Protein–RNA interactions for Protein: Q9NZU5

LMCD1, LIM and cysteine-rich domains protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 365 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LMCD1Q9NZU5 EFCAB6-202ENST00000356087 1129 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
LMCD1Q9NZU5 ESRRAP1-201ENST00000400596 1257 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
LMCD1Q9NZU5 AC093833.1-201ENST00000442821 553 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
LMCD1Q9NZU5 AC009086.2-201ENST00000449759 610 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.96■■□□□ 1.27
LMCD1Q9NZU5 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
LMCD1Q9NZU5 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
LMCD1Q9NZU5 PDIA2-201ENST00000219406 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
LMCD1Q9NZU5 GCC2-AS1-201ENST00000322353 558 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
LMCD1Q9NZU5 LINC01191-201ENST00000412690 844 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
LMCD1Q9NZU5 PLAGL1-207ENST00000417959 1645 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
LMCD1Q9NZU5 CYP2T1P-201ENST00000432607 1285 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
LMCD1Q9NZU5 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
LMCD1Q9NZU5 SNX24-211ENST00000513881 1563 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
LMCD1Q9NZU5 AL390816.2-201ENST00000554252 737 ntTSL 3 BASIC22.95■■□□□ 1.26
LMCD1Q9NZU5 MIR222HG-201ENST00000602461 1379 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
LMCD1Q9NZU5 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
LMCD1Q9NZU5 OLIG2-202ENST00000382357 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
LMCD1Q9NZU5 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
LMCD1Q9NZU5 VDAC1-203ENST00000395047 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
LMCD1Q9NZU5 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
LMCD1Q9NZU5 TMEM230-205ENST00000379279 1636 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
LMCD1Q9NZU5 GPR137-201ENST00000313074 1485 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
LMCD1Q9NZU5 GPR137-203ENST00000411458 1495 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
LMCD1Q9NZU5 GNB2-209ENST00000436220 1479 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
LMCD1Q9NZU5 AC055733.4-201ENST00000638462 1354 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
LMCD1Q9NZU5 MMP23B-202ENST00000378675 1309 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
LMCD1Q9NZU5 CALML5-201ENST00000380332 859 ntAPPRIS P1 BASIC22.94■■□□□ 1.26
LMCD1Q9NZU5 AL391244.2-201ENST00000428932 543 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
LMCD1Q9NZU5 LTB-210ENST00000429299 897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
LMCD1Q9NZU5 COL19A1-203ENST00000478620 589 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
LMCD1Q9NZU5 AC142381.4-202ENST00000563973 229 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
LMCD1Q9NZU5 AC100835.1-201ENST00000565737 498 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
LMCD1Q9NZU5 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
LMCD1Q9NZU5 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
LMCD1Q9NZU5 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
LMCD1Q9NZU5 PDLIM3-203ENST00000284771 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
LMCD1Q9NZU5 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
LMCD1Q9NZU5 BIN1-202ENST00000316724 2693 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
LMCD1Q9NZU5 RARRES2-201ENST00000223271 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
LMCD1Q9NZU5 INTS11-205ENST00000429572 1104 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
LMCD1Q9NZU5 CTBP1-AS2-203ENST00000507044 739 ntTSL 3 BASIC22.93■■□□□ 1.26
LMCD1Q9NZU5 C14orf28-204ENST00000557112 1097 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
LMCD1Q9NZU5 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
LMCD1Q9NZU5 REPS2-202ENST00000357277 7953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
LMCD1Q9NZU5 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
LMCD1Q9NZU5 U2AF2-202ENST00000450554 3022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
LMCD1Q9NZU5 AUTS2-203ENST00000406775 5950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
LMCD1Q9NZU5 SOS2-201ENST00000216373 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
LMCD1Q9NZU5 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
LMCD1Q9NZU5 ODC1-201ENST00000234111 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
LMCD1Q9NZU5 PRR7-202ENST00000502922 1345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
LMCD1Q9NZU5 FAM102B-201ENST00000370035 5600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
LMCD1Q9NZU5 OIP5-201ENST00000220514 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
LMCD1Q9NZU5 SEC61A2-206ENST00000379051 707 ntTSL 3 BASIC22.92■■□□□ 1.26
LMCD1Q9NZU5 ZCCHC9-204ENST00000438268 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
LMCD1Q9NZU5 ZPBP-201ENST00000046087 1213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
LMCD1Q9NZU5 AC097658.1-201ENST00000475555 843 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
LMCD1Q9NZU5 PHB2-213ENST00000546111 858 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
LMCD1Q9NZU5 PTGIR-205ENST00000597185 775 ntTSL 3 BASIC22.92■■□□□ 1.26
LMCD1Q9NZU5 AL136982.7-201ENST00000609363 465 ntTSL 4 BASIC22.92■■□□□ 1.26
LMCD1Q9NZU5 AC008694.1-202ENST00000636953 945 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
LMCD1Q9NZU5 MYC-209ENST00000641252 345 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
LMCD1Q9NZU5 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
LMCD1Q9NZU5 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
LMCD1Q9NZU5 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
LMCD1Q9NZU5 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
LMCD1Q9NZU5 KCNT1-201ENST00000263604 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
LMCD1Q9NZU5 SLC35A2-202ENST00000376512 903 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
LMCD1Q9NZU5 BMP1-204ENST00000397814 836 ntTSL 4 BASIC22.91■■□□□ 1.26
LMCD1Q9NZU5 UQCRFS1P1-201ENST00000435169 820 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
LMCD1Q9NZU5 CASP6-205ENST00000505486 538 ntTSL 4 BASIC22.91■■□□□ 1.26
LMCD1Q9NZU5 ZNF324-202ENST00000535298 1006 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
LMCD1Q9NZU5 AC044860.1-201ENST00000560756 1160 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
LMCD1Q9NZU5 MCRIP1-204ENST00000570507 765 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
LMCD1Q9NZU5 MCRIP1-208ENST00000575061 618 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
LMCD1Q9NZU5 MTURN-201ENST00000324453 5937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
LMCD1Q9NZU5 ZC3H14-219ENST00000556945 2075 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
LMCD1Q9NZU5 CTDSP2-204ENST00000548823 1368 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
LMCD1Q9NZU5 MREG-201ENST00000263268 1314 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
LMCD1Q9NZU5 MFSD7-209ENST00000515118 1556 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
LMCD1Q9NZU5 DNPH1-202ENST00000393987 796 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
LMCD1Q9NZU5 YBEY-204ENST00000397692 433 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
LMCD1Q9NZU5 HOXD12-201ENST00000404162 841 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
LMCD1Q9NZU5 AC007285.1-201ENST00000422239 893 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
LMCD1Q9NZU5 AP000697.1-201ENST00000430607 339 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
LMCD1Q9NZU5 AL158047.1-201ENST00000445918 881 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
LMCD1Q9NZU5 DHRS4L2-204ENST00000537912 918 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
LMCD1Q9NZU5 AC138028.5-201ENST00000566114 558 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
LMCD1Q9NZU5 Z92544.1-201ENST00000567091 730 ntTSL 3 BASIC22.9■■□□□ 1.26
LMCD1Q9NZU5 AC069236.1-201ENST00000604339 616 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
LMCD1Q9NZU5 RAB3A-201ENST00000222256 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
LMCD1Q9NZU5 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC22.9■■□□□ 1.26
LMCD1Q9NZU5 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
LMCD1Q9NZU5 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
LMCD1Q9NZU5 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
LMCD1Q9NZU5 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
LMCD1Q9NZU5 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
LMCD1Q9NZU5 AC079630.1-202ENST00000618127 1840 ntBASIC22.89■■□□□ 1.26
LMCD1Q9NZU5 CCDC74A-201ENST00000295171 1543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
LMCD1Q9NZU5 CCDC74B-201ENST00000310463 1549 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34 ms