Protein–RNA interactions for Protein: Q9NX08

COMMD8, COMM domain-containing protein 8, humanhuman

Predictions only

Length 183 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COMMD8Q9NX08 RANBP10-206ENST00000602677 2374 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
COMMD8Q9NX08 AC079328.2-202ENST00000560903 1410 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
COMMD8Q9NX08 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.18
COMMD8Q9NX08 REPIN1-214ENST00000489432 2058 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
COMMD8Q9NX08 ZPBP-201ENST00000046087 1213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
COMMD8Q9NX08 ASRGL1-210ENST00000534571 639 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
COMMD8Q9NX08 AC053503.5-201ENST00000601508 636 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
COMMD8Q9NX08 AC243773.2-201ENST00000616341 490 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
COMMD8Q9NX08 TRIM2-212ENST00000632856 656 ntTSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.17
COMMD8Q9NX08 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
COMMD8Q9NX08 RGS7-204ENST00000366565 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
COMMD8Q9NX08 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
COMMD8Q9NX08 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
COMMD8Q9NX08 HAUS4-201ENST00000206474 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
COMMD8Q9NX08 SOCS7-202ENST00000613678 1827 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
COMMD8Q9NX08 MAPK9-206ENST00000425491 2266 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
COMMD8Q9NX08 ME2-208ENST00000638937 2471 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
COMMD8Q9NX08 CCDC74B-205ENST00000409943 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
COMMD8Q9NX08 AC004911.1-201ENST00000416316 871 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
COMMD8Q9NX08 ATP6V0B-205ENST00000472174 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
COMMD8Q9NX08 TSPAN11-202ENST00000535215 988 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
COMMD8Q9NX08 AC138907.5-202ENST00000569484 235 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
COMMD8Q9NX08 AC110285.4-201ENST00000572590 424 ntTSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
COMMD8Q9NX08 SEPT4-215ENST00000580809 952 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
COMMD8Q9NX08 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
COMMD8Q9NX08 ABHD6-205ENST00000478253 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
COMMD8Q9NX08 AGAP3-201ENST00000335367 2675 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
COMMD8Q9NX08 TSPAN4-206ENST00000397408 1430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
COMMD8Q9NX08 ANKRD44-204ENST00000409919 1622 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
COMMD8Q9NX08 CBWD3-202ENST00000377342 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
COMMD8Q9NX08 ZNF37BP-201ENST00000435805 1695 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
COMMD8Q9NX08 BFSP1-202ENST00000377873 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
COMMD8Q9NX08 PHLPP1-201ENST00000262719 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
COMMD8Q9NX08 ZNF292-204ENST00000392985 1096 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
COMMD8Q9NX08 GRPEL2-202ENST00000416916 1006 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
COMMD8Q9NX08 SERP1-208ENST00000491660 830 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
COMMD8Q9NX08 AL731577.2-201ENST00000508096 555 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
COMMD8Q9NX08 C19orf84-201ENST00000570516 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
COMMD8Q9NX08 H2AFY2-201ENST00000373255 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
COMMD8Q9NX08 AC012676.1-201ENST00000574705 1949 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
COMMD8Q9NX08 RNF180-201ENST00000296615 1727 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
COMMD8Q9NX08 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
COMMD8Q9NX08 PGF-201ENST00000238607 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
COMMD8Q9NX08 RALGPS1-207ENST00000394022 1672 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
COMMD8Q9NX08 NFKBIL1-203ENST00000376148 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
COMMD8Q9NX08 RUSC1-AS1-203ENST00000450199 1636 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
COMMD8Q9NX08 AC133561.1-201ENST00000568600 2415 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
COMMD8Q9NX08 CCDC9-201ENST00000221922 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
COMMD8Q9NX08 EFNA2-201ENST00000215368 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
COMMD8Q9NX08 NEDD8-201ENST00000250495 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
COMMD8Q9NX08 TNFRSF18-203ENST00000379268 1179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
COMMD8Q9NX08 KRT18P20-201ENST00000548986 1279 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
COMMD8Q9NX08 LINC01976-201ENST00000565120 434 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
COMMD8Q9NX08 VPS53-216ENST00000574029 585 ntTSL 4 BASIC22.36■■□□□ 1.17
COMMD8Q9NX08 WWOX-218ENST00000627394 894 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
COMMD8Q9NX08 CCDC154-201ENST00000389176 2212 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
COMMD8Q9NX08 AL137002.2-201ENST00000639766 2238 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
COMMD8Q9NX08 DMRT2-209ENST00000635183 2190 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
COMMD8Q9NX08 ADRM1-204ENST00000491935 1530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
COMMD8Q9NX08 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
COMMD8Q9NX08 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
COMMD8Q9NX08 NABP2-203ENST00000380198 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
COMMD8Q9NX08 PROSER2-205ENST00000622831 1646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
COMMD8Q9NX08 B4GALNT1-202ENST00000418555 1861 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
COMMD8Q9NX08 IQCD-203ENST00000546692 1872 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
COMMD8Q9NX08 DUX4-203ENST00000565211 1710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
COMMD8Q9NX08 HLA-C-203ENST00000383329 1554 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
COMMD8Q9NX08 HLA-DPB1-211ENST00000418931 1560 ntAPPRIS P2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
COMMD8Q9NX08 HCFC1R1-201ENST00000248089 965 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
COMMD8Q9NX08 CBR1-201ENST00000290349 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
COMMD8Q9NX08 CD47-202ENST00000361309 1285 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
COMMD8Q9NX08 PPA1-202ENST00000373232 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
COMMD8Q9NX08 RASGRP2-209ENST00000394429 453 ntTSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
COMMD8Q9NX08 SMIM12-202ENST00000423898 897 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
COMMD8Q9NX08 LTB-211ENST00000446745 853 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
COMMD8Q9NX08 COX4I1-216ENST00000568794 794 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
COMMD8Q9NX08 HCFC1R1-207ENST00000574980 845 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
COMMD8Q9NX08 AP001160.3-201ENST00000601484 763 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
COMMD8Q9NX08 HOXD1-201ENST00000331462 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
COMMD8Q9NX08 AC080038.3-201ENST00000623346 1952 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
COMMD8Q9NX08 ABHD6-201ENST00000295962 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
COMMD8Q9NX08 DISC1-223ENST00000628350 2363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
COMMD8Q9NX08 MFSD3-201ENST00000301327 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
COMMD8Q9NX08 HSF4-215ENST00000521374 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
COMMD8Q9NX08 DONSON-202ENST00000303113 2028 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
COMMD8Q9NX08 MSRB1-201ENST00000361871 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
COMMD8Q9NX08 ELOA-201ENST00000418390 5154 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
COMMD8Q9NX08 LIN7B-201ENST00000221459 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
COMMD8Q9NX08 AC010141.2-201ENST00000452426 721 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
COMMD8Q9NX08 AC080013.1-202ENST00000465477 674 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
COMMD8Q9NX08 DLX3-202ENST00000512495 834 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
COMMD8Q9NX08 RARRES2P11-201ENST00000635158 484 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
COMMD8Q9NX08 LSM14B-201ENST00000279068 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
COMMD8Q9NX08 CNIH2-201ENST00000311445 1356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
COMMD8Q9NX08 NOC4L-201ENST00000330579 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
COMMD8Q9NX08 SLC52A2-211ENST00000532887 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
COMMD8Q9NX08 LINGO3-201ENST00000585527 2241 ntAPPRIS P1 BASIC22.34■■□□□ 1.17
COMMD8Q9NX08 ZNF784-201ENST00000325351 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
COMMD8Q9NX08 DOK1-203ENST00000409429 1955 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
COMMD8Q9NX08 MLNR-201ENST00000218721 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
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