Protein–RNA interactions for Protein: Q9NUM3

SLC39A9, Zinc transporter ZIP9, humanhuman

Predictions only

Length 307 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC39A9Q9NUM3 BID-215ENST00000622694 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
SLC39A9Q9NUM3 MATR3-206ENST00000503811 2518 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
SLC39A9Q9NUM3 MARK1-202ENST00000366918 5169 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
SLC39A9Q9NUM3 ZMAT3-203ENST00000432729 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.33
SLC39A9Q9NUM3 AGAP4-207ENST00000616763 2784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
SLC39A9Q9NUM3 PRMT8-202ENST00000382622 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
SLC39A9Q9NUM3 SMIM11B-205ENST00000624304 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
SLC39A9Q9NUM3 TTYH1-203ENST00000376531 1763 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
SLC39A9Q9NUM3 SPAST-204ENST00000621856 1715 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
SLC39A9Q9NUM3 KPTN-201ENST00000338134 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
SLC39A9Q9NUM3 WDR86-207ENST00000621812 1542 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
SLC39A9Q9NUM3 STMN4-201ENST00000265770 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
SLC39A9Q9NUM3 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
SLC39A9Q9NUM3 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC17.08■□□□□ 0.32
SLC39A9Q9NUM3 STX6-204ENST00000542060 4809 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
SLC39A9Q9NUM3 KREMEN2-201ENST00000303746 2326 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
SLC39A9Q9NUM3 INTS11-208ENST00000435064 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
SLC39A9Q9NUM3 TMEM255B-202ENST00000375353 6100 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
SLC39A9Q9NUM3 NF2-201ENST00000334961 2020 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
SLC39A9Q9NUM3 CENPB-201ENST00000379751 2840 ntAPPRIS P1 BASIC17.07■□□□□ 0.32
SLC39A9Q9NUM3 ARL6IP4-201ENST00000315580 1644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
SLC39A9Q9NUM3 SGTA-201ENST00000221566 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
SLC39A9Q9NUM3 C6orf89-201ENST00000355190 1309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
SLC39A9Q9NUM3 SMARCC1-201ENST00000254480 6375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
SLC39A9Q9NUM3 PLEKHH3-201ENST00000293349 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
SLC39A9Q9NUM3 PITPNC1-201ENST00000299954 6359 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
SLC39A9Q9NUM3 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
SLC39A9Q9NUM3 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
SLC39A9Q9NUM3 ASCL5-201ENST00000449188 2026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.07■□□□□ 0.32
SLC39A9Q9NUM3 NPY4R-201ENST00000374312 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
SLC39A9Q9NUM3 NPY4R2-201ENST00000576178 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
SLC39A9Q9NUM3 NPTX1-201ENST00000306773 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
SLC39A9Q9NUM3 PWWP2A-205ENST00000523662 1819 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
SLC39A9Q9NUM3 A1BG-201ENST00000263100 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
SLC39A9Q9NUM3 ZBTB46-203ENST00000395104 5198 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
SLC39A9Q9NUM3 RPP38-207ENST00000616640 1537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
SLC39A9Q9NUM3 C19orf35-201ENST00000342063 2574 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
SLC39A9Q9NUM3 ZNF503-AS2-202ENST00000466942 1430 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
SLC39A9Q9NUM3 FAM117B-201ENST00000392238 5763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
SLC39A9Q9NUM3 SPPL2B-212ENST00000618220 2459 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
SLC39A9Q9NUM3 IRX5-202ENST00000394636 2401 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC17.06■□□□□ 0.32
SLC39A9Q9NUM3 WNT10B-202ENST00000403957 1817 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
SLC39A9Q9NUM3 MCRIP1-202ENST00000457257 942 ntTSL 3 BASIC17.06■□□□□ 0.32
SLC39A9Q9NUM3 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
SLC39A9Q9NUM3 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC17.06■□□□□ 0.32
SLC39A9Q9NUM3 DUSP22-214ENST00000605315 867 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
SLC39A9Q9NUM3 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
SLC39A9Q9NUM3 KANSL1-202ENST00000432791 5343 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
SLC39A9Q9NUM3 ARHGAP11A-205ENST00000563864 2279 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
SLC39A9Q9NUM3 ME2-206ENST00000638410 2289 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
SLC39A9Q9NUM3 ME2-210ENST00000639255 2262 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
SLC39A9Q9NUM3 CACTIN-202ENST00000248420 2671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
SLC39A9Q9NUM3 MFSD7-202ENST00000347950 1599 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
SLC39A9Q9NUM3 MSANTD1-204ENST00000510580 2039 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
SLC39A9Q9NUM3 SLC1A6-203ENST00000544886 2420 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
SLC39A9Q9NUM3 KLHL17-205ENST00000622660 1950 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
SLC39A9Q9NUM3 C10orf55-202ENST00000412307 2360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
SLC39A9Q9NUM3 ZNF668-207ENST00000535577 2396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
SLC39A9Q9NUM3 CAPN12-201ENST00000328867 2762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
SLC39A9Q9NUM3 MBD3-201ENST00000156825 5518 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
SLC39A9Q9NUM3 UCHL5-205ENST00000367454 1815 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
SLC39A9Q9NUM3 CBWD5-207ENST00000382405 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
SLC39A9Q9NUM3 LRR1-201ENST00000298288 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
SLC39A9Q9NUM3 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
SLC39A9Q9NUM3 EIF3J-203ENST00000535391 925 ntTSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
SLC39A9Q9NUM3 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
SLC39A9Q9NUM3 KIRREL2-201ENST00000262625 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
SLC39A9Q9NUM3 ST3GAL3-207ENST00000353126 1969 ntTSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
SLC39A9Q9NUM3 POTEC-204ENST00000620346 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
SLC39A9Q9NUM3 HDGFL2-208ENST00000616600 2281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
SLC39A9Q9NUM3 SLC29A4-202ENST00000396872 5685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
SLC39A9Q9NUM3 SPTBN4-202ENST00000352632 8676 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
SLC39A9Q9NUM3 AC096677.1-201ENST00000454651 1516 ntTSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
SLC39A9Q9NUM3 CBWD1-203ENST00000377400 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
SLC39A9Q9NUM3 USP21-202ENST00000368001 2095 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
SLC39A9Q9NUM3 LINC01116-201ENST00000295549 1407 ntTSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
SLC39A9Q9NUM3 RNF180-201ENST00000296615 1727 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
SLC39A9Q9NUM3 ARMC9-201ENST00000349938 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
SLC39A9Q9NUM3 ITGB1BP1-202ENST00000355346 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
SLC39A9Q9NUM3 PHOSPHO1-202ENST00000413580 2173 ntTSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
SLC39A9Q9NUM3 KCTD12-201ENST00000377474 6225 ntAPPRIS P1 BASIC17.04■□□□□ 0.32
SLC39A9Q9NUM3 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
SLC39A9Q9NUM3 ASB1-202ENST00000409297 878 ntTSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
SLC39A9Q9NUM3 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
SLC39A9Q9NUM3 DUX4L4-201ENST00000566884 1269 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
SLC39A9Q9NUM3 CA15P2-201ENST00000611168 834 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
SLC39A9Q9NUM3 BTBD11-201ENST00000280758 5767 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
SLC39A9Q9NUM3 RNF165-205ENST00000588679 2904 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
SLC39A9Q9NUM3 EDEM1-201ENST00000256497 6146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
SLC39A9Q9NUM3 TSHZ3-201ENST00000240587 5176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
SLC39A9Q9NUM3 AIRN-201ENST00000601203 4374 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
SLC39A9Q9NUM3 MAPK9-208ENST00000455781 4336 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
SLC39A9Q9NUM3 SMIM10L2B-201ENST00000433425 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
SLC39A9Q9NUM3 SLC17A7-201ENST00000221485 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
SLC39A9Q9NUM3 MARCH9-201ENST00000266643 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
SLC39A9Q9NUM3 PRKAA1-202ENST00000354209 1918 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
SLC39A9Q9NUM3 SH2D5-202ENST00000444387 1934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
SLC39A9Q9NUM3 FAM118B-209ENST00000533050 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
SLC39A9Q9NUM3 FHL3-201ENST00000373016 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
SLC39A9Q9NUM3 SNX21-212ENST00000491381 1607 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44 ms