Protein–RNA interactions for Protein: Q9NYG2

ZDHHC3, Palmitoyltransferase ZDHHC3, humanhuman

Predictions only

Length 299 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZDHHC3Q9NYG2 REXO1-201ENST00000170168 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
ZDHHC3Q9NYG2 SYNGR2-203ENST00000588282 1553 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
ZDHHC3Q9NYG2 CCDC160-201ENST00000370809 1299 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
ZDHHC3Q9NYG2 TPRG1LP1-201ENST00000598702 760 ntBASIC21.19■□□□□ 0.98
ZDHHC3Q9NYG2 BRWD1-202ENST00000341322 2495 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
ZDHHC3Q9NYG2 HOXA10-201ENST00000283921 2541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
ZDHHC3Q9NYG2 C2orf72-201ENST00000373640 3657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
ZDHHC3Q9NYG2 RBBP7-202ENST00000380084 2036 ntTSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
ZDHHC3Q9NYG2 FOXJ1-201ENST00000322957 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
ZDHHC3Q9NYG2 NARF-202ENST00000345415 1487 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
ZDHHC3Q9NYG2 ZNF707-222ENST00000532158 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
ZDHHC3Q9NYG2 KHDRBS2-201ENST00000281156 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
ZDHHC3Q9NYG2 MANEAL-203ENST00000397631 2327 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
ZDHHC3Q9NYG2 AC026471.6-201ENST00000622954 1905 ntBASIC21.18■□□□□ 0.98
ZDHHC3Q9NYG2 SLC12A5-AS1-202ENST00000535913 1957 ntTSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
ZDHHC3Q9NYG2 GPSM1-201ENST00000291775 2114 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
ZDHHC3Q9NYG2 CRB3-202ENST00000356762 733 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
ZDHHC3Q9NYG2 NUDT14-202ENST00000392568 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
ZDHHC3Q9NYG2 CDKN2AIPNL-201ENST00000395009 800 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
ZDHHC3Q9NYG2 PPM1N-207ENST00000451287 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
ZDHHC3Q9NYG2 AC135048.1-201ENST00000566056 1318 ntTSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
ZDHHC3Q9NYG2 RAB24-202ENST00000303270 1385 ntTSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
ZDHHC3Q9NYG2 ZFAND6-224ENST00000618205 1659 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
ZDHHC3Q9NYG2 ACAA1-202ENST00000333167 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
ZDHHC3Q9NYG2 DISC1-205ENST00000366636 2224 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
ZDHHC3Q9NYG2 PAXBP1-201ENST00000290178 2564 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
ZDHHC3Q9NYG2 LINC00472-204ENST00000436803 667 ntTSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
ZDHHC3Q9NYG2 AC116614.1-201ENST00000456949 539 ntTSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
ZDHHC3Q9NYG2 SDR39U1-208ENST00000554698 1364 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
ZDHHC3Q9NYG2 AC055733.4-201ENST00000638462 1354 ntBASIC21.17■□□□□ 0.98
ZDHHC3Q9NYG2 ZDHHC7-203ENST00000564466 1488 ntTSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
ZDHHC3Q9NYG2 NDUFB2-212ENST00000476279 1666 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
ZDHHC3Q9NYG2 OXCT2-201ENST00000327582 1826 ntAPPRIS P1 BASIC21.17■□□□□ 0.98
ZDHHC3Q9NYG2 ACVRL1-201ENST00000388922 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
ZDHHC3Q9NYG2 FAM72A-202ENST00000367128 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
ZDHHC3Q9NYG2 FAM72D-201ENST00000400889 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
ZDHHC3Q9NYG2 CADPS-219ENST00000612439 5455 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
ZDHHC3Q9NYG2 TRIM54-202ENST00000380075 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
ZDHHC3Q9NYG2 CTU2-202ENST00000453996 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
ZDHHC3Q9NYG2 ACSL1-205ENST00000504900 1583 ntTSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
ZDHHC3Q9NYG2 HBM-201ENST00000356815 506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
ZDHHC3Q9NYG2 AC127029.2-201ENST00000577329 502 ntTSL 3 BASIC21.16■□□□□ 0.98
ZDHHC3Q9NYG2 SP2-202ENST00000613139 908 ntTSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
ZDHHC3Q9NYG2 FAM19A5-202ENST00000358295 2638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
ZDHHC3Q9NYG2 PDIA6-207ENST00000540494 2509 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
ZDHHC3Q9NYG2 RHOT1-205ENST00000545287 2516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
ZDHHC3Q9NYG2 RNF149-201ENST00000295317 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
ZDHHC3Q9NYG2 LAMP5-AS1-201ENST00000443469 1928 ntTSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
ZDHHC3Q9NYG2 SLC25A42-201ENST00000318596 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
ZDHHC3Q9NYG2 NAA35-202ENST00000376040 1797 ntTSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
ZDHHC3Q9NYG2 SPRTN-201ENST00000008440 1667 ntTSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
ZDHHC3Q9NYG2 MRGBP-201ENST00000370487 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
ZDHHC3Q9NYG2 ELOA3B-201ENST00000611323 1641 ntAPPRIS P1 BASIC21.15■□□□□ 0.98
ZDHHC3Q9NYG2 ELOA3D-201ENST00000620881 1641 ntAPPRIS P1 BASIC21.15■□□□□ 0.98
ZDHHC3Q9NYG2 HMCES-203ENST00000417226 1490 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
ZDHHC3Q9NYG2 NRG3-201ENST00000372141 2158 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
ZDHHC3Q9NYG2 PPP3CC-202ENST00000289963 2135 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
ZDHHC3Q9NYG2 AC011446.1-201ENST00000591825 458 ntTSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
ZDHHC3Q9NYG2 ACBD4-216ENST00000619916 1276 ntTSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
ZDHHC3Q9NYG2 NEIL1-206ENST00000564784 2019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
ZDHHC3Q9NYG2 SPHK1-202ENST00000392496 1779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
ZDHHC3Q9NYG2 RASL12-202ENST00000421977 1523 ntTSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.98
ZDHHC3Q9NYG2 NOXA1-202ENST00000392815 1464 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
ZDHHC3Q9NYG2 GOLGA2P6-201ENST00000340929 2049 ntBASIC21.14■□□□□ 0.98
ZDHHC3Q9NYG2 BCS1L-210ENST00000431802 2015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.98
ZDHHC3Q9NYG2 AKT2-210ENST00000424901 5170 ntTSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
ZDHHC3Q9NYG2 PPCS-202ENST00000372560 793 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
ZDHHC3Q9NYG2 AC123595.1-201ENST00000440769 1046 ntBASIC21.14■□□□□ 0.97
ZDHHC3Q9NYG2 YBX1P1-201ENST00000445822 960 ntBASIC21.14■□□□□ 0.97
ZDHHC3Q9NYG2 ELANE-202ENST00000590230 1028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
ZDHHC3Q9NYG2 MEIS3-202ENST00000441740 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
ZDHHC3Q9NYG2 EIF2B4-211ENST00000616081 1754 ntTSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
ZDHHC3Q9NYG2 PFKFB3-216ENST00000625260 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
ZDHHC3Q9NYG2 GGA2-211ENST00000567468 1713 ntTSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
ZDHHC3Q9NYG2 IRX2-202ENST00000382611 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
ZDHHC3Q9NYG2 CCDC106-207ENST00000591578 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
ZDHHC3Q9NYG2 ARMC6-201ENST00000269932 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
ZDHHC3Q9NYG2 PGRMC2-201ENST00000296425 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
ZDHHC3Q9NYG2 LINC00565-201ENST00000562710 2331 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
ZDHHC3Q9NYG2 NFKBIL1-203ENST00000376148 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
ZDHHC3Q9NYG2 NFIX-203ENST00000397661 3143 ntTSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
ZDHHC3Q9NYG2 SH2D3A-201ENST00000245908 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
ZDHHC3Q9NYG2 SKIDA1-201ENST00000444772 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
ZDHHC3Q9NYG2 AC079328.2-202ENST00000560903 1410 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
ZDHHC3Q9NYG2 CALM1-202ENST00000447653 1104 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
ZDHHC3Q9NYG2 BCAP29-209ENST00000465919 942 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
ZDHHC3Q9NYG2 ARHGAP24-206ENST00000503995 1273 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
ZDHHC3Q9NYG2 C1QTNF5-203ENST00000530681 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
ZDHHC3Q9NYG2 ORAI3-202ENST00000562699 628 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
ZDHHC3Q9NYG2 ILDR2-205ENST00000526687 2299 ntTSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
ZDHHC3Q9NYG2 AC010542.4-201ENST00000563151 1910 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
ZDHHC3Q9NYG2 AC073188.6-202ENST00000616616 2281 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
ZDHHC3Q9NYG2 P4HA3-202ENST00000427714 2248 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
ZDHHC3Q9NYG2 LRP5L-203ENST00000444995 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
ZDHHC3Q9NYG2 GPR35-204ENST00000430267 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
ZDHHC3Q9NYG2 LINC02228-203ENST00000641970 1355 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
ZDHHC3Q9NYG2 DCTD-201ENST00000357067 1931 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
ZDHHC3Q9NYG2 MRPL14-201ENST00000372014 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
ZDHHC3Q9NYG2 LTC4S-202ENST00000401985 486 ntTSL 3 BASIC21.12■□□□□ 0.97
ZDHHC3Q9NYG2 SDHAP3-201ENST00000436493 736 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.2 ms