Protein–RNA interactions for Protein: Q9NQ69

LHX9, LIM/homeobox protein Lhx9, humanhuman

Predictions only

Length 397 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LHX9Q9NQ69 AC074143.1-203ENST00000518227 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
LHX9Q9NQ69 ANKRD19P-205ENST00000473204 2370 ntTSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
LHX9Q9NQ69 CAPN12-212ENST00000601953 2381 ntTSL 5 BASIC20.64■□□□□ 0.89
LHX9Q9NQ69 ANKHD1-205ENST00000394723 2135 ntTSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
LHX9Q9NQ69 MPRIP-203ENST00000395806 527 ntTSL 3 BASIC20.64■□□□□ 0.89
LHX9Q9NQ69 AC073343.2-201ENST00000413182 548 ntTSL 4 BASIC20.64■□□□□ 0.89
LHX9Q9NQ69 FNDC3B-204ENST00000421757 946 ntTSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
LHX9Q9NQ69 IDNK-204ENST00000454393 1210 ntTSL 3 BASIC20.64■□□□□ 0.89
LHX9Q9NQ69 ARHGAP24-206ENST00000503995 1273 ntTSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
LHX9Q9NQ69 PLPP7-202ENST00000372264 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
LHX9Q9NQ69 GPR137B-202ENST00000366592 2042 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
LHX9Q9NQ69 PRKAA1-202ENST00000354209 1918 ntTSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
LHX9Q9NQ69 SH2D5-202ENST00000444387 1934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.64■□□□□ 0.89
LHX9Q9NQ69 SOX18-201ENST00000340356 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
LHX9Q9NQ69 PAXBP1-201ENST00000290178 2564 ntTSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
LHX9Q9NQ69 TUBG1-201ENST00000251413 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
LHX9Q9NQ69 IGFBP1-202ENST00000457280 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.64■□□□□ 0.89
LHX9Q9NQ69 ADAP2-204ENST00000580525 1598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
LHX9Q9NQ69 DAZAP1-211ENST00000592522 2157 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
LHX9Q9NQ69 IER5L-201ENST00000372491 2711 ntAPPRIS P1 BASIC20.63■□□□□ 0.89
LHX9Q9NQ69 SOAT2-201ENST00000301466 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
LHX9Q9NQ69 CYHR1-201ENST00000306145 1409 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
LHX9Q9NQ69 SOCS1-201ENST00000332029 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
LHX9Q9NQ69 VGLL4-208ENST00000424529 1025 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
LHX9Q9NQ69 AC012414.4-201ENST00000560839 1074 ntTSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
LHX9Q9NQ69 GALNS-213ENST00000569433 723 ntTSL 3 BASIC20.63■□□□□ 0.89
LHX9Q9NQ69 SMUG1P1-201ENST00000590640 811 ntBASIC20.63■□□□□ 0.89
LHX9Q9NQ69 AC060814.5-201ENST00000630916 1074 ntTSL 2 BASIC20.63■□□□□ 0.89
LHX9Q9NQ69 ANKRD44-204ENST00000409919 1622 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
LHX9Q9NQ69 BRWD1-202ENST00000341322 2495 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
LHX9Q9NQ69 OXCT2P1-201ENST00000447263 1535 ntBASIC20.63■□□□□ 0.89
LHX9Q9NQ69 MYB-221ENST00000527615 2381 ntTSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
LHX9Q9NQ69 KCNAB3-201ENST00000303790 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
LHX9Q9NQ69 SMUG1-215ENST00000508394 1697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
LHX9Q9NQ69 LMLN-210ENST00000482695 2010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
LHX9Q9NQ69 GABARAPL2-205ENST00000568455 646 ntTSL 3 BASIC20.62■□□□□ 0.89
LHX9Q9NQ69 KRT18P61-201ENST00000585825 1298 ntBASIC20.62■□□□□ 0.89
LHX9Q9NQ69 AP001160.5-201ENST00000636508 485 ntAPPRIS P1 BASIC20.62■□□□□ 0.89
LHX9Q9NQ69 DENND1A-201ENST00000373618 3003 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
LHX9Q9NQ69 HOXA10-201ENST00000283921 2541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
LHX9Q9NQ69 PDK3-201ENST00000379162 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
LHX9Q9NQ69 PRR7-201ENST00000323249 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
LHX9Q9NQ69 NOX4-209ENST00000527626 1774 ntTSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
LHX9Q9NQ69 SLC35A3-204ENST00000427993 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
LHX9Q9NQ69 IRX2-202ENST00000382611 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
LHX9Q9NQ69 NFIX-203ENST00000397661 3143 ntTSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
LHX9Q9NQ69 ZGPAT-201ENST00000328969 1945 ntTSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
LHX9Q9NQ69 DPP7-201ENST00000371579 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
LHX9Q9NQ69 TESC-201ENST00000335209 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
LHX9Q9NQ69 COX20-201ENST00000366528 568 ntTSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
LHX9Q9NQ69 OLFM1-206ENST00000371799 961 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
LHX9Q9NQ69 FGF12-AS2-201ENST00000443165 580 ntTSL 4 BASIC20.61■□□□□ 0.89
LHX9Q9NQ69 CTAG1A-201ENST00000593606 993 ntTSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
LHX9Q9NQ69 PLEKHA8-208ENST00000622102 2140 ntTSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
LHX9Q9NQ69 UCHL5-205ENST00000367454 1815 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
LHX9Q9NQ69 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
LHX9Q9NQ69 NOTUM-201ENST00000409678 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
LHX9Q9NQ69 NELFCD-213ENST00000602795 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
LHX9Q9NQ69 FASTK-212ENST00000482571 1764 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
LHX9Q9NQ69 ZSWIM7-201ENST00000399277 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
LHX9Q9NQ69 BASP1-203ENST00000616743 1711 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.61■□□□□ 0.89
LHX9Q9NQ69 SCRT2-201ENST00000246104 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
LHX9Q9NQ69 SNX21-212ENST00000491381 1607 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
LHX9Q9NQ69 CD6-203ENST00000352009 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
LHX9Q9NQ69 C22orf34-203ENST00000405854 1593 ntTSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
LHX9Q9NQ69 MXRA8-203ENST00000445648 2001 ntTSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
LHX9Q9NQ69 NEIL1-206ENST00000564784 2019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
LHX9Q9NQ69 TMEM121-201ENST00000392519 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
LHX9Q9NQ69 KRTAP17-1-201ENST00000334202 779 ntAPPRIS P1 BASIC20.6■□□□□ 0.89
LHX9Q9NQ69 ADAMTS13-204ENST00000371911 1155 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
LHX9Q9NQ69 AC092468.1-201ENST00000491321 562 ntTSL 4 BASIC20.6■□□□□ 0.89
LHX9Q9NQ69 AL032819.3-201ENST00000640283 925 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
LHX9Q9NQ69 FDFT1-201ENST00000220584 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
LHX9Q9NQ69 SELENOO-201ENST00000380903 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
LHX9Q9NQ69 SELENOO-203ENST00000611222 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
LHX9Q9NQ69 DNAJC25-201ENST00000313525 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
LHX9Q9NQ69 RNF149-201ENST00000295317 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
LHX9Q9NQ69 SLC41A3-202ENST00000346785 1705 ntTSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
LHX9Q9NQ69 DUX4-203ENST00000565211 1710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
LHX9Q9NQ69 PLPP5-203ENST00000424479 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
LHX9Q9NQ69 LINC00565-201ENST00000562710 2331 ntBASIC20.59■□□□□ 0.89
LHX9Q9NQ69 ALDH6A1-201ENST00000350259 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
LHX9Q9NQ69 AP004607.4-201ENST00000530158 1459 ntBASIC20.59■□□□□ 0.89
LHX9Q9NQ69 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
LHX9Q9NQ69 FOXJ1-201ENST00000322957 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
LHX9Q9NQ69 C11orf96-202ENST00000528572 1834 ntBASIC20.59■□□□□ 0.89
LHX9Q9NQ69 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
LHX9Q9NQ69 MFSD7-209ENST00000515118 1556 ntTSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
LHX9Q9NQ69 RPS6-203ENST00000380384 1355 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
LHX9Q9NQ69 CFAP99-206ENST00000616117 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
LHX9Q9NQ69 FAM72A-202ENST00000367128 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
LHX9Q9NQ69 FAM72D-201ENST00000400889 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
LHX9Q9NQ69 NEDD8-201ENST00000250495 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
LHX9Q9NQ69 UCHL1-201ENST00000284440 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
LHX9Q9NQ69 C16orf86-201ENST00000403458 1267 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
LHX9Q9NQ69 AC016769.1-201ENST00000409132 1010 ntBASIC20.58■□□□□ 0.89
LHX9Q9NQ69 AC006015.1-201ENST00000429970 570 ntBASIC20.58■□□□□ 0.89
LHX9Q9NQ69 FAM66D-201ENST00000434078 918 ntTSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
LHX9Q9NQ69 UCHL1-210ENST00000512788 785 ntTSL 3 BASIC20.58■□□□□ 0.89
LHX9Q9NQ69 AC137761.2-201ENST00000561729 223 ntBASIC20.58■□□□□ 0.89
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.3 ms