Protein–RNA interactions for Protein: Q9NY91

SLC5A4, Solute carrier family 5 member 4, humanhuman

Predictions only

Length 659 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC5A4Q9NY91 LIMD2-202ENST00000578061 756 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
SLC5A4Q9NY91 ELAC1-204ENST00000591429 975 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
SLC5A4Q9NY91 ZNF213-208ENST00000576416 2240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
SLC5A4Q9NY91 IGSF21-201ENST00000251296 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
SLC5A4Q9NY91 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC24.39■■□□□ 1.49
SLC5A4Q9NY91 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
SLC5A4Q9NY91 FNTA-208ENST00000529687 1950 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
SLC5A4Q9NY91 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
SLC5A4Q9NY91 AC034102.6-201ENST00000550947 559 ntTSL 4 BASIC24.38■■□□□ 1.49
SLC5A4Q9NY91 NDUFB10-204ENST00000569148 628 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
SLC5A4Q9NY91 AC053503.5-201ENST00000601508 636 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
SLC5A4Q9NY91 CASTOR1-201ENST00000404953 1460 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
SLC5A4Q9NY91 ADAM22-209ENST00000439864 2576 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
SLC5A4Q9NY91 SIX3-201ENST00000260653 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
SLC5A4Q9NY91 CACNB1-201ENST00000344140 1889 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
SLC5A4Q9NY91 MED10-201ENST00000255764 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
SLC5A4Q9NY91 MGST3-205ENST00000367889 1015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
SLC5A4Q9NY91 RAMP1-202ENST00000403885 650 ntTSL 3 BASIC24.37■■□□□ 1.49
SLC5A4Q9NY91 FADS3-204ENST00000525588 1254 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
SLC5A4Q9NY91 EEF1DP3-203ENST00000566025 782 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
SLC5A4Q9NY91 CIRBP-214ENST00000587896 1081 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
SLC5A4Q9NY91 TNNI3-207ENST00000588882 669 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
SLC5A4Q9NY91 PET100-202ENST00000594797 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
SLC5A4Q9NY91 AL136982.7-201ENST00000609363 465 ntTSL 4 BASIC24.37■■□□□ 1.49
SLC5A4Q9NY91 AC066615.1-201ENST00000640911 628 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
SLC5A4Q9NY91 C22orf34-203ENST00000405854 1593 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
SLC5A4Q9NY91 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
SLC5A4Q9NY91 NPY4R-201ENST00000374312 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
SLC5A4Q9NY91 NPY4R2-201ENST00000576178 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
SLC5A4Q9NY91 ECHDC2-221ENST00000536120 1446 ntTSL 3 BASIC24.36■■□□□ 1.49
SLC5A4Q9NY91 PLAGL1-207ENST00000417959 1645 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
SLC5A4Q9NY91 COA6-202ENST00000366613 641 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
SLC5A4Q9NY91 CYB5R4-201ENST00000369679 768 ntTSL 3 BASIC24.36■■□□□ 1.49
SLC5A4Q9NY91 MCHR1-202ENST00000381433 1219 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
SLC5A4Q9NY91 AP000282.1-201ENST00000454622 682 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
SLC5A4Q9NY91 F2RL3-202ENST00000599210 613 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
SLC5A4Q9NY91 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
SLC5A4Q9NY91 KLHDC9-201ENST00000368011 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
SLC5A4Q9NY91 C12orf42-208ENST00000548883 1336 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
SLC5A4Q9NY91 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
SLC5A4Q9NY91 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
SLC5A4Q9NY91 IFNGR2-203ENST00000405436 1684 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
SLC5A4Q9NY91 CENPN-201ENST00000299572 1398 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
SLC5A4Q9NY91 ZNF148-203ENST00000468369 1025 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
SLC5A4Q9NY91 C17orf107-202ENST00000521575 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
SLC5A4Q9NY91 C12orf43-208ENST00000539736 1033 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
SLC5A4Q9NY91 MYO19-221ENST00000620640 1186 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
SLC5A4Q9NY91 TBCB-214ENST00000629269 413 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
SLC5A4Q9NY91 PGF-206ENST00000555567 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
SLC5A4Q9NY91 SLC22A31-201ENST00000562855 1909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
SLC5A4Q9NY91 CCDC74A-201ENST00000295171 1543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
SLC5A4Q9NY91 CCDC74B-201ENST00000310463 1549 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
SLC5A4Q9NY91 DOC2A-218ENST00000616445 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
SLC5A4Q9NY91 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
SLC5A4Q9NY91 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
SLC5A4Q9NY91 B3GALNT2-202ENST00000366600 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
SLC5A4Q9NY91 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
SLC5A4Q9NY91 SPINT2-202ENST00000454580 1367 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
SLC5A4Q9NY91 CPED1-202ENST00000340646 1056 ntTSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
SLC5A4Q9NY91 AC007322.4-201ENST00000509611 723 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
SLC5A4Q9NY91 AC027451.1-201ENST00000530667 553 ntTSL 4 BASIC24.34■■□□□ 1.49
SLC5A4Q9NY91 DDN-AS1-201ENST00000547395 858 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
SLC5A4Q9NY91 AC120498.10-201ENST00000621827 505 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
SLC5A4Q9NY91 AC008694.1-202ENST00000636953 945 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
SLC5A4Q9NY91 NOC4L-201ENST00000330579 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
SLC5A4Q9NY91 TRABD2A-203ENST00000409520 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
SLC5A4Q9NY91 HOMER3-204ENST00000539827 1979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
SLC5A4Q9NY91 ATG101-201ENST00000336854 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
SLC5A4Q9NY91 SLC41A3-201ENST00000315891 1797 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
SLC5A4Q9NY91 NAA10-208ENST00000464845 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
SLC5A4Q9NY91 DTYMK-201ENST00000305784 1232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
SLC5A4Q9NY91 CUEDC2-201ENST00000369937 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
SLC5A4Q9NY91 FDX2-202ENST00000393708 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
SLC5A4Q9NY91 LINC02531-201ENST00000404689 593 ntTSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
SLC5A4Q9NY91 RPL29-204ENST00000479017 670 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.33■■□□□ 1.49
SLC5A4Q9NY91 BEX2-204ENST00000536889 1077 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
SLC5A4Q9NY91 AP005205.2-201ENST00000577327 491 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
SLC5A4Q9NY91 OR10C1-204ENST00000622521 1039 ntBASIC24.33■■□□□ 1.49
SLC5A4Q9NY91 RNF166-202ENST00000537718 1525 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
SLC5A4Q9NY91 ZBTB42-202ENST00000555360 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
SLC5A4Q9NY91 AGAP3-201ENST00000335367 2675 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
SLC5A4Q9NY91 MRPL37-206ENST00000605337 1582 ntTSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.48
SLC5A4Q9NY91 PRR16-202ENST00000407149 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
SLC5A4Q9NY91 TYMP-202ENST00000395678 1614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
SLC5A4Q9NY91 GRTP1-203ENST00000375431 1384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
SLC5A4Q9NY91 RWDD4-206ENST00000512740 1393 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
SLC5A4Q9NY91 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
SLC5A4Q9NY91 C3orf80-201ENST00000326474 2718 ntAPPRIS P1 BASIC24.32■■□□□ 1.48
SLC5A4Q9NY91 ZNF644-203ENST00000361321 1253 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
SLC5A4Q9NY91 MANBAL-202ENST00000373606 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
SLC5A4Q9NY91 ZNF295-AS1-201ENST00000412906 952 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
SLC5A4Q9NY91 MIR4651-201ENST00000582622 73 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
SLC5A4Q9NY91 CIRBP-211ENST00000586773 942 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
SLC5A4Q9NY91 ALDH3A2-224ENST00000626500 995 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
SLC5A4Q9NY91 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
SLC5A4Q9NY91 AC068338.2-201ENST00000563278 1430 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
SLC5A4Q9NY91 UBE2E3-201ENST00000392415 1347 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.32■■□□□ 1.48
SLC5A4Q9NY91 MEIOB-202ENST00000397344 1792 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
SLC5A4Q9NY91 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
SLC5A4Q9NY91 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.3 ms