Protein–RNA interactions for Protein: Q9NSE7

ABCC13, Putative ATP-binding cassette sub-family C member 13, humanhuman

Predictions only

Length 274 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ABCC13Q9NSE7 SFTPC-205ENST00000521315 1046 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
ABCC13Q9NSE7 TSEN15-207ENST00000533373 618 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
ABCC13Q9NSE7 IL15RA-206ENST00000397248 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
ABCC13Q9NSE7 CERKL-204ENST00000374970 1392 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
ABCC13Q9NSE7 TPM4-201ENST00000300933 2666 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
ABCC13Q9NSE7 MME-202ENST00000382989 1319 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
ABCC13Q9NSE7 TLX2-201ENST00000233638 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
ABCC13Q9NSE7 NPTXR-201ENST00000333039 5784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
ABCC13Q9NSE7 MFF-207ENST00000409565 1548 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
ABCC13Q9NSE7 LINC02175-201ENST00000571219 1875 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
ABCC13Q9NSE7 RNF39-201ENST00000244360 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
ABCC13Q9NSE7 TSPAN3-202ENST00000346495 1647 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
ABCC13Q9NSE7 DACT2-203ENST00000607983 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
ABCC13Q9NSE7 BCKDHB-203ENST00000369760 743 ntTSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.17
ABCC13Q9NSE7 PARL-206ENST00000435888 1098 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
ABCC13Q9NSE7 CALM1-202ENST00000447653 1104 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
ABCC13Q9NSE7 TPT1-AS1-211ENST00000520622 604 ntTSL 4 BASIC22.33■■□□□ 1.17
ABCC13Q9NSE7 AC018553.2-201ENST00000637770 1064 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
ABCC13Q9NSE7 MFSD6L-201ENST00000329805 2188 ntAPPRIS P1 BASIC22.33■■□□□ 1.16
ABCC13Q9NSE7 ZNF444-201ENST00000337080 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
ABCC13Q9NSE7 PLEKHA8-208ENST00000622102 2140 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.16
ABCC13Q9NSE7 IL17RE-201ENST00000383814 2704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
ABCC13Q9NSE7 TPRN-202ENST00000409012 2718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
ABCC13Q9NSE7 SERTAD3-201ENST00000322354 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
ABCC13Q9NSE7 FMR1-AS1-202ENST00000596112 1845 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
ABCC13Q9NSE7 KAT2B-201ENST00000263754 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
ABCC13Q9NSE7 JSRP1-201ENST00000300961 1138 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
ABCC13Q9NSE7 UBE2D3-201ENST00000321805 1087 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
ABCC13Q9NSE7 YJEFN3-203ENST00000514277 995 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
ABCC13Q9NSE7 AL512625.3-202ENST00000591993 1091 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
ABCC13Q9NSE7 HSD17B14-204ENST00000599157 991 ntTSL 3 BASIC22.32■■□□□ 1.16
ABCC13Q9NSE7 KCNMA1-224ENST00000618048 1269 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
ABCC13Q9NSE7 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
ABCC13Q9NSE7 AP004607.4-201ENST00000530158 1459 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
ABCC13Q9NSE7 KRT87P-202ENST00000534226 1464 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
ABCC13Q9NSE7 IFNGR2-203ENST00000405436 1684 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
ABCC13Q9NSE7 EPHA8-202ENST00000374644 1802 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
ABCC13Q9NSE7 AL117328.2-201ENST00000624617 1940 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
ABCC13Q9NSE7 BEST2-204ENST00000553030 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
ABCC13Q9NSE7 LMF1-202ENST00000543238 2103 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
ABCC13Q9NSE7 KCNK13-201ENST00000282146 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
ABCC13Q9NSE7 NBL1-202ENST00000375136 2172 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
ABCC13Q9NSE7 SMPD5-201ENST00000528912 1390 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
ABCC13Q9NSE7 LY6E-201ENST00000292494 1181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
ABCC13Q9NSE7 AC012414.4-201ENST00000560839 1074 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
ABCC13Q9NSE7 GALNS-213ENST00000569433 723 ntTSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
ABCC13Q9NSE7 AC060814.5-201ENST00000630916 1074 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
ABCC13Q9NSE7 AP001160.5-201ENST00000636508 485 ntAPPRIS P1 BASIC22.31■■□□□ 1.16
ABCC13Q9NSE7 EGR4-202ENST00000545030 2372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
ABCC13Q9NSE7 ALG1L9P-201ENST00000508969 2165 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
ABCC13Q9NSE7 HACD1-202ENST00000361271 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
ABCC13Q9NSE7 HLA-C-203ENST00000383329 1554 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
ABCC13Q9NSE7 ANKHD1-205ENST00000394723 2135 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
ABCC13Q9NSE7 GPR137B-202ENST00000366592 2042 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
ABCC13Q9NSE7 CAMKK2-208ENST00000412367 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
ABCC13Q9NSE7 NRL-201ENST00000396995 810 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
ABCC13Q9NSE7 ATE1-AS1-201ENST00000437593 951 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
ABCC13Q9NSE7 AC104564.3-201ENST00000582367 638 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
ABCC13Q9NSE7 AC079328.2-202ENST00000560903 1410 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
ABCC13Q9NSE7 AC004854.2-201ENST00000608450 1441 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
ABCC13Q9NSE7 ARL13B-205ENST00000471138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
ABCC13Q9NSE7 NABP2-203ENST00000380198 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
ABCC13Q9NSE7 SPHK1-201ENST00000323374 2138 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
ABCC13Q9NSE7 SYNGR2-203ENST00000588282 1553 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
ABCC13Q9NSE7 BICDL2-201ENST00000389347 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
ABCC13Q9NSE7 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
ABCC13Q9NSE7 UCHL1-201ENST00000284440 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
ABCC13Q9NSE7 TNFRSF18-202ENST00000379265 705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
ABCC13Q9NSE7 C19orf12-205ENST00000392278 895 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
ABCC13Q9NSE7 KRTAP5-2-201ENST00000412090 1118 ntAPPRIS P1 BASIC22.29■■□□□ 1.16
ABCC13Q9NSE7 PGAP3-204ENST00000429199 970 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
ABCC13Q9NSE7 UCHL1-210ENST00000512788 785 ntTSL 3 BASIC22.29■■□□□ 1.16
ABCC13Q9NSE7 TESC-206ENST00000541210 936 ntTSL 3 BASIC22.29■■□□□ 1.16
ABCC13Q9NSE7 PACRGL-227ENST00000513459 1773 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
ABCC13Q9NSE7 ECHDC2-221ENST00000536120 1446 ntTSL 3 BASIC22.29■■□□□ 1.16
ABCC13Q9NSE7 ENTPD5-206ENST00000556242 1437 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
ABCC13Q9NSE7 CHRAC1-203ENST00000519533 1678 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
ABCC13Q9NSE7 ZNF568-208ENST00000586353 1902 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
ABCC13Q9NSE7 CPE-201ENST00000402744 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
ABCC13Q9NSE7 AC092384.1-201ENST00000378347 1812 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
ABCC13Q9NSE7 ST3GAL4-215ENST00000532243 1825 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
ABCC13Q9NSE7 GGA2-211ENST00000567468 1713 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
ABCC13Q9NSE7 GATA1-202ENST00000376670 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
ABCC13Q9NSE7 PROSER2-205ENST00000622831 1646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
ABCC13Q9NSE7 MXRA8-203ENST00000445648 2001 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
ABCC13Q9NSE7 CITED2-202ENST00000536159 1797 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.28■■□□□ 1.16
ABCC13Q9NSE7 CITED2-203ENST00000537332 1780 ntTSL 3 BASIC22.28■■□□□ 1.16
ABCC13Q9NSE7 CBWD3-202ENST00000377342 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
ABCC13Q9NSE7 HIST2H2AC-201ENST00000331380 390 ntAPPRIS P1 BASIC22.28■■□□□ 1.16
ABCC13Q9NSE7 TRAPPC2L-213ENST00000567895 854 ntTSL 3 BASIC22.28■■□□□ 1.16
ABCC13Q9NSE7 AC140479.5-201ENST00000568189 735 ntTSL 3 BASIC22.28■■□□□ 1.16
ABCC13Q9NSE7 CIRBP-222ENST00000589235 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
ABCC13Q9NSE7 FAM99A-202ENST00000538190 1989 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
ABCC13Q9NSE7 SLC2A11-202ENST00000316185 1555 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
ABCC13Q9NSE7 GMDS-202ENST00000380815 1752 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
ABCC13Q9NSE7 ANKRD19P-205ENST00000473204 2370 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
ABCC13Q9NSE7 AGAP3-201ENST00000335367 2675 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
ABCC13Q9NSE7 AKT1S1-206ENST00000391834 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
ABCC13Q9NSE7 C5orf38-201ENST00000334000 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
ABCC13Q9NSE7 SELENOO-201ENST00000380903 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.2 ms