Protein–RNA interactions for Protein: Q9NRD1

FBXO6, F-box only protein 6, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 293 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FBXO6Q9NRD1 P4HTM-202ENST00000383729 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
FBXO6Q9NRD1 DISC1-205ENST00000366636 2224 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
FBXO6Q9NRD1 CLK3-202ENST00000395066 2621 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
FBXO6Q9NRD1 SLC47A1P1-202ENST00000449666 945 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
FBXO6Q9NRD1 LINC01632-201ENST00000615763 496 ntTSL 3 BASIC21.55■■□□□ 1.04
FBXO6Q9NRD1 MIR210HG-201ENST00000500447 1965 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
FBXO6Q9NRD1 MAGI2-212ENST00000626691 4599 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
FBXO6Q9NRD1 LRP5-201ENST00000294304 5159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
FBXO6Q9NRD1 A1BG-201ENST00000263100 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
FBXO6Q9NRD1 BAZ1A-201ENST00000358716 5920 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
FBXO6Q9NRD1 GCH1-206ENST00000543643 1897 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
FBXO6Q9NRD1 EIF2B4-211ENST00000616081 1754 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
FBXO6Q9NRD1 C1orf174-201ENST00000361605 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
FBXO6Q9NRD1 RUNX3-202ENST00000338888 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
FBXO6Q9NRD1 TSKS-202ENST00000358830 1367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
FBXO6Q9NRD1 DCTPP1-201ENST00000319285 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
FBXO6Q9NRD1 LGALS9B-201ENST00000324290 1243 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
FBXO6Q9NRD1 AP006621.3-202ENST00000530083 765 ntTSL 3 BASIC21.54■■□□□ 1.04
FBXO6Q9NRD1 RPRD1A-207ENST00000588737 1264 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
FBXO6Q9NRD1 PLEKHJ1-213ENST00000591099 1092 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
FBXO6Q9NRD1 SF1-220ENST00000626028 704 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
FBXO6Q9NRD1 KLHDC1-201ENST00000359332 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
FBXO6Q9NRD1 PSKH1-202ENST00000570631 1509 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
FBXO6Q9NRD1 CCDC189-206ENST00000543610 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
FBXO6Q9NRD1 AGMAT-201ENST00000375826 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
FBXO6Q9NRD1 TUB-201ENST00000299506 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
FBXO6Q9NRD1 DUSP26-201ENST00000256261 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
FBXO6Q9NRD1 CDK5R2-201ENST00000302625 2508 ntAPPRIS P1 BASIC21.53■■□□□ 1.04
FBXO6Q9NRD1 SERTAD3-201ENST00000322354 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
FBXO6Q9NRD1 REPS2-202ENST00000357277 7953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
FBXO6Q9NRD1 C19orf60-201ENST00000358607 839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
FBXO6Q9NRD1 MAST4-205ENST00000406039 717 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
FBXO6Q9NRD1 KDELR3-202ENST00000409006 931 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
FBXO6Q9NRD1 NKX2-5-202ENST00000424406 1124 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
FBXO6Q9NRD1 C19orf60-202ENST00000450195 702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
FBXO6Q9NRD1 AC010141.3-201ENST00000456659 717 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
FBXO6Q9NRD1 AC004707.1-201ENST00000511627 715 ntTSL 3 BASIC21.53■■□□□ 1.04
FBXO6Q9NRD1 AC087239.1-201ENST00000622671 572 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
FBXO6Q9NRD1 FAM110A-206ENST00000541082 1614 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.53■■□□□ 1.04
FBXO6Q9NRD1 B4GALNT1-202ENST00000418555 1861 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
FBXO6Q9NRD1 OR7E47P-201ENST00000546390 1422 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
FBXO6Q9NRD1 DCAF4-202ENST00000358377 2024 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
FBXO6Q9NRD1 C12orf75-208ENST00000612117 1329 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
FBXO6Q9NRD1 LSM14A-202ENST00000540746 2152 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
FBXO6Q9NRD1 ADAP2-204ENST00000580525 1598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
FBXO6Q9NRD1 KCNQ5-205ENST00000370398 6345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
FBXO6Q9NRD1 TGFBR3L-202ENST00000565886 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
FBXO6Q9NRD1 FIZ1-205ENST00000592585 489 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
FBXO6Q9NRD1 TGFBR1-202ENST00000374994 6516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
FBXO6Q9NRD1 HMGA2-205ENST00000425208 1444 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
FBXO6Q9NRD1 AOC1-202ENST00000416793 2453 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
FBXO6Q9NRD1 RHBDD2-201ENST00000006777 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
FBXO6Q9NRD1 FMR1-201ENST00000218200 4333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
FBXO6Q9NRD1 C22orf34-203ENST00000405854 1593 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
FBXO6Q9NRD1 NKX2-5-201ENST00000329198 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
FBXO6Q9NRD1 ME2-206ENST00000638410 2289 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.03
FBXO6Q9NRD1 ME2-210ENST00000639255 2262 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.03
FBXO6Q9NRD1 LHFPL3-202ENST00000424859 1852 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
FBXO6Q9NRD1 EXOC3L2-202ENST00000413988 2964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
FBXO6Q9NRD1 TSPAN3-202ENST00000346495 1647 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
FBXO6Q9NRD1 PLD6-201ENST00000321560 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
FBXO6Q9NRD1 S1PR5-202ENST00000439028 2191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
FBXO6Q9NRD1 RAP2C-202ENST00000370874 2333 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
FBXO6Q9NRD1 C1QL4-201ENST00000334221 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
FBXO6Q9NRD1 ADCK2-201ENST00000072869 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
FBXO6Q9NRD1 TMEM51-203ENST00000400796 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
FBXO6Q9NRD1 BOK-201ENST00000318407 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
FBXO6Q9NRD1 POLR3GL-201ENST00000369313 818 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
FBXO6Q9NRD1 PTMA-205ENST00000410064 814 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
FBXO6Q9NRD1 ABLIM2-205ENST00000428004 2573 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
FBXO6Q9NRD1 SOX21-201ENST00000376945 2778 ntAPPRIS P1 BASIC21.51■■□□□ 1.03
FBXO6Q9NRD1 EPHA6-202ENST00000470610 2058 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
FBXO6Q9NRD1 GSPT1-203ENST00000439887 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
FBXO6Q9NRD1 ERLEC1-202ENST00000378239 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
FBXO6Q9NRD1 POLR2F-205ENST00000442738 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
FBXO6Q9NRD1 PILRB-207ENST00000448382 2314 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
FBXO6Q9NRD1 MFSD6L-201ENST00000329805 2188 ntAPPRIS P1 BASIC21.5■■□□□ 1.03
FBXO6Q9NRD1 ALDH6A1-201ENST00000350259 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
FBXO6Q9NRD1 LINC02175-201ENST00000571219 1875 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
FBXO6Q9NRD1 MFSD7-209ENST00000515118 1556 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
FBXO6Q9NRD1 KCTD13-207ENST00000568000 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
FBXO6Q9NRD1 CAV2-201ENST00000222693 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
FBXO6Q9NRD1 UNC93B3-201ENST00000308076 687 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
FBXO6Q9NRD1 STRADB-201ENST00000194530 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
FBXO6Q9NRD1 DOK3-201ENST00000312943 2292 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
FBXO6Q9NRD1 NPAS3-210ENST00000551492 2817 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
FBXO6Q9NRD1 CDV3-201ENST00000264993 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
FBXO6Q9NRD1 PAXIP1-202ENST00000404141 3827 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
FBXO6Q9NRD1 RARA-201ENST00000254066 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
FBXO6Q9NRD1 GPR162-201ENST00000311268 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
FBXO6Q9NRD1 AURKAIP1-204ENST00000378853 875 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
FBXO6Q9NRD1 KRTAP5-1-201ENST00000382171 942 ntAPPRIS P1 BASIC21.49■■□□□ 1.03
FBXO6Q9NRD1 TYROBP-203ENST00000544690 522 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
FBXO6Q9NRD1 C15orf61-202ENST00000557807 769 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
FBXO6Q9NRD1 PCSK6-217ENST00000618548 4269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
FBXO6Q9NRD1 SPRN-201ENST00000414069 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
FBXO6Q9NRD1 LGR4-201ENST00000379214 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
FBXO6Q9NRD1 EFHD2-201ENST00000375980 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
FBXO6Q9NRD1 RBBP7-202ENST00000380084 2036 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
FBXO6Q9NRD1 TMEM129-201ENST00000303277 2678 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.4 ms