Protein–RNA interactions for Protein: Q9P2B4

CTTNBP2NL, CTTNBP2 N-terminal-like protein, humanhuman

Predictions only

Length 639 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTTNBP2NLQ9P2B4 HYI-204ENST00000372432 1066 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
CTTNBP2NLQ9P2B4 AURKAIP1-204ENST00000378853 875 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
CTTNBP2NLQ9P2B4 TMEM80-201ENST00000397510 1094 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
CTTNBP2NLQ9P2B4 ZNF264-206ENST00000600531 774 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
CTTNBP2NLQ9P2B4 AL445237.1-202ENST00000604581 425 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
CTTNBP2NLQ9P2B4 MIR663AHG-233ENST00000609248 830 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
CTTNBP2NLQ9P2B4 AC011298.3-201ENST00000615796 283 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
CTTNBP2NLQ9P2B4 C12orf75-208ENST00000612117 1329 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
CTTNBP2NLQ9P2B4 RNF166-202ENST00000537718 1525 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
CTTNBP2NLQ9P2B4 TLE3-216ENST00000559191 1575 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
CTTNBP2NLQ9P2B4 OXCT2-201ENST00000327582 1826 ntAPPRIS P1 BASIC22.7■■□□□ 1.22
CTTNBP2NLQ9P2B4 MFSD14C-208ENST00000637864 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
CTTNBP2NLQ9P2B4 TPST1-201ENST00000304842 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
CTTNBP2NLQ9P2B4 MXRA8-201ENST00000309212 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
CTTNBP2NLQ9P2B4 OAF-201ENST00000328965 2525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
CTTNBP2NLQ9P2B4 INAFM2-202ENST00000638170 3052 ntAPPRIS P1 BASIC22.7■■□□□ 1.22
CTTNBP2NLQ9P2B4 TCF7L1-201ENST00000282111 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CTTNBP2NLQ9P2B4 CCDC130-201ENST00000221554 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CTTNBP2NLQ9P2B4 CCDC106-207ENST00000591578 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CTTNBP2NLQ9P2B4 HSPB2-201ENST00000304298 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CTTNBP2NLQ9P2B4 CCDC166-201ENST00000542437 1320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
CTTNBP2NLQ9P2B4 KRTAP5-4-201ENST00000399682 1181 ntAPPRIS P5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
CTTNBP2NLQ9P2B4 TCEA1-214ENST00000640382 1234 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
CTTNBP2NLQ9P2B4 DRD2-202ENST00000362072 2789 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CTTNBP2NLQ9P2B4 OSBPL5-208ENST00000478260 2653 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
CTTNBP2NLQ9P2B4 ADCK2-201ENST00000072869 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CTTNBP2NLQ9P2B4 PMPCA-201ENST00000371717 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CTTNBP2NLQ9P2B4 PSIP1-201ENST00000380715 1966 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CTTNBP2NLQ9P2B4 KLHL17-205ENST00000622660 1950 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
CTTNBP2NLQ9P2B4 PFKFB3-216ENST00000625260 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
CTTNBP2NLQ9P2B4 GRIN1-208ENST00000371561 5149 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CTTNBP2NLQ9P2B4 EEF1D-201ENST00000317198 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
CTTNBP2NLQ9P2B4 ACP4-201ENST00000270593 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CTTNBP2NLQ9P2B4 SLC47A1P1-202ENST00000449666 945 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
CTTNBP2NLQ9P2B4 AC090241.2-201ENST00000602329 432 ntTSL 4 BASIC22.68■■□□□ 1.22
CTTNBP2NLQ9P2B4 SAP25-203ENST00000614631 987 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
CTTNBP2NLQ9P2B4 CCNL1-203ENST00000461804 1998 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
CTTNBP2NLQ9P2B4 AL024507.2-201ENST00000606070 2574 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
CTTNBP2NLQ9P2B4 CTCF-202ENST00000401394 2978 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CTTNBP2NLQ9P2B4 FAM110A-206ENST00000541082 1614 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.68■■□□□ 1.22
CTTNBP2NLQ9P2B4 PXK-211ENST00000484288 2031 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CTTNBP2NLQ9P2B4 PTP4A3-203ENST00000520105 1866 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
CTTNBP2NLQ9P2B4 POLR3GL-201ENST00000369313 818 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
CTTNBP2NLQ9P2B4 PRICKLE4-201ENST00000394259 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
CTTNBP2NLQ9P2B4 AC104564.3-201ENST00000582367 638 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
CTTNBP2NLQ9P2B4 SF1-220ENST00000626028 704 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
CTTNBP2NLQ9P2B4 Z98883.1-202ENST00000635107 1289 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
CTTNBP2NLQ9P2B4 NAA35-202ENST00000376040 1797 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
CTTNBP2NLQ9P2B4 SNX7-201ENST00000306121 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CTTNBP2NLQ9P2B4 BASP1-203ENST00000616743 1711 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.67■■□□□ 1.22
CTTNBP2NLQ9P2B4 SMUG1-215ENST00000508394 1697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
CTTNBP2NLQ9P2B4 KIAA0895-204ENST00000415803 2865 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CTTNBP2NLQ9P2B4 MAPK9-206ENST00000425491 2266 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
CTTNBP2NLQ9P2B4 LY6K-201ENST00000292430 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
CTTNBP2NLQ9P2B4 PYGO2-201ENST00000368456 1306 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
CTTNBP2NLQ9P2B4 MCAT-201ENST00000290429 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
CTTNBP2NLQ9P2B4 PRSS33-202ENST00000570702 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
CTTNBP2NLQ9P2B4 CAMKK2-208ENST00000412367 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
CTTNBP2NLQ9P2B4 STOX1-202ENST00000399162 935 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
CTTNBP2NLQ9P2B4 STOX1-203ENST00000399165 1135 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
CTTNBP2NLQ9P2B4 LHPP-202ENST00000368842 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
CTTNBP2NLQ9P2B4 MAP3K3-201ENST00000361357 4818 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
CTTNBP2NLQ9P2B4 PIAS2-203ENST00000545673 1590 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
CTTNBP2NLQ9P2B4 SYNGR2-203ENST00000588282 1553 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
CTTNBP2NLQ9P2B4 PTPN18-202ENST00000347849 2472 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
CTTNBP2NLQ9P2B4 NARF-202ENST00000345415 1487 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
CTTNBP2NLQ9P2B4 PTDSS2-201ENST00000308020 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
CTTNBP2NLQ9P2B4 CDKN2C-203ENST00000396148 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
CTTNBP2NLQ9P2B4 TPTEP1-205ENST00000558085 1738 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
CTTNBP2NLQ9P2B4 ZDHHC5-204ENST00000527985 2817 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
CTTNBP2NLQ9P2B4 PYCR1-203ENST00000402252 1346 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
CTTNBP2NLQ9P2B4 PYCARD-202ENST00000350605 696 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
CTTNBP2NLQ9P2B4 SMIM29-205ENST00000468145 903 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
CTTNBP2NLQ9P2B4 SMIM29-207ENST00000481533 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
CTTNBP2NLQ9P2B4 AC004707.1-201ENST00000511627 715 ntTSL 3 BASIC22.65■■□□□ 1.22
CTTNBP2NLQ9P2B4 TMC6-212ENST00000589553 2389 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
CTTNBP2NLQ9P2B4 RSPO1-201ENST00000356545 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
CTTNBP2NLQ9P2B4 KCTD13-202ENST00000561540 1773 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
CTTNBP2NLQ9P2B4 RAP1B-204ENST00000393436 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
CTTNBP2NLQ9P2B4 PLEKHG4-201ENST00000360461 6782 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
CTTNBP2NLQ9P2B4 ST3GAL3-207ENST00000353126 1969 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
CTTNBP2NLQ9P2B4 UPF1-207ENST00000599848 5311 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
CTTNBP2NLQ9P2B4 CIZ1-206ENST00000372954 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
CTTNBP2NLQ9P2B4 PABPC1L2B-201ENST00000373521 2197 ntAPPRIS P1 BASIC22.65■■□□□ 1.22
CTTNBP2NLQ9P2B4 ITGB1BP1-203ENST00000359712 2126 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.22
CTTNBP2NLQ9P2B4 PRICKLE3-206ENST00000599218 2062 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
CTTNBP2NLQ9P2B4 HLA-C-203ENST00000383329 1554 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.64■■□□□ 1.22
CTTNBP2NLQ9P2B4 FAM20C-201ENST00000313766 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
CTTNBP2NLQ9P2B4 YIF1A-201ENST00000359461 943 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
CTTNBP2NLQ9P2B4 YIF1A-203ENST00000376901 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
CTTNBP2NLQ9P2B4 MAST4-206ENST00000406374 1066 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
CTTNBP2NLQ9P2B4 AP005435.1-201ENST00000529293 1178 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
CTTNBP2NLQ9P2B4 SERGEF-219ENST00000532265 1124 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
CTTNBP2NLQ9P2B4 AC018553.2-201ENST00000637770 1064 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
CTTNBP2NLQ9P2B4 DOK3-202ENST00000357198 1729 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
CTTNBP2NLQ9P2B4 SCRN2-212ENST00000584123 1745 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
CTTNBP2NLQ9P2B4 CACNA1B-201ENST00000277549 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
CTTNBP2NLQ9P2B4 CACNA1B-202ENST00000277551 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
CTTNBP2NLQ9P2B4 B4GAT1-201ENST00000311181 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
CTTNBP2NLQ9P2B4 B4GALNT1-203ENST00000449184 1633 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.8 ms