Protein–RNA interactions for Protein: Q9NXJ5

PGPEP1, Pyroglutamyl-peptidase 1, humanhuman

Predictions only

Length 209 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PGPEP1Q9NXJ5 ARMC9-201ENST00000349938 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
PGPEP1Q9NXJ5 RAP2C-202ENST00000370874 2333 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.03
PGPEP1Q9NXJ5 NUDT10-201ENST00000356450 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
PGPEP1Q9NXJ5 GPR157-201ENST00000377411 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
PGPEP1Q9NXJ5 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
PGPEP1Q9NXJ5 FLT1-204ENST00000541932 2969 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
PGPEP1Q9NXJ5 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
PGPEP1Q9NXJ5 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.03
PGPEP1Q9NXJ5 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
PGPEP1Q9NXJ5 CACTIN-202ENST00000248420 2671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
PGPEP1Q9NXJ5 MAP7-206ENST00000611373 2317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
PGPEP1Q9NXJ5 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
PGPEP1Q9NXJ5 PLCB2-204ENST00000557821 4517 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
PGPEP1Q9NXJ5 AGAP3-202ENST00000397238 3225 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
PGPEP1Q9NXJ5 TMEM161A-202ENST00000450333 1930 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
PGPEP1Q9NXJ5 TNFRSF25-201ENST00000348333 1119 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
PGPEP1Q9NXJ5 TNFRSF25-202ENST00000351748 705 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
PGPEP1Q9NXJ5 AL357078.1-201ENST00000448344 310 ntTSL 4 BASIC15.26■□□□□ 0.03
PGPEP1Q9NXJ5 ZNF584-205ENST00000596281 575 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
PGPEP1Q9NXJ5 AC110285.6-201ENST00000617652 491 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
PGPEP1Q9NXJ5 GPX4-213ENST00000622390 1002 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
PGPEP1Q9NXJ5 AP001002.2-201ENST00000625137 386 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
PGPEP1Q9NXJ5 SAMD10-201ENST00000369886 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
PGPEP1Q9NXJ5 CRTC1-203ENST00000594658 2384 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
PGPEP1Q9NXJ5 PRKCI-201ENST00000295797 4950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
PGPEP1Q9NXJ5 KCNS2-201ENST00000287042 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
PGPEP1Q9NXJ5 SPATA5L1-201ENST00000305560 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
PGPEP1Q9NXJ5 INSM1-201ENST00000310227 2829 ntAPPRIS P1 BASIC15.25■□□□□ 0.03
PGPEP1Q9NXJ5 DLG3-202ENST00000374355 5074 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
PGPEP1Q9NXJ5 TMEM132A-202ENST00000453848 3346 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
PGPEP1Q9NXJ5 BCKDK-202ENST00000287507 1907 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
PGPEP1Q9NXJ5 EYA2-202ENST00000327619 2702 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
PGPEP1Q9NXJ5 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
PGPEP1Q9NXJ5 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
PGPEP1Q9NXJ5 TLE3-201ENST00000317509 5207 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
PGPEP1Q9NXJ5 TBL1Y-201ENST00000346432 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
PGPEP1Q9NXJ5 SURF2-201ENST00000371964 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
PGPEP1Q9NXJ5 CDKN2A-208ENST00000498124 880 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
PGPEP1Q9NXJ5 CHTF8-208ENST00000522091 863 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
PGPEP1Q9NXJ5 MIR4466-201ENST00000606121 54 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
PGPEP1Q9NXJ5 AC006213.4-201ENST00000616184 634 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
PGPEP1Q9NXJ5 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
PGPEP1Q9NXJ5 FADS6-204ENST00000614223 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
PGPEP1Q9NXJ5 HGNC:18790-203ENST00000433139 2254 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
PGPEP1Q9NXJ5 TFG-201ENST00000240851 1978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
PGPEP1Q9NXJ5 GRK4-206ENST00000504933 1971 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
PGPEP1Q9NXJ5 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
PGPEP1Q9NXJ5 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
PGPEP1Q9NXJ5 AC005906.2-202ENST00000638821 2168 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
PGPEP1Q9NXJ5 CAPN1-226ENST00000533820 3083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
PGPEP1Q9NXJ5 CNTFR-202ENST00000378980 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
PGPEP1Q9NXJ5 ZNF707-202ENST00000418203 2661 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
PGPEP1Q9NXJ5 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
PGPEP1Q9NXJ5 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
PGPEP1Q9NXJ5 MARK2-202ENST00000361128 3004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
PGPEP1Q9NXJ5 SMARCD1-201ENST00000381513 3237 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
PGPEP1Q9NXJ5 SUSD2-201ENST00000358321 3404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
PGPEP1Q9NXJ5 KCNQ4-204ENST00000509682 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
PGPEP1Q9NXJ5 HEBP2-204ENST00000607197 10014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
PGPEP1Q9NXJ5 RALGAPA1-219ENST00000637992 8512 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
PGPEP1Q9NXJ5 DNPH1-201ENST00000230431 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
PGPEP1Q9NXJ5 PYCARD-202ENST00000350605 696 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
PGPEP1Q9NXJ5 SOX3-201ENST00000370536 2132 ntAPPRIS P1 BASIC15.24■□□□□ 0.03
PGPEP1Q9NXJ5 MIR17HG-201ENST00000400282 931 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
PGPEP1Q9NXJ5 APOBEC3H-202ENST00000401756 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
PGPEP1Q9NXJ5 NDUFB2-207ENST00000465506 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
PGPEP1Q9NXJ5 ERRFI1-204ENST00000474874 479 ntTSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
PGPEP1Q9NXJ5 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
PGPEP1Q9NXJ5 EEF1D-203ENST00000419152 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
PGPEP1Q9NXJ5 DGKZ-214ENST00000527911 3337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
PGPEP1Q9NXJ5 IKZF1-207ENST00000413698 1808 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
PGPEP1Q9NXJ5 NR0B1-202ENST00000378970 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
PGPEP1Q9NXJ5 DNAAF3-207ENST00000527223 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
PGPEP1Q9NXJ5 AC135782.1-201ENST00000537498 2154 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
PGPEP1Q9NXJ5 HOMER3-204ENST00000539827 1979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
PGPEP1Q9NXJ5 PTOV1-220ENST00000601675 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
PGPEP1Q9NXJ5 GAL3ST3-201ENST00000312006 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
PGPEP1Q9NXJ5 PLPP5-203ENST00000424479 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
PGPEP1Q9NXJ5 CFAP97-205ENST00000514798 2895 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
PGPEP1Q9NXJ5 HES5-201ENST00000378453 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
PGPEP1Q9NXJ5 GOLGA3-203ENST00000456883 5496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
PGPEP1Q9NXJ5 COMT-203ENST00000403184 2217 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
PGPEP1Q9NXJ5 CRYAA-201ENST00000291554 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
PGPEP1Q9NXJ5 GULP1-204ENST00000409637 1242 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
PGPEP1Q9NXJ5 SERTAD4-AS1-202ENST00000475406 591 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
PGPEP1Q9NXJ5 SSR2-210ENST00000480567 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
PGPEP1Q9NXJ5 POLR2F-211ENST00000488684 564 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
PGPEP1Q9NXJ5 AC009097.2-201ENST00000562763 465 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
PGPEP1Q9NXJ5 AC119427.1-201ENST00000633182 556 ntTSL 4 BASIC15.23■□□□□ 0.03
PGPEP1Q9NXJ5 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
PGPEP1Q9NXJ5 ST3GAL4-209ENST00000526727 1967 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
PGPEP1Q9NXJ5 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
PGPEP1Q9NXJ5 PTPRE-201ENST00000254667 5331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
PGPEP1Q9NXJ5 IER2-201ENST00000292433 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
PGPEP1Q9NXJ5 PHF11-202ENST00000378319 1359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
PGPEP1Q9NXJ5 BRSK2-208ENST00000528841 3586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
PGPEP1Q9NXJ5 SPON2-222ENST00000617421 2156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
PGPEP1Q9NXJ5 ASPM-201ENST00000294732 6132 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
PGPEP1Q9NXJ5 FUBP3-201ENST00000319725 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
PGPEP1Q9NXJ5 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24 ms