Protein–RNA interactions for Protein: Q9P2E7

PCDH10, Protocadherin-10, humanhuman

Predictions only

Length 1,040 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PCDH10Q9P2E7 AC068338.2-201ENST00000563278 1430 ntBASIC23.86■■□□□ 1.41
PCDH10Q9P2E7 KRT7-201ENST00000331817 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
PCDH10Q9P2E7 H1FX-201ENST00000333762 1507 ntAPPRIS P1 BASIC23.86■■□□□ 1.41
PCDH10Q9P2E7 OXCT2P1-201ENST00000447263 1535 ntBASIC23.86■■□□□ 1.41
PCDH10Q9P2E7 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
PCDH10Q9P2E7 MGST3-205ENST00000367889 1015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
PCDH10Q9P2E7 NPM2-204ENST00000518119 1190 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
PCDH10Q9P2E7 HTATIP2-208ENST00000532505 595 ntTSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
PCDH10Q9P2E7 AL049780.2-201ENST00000556236 367 ntTSL 3 BASIC23.86■■□□□ 1.41
PCDH10Q9P2E7 USF2-205ENST00000594064 1179 ntTSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
PCDH10Q9P2E7 CIRBP-246ENST00000628979 1043 ntTSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
PCDH10Q9P2E7 BASP1-203ENST00000616743 1711 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.86■■□□□ 1.41
PCDH10Q9P2E7 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
PCDH10Q9P2E7 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC23.86■■□□□ 1.41
PCDH10Q9P2E7 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
PCDH10Q9P2E7 ZNF644-203ENST00000361321 1253 ntTSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
PCDH10Q9P2E7 UNC93B6-201ENST00000525262 1143 ntTSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
PCDH10Q9P2E7 AC007493.2-201ENST00000568427 478 ntTSL 3 BASIC23.85■■□□□ 1.41
PCDH10Q9P2E7 AC003102.1-201ENST00000588279 569 ntTSL 4 BASIC23.85■■□□□ 1.41
PCDH10Q9P2E7 TCP1-202ENST00000392168 1878 ntTSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
PCDH10Q9P2E7 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
PCDH10Q9P2E7 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
PCDH10Q9P2E7 EEF1D-225ENST00000529272 1311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
PCDH10Q9P2E7 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
PCDH10Q9P2E7 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
PCDH10Q9P2E7 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
PCDH10Q9P2E7 PITX3-201ENST00000370002 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
PCDH10Q9P2E7 DCTN3-202ENST00000341694 899 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
PCDH10Q9P2E7 AL360181.5-201ENST00000368554 1044 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
PCDH10Q9P2E7 DCTN3-205ENST00000378916 773 ntTSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
PCDH10Q9P2E7 PLLP-204ENST00000569059 665 ntTSL 3 BASIC23.84■■□□□ 1.41
PCDH10Q9P2E7 AC126696.3-202ENST00000570159 553 ntTSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
PCDH10Q9P2E7 F2RL3-202ENST00000599210 613 ntTSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
PCDH10Q9P2E7 JOSD2-205ENST00000601423 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
PCDH10Q9P2E7 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
PCDH10Q9P2E7 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
PCDH10Q9P2E7 TRAPPC3-209ENST00000616395 1336 ntTSL 3 BASIC23.84■■□□□ 1.41
PCDH10Q9P2E7 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
PCDH10Q9P2E7 ADAP2-204ENST00000580525 1598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
PCDH10Q9P2E7 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC23.83■■□□□ 1.41
PCDH10Q9P2E7 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
PCDH10Q9P2E7 NKAIN4-201ENST00000370307 793 ntTSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
PCDH10Q9P2E7 CBY3-201ENST00000376974 785 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.41
PCDH10Q9P2E7 GAS7-202ENST00000396115 929 ntTSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
PCDH10Q9P2E7 DGCR6L-202ENST00000405465 962 ntTSL 3 BASIC23.83■■□□□ 1.41
PCDH10Q9P2E7 GPX1-202ENST00000419783 1146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
PCDH10Q9P2E7 IGFBP6-203ENST00000548547 1177 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
PCDH10Q9P2E7 ISG20-210ENST00000560741 800 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
PCDH10Q9P2E7 NBPF14-202ENST00000593495 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
PCDH10Q9P2E7 MYO19-221ENST00000620640 1186 ntTSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.41
PCDH10Q9P2E7 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
PCDH10Q9P2E7 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
PCDH10Q9P2E7 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
PCDH10Q9P2E7 ACSL1-205ENST00000504900 1583 ntTSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
PCDH10Q9P2E7 MFSD7-209ENST00000515118 1556 ntTSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
PCDH10Q9P2E7 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
PCDH10Q9P2E7 GOLGA6L9-202ENST00000618348 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
PCDH10Q9P2E7 F8A2-201ENST00000369505 1116 ntAPPRIS P1 BASIC23.82■■□□□ 1.4
PCDH10Q9P2E7 PUSL1-201ENST00000379031 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
PCDH10Q9P2E7 AC011446.2-202ENST00000592882 756 ntTSL 3 BASIC23.82■■□□□ 1.4
PCDH10Q9P2E7 AC020913.2-201ENST00000601929 629 ntTSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
PCDH10Q9P2E7 Z99916.2-201ENST00000604037 246 ntBASIC23.82■■□□□ 1.4
PCDH10Q9P2E7 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
PCDH10Q9P2E7 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
PCDH10Q9P2E7 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
PCDH10Q9P2E7 DHRS4-204ENST00000543741 1340 ntTSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
PCDH10Q9P2E7 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
PCDH10Q9P2E7 CTU2-201ENST00000312060 1672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
PCDH10Q9P2E7 C16orf74-201ENST00000284245 906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
PCDH10Q9P2E7 AC087499.1-201ENST00000418141 1075 ntBASIC23.81■■□□□ 1.4
PCDH10Q9P2E7 LINC01301-204ENST00000530725 577 ntTSL 4 BASIC23.81■■□□□ 1.4
PCDH10Q9P2E7 KRT17P2-201ENST00000300992 1314 ntBASIC23.81■■□□□ 1.4
PCDH10Q9P2E7 KLHDC9-201ENST00000368011 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
PCDH10Q9P2E7 AL353803.4-201ENST00000565882 1934 ntBASIC23.8■■□□□ 1.4
PCDH10Q9P2E7 CPED1-202ENST00000340646 1056 ntTSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
PCDH10Q9P2E7 BX276092.2-201ENST00000417668 665 ntBASIC23.8■■□□□ 1.4
PCDH10Q9P2E7 BET1L-207ENST00000529614 560 ntTSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
PCDH10Q9P2E7 AP005205.2-201ENST00000577327 491 ntTSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
PCDH10Q9P2E7 AC073648.6-201ENST00000641589 218 ntBASIC23.8■■□□□ 1.4
PCDH10Q9P2E7 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
PCDH10Q9P2E7 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
PCDH10Q9P2E7 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
PCDH10Q9P2E7 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
PCDH10Q9P2E7 GRTP1-203ENST00000375431 1384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
PCDH10Q9P2E7 SEPT5-210ENST00000455784 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
PCDH10Q9P2E7 RPL3-201ENST00000216146 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
PCDH10Q9P2E7 NAA10-208ENST00000464845 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
PCDH10Q9P2E7 RBX1-201ENST00000216225 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
PCDH10Q9P2E7 CFC1-201ENST00000259216 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
PCDH10Q9P2E7 CFC1B-201ENST00000281882 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
PCDH10Q9P2E7 GRTP1-201ENST00000326039 1294 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
PCDH10Q9P2E7 AC080075.1-201ENST00000469747 427 ntTSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
PCDH10Q9P2E7 LCN6-203ENST00000476567 1015 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
PCDH10Q9P2E7 PENK-204ENST00000518770 863 ntTSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
PCDH10Q9P2E7 TRIM35-203ENST00000521253 1215 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
PCDH10Q9P2E7 GPHA2-202ENST00000532246 466 ntTSL 3 BASIC23.79■■□□□ 1.4
PCDH10Q9P2E7 MLF2-210ENST00000542154 838 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
PCDH10Q9P2E7 USP45-205ENST00000472914 1617 ntTSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
PCDH10Q9P2E7 TMCC2-209ENST00000637895 1455 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
PCDH10Q9P2E7 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.8 ms