Protein–RNA interactions for Protein: Q9NXE4

SMPD4, Sphingomyelin phosphodiesterase 4, humanhuman

Predictions only

Length 827 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMPD4Q9NXE4 TOP1MT-201ENST00000329245 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.15
SMPD4Q9NXE4 KREMEN2-203ENST00000571007 1877 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
SMPD4Q9NXE4 PHC2-202ENST00000373418 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
SMPD4Q9NXE4 SERP1-208ENST00000491660 830 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
SMPD4Q9NXE4 TPT1-AS1-211ENST00000520622 604 ntTSL 4 BASIC22.26■■□□□ 1.15
SMPD4Q9NXE4 AL034346.1-201ENST00000568244 1277 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
SMPD4Q9NXE4 MCRIP1-204ENST00000570507 765 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
SMPD4Q9NXE4 MCRIP1-208ENST00000575061 618 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
SMPD4Q9NXE4 ANAPC11-219ENST00000583839 499 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
SMPD4Q9NXE4 NAT8L-202ENST00000423729 5870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
SMPD4Q9NXE4 CREB1-205ENST00000430624 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
SMPD4Q9NXE4 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
SMPD4Q9NXE4 EFCC1-201ENST00000436022 2691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
SMPD4Q9NXE4 NRG2-201ENST00000289409 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
SMPD4Q9NXE4 IGFBP1-202ENST00000457280 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
SMPD4Q9NXE4 MRPL37-201ENST00000336230 1179 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
SMPD4Q9NXE4 AC106820.5-201ENST00000566085 789 ntTSL 3 BASIC22.25■■□□□ 1.15
SMPD4Q9NXE4 KLK9-202ENST00000594211 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
SMPD4Q9NXE4 AP001160.3-201ENST00000601484 763 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
SMPD4Q9NXE4 AC074143.1-203ENST00000518227 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
SMPD4Q9NXE4 ASF1B-201ENST00000263382 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
SMPD4Q9NXE4 AKR7A2-201ENST00000235835 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
SMPD4Q9NXE4 YY1AP1-212ENST00000404643 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
SMPD4Q9NXE4 GGA2-211ENST00000567468 1713 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
SMPD4Q9NXE4 UTF1-201ENST00000304477 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
SMPD4Q9NXE4 ID1-201ENST00000376105 1233 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
SMPD4Q9NXE4 AC093833.1-201ENST00000442821 553 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
SMPD4Q9NXE4 POLE4-205ENST00000483063 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
SMPD4Q9NXE4 SEPT4-215ENST00000580809 952 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
SMPD4Q9NXE4 RAP2CP1-201ENST00000605103 478 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
SMPD4Q9NXE4 TMEM159-201ENST00000233047 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
SMPD4Q9NXE4 DLL3-202ENST00000356433 2055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
SMPD4Q9NXE4 LHPP-202ENST00000368842 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
SMPD4Q9NXE4 SLC19A1-209ENST00000485649 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
SMPD4Q9NXE4 KPTN-201ENST00000338134 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
SMPD4Q9NXE4 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
SMPD4Q9NXE4 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
SMPD4Q9NXE4 REPIN1-214ENST00000489432 2058 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
SMPD4Q9NXE4 AC138028.2-201ENST00000440406 1539 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
SMPD4Q9NXE4 AP006587.3-201ENST00000525742 1516 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
SMPD4Q9NXE4 DUSP26-201ENST00000256261 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
SMPD4Q9NXE4 FXN-202ENST00000396364 980 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
SMPD4Q9NXE4 KRT18P11-201ENST00000435214 1283 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
SMPD4Q9NXE4 ABHD14A-202ENST00000458031 1113 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
SMPD4Q9NXE4 SNAP23-214ENST00000567094 834 ntTSL 3 BASIC22.23■■□□□ 1.15
SMPD4Q9NXE4 EPO-201ENST00000252723 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
SMPD4Q9NXE4 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
SMPD4Q9NXE4 HOXD1-201ENST00000331462 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
SMPD4Q9NXE4 NDUFB2-212ENST00000476279 1666 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
SMPD4Q9NXE4 CNIH2-201ENST00000311445 1356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
SMPD4Q9NXE4 COG8-201ENST00000562081 1731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
SMPD4Q9NXE4 TK2-208ENST00000545043 1120 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
SMPD4Q9NXE4 UBE2DNL-204ENST00000602536 740 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
SMPD4Q9NXE4 GXYLT1P5-201ENST00000614548 1189 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
SMPD4Q9NXE4 AC068473.5-201ENST00000616428 2072 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
SMPD4Q9NXE4 NEU4-204ENST00000405370 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
SMPD4Q9NXE4 SNRK-203ENST00000437827 1995 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
SMPD4Q9NXE4 DPP7-201ENST00000371579 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
SMPD4Q9NXE4 SLC25A47-202ENST00000557052 1552 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
SMPD4Q9NXE4 C18orf65-201ENST00000622985 2076 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
SMPD4Q9NXE4 ZNF395-210ENST00000523095 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
SMPD4Q9NXE4 AC026185.1-201ENST00000445748 174 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
SMPD4Q9NXE4 TMEM41B-205ENST00000533723 723 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
SMPD4Q9NXE4 Z97986.1-201ENST00000565879 476 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
SMPD4Q9NXE4 C19orf84-201ENST00000570516 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
SMPD4Q9NXE4 MFSD11-216ENST00000590393 1141 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
SMPD4Q9NXE4 DPH7-201ENST00000277540 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
SMPD4Q9NXE4 CD6-203ENST00000352009 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
SMPD4Q9NXE4 DISC1-223ENST00000628350 2363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
SMPD4Q9NXE4 ALKBH7-201ENST00000245812 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
SMPD4Q9NXE4 AQP6-201ENST00000315520 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
SMPD4Q9NXE4 C14orf80-201ENST00000329886 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
SMPD4Q9NXE4 USP45-202ENST00000329966 1444 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
SMPD4Q9NXE4 ECHDC2-221ENST00000536120 1446 ntTSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
SMPD4Q9NXE4 BIN1-209ENST00000393040 2293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
SMPD4Q9NXE4 ADARB1-205ENST00000437626 5032 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
SMPD4Q9NXE4 SNHG7-201ENST00000414282 2357 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.15
SMPD4Q9NXE4 GADD45GIP1-201ENST00000316939 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
SMPD4Q9NXE4 NABP2-203ENST00000380198 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
SMPD4Q9NXE4 SEPT5-210ENST00000455784 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
SMPD4Q9NXE4 EFNA2-201ENST00000215368 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
SMPD4Q9NXE4 LGALS9B-201ENST00000324290 1243 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
SMPD4Q9NXE4 PARP1-202ENST00000366792 553 ntTSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
SMPD4Q9NXE4 ABHD14A-204ENST00000491470 674 ntTSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
SMPD4Q9NXE4 AC106738.1-201ENST00000560487 359 ntTSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
SMPD4Q9NXE4 LINC01976-201ENST00000565120 434 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
SMPD4Q9NXE4 DM1-AS-203ENST00000590076 730 ntTSL 4 BASIC22.2■■□□□ 1.14
SMPD4Q9NXE4 LSR-204ENST00000361790 2210 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
SMPD4Q9NXE4 HTRA2-201ENST00000258080 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
SMPD4Q9NXE4 ADRM1-204ENST00000491935 1530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
SMPD4Q9NXE4 PROSER2-205ENST00000622831 1646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
SMPD4Q9NXE4 AP004608.1-202ENST00000533390 1863 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
SMPD4Q9NXE4 HAS1-201ENST00000222115 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
SMPD4Q9NXE4 KCNQ5-208ENST00000414165 6236 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
SMPD4Q9NXE4 DCXR-201ENST00000306869 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
SMPD4Q9NXE4 IL15RA-207ENST00000397250 584 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
SMPD4Q9NXE4 HLA-L-209ENST00000420110 1011 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
SMPD4Q9NXE4 AL731577.2-201ENST00000508096 555 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
SMPD4Q9NXE4 IL15RA-215ENST00000528354 1037 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
SMPD4Q9NXE4 C12orf43-208ENST00000539736 1033 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.5 ms