Protein–RNA interactions for Protein: Q9NX04

C1orf109, Uncharacterized protein C1orf109, humanhuman

Predictions only

Length 203 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C1orf109Q9NX04 CERS1-205ENST00000623927 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
C1orf109Q9NX04 KCNMA1-209ENST00000372443 5059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
C1orf109Q9NX04 MCAT-201ENST00000290429 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
C1orf109Q9NX04 CDKN2C-203ENST00000396148 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
C1orf109Q9NX04 B4GALNT1-203ENST00000449184 1633 ntTSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
C1orf109Q9NX04 FAM110A-206ENST00000541082 1614 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.54■□□□□ 0.88
C1orf109Q9NX04 RSPO1-201ENST00000356545 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
C1orf109Q9NX04 SCRN2-212ENST00000584123 1745 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
C1orf109Q9NX04 SLC47A1P1-202ENST00000449666 945 ntBASIC20.54■□□□□ 0.88
C1orf109Q9NX04 AC004707.1-201ENST00000511627 715 ntTSL 3 BASIC20.54■□□□□ 0.88
C1orf109Q9NX04 RAB6A-204ENST00000536566 1267 ntTSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
C1orf109Q9NX04 AL034346.1-201ENST00000568244 1277 ntBASIC20.54■□□□□ 0.88
C1orf109Q9NX04 SAP25-203ENST00000614631 987 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
C1orf109Q9NX04 EEF1D-201ENST00000317198 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
C1orf109Q9NX04 PARD3-207ENST00000374788 5996 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
C1orf109Q9NX04 D2HGDH-201ENST00000321264 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
C1orf109Q9NX04 GRTP1-202ENST00000375430 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
C1orf109Q9NX04 CAMKK2-208ENST00000412367 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
C1orf109Q9NX04 POLR2F-205ENST00000442738 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
C1orf109Q9NX04 PRICKLE4-201ENST00000394259 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
C1orf109Q9NX04 STOX1-202ENST00000399162 935 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
C1orf109Q9NX04 STOX1-203ENST00000399165 1135 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
C1orf109Q9NX04 HTATIP2-201ENST00000419348 1477 ntTSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
C1orf109Q9NX04 SMUG1-215ENST00000508394 1697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
C1orf109Q9NX04 FBXO25-203ENST00000352684 2360 ntTSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
C1orf109Q9NX04 PRICKLE3-206ENST00000599218 2062 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
C1orf109Q9NX04 WDR86-203ENST00000469830 1691 ntTSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
C1orf109Q9NX04 LTBP3-201ENST00000301873 4443 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
C1orf109Q9NX04 WT1-210ENST00000639563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
C1orf109Q9NX04 AL445237.1-202ENST00000604581 425 ntTSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
C1orf109Q9NX04 RAP1B-204ENST00000393436 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
C1orf109Q9NX04 MFF-203ENST00000349901 1716 ntTSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
C1orf109Q9NX04 RTL8C-201ENST00000257013 1181 ntAPPRIS P1 BASIC20.51■□□□□ 0.87
C1orf109Q9NX04 TPM1-204ENST00000334895 1637 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
C1orf109Q9NX04 OSBPL10-204ENST00000438237 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
C1orf109Q9NX04 ACSL1-205ENST00000504900 1583 ntTSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
C1orf109Q9NX04 PPP1R12B-212ENST00000480184 1808 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
C1orf109Q9NX04 EPHX3-204ENST00000602233 1805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
C1orf109Q9NX04 B4GAT1-201ENST00000311181 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
C1orf109Q9NX04 SMIM19-203ENST00000417410 1466 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
C1orf109Q9NX04 KCNN4-201ENST00000262888 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
C1orf109Q9NX04 KIAA0895-204ENST00000415803 2865 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
C1orf109Q9NX04 TTC7A-201ENST00000319190 5157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
C1orf109Q9NX04 MAPK9-206ENST00000425491 2266 ntTSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
C1orf109Q9NX04 YIF1A-201ENST00000359461 943 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
C1orf109Q9NX04 YIF1A-203ENST00000376901 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
C1orf109Q9NX04 AC090241.2-201ENST00000602329 432 ntTSL 4 BASIC20.5■□□□□ 0.87
C1orf109Q9NX04 Z98883.1-202ENST00000635107 1289 ntTSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
C1orf109Q9NX04 TANGO2-212ENST00000434570 2180 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
C1orf109Q9NX04 CAPG-201ENST00000263867 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
C1orf109Q9NX04 LMAN2-201ENST00000303127 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
C1orf109Q9NX04 HOMEZ-201ENST00000357460 4971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
C1orf109Q9NX04 KDM3B-201ENST00000314358 6813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
C1orf109Q9NX04 TRABD2A-203ENST00000409520 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
C1orf109Q9NX04 FEM1AP4-201ENST00000443167 1987 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
C1orf109Q9NX04 DPF1-217ENST00000614244 2356 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
C1orf109Q9NX04 GSN-204ENST00000373818 2657 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
C1orf109Q9NX04 AC243965.2-201ENST00000612576 2671 ntTSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
C1orf109Q9NX04 EML2-201ENST00000245925 2264 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
C1orf109Q9NX04 ZNF446-208ENST00000622313 1884 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
C1orf109Q9NX04 TRIM14-202ENST00000342043 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
C1orf109Q9NX04 MSANTD1-204ENST00000510580 2039 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
C1orf109Q9NX04 PTPN18-202ENST00000347849 2472 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
C1orf109Q9NX04 AP004607.7-201ENST00000527152 1677 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
C1orf109Q9NX04 MEIS2-207ENST00000557796 2666 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
C1orf109Q9NX04 PHPT1-201ENST00000247665 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
C1orf109Q9NX04 SNX3-202ENST00000349379 890 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
C1orf109Q9NX04 LINC01632-201ENST00000615763 496 ntTSL 3 BASIC20.49■□□□□ 0.87
C1orf109Q9NX04 THEM6-201ENST00000336138 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
C1orf109Q9NX04 PTDSS2-201ENST00000308020 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
C1orf109Q9NX04 QPCT-201ENST00000338415 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
C1orf109Q9NX04 PPP1R3F-203ENST00000466508 1885 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
C1orf109Q9NX04 FRMD3-204ENST00000376438 2198 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
C1orf109Q9NX04 NTN1-201ENST00000173229 5954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
C1orf109Q9NX04 PYCR1-203ENST00000402252 1346 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
C1orf109Q9NX04 HAUS4-201ENST00000206474 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
C1orf109Q9NX04 OSR1-201ENST00000272223 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
C1orf109Q9NX04 C1QL4-201ENST00000334221 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
C1orf109Q9NX04 TMC6-212ENST00000589553 2389 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
C1orf109Q9NX04 CENPH-201ENST00000283006 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
C1orf109Q9NX04 TNFAIP8L3-202ENST00000637513 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
C1orf109Q9NX04 VRK2-201ENST00000340157 1888 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
C1orf109Q9NX04 XPA-201ENST00000375128 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
C1orf109Q9NX04 BAZ1A-202ENST00000360310 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
C1orf109Q9NX04 CLTB-201ENST00000310418 1215 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
C1orf109Q9NX04 CLTB-202ENST00000345807 1161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
C1orf109Q9NX04 PYCARD-202ENST00000350605 696 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
C1orf109Q9NX04 CHKB-AS1-201ENST00000380711 578 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
C1orf109Q9NX04 MAST4-206ENST00000406374 1066 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
C1orf109Q9NX04 SMIM29-205ENST00000468145 903 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
C1orf109Q9NX04 SMIM29-207ENST00000481533 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
C1orf109Q9NX04 ZNF419-210ENST00000520540 568 ntTSL 4 BASIC20.48■□□□□ 0.87
C1orf109Q9NX04 AP006621.3-202ENST00000530083 765 ntTSL 3 BASIC20.48■□□□□ 0.87
C1orf109Q9NX04 C15orf61-202ENST00000557807 769 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
C1orf109Q9NX04 TGFBR3L-202ENST00000565886 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
C1orf109Q9NX04 GALNS-211ENST00000568311 703 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
C1orf109Q9NX04 COL23A1-201ENST00000390654 3061 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
C1orf109Q9NX04 REV1-201ENST00000258428 4751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
C1orf109Q9NX04 NISCH-201ENST00000345716 5238 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
C1orf109Q9NX04 HSF2BP-201ENST00000291560 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.8 ms