
RCOR3Q9P2K3 SH2B1-204ENST00000395532 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
RCOR3Q9P2K3 PAFAH1B2-205ENST00000529887 1056 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
RCOR3Q9P2K3 AL354811.1-201ENST00000610286 706 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
RCOR3Q9P2K3 TRAF4-217ENST00000618771 543 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
RCOR3Q9P2K3 GSX2-201ENST00000326902 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
RCOR3Q9P2K3 ABHD12B-201ENST00000337334 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
RCOR3Q9P2K3 PAQR6-212ENST00000540423 1729 ntTSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
RCOR3Q9P2K3 SERBP1-202ENST00000370990 1621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
RCOR3Q9P2K3 SYNDIG1-201ENST00000376862 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
RCOR3Q9P2K3 MPST-204ENST00000404393 1329 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
RCOR3Q9P2K3 BARHL1-201ENST00000263610 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
RCOR3Q9P2K3 COL8A2-203ENST00000481785 2036 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
RCOR3Q9P2K3 OXCT2-201ENST00000327582 1826 ntAPPRIS P1 BASIC22.04■■□□□ 1.12
RCOR3Q9P2K3 CDKN1C-204ENST00000440480 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
RCOR3Q9P2K3 CRTC2-203ENST00000368633 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
RCOR3Q9P2K3 NAGPA-202ENST00000381955 2100 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
RCOR3Q9P2K3 AC079328.2-202ENST00000560903 1410 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
RCOR3Q9P2K3 CCDC38-201ENST00000344280 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
RCOR3Q9P2K3 PRKAR1B-211ENST00000537384 2533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
RCOR3Q9P2K3 ARPC5L-201ENST00000259477 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
RCOR3Q9P2K3 LINC00454-202ENST00000430978 1327 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
RCOR3Q9P2K3 RYK-208ENST00000620660 2942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
RCOR3Q9P2K3 CENPS-CORT-201ENST00000400900 1469 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
RCOR3Q9P2K3 MTX2-201ENST00000249442 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
RCOR3Q9P2K3 ELL3-201ENST00000319359 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
RCOR3Q9P2K3 SMPD5-201ENST00000528912 1390 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
RCOR3Q9P2K3 LIN7B-202ENST00000391864 582 ntTSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
RCOR3Q9P2K3 ANKRD63-201ENST00000434396 1143 ntAPPRIS P1 BASIC22.03■■□□□ 1.12
RCOR3Q9P2K3 AL358852.1-201ENST00000623174 1268 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
RCOR3Q9P2K3 SPAG16-202ENST00000331683 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
RCOR3Q9P2K3 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
RCOR3Q9P2K3 LGALS9C-201ENST00000328114 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
RCOR3Q9P2K3 ARRB2-201ENST00000269260 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
RCOR3Q9P2K3 AC055733.4-201ENST00000638462 1354 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
RCOR3Q9P2K3 ANKRD53-204ENST00000457410 1671 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
RCOR3Q9P2K3 AC005224.4-201ENST00000583262 1652 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
RCOR3Q9P2K3 CENPB-201ENST00000379751 2840 ntAPPRIS P1 BASIC22.02■■□□□ 1.12
RCOR3Q9P2K3 TPST1-201ENST00000304842 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
RCOR3Q9P2K3 HYI-206ENST00000372434 1025 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
RCOR3Q9P2K3 NGEF-203ENST00000409079 1022 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
RCOR3Q9P2K3 FAM66D-201ENST00000434078 918 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
RCOR3Q9P2K3 AL355877.1-204ENST00000451482 1078 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
RCOR3Q9P2K3 TRAPPC6A-205ENST00000592647 514 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
RCOR3Q9P2K3 TBR1-202ENST00000410035 1454 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
RCOR3Q9P2K3 MBNL3-202ENST00000370844 1643 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
RCOR3Q9P2K3 LCK-214ENST00000619559 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
RCOR3Q9P2K3 MGAT4D-208ENST00000515354 1806 ntTSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
RCOR3Q9P2K3 SGMS1-210ENST00000619438 1680 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
RCOR3Q9P2K3 SDR39U1-208ENST00000554698 1364 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
RCOR3Q9P2K3 SOX17-201ENST00000297316 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
RCOR3Q9P2K3 SNX7-201ENST00000306121 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
RCOR3Q9P2K3 MFF-203ENST00000349901 1716 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
RCOR3Q9P2K3 HLA-DPB1-211ENST00000418931 1560 ntAPPRIS P2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
RCOR3Q9P2K3 RAPH1-210ENST00000453034 2394 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
RCOR3Q9P2K3 CALM1-202ENST00000447653 1104 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
RCOR3Q9P2K3 RHOF-204ENST00000537265 699 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
RCOR3Q9P2K3 PTGDR-202ENST00000553372 1216 ntTSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
RCOR3Q9P2K3 SLC4A3-203ENST00000358055 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
RCOR3Q9P2K3 PHF10-202ENST00000366780 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
RCOR3Q9P2K3 PPP2R5E-204ENST00000555899 2164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.7 ms