Protein–RNA interactions for Protein: Q9NSC5

HOMER3, Homer protein homolog 3, humanhuman

Predictions only

Length 361 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOMER3Q9NSC5 IRX4-207ENST00000613726 2403 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
HOMER3Q9NSC5 SCRN2-212ENST00000584123 1745 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
HOMER3Q9NSC5 TNFAIP8L3-202ENST00000637513 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
HOMER3Q9NSC5 FAM120B-204ENST00000625626 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
HOMER3Q9NSC5 FAM193B-217ENST00000514747 2913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
HOMER3Q9NSC5 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
HOMER3Q9NSC5 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
HOMER3Q9NSC5 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
HOMER3Q9NSC5 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
HOMER3Q9NSC5 COMT-202ENST00000361682 2437 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
HOMER3Q9NSC5 HLA-C-203ENST00000383329 1554 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
HOMER3Q9NSC5 TLE3-216ENST00000559191 1575 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
HOMER3Q9NSC5 NRXN1-202ENST00000342183 3315 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
HOMER3Q9NSC5 FEM1AP4-201ENST00000443167 1987 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
HOMER3Q9NSC5 PXK-211ENST00000484288 2031 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
HOMER3Q9NSC5 TTYH1-203ENST00000376531 1763 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
HOMER3Q9NSC5 FBXL14-201ENST00000339235 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
HOMER3Q9NSC5 PPP1R12B-212ENST00000480184 1808 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
HOMER3Q9NSC5 IMPA2-201ENST00000269159 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
HOMER3Q9NSC5 CCSAP-203ENST00000366687 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
HOMER3Q9NSC5 CCNL1-203ENST00000461804 1998 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
HOMER3Q9NSC5 PALM-202ENST00000338448 2725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
HOMER3Q9NSC5 AC010141.3-201ENST00000456659 717 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
HOMER3Q9NSC5 DYRK3-202ENST00000367108 2218 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
HOMER3Q9NSC5 OSR1-201ENST00000272223 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
HOMER3Q9NSC5 TMC6-212ENST00000589553 2389 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
HOMER3Q9NSC5 SNUPN-201ENST00000308588 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
HOMER3Q9NSC5 C2CD4B-201ENST00000380392 1579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
HOMER3Q9NSC5 RAP1B-204ENST00000393436 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
HOMER3Q9NSC5 UBA5-211ENST00000493720 2058 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
HOMER3Q9NSC5 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
HOMER3Q9NSC5 MIR17HG-201ENST00000400282 931 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
HOMER3Q9NSC5 AL122058.1-201ENST00000412321 1166 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
HOMER3Q9NSC5 MIR3621-201ENST00000580529 85 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
HOMER3Q9NSC5 AC096887.1-203ENST00000607203 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
HOMER3Q9NSC5 DBX2-201ENST00000332700 2806 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
HOMER3Q9NSC5 HSPB2-201ENST00000304298 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
HOMER3Q9NSC5 ZNF707-201ENST00000358656 2183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
HOMER3Q9NSC5 MFSD7-209ENST00000515118 1556 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
HOMER3Q9NSC5 TIMM50-201ENST00000314349 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
HOMER3Q9NSC5 DUSP9-202ENST00000370167 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
HOMER3Q9NSC5 B4GALNT1-203ENST00000449184 1633 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.15
HOMER3Q9NSC5 TRIM3-202ENST00000359518 3042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.15
HOMER3Q9NSC5 MFF-203ENST00000349901 1716 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
HOMER3Q9NSC5 XBP1-207ENST00000611155 1794 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
HOMER3Q9NSC5 KLC2-207ENST00000421552 2721 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
HOMER3Q9NSC5 UBE2E2-203ENST00000425792 1248 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
HOMER3Q9NSC5 CCDC189-211ENST00000545825 1046 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
HOMER3Q9NSC5 KRAS-204ENST00000557334 1052 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
HOMER3Q9NSC5 ZNRF1-205ENST00000566250 1069 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
HOMER3Q9NSC5 ZNRF1-206ENST00000567962 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
HOMER3Q9NSC5 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
HOMER3Q9NSC5 CCDC194-202ENST00000636079 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
HOMER3Q9NSC5 NUDT16L1-204ENST00000586536 1406 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
HOMER3Q9NSC5 RNF166-202ENST00000537718 1525 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
HOMER3Q9NSC5 DUSP5-201ENST00000369583 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
HOMER3Q9NSC5 LRRC4B-201ENST00000389201 2958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
HOMER3Q9NSC5 LMAN2-201ENST00000303127 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
HOMER3Q9NSC5 FLVCR1-201ENST00000366971 5939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
HOMER3Q9NSC5 PSIP1-201ENST00000380715 1966 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
HOMER3Q9NSC5 MSANTD1-204ENST00000510580 2039 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
HOMER3Q9NSC5 ARFGAP3-201ENST00000263245 2857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
HOMER3Q9NSC5 KISS1-201ENST00000367194 709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
HOMER3Q9NSC5 AC103702.2-201ENST00000433510 1270 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
HOMER3Q9NSC5 CDKN2A-208ENST00000498124 880 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
HOMER3Q9NSC5 AL034346.1-201ENST00000568244 1277 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
HOMER3Q9NSC5 AC091982.4-201ENST00000623943 726 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
HOMER3Q9NSC5 TUBBP5-204ENST00000635438 565 ntTSL 4 BASIC22.19■■□□□ 1.14
HOMER3Q9NSC5 TBX1-203ENST00000359500 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
HOMER3Q9NSC5 UCHL5-201ENST00000367448 1534 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
HOMER3Q9NSC5 PRR16-202ENST00000407149 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
HOMER3Q9NSC5 HSF2BP-201ENST00000291560 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
HOMER3Q9NSC5 ARSA-202ENST00000356098 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
HOMER3Q9NSC5 AC026471.6-201ENST00000622954 1905 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
HOMER3Q9NSC5 GPSM1-201ENST00000291775 2114 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
HOMER3Q9NSC5 TPST1-201ENST00000304842 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
HOMER3Q9NSC5 C8orf82-201ENST00000313465 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
HOMER3Q9NSC5 LINC01123-202ENST00000419296 2436 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
HOMER3Q9NSC5 EML6-201ENST00000356458 8320 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
HOMER3Q9NSC5 INAFM2-202ENST00000638170 3052 ntAPPRIS P1 BASIC22.19■■□□□ 1.14
HOMER3Q9NSC5 EED-201ENST00000263360 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
HOMER3Q9NSC5 CPEB1-AS1-201ENST00000560650 2138 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
HOMER3Q9NSC5 PRICKLE3-206ENST00000599218 2062 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
HOMER3Q9NSC5 PPP1R3F-203ENST00000466508 1885 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
HOMER3Q9NSC5 SYNGR2-203ENST00000588282 1553 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
HOMER3Q9NSC5 OXCT2P1-201ENST00000447263 1535 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
HOMER3Q9NSC5 SRD5A1P1-201ENST00000442297 786 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
HOMER3Q9NSC5 AC019163.1-201ENST00000512634 610 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
HOMER3Q9NSC5 C16orf59-201ENST00000361837 1662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
HOMER3Q9NSC5 B3GALT4-204ENST00000451237 1694 ntAPPRIS P1 BASIC22.17■■□□□ 1.14
HOMER3Q9NSC5 WDR86-203ENST00000469830 1691 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
HOMER3Q9NSC5 LSM14A-202ENST00000540746 2152 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
HOMER3Q9NSC5 UBE2C-202ENST00000335046 737 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
HOMER3Q9NSC5 DPP10-AS1-201ENST00000432658 730 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
HOMER3Q9NSC5 PABPN1-207ENST00000556821 1220 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
HOMER3Q9NSC5 ARHGDIA-217ENST00000584461 886 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
HOMER3Q9NSC5 ALDH6A1-201ENST00000350259 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
HOMER3Q9NSC5 TEX22-201ENST00000451127 2571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
HOMER3Q9NSC5 SLC1A6-203ENST00000544886 2420 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
HOMER3Q9NSC5 EPN1-201ENST00000085079 2355 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.5 ms