Protein–RNA interactions for Protein: Q9NX57

RAB20, Ras-related protein Rab-20, humanhuman

Predictions only

Length 234 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB20Q9NX57 ORMDL1-202ENST00000392349 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
RAB20Q9NX57 AC018553.2-201ENST00000637770 1064 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
RAB20Q9NX57 CRTC2-203ENST00000368633 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
RAB20Q9NX57 FBXW4P1-201ENST00000426721 2239 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
RAB20Q9NX57 PSPH-202ENST00000395471 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
RAB20Q9NX57 ACAA1-202ENST00000333167 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
RAB20Q9NX57 ZFAND2B-202ENST00000409097 1765 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
RAB20Q9NX57 CITED2-202ENST00000536159 1797 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.14■■□□□ 1.29
RAB20Q9NX57 CITED2-203ENST00000537332 1780 ntTSL 3 BASIC23.14■■□□□ 1.29
RAB20Q9NX57 AC010542.4-201ENST00000563151 1910 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
RAB20Q9NX57 CHRAC1-203ENST00000519533 1678 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
RAB20Q9NX57 TIGD5-201ENST00000504548 5390 ntAPPRIS P1 BASIC23.13■■□□□ 1.29
RAB20Q9NX57 BID-212ENST00000614949 1988 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
RAB20Q9NX57 PCSK1N-201ENST00000218230 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
RAB20Q9NX57 CLPSL2-201ENST00000360454 488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
RAB20Q9NX57 SH3GLB2-203ENST00000372564 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
RAB20Q9NX57 MFF-208ENST00000409616 1247 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
RAB20Q9NX57 POLR2H-204ENST00000438240 994 ntTSL 3 BASIC23.13■■□□□ 1.29
RAB20Q9NX57 AC012313.1-203ENST00000597980 570 ntTSL 4 BASIC23.13■■□□□ 1.29
RAB20Q9NX57 EIF2B4-211ENST00000616081 1754 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
RAB20Q9NX57 CAPG-201ENST00000263867 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
RAB20Q9NX57 VDAC1-203ENST00000395047 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
RAB20Q9NX57 ZNF511-202ENST00000361518 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
RAB20Q9NX57 GPSM1-201ENST00000291775 2114 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
RAB20Q9NX57 MAPK8IP1P2-201ENST00000580257 1472 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
RAB20Q9NX57 HAUS4-201ENST00000206474 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
RAB20Q9NX57 CNTFR-202ENST00000378980 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
RAB20Q9NX57 IRS3P-201ENST00000223076 1006 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
RAB20Q9NX57 P2RX5-201ENST00000225328 2309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
RAB20Q9NX57 FAM219A-202ENST00000379078 770 ntTSL 3 BASIC23.12■■□□□ 1.29
RAB20Q9NX57 STOML2-202ENST00000452248 1296 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
RAB20Q9NX57 STOML2-205ENST00000619795 1293 ntTSL 3 BASIC23.12■■□□□ 1.29
RAB20Q9NX57 SMURF1-201ENST00000361125 5737 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
RAB20Q9NX57 ANKRD53-204ENST00000457410 1671 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
RAB20Q9NX57 MTX2-201ENST00000249442 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
RAB20Q9NX57 PTGER3-204ENST00000356595 1943 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
RAB20Q9NX57 PTGER3-207ENST00000370931 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
RAB20Q9NX57 TBR1-202ENST00000410035 1454 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
RAB20Q9NX57 GOLGA2P6-201ENST00000340929 2049 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
RAB20Q9NX57 ABHD12B-201ENST00000337334 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
RAB20Q9NX57 PGRMC2-201ENST00000296425 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
RAB20Q9NX57 MED14OS-201ENST00000456333 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
RAB20Q9NX57 AC012414.1-201ENST00000556676 535 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
RAB20Q9NX57 MCRIP1-204ENST00000570507 765 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
RAB20Q9NX57 MCRIP1-208ENST00000575061 618 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
RAB20Q9NX57 SLC26A5-209ENST00000393735 1947 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
RAB20Q9NX57 TMEM200B-201ENST00000420504 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
RAB20Q9NX57 LETM1-201ENST00000302787 5462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
RAB20Q9NX57 WWC2-AS2-201ENST00000578387 2183 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
RAB20Q9NX57 GFRA3-201ENST00000274721 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
RAB20Q9NX57 C19orf68-201ENST00000328759 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
RAB20Q9NX57 PHF2-201ENST00000359246 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
RAB20Q9NX57 PHF10-202ENST00000366780 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
RAB20Q9NX57 HLA-C-203ENST00000383329 1554 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
RAB20Q9NX57 SYNGR2-203ENST00000588282 1553 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
RAB20Q9NX57 GUSB-201ENST00000304895 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
RAB20Q9NX57 MEF2A-207ENST00000558812 2186 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
RAB20Q9NX57 SKI-201ENST00000378536 5613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
RAB20Q9NX57 SPHK1-202ENST00000392496 1779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
RAB20Q9NX57 CTU2-202ENST00000453996 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
RAB20Q9NX57 BX005040.4-201ENST00000637145 1518 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
RAB20Q9NX57 CDKN2A-210ENST00000530628 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
RAB20Q9NX57 SLC39A3-203ENST00000545664 1219 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
RAB20Q9NX57 PTGDR-202ENST00000553372 1216 ntTSL 3 BASIC23.1■■□□□ 1.29
RAB20Q9NX57 AC005775.1-201ENST00000592413 850 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
RAB20Q9NX57 NARF-202ENST00000345415 1487 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
RAB20Q9NX57 SOCS7-202ENST00000613678 1827 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
RAB20Q9NX57 RASGRP2-210ENST00000394430 2174 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
RAB20Q9NX57 CUEDC1-202ENST00000407144 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
RAB20Q9NX57 ME2-206ENST00000638410 2289 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
RAB20Q9NX57 ME2-210ENST00000639255 2262 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
RAB20Q9NX57 ABCG4-204ENST00000615496 2459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
RAB20Q9NX57 KCNK15-201ENST00000372861 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
RAB20Q9NX57 ZSCAN18-217ENST00000601144 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
RAB20Q9NX57 PHACTR3-202ENST00000359926 2252 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
RAB20Q9NX57 FDX2-202ENST00000393708 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
RAB20Q9NX57 AL354811.1-201ENST00000610286 706 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
RAB20Q9NX57 MESP1-201ENST00000300057 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
RAB20Q9NX57 ELL3-201ENST00000319359 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
RAB20Q9NX57 PRR7-201ENST00000323249 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
RAB20Q9NX57 DES-201ENST00000373960 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
RAB20Q9NX57 NAA35-202ENST00000376040 1797 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
RAB20Q9NX57 PXK-203ENST00000383715 1756 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
RAB20Q9NX57 DTNBP1-201ENST00000338950 1880 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
RAB20Q9NX57 MPST-204ENST00000404393 1329 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
RAB20Q9NX57 SERBP1-202ENST00000370990 1621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
RAB20Q9NX57 LAMP5-AS1-201ENST00000443469 1928 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
RAB20Q9NX57 LIMS2-201ENST00000324938 2111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
RAB20Q9NX57 CROT-202ENST00000412227 1213 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
RAB20Q9NX57 AL358852.1-201ENST00000623174 1268 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
RAB20Q9NX57 TMEM9B-201ENST00000309134 1659 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
RAB20Q9NX57 WRNIP1-203ENST00000380771 2595 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
RAB20Q9NX57 GTPBP6-201ENST00000326153 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
RAB20Q9NX57 MBNL3-202ENST00000370844 1643 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
RAB20Q9NX57 AP006587.3-201ENST00000525742 1516 ntBASIC23.08■■□□□ 1.28
RAB20Q9NX57 NABP2-202ENST00000341463 1411 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.08■■□□□ 1.28
RAB20Q9NX57 AC009237.3-201ENST00000393279 1427 ntBASIC23.08■■□□□ 1.28
RAB20Q9NX57 ZBTB22-208ENST00000431845 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
RAB20Q9NX57 VGLL3-201ENST00000383698 2475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
RAB20Q9NX57 ACSL1-205ENST00000504900 1583 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 8.7 ms