Protein–RNA interactions for Protein: Q9NTN9

SEMA4G, Semaphorin-4G, humanhuman

Predictions only

Length 838 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SEMA4GQ9NTN9 WDR86-201ENST00000334493 2023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1
SEMA4GQ9NTN9 PRR7-202ENST00000502922 1345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
SEMA4GQ9NTN9 SNX24-211ENST00000513881 1563 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
SEMA4GQ9NTN9 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
SEMA4GQ9NTN9 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
SEMA4GQ9NTN9 ZNF644-203ENST00000361321 1253 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
SEMA4GQ9NTN9 MAP1LC3A-202ENST00000374837 961 ntTSL 3 BASIC21.32■■□□□ 1
SEMA4GQ9NTN9 BMP1-204ENST00000397814 836 ntTSL 4 BASIC21.32■■□□□ 1
SEMA4GQ9NTN9 BET1L-204ENST00000410108 637 ntTSL 3 BASIC21.32■■□□□ 1
SEMA4GQ9NTN9 AL391244.2-201ENST00000428932 543 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
SEMA4GQ9NTN9 CYP2T1P-201ENST00000432607 1285 ntBASIC21.32■■□□□ 1
SEMA4GQ9NTN9 AC011611.3-201ENST00000552367 569 ntTSL 4 BASIC21.32■■□□□ 1
SEMA4GQ9NTN9 C14orf28-204ENST00000557112 1097 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
SEMA4GQ9NTN9 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
SEMA4GQ9NTN9 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
SEMA4GQ9NTN9 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
SEMA4GQ9NTN9 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
SEMA4GQ9NTN9 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
SEMA4GQ9NTN9 VDAC1-203ENST00000395047 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
SEMA4GQ9NTN9 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
SEMA4GQ9NTN9 USP45-205ENST00000472914 1617 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
SEMA4GQ9NTN9 MTHFS-201ENST00000258874 907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
SEMA4GQ9NTN9 ELF3-AS1-202ENST00000419190 788 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
SEMA4GQ9NTN9 AC093833.1-201ENST00000442821 553 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
SEMA4GQ9NTN9 KRT18P20-201ENST00000548986 1279 ntBASIC21.31■■□□□ 1
SEMA4GQ9NTN9 AC003102.1-201ENST00000588279 569 ntTSL 4 BASIC21.31■■□□□ 1
SEMA4GQ9NTN9 AC006058.3-201ENST00000606217 1069 ntBASIC21.31■■□□□ 1
SEMA4GQ9NTN9 BX649632.1-201ENST00000610187 819 ntTSL 3 BASIC21.31■■□□□ 1
SEMA4GQ9NTN9 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
SEMA4GQ9NTN9 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
SEMA4GQ9NTN9 SLC2A11-202ENST00000316185 1555 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
SEMA4GQ9NTN9 AC068338.2-201ENST00000563278 1430 ntBASIC21.3■■□□□ 1
SEMA4GQ9NTN9 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
SEMA4GQ9NTN9 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
SEMA4GQ9NTN9 CCDC107-202ENST00000378406 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
SEMA4GQ9NTN9 CCDC107-206ENST00000426546 1242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
SEMA4GQ9NTN9 YKT6-207ENST00000496112 1270 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
SEMA4GQ9NTN9 EIF3J-AS1-205ENST00000560750 1093 ntTSL 3 BASIC21.3■■□□□ 1
SEMA4GQ9NTN9 FAM71E1-204ENST00000600100 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
SEMA4GQ9NTN9 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
SEMA4GQ9NTN9 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
SEMA4GQ9NTN9 UBE3C-209ENST00000611269 1866 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
SEMA4GQ9NTN9 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
SEMA4GQ9NTN9 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
SEMA4GQ9NTN9 ELOA3B-201ENST00000611323 1641 ntAPPRIS P1 BASIC21.29■■□□□ 1
SEMA4GQ9NTN9 ELOA3D-201ENST00000620881 1641 ntAPPRIS P1 BASIC21.29■■□□□ 1
SEMA4GQ9NTN9 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
SEMA4GQ9NTN9 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
SEMA4GQ9NTN9 PITX3-201ENST00000370002 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
SEMA4GQ9NTN9 AC007285.1-201ENST00000422239 893 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
SEMA4GQ9NTN9 ASMTL-AS1-203ENST00000425740 840 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
SEMA4GQ9NTN9 AP000697.1-201ENST00000430607 339 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
SEMA4GQ9NTN9 UNC93B6-201ENST00000525262 1143 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
SEMA4GQ9NTN9 AP000785.1-201ENST00000527314 613 ntTSL 4 BASIC21.29■■□□□ 1
SEMA4GQ9NTN9 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
SEMA4GQ9NTN9 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
SEMA4GQ9NTN9 ABHD6-205ENST00000478253 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
SEMA4GQ9NTN9 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
SEMA4GQ9NTN9 ADAM22-209ENST00000439864 2576 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
SEMA4GQ9NTN9 OIP5-201ENST00000220514 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
SEMA4GQ9NTN9 GCC2-AS1-201ENST00000322353 558 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
SEMA4GQ9NTN9 DNPH1-202ENST00000393987 796 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
SEMA4GQ9NTN9 ZCCHC9-204ENST00000438268 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
SEMA4GQ9NTN9 AC010141.2-201ENST00000452426 721 ntBASIC21.28■■□□□ 1
SEMA4GQ9NTN9 AC128676.1-201ENST00000454392 318 ntBASIC21.28■■□□□ 1
SEMA4GQ9NTN9 COL19A1-203ENST00000478620 589 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
SEMA4GQ9NTN9 UNC93B4-201ENST00000505679 747 ntBASIC21.28■■□□□ 1
SEMA4GQ9NTN9 AC110285.4-201ENST00000572590 424 ntTSL 3 BASIC21.28■■□□□ 1
SEMA4GQ9NTN9 CIRBP-211ENST00000586773 942 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
SEMA4GQ9NTN9 AC083880.1-201ENST00000608266 535 ntBASIC21.28■■□□□ 1
SEMA4GQ9NTN9 OR10C1-204ENST00000622521 1039 ntBASIC21.28■■□□□ 1
SEMA4GQ9NTN9 PLAGL1-207ENST00000417959 1645 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
SEMA4GQ9NTN9 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
SEMA4GQ9NTN9 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
SEMA4GQ9NTN9 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
SEMA4GQ9NTN9 MTHFD1L-201ENST00000367307 1049 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
SEMA4GQ9NTN9 SMNDC1-201ENST00000369592 1110 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.27■■□□□ 1
SEMA4GQ9NTN9 LINC01191-201ENST00000412690 844 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
SEMA4GQ9NTN9 LINC01816-201ENST00000414141 662 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
SEMA4GQ9NTN9 GNAS-AS1-201ENST00000424094 1156 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
SEMA4GQ9NTN9 UQCRFS1P1-201ENST00000435169 820 ntBASIC21.27■■□□□ 1
SEMA4GQ9NTN9 NREP-209ENST00000455559 698 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.27■■□□□ 1
SEMA4GQ9NTN9 TERF1P5-201ENST00000477545 1207 ntBASIC21.27■■□□□ 1
SEMA4GQ9NTN9 CIRBP-246ENST00000628979 1043 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
SEMA4GQ9NTN9 CTU2-201ENST00000312060 1672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
SEMA4GQ9NTN9 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
SEMA4GQ9NTN9 CASP9-203ENST00000375890 1351 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
SEMA4GQ9NTN9 CDX1-201ENST00000231656 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
SEMA4GQ9NTN9 PXK-203ENST00000383715 1756 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
SEMA4GQ9NTN9 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
SEMA4GQ9NTN9 AC096677.1-201ENST00000454651 1516 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
SEMA4GQ9NTN9 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
SEMA4GQ9NTN9 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
SEMA4GQ9NTN9 GDI1-204ENST00000447750 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
SEMA4GQ9NTN9 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
SEMA4GQ9NTN9 EFCAB6-202ENST00000356087 1129 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
SEMA4GQ9NTN9 GTF2A2-203ENST00000396061 758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
SEMA4GQ9NTN9 AC097658.1-201ENST00000475555 843 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
SEMA4GQ9NTN9 OGFR-204ENST00000621591 1194 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
SEMA4GQ9NTN9 AC008694.1-202ENST00000636953 945 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.6 ms