Protein–RNA interactions for Protein: Q9NQS3

NECTIN3, Nectin-3, humanhuman

Predictions only

Length 549 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NECTIN3Q9NQS3 RELL2-205ENST00000518856 1419 ntTSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
NECTIN3Q9NQS3 FDFT1-201ENST00000220584 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
NECTIN3Q9NQS3 GPRC5B-210ENST00000569847 1830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
NECTIN3Q9NQS3 CCDC38-201ENST00000344280 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
NECTIN3Q9NQS3 OXCT2P1-201ENST00000447263 1535 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
NECTIN3Q9NQS3 HADH-201ENST00000309522 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
NECTIN3Q9NQS3 PHF10-202ENST00000366780 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
NECTIN3Q9NQS3 SLC25A39-201ENST00000225308 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
NECTIN3Q9NQS3 GRM6-201ENST00000231188 6143 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
NECTIN3Q9NQS3 RBAK-202ENST00000396912 6551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
NECTIN3Q9NQS3 PPP1R13B-201ENST00000202556 4958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
NECTIN3Q9NQS3 SMUG1-215ENST00000508394 1697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
NECTIN3Q9NQS3 NINJ1-201ENST00000375446 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
NECTIN3Q9NQS3 LBX2-202ENST00000377566 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
NECTIN3Q9NQS3 PRDX4-202ENST00000379341 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
NECTIN3Q9NQS3 LHPP-203ENST00000392757 840 ntTSL 3 BASIC20.43■□□□□ 0.86
NECTIN3Q9NQS3 HES6-202ENST00000409002 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
NECTIN3Q9NQS3 AL121603.2-201ENST00000557373 2117 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
NECTIN3Q9NQS3 AC010999.2-201ENST00000621974 596 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
NECTIN3Q9NQS3 LRRC34-201ENST00000446859 1718 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
NECTIN3Q9NQS3 ZFAND2B-202ENST00000409097 1765 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
NECTIN3Q9NQS3 MFSD7-203ENST00000404286 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
NECTIN3Q9NQS3 ALKAL2-204ENST00000403610 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
NECTIN3Q9NQS3 NDUFAF1-201ENST00000260361 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
NECTIN3Q9NQS3 CRHR1-202ENST00000314537 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
NECTIN3Q9NQS3 ADORA2A-AS1-203ENST00000427813 2027 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
NECTIN3Q9NQS3 FBXL22-201ENST00000360587 1526 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
NECTIN3Q9NQS3 MAG-202ENST00000392213 2390 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
NECTIN3Q9NQS3 C2orf72-201ENST00000373640 3657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
NECTIN3Q9NQS3 PHPT1-201ENST00000247665 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
NECTIN3Q9NQS3 JTB-203ENST00000368589 1216 ntTSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
NECTIN3Q9NQS3 LINC01167-201ENST00000423232 604 ntTSL 3 BASIC20.42■□□□□ 0.86
NECTIN3Q9NQS3 LRRC75A-AS1-202ENST00000470491 1057 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
NECTIN3Q9NQS3 LINC02136-201ENST00000567469 530 ntTSL 4 BASIC20.42■□□□□ 0.86
NECTIN3Q9NQS3 RPS6KA2-201ENST00000265678 5824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
NECTIN3Q9NQS3 RAB24-201ENST00000303251 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
NECTIN3Q9NQS3 AZIN2-204ENST00000373443 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
NECTIN3Q9NQS3 DOC2A-218ENST00000616445 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
NECTIN3Q9NQS3 ZDHHC5-204ENST00000527985 2817 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
NECTIN3Q9NQS3 NABP2-202ENST00000341463 1411 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.42■□□□□ 0.86
NECTIN3Q9NQS3 MAIP1-201ENST00000295079 1495 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
NECTIN3Q9NQS3 ESRRAP2-201ENST00000418437 1549 ntBASIC20.42■□□□□ 0.86
NECTIN3Q9NQS3 PKD1P6-201ENST00000343738 4769 ntBASIC20.42■□□□□ 0.86
NECTIN3Q9NQS3 OLFM1-204ENST00000371793 2444 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.42■□□□□ 0.86
NECTIN3Q9NQS3 ANKRD53-204ENST00000457410 1671 ntTSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
NECTIN3Q9NQS3 INPP1-201ENST00000322522 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
NECTIN3Q9NQS3 BID-212ENST00000614949 1988 ntTSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
NECTIN3Q9NQS3 CLPB-202ENST00000340729 2071 ntTSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
NECTIN3Q9NQS3 KIF12-207ENST00000640217 2194 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
NECTIN3Q9NQS3 AC009126.1-201ENST00000501338 2245 ntTSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
NECTIN3Q9NQS3 GADD45G-202ENST00000375769 977 ntTSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
NECTIN3Q9NQS3 MIR935-201ENST00000401179 91 ntBASIC20.41■□□□□ 0.86
NECTIN3Q9NQS3 TUNAR-203ENST00000554321 767 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20.41■□□□□ 0.86
NECTIN3Q9NQS3 AC005775.1-201ENST00000592413 850 ntTSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
NECTIN3Q9NQS3 AC105233.4-201ENST00000642045 216 ntBASIC20.41■□□□□ 0.86
NECTIN3Q9NQS3 CLN6-201ENST00000249806 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
NECTIN3Q9NQS3 EFHD1-201ENST00000264059 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
NECTIN3Q9NQS3 RPL8-201ENST00000262584 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
NECTIN3Q9NQS3 PHF7-201ENST00000327906 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
NECTIN3Q9NQS3 OAF-201ENST00000328965 2525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
NECTIN3Q9NQS3 CTCF-202ENST00000401394 2978 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
NECTIN3Q9NQS3 SLCO3A1-202ENST00000424469 2705 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
NECTIN3Q9NQS3 BX005266.2-202ENST00000446626 2245 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
NECTIN3Q9NQS3 ITGA9-AS1-210ENST00000457661 738 ntTSL 4 BASIC20.4■□□□□ 0.86
NECTIN3Q9NQS3 AC012414.1-201ENST00000556676 535 ntBASIC20.4■□□□□ 0.86
NECTIN3Q9NQS3 BAZ1A-202ENST00000360310 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
NECTIN3Q9NQS3 PDZRN4-202ENST00000402685 3347 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
NECTIN3Q9NQS3 MAGI2-212ENST00000626691 4599 ntTSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.86
NECTIN3Q9NQS3 DLL3-202ENST00000356433 2055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.86
NECTIN3Q9NQS3 PLEKHO1-201ENST00000369124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
NECTIN3Q9NQS3 ZNF395-210ENST00000523095 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
NECTIN3Q9NQS3 SAXO1-201ENST00000380530 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.86
NECTIN3Q9NQS3 CKMT1B-207ENST00000441322 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
NECTIN3Q9NQS3 ADAP2-204ENST00000580525 1598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
NECTIN3Q9NQS3 DENND4B-201ENST00000361217 5706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
NECTIN3Q9NQS3 SMURF1-202ENST00000361368 5581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
NECTIN3Q9NQS3 EFS-202ENST00000351354 2704 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
NECTIN3Q9NQS3 CYC1-201ENST00000318911 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
NECTIN3Q9NQS3 POLR2H-204ENST00000438240 994 ntTSL 3 BASIC20.39■□□□□ 0.85
NECTIN3Q9NQS3 ZFAS1-206ENST00000450535 1075 ntTSL 3 BASIC20.39■□□□□ 0.85
NECTIN3Q9NQS3 MIR6084-201ENST00000622012 110 ntBASIC20.39■□□□□ 0.85
NECTIN3Q9NQS3 CHST7-201ENST00000276055 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
NECTIN3Q9NQS3 NKX6-1-202ENST00000515820 2194 ntTSL 3 BASIC20.39■□□□□ 0.85
NECTIN3Q9NQS3 ZIM2-201ENST00000593711 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
NECTIN3Q9NQS3 TMEM159-201ENST00000233047 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
NECTIN3Q9NQS3 SOAT2-201ENST00000301466 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
NECTIN3Q9NQS3 TRIM54-202ENST00000380075 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
NECTIN3Q9NQS3 NOXO1-201ENST00000354249 1618 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
NECTIN3Q9NQS3 RNPEP-201ENST00000295640 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
NECTIN3Q9NQS3 CBLN3-201ENST00000267406 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
NECTIN3Q9NQS3 TRIM28-201ENST00000253024 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
NECTIN3Q9NQS3 ILDR2-204ENST00000525740 2242 ntTSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
NECTIN3Q9NQS3 MTCL1-201ENST00000306329 5718 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
NECTIN3Q9NQS3 CLN3-207ENST00000395653 1430 ntTSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
NECTIN3Q9NQS3 CACNA1B-201ENST00000277549 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
NECTIN3Q9NQS3 CACNA1B-202ENST00000277551 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
NECTIN3Q9NQS3 MTCH2-201ENST00000302503 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
NECTIN3Q9NQS3 NME4-201ENST00000219479 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
NECTIN3Q9NQS3 NME4-202ENST00000382940 766 ntTSL 3 BASIC20.38■□□□□ 0.85
NECTIN3Q9NQS3 STOML2-202ENST00000452248 1296 ntTSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 55.6 ms