Protein–RNA interactions for Protein: Q9NZN3

EHD3, EH domain-containing protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 535 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EHD3Q9NZN3 LHFPL3-202ENST00000424859 1852 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
EHD3Q9NZN3 BASP1-203ENST00000616743 1711 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.38■□□□□ 0.85
EHD3Q9NZN3 TRIP13-201ENST00000166345 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
EHD3Q9NZN3 HMBS-201ENST00000278715 1501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
EHD3Q9NZN3 BRWD1-202ENST00000341322 2495 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
EHD3Q9NZN3 TRIM14-202ENST00000342043 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
EHD3Q9NZN3 TMEM25-205ENST00000411589 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
EHD3Q9NZN3 DNAJB11-202ENST00000439351 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
EHD3Q9NZN3 LLGL2-202ENST00000375227 1374 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
EHD3Q9NZN3 PDK3-201ENST00000379162 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
EHD3Q9NZN3 TMEM51-203ENST00000400796 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
EHD3Q9NZN3 SKI-201ENST00000378536 5613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
EHD3Q9NZN3 CCDC115-202ENST00000409127 1247 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
EHD3Q9NZN3 CKLF-205ENST00000417030 628 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC20.37■□□□□ 0.85
EHD3Q9NZN3 AL355987.3-201ENST00000456614 735 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20.37■□□□□ 0.85
EHD3Q9NZN3 AC061979.1-201ENST00000532061 434 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
EHD3Q9NZN3 AL359317.1-201ENST00000556316 578 ntTSL 4 BASIC20.37■□□□□ 0.85
EHD3Q9NZN3 PPP1R14A-204ENST00000591291 433 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
EHD3Q9NZN3 AC106739.1-201ENST00000617035 715 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
EHD3Q9NZN3 LONP1-203ENST00000585374 2882 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
EHD3Q9NZN3 FAM99A-202ENST00000538190 1989 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
EHD3Q9NZN3 TNFAIP2-209ENST00000560869 4683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
EHD3Q9NZN3 SMG7-AS1-201ENST00000421703 2220 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
EHD3Q9NZN3 PSPH-202ENST00000395471 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
EHD3Q9NZN3 PLEKHA8-203ENST00000396259 2840 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
EHD3Q9NZN3 ZNF784-201ENST00000325351 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
EHD3Q9NZN3 MIR210HG-201ENST00000500447 1965 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
EHD3Q9NZN3 D2HGDH-201ENST00000321264 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
EHD3Q9NZN3 CHST7-201ENST00000276055 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
EHD3Q9NZN3 SLC26A1-203ENST00000398520 1111 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
EHD3Q9NZN3 AL034346.1-201ENST00000568244 1277 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
EHD3Q9NZN3 B4GALNT1-202ENST00000418555 1861 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
EHD3Q9NZN3 PHLDB2-210ENST00000478922 1861 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
EHD3Q9NZN3 MFSD6L-201ENST00000329805 2188 ntAPPRIS P1 BASIC20.36■□□□□ 0.85
EHD3Q9NZN3 ACP1-201ENST00000272065 1549 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
EHD3Q9NZN3 COL15A1-201ENST00000375001 5496 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
EHD3Q9NZN3 LINC01140-202ENST00000467438 2375 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
EHD3Q9NZN3 B4GAT1-201ENST00000311181 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
EHD3Q9NZN3 SMURF1-202ENST00000361368 5581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
EHD3Q9NZN3 TMEFF1-201ENST00000374879 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
EHD3Q9NZN3 KIAA0895-204ENST00000415803 2865 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
EHD3Q9NZN3 SPAST-204ENST00000621856 1715 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
EHD3Q9NZN3 NPAS3-210ENST00000551492 2817 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
EHD3Q9NZN3 IKBKG-212ENST00000617207 1949 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC20.35■□□□□ 0.85
EHD3Q9NZN3 RAPH1-210ENST00000453034 2394 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
EHD3Q9NZN3 ZDHHC16-205ENST00000370846 1280 ntTSL 3 BASIC20.35■□□□□ 0.85
EHD3Q9NZN3 AC068580.1-201ENST00000446489 252 ntTSL 3 BASIC20.35■□□□□ 0.85
EHD3Q9NZN3 CREB3L2-203ENST00000452463 1105 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
EHD3Q9NZN3 AC133561.4-201ENST00000566112 224 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
EHD3Q9NZN3 GOLGA2P6-201ENST00000340929 2049 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
EHD3Q9NZN3 SPAG16-202ENST00000331683 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
EHD3Q9NZN3 SMUG1-215ENST00000508394 1697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
EHD3Q9NZN3 CPNE2-201ENST00000290776 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
EHD3Q9NZN3 XPA-201ENST00000375128 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
EHD3Q9NZN3 SH2B1-204ENST00000395532 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
EHD3Q9NZN3 PRSS22-201ENST00000161006 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
EHD3Q9NZN3 ING1-201ENST00000333219 5119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
EHD3Q9NZN3 ANKRD13D-202ENST00000447274 2881 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
EHD3Q9NZN3 PRR16-202ENST00000407149 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
EHD3Q9NZN3 EDA-201ENST00000338901 1233 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
EHD3Q9NZN3 POLR2F-203ENST00000407936 582 ntTSL 3 BASIC20.34■□□□□ 0.85
EHD3Q9NZN3 POLR2F-207ENST00000460648 518 ntTSL 4 BASIC20.34■□□□□ 0.85
EHD3Q9NZN3 SCO2-204ENST00000543927 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
EHD3Q9NZN3 HRH3-203ENST00000611492 900 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
EHD3Q9NZN3 MPST-208ENST00000628507 698 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
EHD3Q9NZN3 BAG1-212ENST00000641048 1038 ntAPPRIS P3 BASIC20.34■□□□□ 0.85
EHD3Q9NZN3 AKR7A2-201ENST00000235835 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
EHD3Q9NZN3 MANEAL-203ENST00000397631 2327 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
EHD3Q9NZN3 RNF166-202ENST00000537718 1525 ntTSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
EHD3Q9NZN3 CNTFR-202ENST00000378980 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
EHD3Q9NZN3 IRX2-202ENST00000382611 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
EHD3Q9NZN3 GCH1-206ENST00000543643 1897 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
EHD3Q9NZN3 CNNM1-201ENST00000356713 5959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
EHD3Q9NZN3 AZIN2-204ENST00000373443 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
EHD3Q9NZN3 MRPL41-201ENST00000371443 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
EHD3Q9NZN3 AP006621.1-201ENST00000532946 536 ntTSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
EHD3Q9NZN3 SSPN-204ENST00000535504 419 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
EHD3Q9NZN3 AC093249.6-202ENST00000568500 1142 ntTSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
EHD3Q9NZN3 MEF2A-207ENST00000558812 2186 ntTSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
EHD3Q9NZN3 EIF2B4-211ENST00000616081 1754 ntTSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.84
EHD3Q9NZN3 FAM19A5-202ENST00000358295 2638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.84
EHD3Q9NZN3 MAP7D1-201ENST00000316156 3456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
EHD3Q9NZN3 PGRMC2-201ENST00000296425 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
EHD3Q9NZN3 SAV1-201ENST00000324679 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
EHD3Q9NZN3 ALDH6A1-201ENST00000350259 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.84
EHD3Q9NZN3 LINC02175-201ENST00000571219 1875 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
EHD3Q9NZN3 CHRAC1-203ENST00000519533 1678 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
EHD3Q9NZN3 PTPRJ-208ENST00000615445 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
EHD3Q9NZN3 MRPL37-202ENST00000360840 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
EHD3Q9NZN3 GPR27-201ENST00000304411 2447 ntAPPRIS P1 BASIC20.32■□□□□ 0.84
EHD3Q9NZN3 ILDR2-206ENST00000528703 2446 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
EHD3Q9NZN3 DTX4-201ENST00000227451 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
EHD3Q9NZN3 C20orf144-201ENST00000375222 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
EHD3Q9NZN3 CAMTA1-208ENST00000473578 567 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
EHD3Q9NZN3 IGHV3-19-201ENST00000521488 291 ntBASIC20.32■□□□□ 0.84
EHD3Q9NZN3 AICDA-202ENST00000537228 667 ntTSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
EHD3Q9NZN3 AC027682.1-201ENST00000562846 899 ntBASIC20.32■□□□□ 0.84
EHD3Q9NZN3 HOMER3-206ENST00000594439 982 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
EHD3Q9NZN3 MYDGF-203ENST00000599630 713 ntTSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
EHD3Q9NZN3 GRAMD4P4-201ENST00000613563 1115 ntBASIC20.32■□□□□ 0.84
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.4 ms