Protein–RNA interactions for Protein: Q9NVP2

ASF1B, Histone chaperone ASF1B, humanhuman

Predictions only

Length 202 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ASF1BQ9NVP2 CASP9-203ENST00000375890 1351 ntTSL 2 BASIC19.62■□□□□ 0.73
ASF1BQ9NVP2 EFNA2-201ENST00000215368 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
ASF1BQ9NVP2 NFS1-201ENST00000306750 738 ntTSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
ASF1BQ9NVP2 LYRM9-201ENST00000379102 501 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.62■□□□□ 0.73
ASF1BQ9NVP2 SLC29A4P1-201ENST00000398760 971 ntBASIC19.62■□□□□ 0.73
ASF1BQ9NVP2 EIF5A-205ENST00000419711 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
ASF1BQ9NVP2 LYRM9-206ENST00000508862 807 ntTSL 3 BASIC19.62■□□□□ 0.73
ASF1BQ9NVP2 CAMTA1-216ENST00000557126 486 ntTSL 2 BASIC19.62■□□□□ 0.73
ASF1BQ9NVP2 AC007216.1-201ENST00000570197 601 ntTSL 4 BASIC19.62■□□□□ 0.73
ASF1BQ9NVP2 NMRAL1-212ENST00000574425 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.62■□□□□ 0.73
ASF1BQ9NVP2 PARP1-210ENST00000629232 477 ntTSL 5 BASIC19.62■□□□□ 0.73
ASF1BQ9NVP2 CARM1-201ENST00000327064 3330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
ASF1BQ9NVP2 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC19.62■□□□□ 0.73
ASF1BQ9NVP2 BX088645.1-201ENST00000636699 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.62■□□□□ 0.73
ASF1BQ9NVP2 JAGN1-201ENST00000307768 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
ASF1BQ9NVP2 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.61■□□□□ 0.73
ASF1BQ9NVP2 NKX3-2-201ENST00000382438 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
ASF1BQ9NVP2 ZSWIM7-205ENST00000472495 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
ASF1BQ9NVP2 NDUFS3-207ENST00000529276 558 ntTSL 2 BASIC19.61■□□□□ 0.73
ASF1BQ9NVP2 OAS3-207ENST00000551007 998 ntTSL 2 BASIC19.61■□□□□ 0.73
ASF1BQ9NVP2 SNAP23-210ENST00000564153 775 ntTSL 2 BASIC19.61■□□□□ 0.73
ASF1BQ9NVP2 PDLIM3-203ENST00000284771 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
ASF1BQ9NVP2 FGFRL1-203ENST00000504138 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
ASF1BQ9NVP2 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
ASF1BQ9NVP2 DACT2-203ENST00000607983 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
ASF1BQ9NVP2 VIL1-204ENST00000440053 1454 ntTSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
ASF1BQ9NVP2 UNC119-202ENST00000335765 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
ASF1BQ9NVP2 AC009237.3-201ENST00000393279 1427 ntBASIC19.6■□□□□ 0.73
ASF1BQ9NVP2 FMR1-AS1-202ENST00000596112 1845 ntTSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
ASF1BQ9NVP2 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
ASF1BQ9NVP2 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
ASF1BQ9NVP2 C7orf26-202ENST00000359073 1762 ntTSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
ASF1BQ9NVP2 NKX2-5-201ENST00000329198 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
ASF1BQ9NVP2 RAB1A-202ENST00000409751 1333 ntTSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
ASF1BQ9NVP2 WDR86-201ENST00000334493 2023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
ASF1BQ9NVP2 TMEM218-201ENST00000279968 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
ASF1BQ9NVP2 SNRNP25-202ENST00000383018 1085 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
ASF1BQ9NVP2 LINC01117-201ENST00000443670 699 ntTSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
ASF1BQ9NVP2 AL731577.2-201ENST00000508096 555 ntTSL 2 BASIC19.6■□□□□ 0.73
ASF1BQ9NVP2 NCAPD3-204ENST00000526422 1060 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.6■□□□□ 0.73
ASF1BQ9NVP2 PFKL-212ENST00000628044 129 ntTSL 3 BASIC19.6■□□□□ 0.73
ASF1BQ9NVP2 LTK-202ENST00000355166 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
ASF1BQ9NVP2 BFSP1-202ENST00000377873 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
ASF1BQ9NVP2 VDAC1-203ENST00000395047 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
ASF1BQ9NVP2 DLEU2-208ENST00000621282 3068 ntTSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
ASF1BQ9NVP2 SLC35D3-201ENST00000331858 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
ASF1BQ9NVP2 ARHGAP27-207ENST00000528273 2319 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
ASF1BQ9NVP2 MYCN-201ENST00000281043 2602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
ASF1BQ9NVP2 GALNT8-202ENST00000433855 5977 ntTSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
ASF1BQ9NVP2 MAP2K5-204ENST00000395476 1689 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
ASF1BQ9NVP2 SGMS1-210ENST00000619438 1680 ntTSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
ASF1BQ9NVP2 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
ASF1BQ9NVP2 IL17RE-201ENST00000383814 2704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
ASF1BQ9NVP2 TMEM121B-201ENST00000331437 4954 ntAPPRIS P3 BASIC19.59■□□□□ 0.73
ASF1BQ9NVP2 FMR1-202ENST00000334557 1295 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
ASF1BQ9NVP2 ARL5A-202ENST00000428992 747 ntTSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
ASF1BQ9NVP2 EDA-210ENST00000527388 927 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
ASF1BQ9NVP2 PAQR4-205ENST00000576565 842 ntTSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
ASF1BQ9NVP2 MIR4651-201ENST00000582622 73 ntBASIC19.59■□□□□ 0.73
ASF1BQ9NVP2 AC018730.2-201ENST00000598623 443 ntTSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
ASF1BQ9NVP2 EPCAM-202ENST00000405271 1530 ntTSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
ASF1BQ9NVP2 BASP1-203ENST00000616743 1711 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.59■□□□□ 0.73
ASF1BQ9NVP2 TRIM3-201ENST00000345851 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
ASF1BQ9NVP2 SERBP1-202ENST00000370990 1621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
ASF1BQ9NVP2 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
ASF1BQ9NVP2 AFDN-AS1-201ENST00000359760 2238 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
ASF1BQ9NVP2 NOXO1-203ENST00000397280 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
ASF1BQ9NVP2 CT47A12-201ENST00000419982 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
ASF1BQ9NVP2 SCO2-203ENST00000535425 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.72
ASF1BQ9NVP2 MVB12A-212ENST00000543795 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.72
ASF1BQ9NVP2 DDN-AS1-201ENST00000547395 858 ntTSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.72
ASF1BQ9NVP2 RGMA-211ENST00000557420 989 ntTSL 3 BASIC19.58■□□□□ 0.72
ASF1BQ9NVP2 MYCNOS-205ENST00000641950 531 ntBASIC19.58■□□□□ 0.72
ASF1BQ9NVP2 COL15A1-205ENST00000610452 5422 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.72
ASF1BQ9NVP2 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.72
ASF1BQ9NVP2 KCNK13-201ENST00000282146 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
ASF1BQ9NVP2 KDF1-201ENST00000320567 1793 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
ASF1BQ9NVP2 PDE5A-201ENST00000264805 3020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
ASF1BQ9NVP2 HOXA10-206ENST00000613671 2175 ntTSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
ASF1BQ9NVP2 B3GALT6-201ENST00000379198 2777 ntAPPRIS P1 BASIC19.57■□□□□ 0.72
ASF1BQ9NVP2 ZNF316-201ENST00000382252 5392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
ASF1BQ9NVP2 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
ASF1BQ9NVP2 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
ASF1BQ9NVP2 BRI3-207ENST00000539286 699 ntTSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
ASF1BQ9NVP2 AC005697.1-201ENST00000582441 582 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC19.57■□□□□ 0.72
ASF1BQ9NVP2 AP001160.3-201ENST00000601484 763 ntBASIC19.57■□□□□ 0.72
ASF1BQ9NVP2 PKD1P6-201ENST00000343738 4769 ntBASIC19.57■□□□□ 0.72
ASF1BQ9NVP2 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
ASF1BQ9NVP2 EPHA8-202ENST00000374644 1802 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
ASF1BQ9NVP2 TSPAN4-206ENST00000397408 1430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
ASF1BQ9NVP2 ADAP2-204ENST00000580525 1598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
ASF1BQ9NVP2 NAT16-204ENST00000455377 1492 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
ASF1BQ9NVP2 GRM6-202ENST00000517717 2673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
ASF1BQ9NVP2 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
ASF1BQ9NVP2 DCTN3-202ENST00000341694 899 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
ASF1BQ9NVP2 DCTN3-205ENST00000378916 773 ntTSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
ASF1BQ9NVP2 MCHR1-202ENST00000381433 1219 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
ASF1BQ9NVP2 RORB-AS1-201ENST00000417576 1178 ntTSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
ASF1BQ9NVP2 PXK-203ENST00000383715 1756 ntTSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
ASF1BQ9NVP2 CCDC157-202ENST00000399824 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.7 ms