Protein–RNA interactions for Protein: Q9NS68

TNFRSF19, Tumor necrosis factor receptor superfamily member 19, humanhuman

Predictions only

Length 423 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNFRSF19Q9NS68 LSM11-201ENST00000286307 6584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
TNFRSF19Q9NS68 STK25-234ENST00000535007 2459 ntTSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
TNFRSF19Q9NS68 AIDA-202ENST00000355727 1072 ntTSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
TNFRSF19Q9NS68 PPA1-202ENST00000373232 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
TNFRSF19Q9NS68 MPRIP-203ENST00000395806 527 ntTSL 3 BASIC17.55■□□□□ 0.4
TNFRSF19Q9NS68 AC084116.4-201ENST00000524320 484 ntTSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
TNFRSF19Q9NS68 FAM129C-211ENST00000600871 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
TNFRSF19Q9NS68 UBA5-208ENST00000473651 1513 ntTSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
TNFRSF19Q9NS68 TPST2-203ENST00000403880 2084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
TNFRSF19Q9NS68 FBRS-202ENST00000356166 5200 ntTSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
TNFRSF19Q9NS68 ATP6V0A2-201ENST00000330342 6542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
TNFRSF19Q9NS68 MEF2A-202ENST00000354410 5824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
TNFRSF19Q9NS68 GCA-201ENST00000233612 1694 ntTSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
TNFRSF19Q9NS68 MAP2K5-204ENST00000395476 1689 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
TNFRSF19Q9NS68 RAD9A-201ENST00000307980 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
TNFRSF19Q9NS68 MIR222HG-201ENST00000602461 1379 ntTSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
TNFRSF19Q9NS68 NKX3-2-201ENST00000382438 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
TNFRSF19Q9NS68 AC135048.1-201ENST00000566056 1318 ntTSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
TNFRSF19Q9NS68 ZNF354A-201ENST00000335815 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
TNFRSF19Q9NS68 COMT-203ENST00000403184 2217 ntTSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
TNFRSF19Q9NS68 UCHL1-201ENST00000284440 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
TNFRSF19Q9NS68 COX20-201ENST00000366528 568 ntTSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
TNFRSF19Q9NS68 AC016769.1-201ENST00000409132 1010 ntBASIC17.54■□□□□ 0.4
TNFRSF19Q9NS68 UCHL1-210ENST00000512788 785 ntTSL 3 BASIC17.54■□□□□ 0.4
TNFRSF19Q9NS68 GABARAPL2-205ENST00000568455 646 ntTSL 3 BASIC17.54■□□□□ 0.4
TNFRSF19Q9NS68 AC007773.1-201ENST00000592680 972 ntTSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
TNFRSF19Q9NS68 HOMEZ-201ENST00000357460 4971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
TNFRSF19Q9NS68 HTATIP2-204ENST00000451739 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
TNFRSF19Q9NS68 BX088645.1-201ENST00000636699 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
TNFRSF19Q9NS68 ENTPD5-206ENST00000556242 1437 ntTSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
TNFRSF19Q9NS68 ASB6-201ENST00000277458 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
TNFRSF19Q9NS68 YY1AP1-212ENST00000404643 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
TNFRSF19Q9NS68 AC004980.1-201ENST00000418663 2667 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
TNFRSF19Q9NS68 EYA2-203ENST00000357410 2465 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
TNFRSF19Q9NS68 RASSF5-202ENST00000579436 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
TNFRSF19Q9NS68 SEC22C-207ENST00000423701 1458 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
TNFRSF19Q9NS68 HSD17B14-201ENST00000263278 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
TNFRSF19Q9NS68 POLR3GL-201ENST00000369313 818 ntTSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
TNFRSF19Q9NS68 ADAMTS13-204ENST00000371911 1155 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
TNFRSF19Q9NS68 AC010141.3-201ENST00000456659 717 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
TNFRSF19Q9NS68 AC137761.2-201ENST00000561729 223 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
TNFRSF19Q9NS68 AC140479.5-201ENST00000568189 735 ntTSL 3 BASIC17.53■□□□□ 0.4
TNFRSF19Q9NS68 AC145350.3-201ENST00000569033 163 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
TNFRSF19Q9NS68 FIZ1-205ENST00000592585 489 ntTSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
TNFRSF19Q9NS68 DISC1-224ENST00000639374 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
TNFRSF19Q9NS68 NAE1-202ENST00000359087 1825 ntTSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
TNFRSF19Q9NS68 IL15RA-204ENST00000379977 1626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
TNFRSF19Q9NS68 ARRDC1-AS1-201ENST00000371417 1409 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
TNFRSF19Q9NS68 CCSAP-203ENST00000366687 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
TNFRSF19Q9NS68 TDRKH-206ENST00000440583 2296 ntTSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
TNFRSF19Q9NS68 AC073188.6-202ENST00000616616 2281 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
TNFRSF19Q9NS68 SOCS1-201ENST00000332029 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
TNFRSF19Q9NS68 STYXL1-204ENST00000360591 1127 ntTSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
TNFRSF19Q9NS68 PGAP3-204ENST00000429199 970 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
TNFRSF19Q9NS68 COX4I1-216ENST00000568794 794 ntTSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
TNFRSF19Q9NS68 GNAO1-211ENST00000570235 568 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
TNFRSF19Q9NS68 AC243773.2-201ENST00000616341 490 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
TNFRSF19Q9NS68 RASD1-202ENST00000579152 1404 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
TNFRSF19Q9NS68 LINC00526-201ENST00000581067 1875 ntBASIC17.52■□□□□ 0.39
TNFRSF19Q9NS68 AC093323.1-201ENST00000307533 2311 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
TNFRSF19Q9NS68 DPEP2-204ENST00000572888 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
TNFRSF19Q9NS68 GATA1-202ENST00000376670 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
TNFRSF19Q9NS68 TUBG1-201ENST00000251413 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
TNFRSF19Q9NS68 CELF5-201ENST00000292672 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
TNFRSF19Q9NS68 AC062017.1-203ENST00000413029 455 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
TNFRSF19Q9NS68 MELTF-AS1-202ENST00000415244 951 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
TNFRSF19Q9NS68 FGF12-AS2-201ENST00000443165 580 ntTSL 4 BASIC17.51■□□□□ 0.39
TNFRSF19Q9NS68 AC012414.4-201ENST00000560839 1074 ntTSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
TNFRSF19Q9NS68 SLC19A1-212ENST00000567670 2029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
TNFRSF19Q9NS68 GALNS-213ENST00000569433 723 ntTSL 3 BASIC17.51■□□□□ 0.39
TNFRSF19Q9NS68 AC060814.5-201ENST00000630916 1074 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
TNFRSF19Q9NS68 ARHGAP5-203ENST00000396582 5786 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
TNFRSF19Q9NS68 BX005040.4-201ENST00000637145 1518 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
TNFRSF19Q9NS68 LTB4R-201ENST00000345363 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
TNFRSF19Q9NS68 STX4-201ENST00000313843 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
TNFRSF19Q9NS68 AC009506.1-201ENST00000418474 1494 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
TNFRSF19Q9NS68 SPOCK3-222ENST00000512681 1457 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
TNFRSF19Q9NS68 ZNF444-201ENST00000337080 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
TNFRSF19Q9NS68 HNRNPM-202ENST00000348943 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
TNFRSF19Q9NS68 ECEL1P1-201ENST00000373592 1742 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
TNFRSF19Q9NS68 H2AFY2-201ENST00000373255 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
TNFRSF19Q9NS68 SPINT2-201ENST00000301244 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
TNFRSF19Q9NS68 KEAP1-202ENST00000393623 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
TNFRSF19Q9NS68 ZFYVE9-201ENST00000287727 5194 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
TNFRSF19Q9NS68 TAF9-201ENST00000217893 1283 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
TNFRSF19Q9NS68 SMIM12-202ENST00000423898 897 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
TNFRSF19Q9NS68 TUSC3-209ENST00000509380 1266 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
TNFRSF19Q9NS68 TRIM2-212ENST00000632856 656 ntTSL 3 BASIC17.5■□□□□ 0.39
TNFRSF19Q9NS68 DLL3-202ENST00000356433 2055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
TNFRSF19Q9NS68 MATK-203ENST00000395045 2073 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
TNFRSF19Q9NS68 ESRRAP2-201ENST00000418437 1549 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
TNFRSF19Q9NS68 ASPSCR1-208ENST00000580534 1776 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
TNFRSF19Q9NS68 CREG1-201ENST00000370509 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
TNFRSF19Q9NS68 ZNF419-203ENST00000354197 1569 ntTSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
TNFRSF19Q9NS68 NFKBID-201ENST00000396901 1834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
TNFRSF19Q9NS68 NFKBID-211ENST00000641389 1834 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
TNFRSF19Q9NS68 CPE-201ENST00000402744 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
TNFRSF19Q9NS68 TMEM235-205ENST00000586400 2272 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
TNFRSF19Q9NS68 GAL3ST1-202ENST00000401975 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
TNFRSF19Q9NS68 PHLDA3-201ENST00000367309 896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.8 ms