Protein–RNA interactions for Protein: Q9NUQ9

FAM49B, Protein FAM49B, humanhuman

Predictions only

Length 324 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAM49BQ9NUQ9 AL133516.1-201ENST00000633012 540 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
FAM49BQ9NUQ9 ZFAND6-224ENST00000618205 1659 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
FAM49BQ9NUQ9 SPRTN-201ENST00000008440 1667 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
FAM49BQ9NUQ9 LHFPL3-202ENST00000424859 1852 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
FAM49BQ9NUQ9 LINC02175-201ENST00000571219 1875 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
FAM49BQ9NUQ9 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
FAM49BQ9NUQ9 MME-202ENST00000382989 1319 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
FAM49BQ9NUQ9 RAB1A-202ENST00000409751 1333 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
FAM49BQ9NUQ9 FOXO1-201ENST00000379561 5735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
FAM49BQ9NUQ9 IL15RA-206ENST00000397248 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
FAM49BQ9NUQ9 RPS6-203ENST00000380384 1355 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
FAM49BQ9NUQ9 MXRA8-203ENST00000445648 2001 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
FAM49BQ9NUQ9 ITM2C-202ENST00000326427 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
FAM49BQ9NUQ9 PLEKHA8-208ENST00000622102 2140 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
FAM49BQ9NUQ9 FRAT1-201ENST00000371021 2649 ntAPPRIS P1 BASIC22.75■■□□□ 1.23
FAM49BQ9NUQ9 TCTEX1D4-201ENST00000339355 763 ntAPPRIS P1 BASIC22.75■■□□□ 1.23
FAM49BQ9NUQ9 SLC35A2-205ENST00000376529 865 ntTSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
FAM49BQ9NUQ9 BHLHA9-201ENST00000391429 902 ntAPPRIS P1 BASIC22.75■■□□□ 1.23
FAM49BQ9NUQ9 ATOX1-207ENST00000524142 749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
FAM49BQ9NUQ9 CLN6-201ENST00000249806 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
FAM49BQ9NUQ9 AP006587.3-201ENST00000525742 1516 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
FAM49BQ9NUQ9 DTNB-201ENST00000288642 2464 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
FAM49BQ9NUQ9 SHMT1-201ENST00000316694 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
FAM49BQ9NUQ9 DTNB-208ENST00000406818 2474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
FAM49BQ9NUQ9 CBWD6-201ENST00000377391 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
FAM49BQ9NUQ9 CHODL-201ENST00000299295 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
FAM49BQ9NUQ9 SOCS7-202ENST00000613678 1827 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
FAM49BQ9NUQ9 ANKRD44-204ENST00000409919 1622 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
FAM49BQ9NUQ9 AC055733.4-201ENST00000638462 1354 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
FAM49BQ9NUQ9 NEU4-204ENST00000405370 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
FAM49BQ9NUQ9 C1orf174-201ENST00000361605 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
FAM49BQ9NUQ9 ATP8A1-207ENST00000510289 2238 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
FAM49BQ9NUQ9 ZBTB46-202ENST00000302995 2335 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
FAM49BQ9NUQ9 HBM-201ENST00000356815 506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
FAM49BQ9NUQ9 AC019068.1-201ENST00000415226 552 ntTSL 4 BASIC22.74■■□□□ 1.23
FAM49BQ9NUQ9 BRD2-214ENST00000496118 735 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
FAM49BQ9NUQ9 AP001160.5-201ENST00000636508 485 ntAPPRIS P1 BASIC22.74■■□□□ 1.23
FAM49BQ9NUQ9 SHMT1-202ENST00000352886 2437 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
FAM49BQ9NUQ9 ELOA3B-201ENST00000611323 1641 ntAPPRIS P1 BASIC22.74■■□□□ 1.23
FAM49BQ9NUQ9 ELOA3D-201ENST00000620881 1641 ntAPPRIS P1 BASIC22.74■■□□□ 1.23
FAM49BQ9NUQ9 AC026471.6-201ENST00000622954 1905 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
FAM49BQ9NUQ9 PHLPP1-201ENST00000262719 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
FAM49BQ9NUQ9 FAM99A-202ENST00000538190 1989 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
FAM49BQ9NUQ9 STX18-205ENST00000505286 1380 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
FAM49BQ9NUQ9 GPR137B-202ENST00000366592 2042 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
FAM49BQ9NUQ9 AC138649.1-201ENST00000619611 1449 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
FAM49BQ9NUQ9 CADPS-219ENST00000612439 5455 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
FAM49BQ9NUQ9 MFSD6L-201ENST00000329805 2188 ntAPPRIS P1 BASIC22.73■■□□□ 1.23
FAM49BQ9NUQ9 PIP5KL1-202ENST00000388747 2198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
FAM49BQ9NUQ9 ADARB1-205ENST00000437626 5032 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
FAM49BQ9NUQ9 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
FAM49BQ9NUQ9 HAUS4-201ENST00000206474 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
FAM49BQ9NUQ9 SPOCK2-203ENST00000412663 1284 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
FAM49BQ9NUQ9 AL162430.1-201ENST00000480705 870 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
FAM49BQ9NUQ9 LINC01942-201ENST00000521373 513 ntTSL 4 BASIC22.73■■□□□ 1.23
FAM49BQ9NUQ9 SLC25A45-206ENST00000526432 894 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
FAM49BQ9NUQ9 AL137779.2-201ENST00000554859 448 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
FAM49BQ9NUQ9 AP003071.3-201ENST00000562506 366 ntTSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
FAM49BQ9NUQ9 LGI4-206ENST00000591633 1113 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
FAM49BQ9NUQ9 AC004528.2-201ENST00000610701 440 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
FAM49BQ9NUQ9 NRSN1-204ENST00000378491 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
FAM49BQ9NUQ9 TALDO1-201ENST00000319006 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
FAM49BQ9NUQ9 EPS8L1-202ENST00000245618 2198 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
FAM49BQ9NUQ9 NEURL4-201ENST00000315614 5182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
FAM49BQ9NUQ9 CCNG2-204ENST00000502280 1459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
FAM49BQ9NUQ9 HTATSF1-201ENST00000218364 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
FAM49BQ9NUQ9 RNF149-201ENST00000295317 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
FAM49BQ9NUQ9 DACT1-201ENST00000335867 2571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
FAM49BQ9NUQ9 TPSG1-201ENST00000234798 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
FAM49BQ9NUQ9 AC079140.4-201ENST00000507448 529 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
FAM49BQ9NUQ9 TMEM70-203ENST00000517439 617 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
FAM49BQ9NUQ9 GLI4-210ENST00000523522 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
FAM49BQ9NUQ9 AC011511.3-201ENST00000587088 355 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
FAM49BQ9NUQ9 AKT1S1-206ENST00000391834 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
FAM49BQ9NUQ9 UCK2-201ENST00000367879 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
FAM49BQ9NUQ9 CREG1-201ENST00000370509 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
FAM49BQ9NUQ9 ZSWIM7-201ENST00000399277 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
FAM49BQ9NUQ9 TSSK1B-201ENST00000390666 2478 ntAPPRIS P1 BASIC22.71■■□□□ 1.23
FAM49BQ9NUQ9 PPP5C-201ENST00000012443 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
FAM49BQ9NUQ9 GPSM1-201ENST00000291775 2114 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
FAM49BQ9NUQ9 UCN-201ENST00000296099 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
FAM49BQ9NUQ9 ACYP2-201ENST00000303536 789 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
FAM49BQ9NUQ9 PCMT1-201ENST00000367378 1293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
FAM49BQ9NUQ9 CHTF8-210ENST00000523421 766 ntTSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
FAM49BQ9NUQ9 MCRIP1-204ENST00000570507 765 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
FAM49BQ9NUQ9 MCRIP1-208ENST00000575061 618 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
FAM49BQ9NUQ9 MIF4GD-211ENST00000580571 952 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
FAM49BQ9NUQ9 SLC35A2-212ENST00000634665 486 ntTSL 4 BASIC22.71■■□□□ 1.23
FAM49BQ9NUQ9 SLC35A3-213ENST00000638988 1286 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
FAM49BQ9NUQ9 MANEAL-203ENST00000397631 2327 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
FAM49BQ9NUQ9 TSPAN3-202ENST00000346495 1647 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
FAM49BQ9NUQ9 B3GALT6-201ENST00000379198 2777 ntAPPRIS P1 BASIC22.71■■□□□ 1.23
FAM49BQ9NUQ9 SOX10-201ENST00000360880 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
FAM49BQ9NUQ9 SOX10-202ENST00000396884 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
FAM49BQ9NUQ9 SPAST-204ENST00000621856 1715 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
FAM49BQ9NUQ9 TMEM165-201ENST00000381334 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
FAM49BQ9NUQ9 NPAS1-202ENST00000449844 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
FAM49BQ9NUQ9 JSRP1-201ENST00000300961 1138 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
FAM49BQ9NUQ9 GUK1-207ENST00000366726 873 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.7■■□□□ 1.22
FAM49BQ9NUQ9 LINC01678-201ENST00000411694 863 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.9 ms