Protein–RNA interactions for Protein: Q9P232

CNTN3, Contactin-3, humanhuman

Predictions only

Length 1,028 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNTN3Q9P232 ECHDC2-221ENST00000536120 1446 ntTSL 3 BASIC23.14■■□□□ 1.29
CNTN3Q9P232 MAGED2-206ENST00000375068 2189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
CNTN3Q9P232 LSM14B-201ENST00000279068 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
CNTN3Q9P232 RBM4B-203ENST00000525754 2339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
CNTN3Q9P232 TLE3-216ENST00000559191 1575 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
CNTN3Q9P232 NKX2-5-201ENST00000329198 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
CNTN3Q9P232 TANGO2-202ENST00000398042 2011 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
CNTN3Q9P232 CBR1-201ENST00000290349 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
CNTN3Q9P232 EXD3-208ENST00000479452 962 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
CNTN3Q9P232 ASRGL1-210ENST00000534571 639 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
CNTN3Q9P232 AC092368.3-201ENST00000562549 1107 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
CNTN3Q9P232 AC104187.1-201ENST00000607510 612 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
CNTN3Q9P232 AC243773.2-201ENST00000616341 490 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
CNTN3Q9P232 UBE2Q2P2-204ENST00000618775 648 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
CNTN3Q9P232 NOX4-209ENST00000527626 1774 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
CNTN3Q9P232 ST8SIA6-201ENST00000377602 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
CNTN3Q9P232 ANXA8-204ENST00000583911 1874 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
CNTN3Q9P232 GMPPA-201ENST00000313597 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
CNTN3Q9P232 ALDH5A1-204ENST00000491546 1699 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
CNTN3Q9P232 TRADD-202ENST00000486556 1833 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
CNTN3Q9P232 SOCS7-202ENST00000613678 1827 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
CNTN3Q9P232 SH2D5-202ENST00000444387 1934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
CNTN3Q9P232 RASSF10-201ENST00000529419 2530 ntAPPRIS P1 BASIC23.12■■□□□ 1.29
CNTN3Q9P232 SLC41A3-202ENST00000346785 1705 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
CNTN3Q9P232 GATA3-AS1-204ENST00000438755 675 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
CNTN3Q9P232 RARG-201ENST00000338561 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
CNTN3Q9P232 CBWD3-202ENST00000377342 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
CNTN3Q9P232 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
CNTN3Q9P232 CCDC9-201ENST00000221922 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
CNTN3Q9P232 AC079328.2-202ENST00000560903 1410 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
CNTN3Q9P232 MLNR-201ENST00000218721 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
CNTN3Q9P232 CD47-202ENST00000361309 1285 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
CNTN3Q9P232 ZNF292-204ENST00000392985 1096 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
CNTN3Q9P232 CALM1-202ENST00000447653 1104 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
CNTN3Q9P232 DLX3-202ENST00000512495 834 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
CNTN3Q9P232 ASB6-201ENST00000277458 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
CNTN3Q9P232 SLC2A8-203ENST00000373371 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
CNTN3Q9P232 NABP2-203ENST00000380198 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
CNTN3Q9P232 HADH-209ENST00000603302 2032 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
CNTN3Q9P232 PROSER2-205ENST00000622831 1646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
CNTN3Q9P232 IQCD-203ENST00000546692 1872 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
CNTN3Q9P232 EPO-201ENST00000252723 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
CNTN3Q9P232 GSTM3-202ENST00000361066 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
CNTN3Q9P232 PDK3-201ENST00000379162 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
CNTN3Q9P232 TSPAN4-206ENST00000397408 1430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
CNTN3Q9P232 HCFC1R1-201ENST00000248089 965 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
CNTN3Q9P232 AC016769.1-201ENST00000409132 1010 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
CNTN3Q9P232 ZSWIM7-205ENST00000472495 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
CNTN3Q9P232 AC106738.1-201ENST00000560487 359 ntTSL 3 BASIC23.1■■□□□ 1.29
CNTN3Q9P232 HCFC1R1-207ENST00000574980 845 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
CNTN3Q9P232 RARRES2P11-201ENST00000635158 484 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
CNTN3Q9P232 AL032819.3-201ENST00000640283 925 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
CNTN3Q9P232 HAUS4-201ENST00000206474 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
CNTN3Q9P232 ZNF707-222ENST00000532158 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
CNTN3Q9P232 SPRED3-202ENST00000586301 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
CNTN3Q9P232 MSL1-203ENST00000577454 2081 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
CNTN3Q9P232 IFNGR2-203ENST00000405436 1684 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
CNTN3Q9P232 TCF3-203ENST00000395423 2779 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
CNTN3Q9P232 DOK1-203ENST00000409429 1955 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
CNTN3Q9P232 GALC-202ENST00000393568 2054 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
CNTN3Q9P232 SMIM12-202ENST00000423898 897 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
CNTN3Q9P232 AC080013.1-202ENST00000465477 674 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
CNTN3Q9P232 AP001363.2-201ENST00000538101 391 ntTSL 3 BASIC23.09■■□□□ 1.29
CNTN3Q9P232 SEC11A-208ENST00000559729 1256 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
CNTN3Q9P232 VPS53-216ENST00000574029 585 ntTSL 4 BASIC23.09■■□□□ 1.29
CNTN3Q9P232 RNASEH2B-206ENST00000611510 1257 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
CNTN3Q9P232 WWOX-218ENST00000627394 894 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
CNTN3Q9P232 AC092053.2-201ENST00000640557 1818 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
CNTN3Q9P232 DPEP2-204ENST00000572888 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
CNTN3Q9P232 MAPKAPK5-AS1-201ENST00000428207 2290 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
CNTN3Q9P232 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
CNTN3Q9P232 GGA2-211ENST00000567468 1713 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
CNTN3Q9P232 HAUS3-202ENST00000443786 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
CNTN3Q9P232 KCNK13-201ENST00000282146 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
CNTN3Q9P232 MLLT10-204ENST00000377091 905 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
CNTN3Q9P232 AC018553.2-201ENST00000637770 1064 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
CNTN3Q9P232 ZNF37BP-201ENST00000435805 1695 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
CNTN3Q9P232 PACRGL-227ENST00000513459 1773 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
CNTN3Q9P232 B4GALNT1-202ENST00000418555 1861 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
CNTN3Q9P232 MIR210HG-201ENST00000500447 1965 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
CNTN3Q9P232 DUX4-203ENST00000565211 1710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
CNTN3Q9P232 RALGPS1-207ENST00000394022 1672 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
CNTN3Q9P232 RIOX1-201ENST00000304061 2429 ntAPPRIS P1 BASIC23.07■■□□□ 1.28
CNTN3Q9P232 GAS2L1P2-201ENST00000436355 1356 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
CNTN3Q9P232 SMPD5-201ENST00000528912 1390 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
CNTN3Q9P232 IZUMO4-203ENST00000395307 944 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
CNTN3Q9P232 SERP1-208ENST00000491660 830 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
CNTN3Q9P232 EEF1DP3-203ENST00000566025 782 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
CNTN3Q9P232 FAM71E1-204ENST00000600100 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
CNTN3Q9P232 CAMKK2-208ENST00000412367 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
CNTN3Q9P232 RNF180-201ENST00000296615 1727 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
CNTN3Q9P232 RBM38-203ENST00000356208 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
CNTN3Q9P232 SNHG7-201ENST00000414282 2357 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
CNTN3Q9P232 NOC4L-201ENST00000330579 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
CNTN3Q9P232 ADRM1-204ENST00000491935 1530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
CNTN3Q9P232 RDX-204ENST00000528498 2511 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
CNTN3Q9P232 AFDN-AS1-201ENST00000359760 2238 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
CNTN3Q9P232 PACRGL-208ENST00000503585 1582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
CNTN3Q9P232 CDR2-201ENST00000268383 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
CNTN3Q9P232 GPRC5B-210ENST00000569847 1830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.7 ms