Protein–RNA interactions for Protein: Q9NQ33

ASCL3, Achaete-scute homolog 3, humanhuman

Predictions only

Length 180 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ASCL3Q9NQ33 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
ASCL3Q9NQ33 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
ASCL3Q9NQ33 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
ASCL3Q9NQ33 TTC9B-201ENST00000311308 843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
ASCL3Q9NQ33 SSNA1-201ENST00000322310 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
ASCL3Q9NQ33 GCC2-AS1-201ENST00000322353 558 ntTSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
ASCL3Q9NQ33 INS-203ENST00000397262 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
ASCL3Q9NQ33 BX276092.2-201ENST00000417668 665 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
ASCL3Q9NQ33 UNC93B6-201ENST00000525262 1143 ntTSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
ASCL3Q9NQ33 PTGER2-202ENST00000557436 643 ntTSL 3 BASIC20.21■□□□□ 0.83
ASCL3Q9NQ33 OGFR-204ENST00000621591 1194 ntTSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
ASCL3Q9NQ33 AP006294.2-201ENST00000641667 209 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
ASCL3Q9NQ33 SLC26A5-209ENST00000393735 1947 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
ASCL3Q9NQ33 CCR10-203ENST00000591765 1942 ntTSL 3 BASIC20.21■□□□□ 0.83
ASCL3Q9NQ33 IMPDH1-210ENST00000480861 1765 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
ASCL3Q9NQ33 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
ASCL3Q9NQ33 PITX3-201ENST00000370002 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
ASCL3Q9NQ33 ESRRAP1-201ENST00000400596 1257 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
ASCL3Q9NQ33 AC021660.2-201ENST00000502999 388 ntTSL 3 BASIC20.2■□□□□ 0.82
ASCL3Q9NQ33 ZNF324-202ENST00000535298 1006 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
ASCL3Q9NQ33 IRX5-204ENST00000560154 879 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
ASCL3Q9NQ33 IRX5-205ENST00000620085 881 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
ASCL3Q9NQ33 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
ASCL3Q9NQ33 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
ASCL3Q9NQ33 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
ASCL3Q9NQ33 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
ASCL3Q9NQ33 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC20.19■□□□□ 0.82
ASCL3Q9NQ33 VPS29-206ENST00000549578 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
ASCL3Q9NQ33 RNPS1-201ENST00000301730 1276 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
ASCL3Q9NQ33 TRA2B-203ENST00000382191 976 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
ASCL3Q9NQ33 TMEM240-202ENST00000425828 717 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
ASCL3Q9NQ33 TMEM185B-201ENST00000426077 2131 ntAPPRIS P1 BASIC20.19■□□□□ 0.82
ASCL3Q9NQ33 CLN6-207ENST00000566347 981 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
ASCL3Q9NQ33 TXNL4A-203ENST00000585474 1185 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
ASCL3Q9NQ33 AP000547.3-201ENST00000592918 1576 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
ASCL3Q9NQ33 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
ASCL3Q9NQ33 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
ASCL3Q9NQ33 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
ASCL3Q9NQ33 TRABD2A-203ENST00000409520 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
ASCL3Q9NQ33 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
ASCL3Q9NQ33 PACRGL-227ENST00000513459 1773 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
ASCL3Q9NQ33 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
ASCL3Q9NQ33 ADARB2-202ENST00000381310 1810 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
ASCL3Q9NQ33 PICK1-202ENST00000404072 2164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
ASCL3Q9NQ33 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
ASCL3Q9NQ33 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
ASCL3Q9NQ33 LINC01960-201ENST00000563759 1884 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
ASCL3Q9NQ33 FASTK-217ENST00000540185 1609 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
ASCL3Q9NQ33 RHEB-204ENST00000472642 900 ntTSL 3 BASIC20.18■□□□□ 0.82
ASCL3Q9NQ33 AC097658.1-201ENST00000475555 843 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
ASCL3Q9NQ33 CTBP1-AS2-203ENST00000507044 739 ntTSL 3 BASIC20.18■□□□□ 0.82
ASCL3Q9NQ33 CAVIN3-203ENST00000530979 957 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
ASCL3Q9NQ33 SEC23A-213ENST00000557280 561 ntTSL 4 BASIC20.18■□□□□ 0.82
ASCL3Q9NQ33 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
ASCL3Q9NQ33 PRR7-202ENST00000502922 1345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
ASCL3Q9NQ33 SERTAD3-201ENST00000322354 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
ASCL3Q9NQ33 CSNK1G3-206ENST00000511130 1356 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
ASCL3Q9NQ33 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
ASCL3Q9NQ33 TUSC3-203ENST00000503731 1498 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
ASCL3Q9NQ33 ADRM1-204ENST00000491935 1530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
ASCL3Q9NQ33 TPM1-204ENST00000334895 1637 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
ASCL3Q9NQ33 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
ASCL3Q9NQ33 AC007285.1-201ENST00000422239 893 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
ASCL3Q9NQ33 DNAJA4-210ENST00000489435 947 ntTSL 3 BASIC20.17■□□□□ 0.82
ASCL3Q9NQ33 SCARA5-203ENST00000518030 1074 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
ASCL3Q9NQ33 BEX2-204ENST00000536889 1077 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
ASCL3Q9NQ33 C14orf28-204ENST00000557112 1097 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
ASCL3Q9NQ33 EIF2AK4-209ENST00000560648 687 ntTSL 3 BASIC20.17■□□□□ 0.82
ASCL3Q9NQ33 Z97653.1-201ENST00000567096 446 ntTSL 3 BASIC20.17■□□□□ 0.82
ASCL3Q9NQ33 AL034346.1-201ENST00000568244 1277 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
ASCL3Q9NQ33 MFSD3-201ENST00000301327 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
ASCL3Q9NQ33 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
ASCL3Q9NQ33 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
ASCL3Q9NQ33 CLN3-240ENST00000631023 1586 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
ASCL3Q9NQ33 DIXDC1-205ENST00000529225 1945 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
ASCL3Q9NQ33 PGF-206ENST00000555567 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
ASCL3Q9NQ33 SLC22A31-201ENST00000562855 1909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
ASCL3Q9NQ33 NPY4R-201ENST00000374312 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
ASCL3Q9NQ33 NPY4R2-201ENST00000576178 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
ASCL3Q9NQ33 CFC1-201ENST00000259216 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
ASCL3Q9NQ33 CFC1B-201ENST00000281882 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
ASCL3Q9NQ33 ASIP-201ENST00000374954 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
ASCL3Q9NQ33 AC007040.1-201ENST00000416229 477 ntTSL 3 BASIC20.16■□□□□ 0.82
ASCL3Q9NQ33 NREP-209ENST00000455559 698 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20.16■□□□□ 0.82
ASCL3Q9NQ33 AC025754.1-201ENST00000507566 407 ntTSL 3 BASIC20.16■□□□□ 0.82
ASCL3Q9NQ33 C12orf43-208ENST00000539736 1033 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
ASCL3Q9NQ33 ZNF263-205ENST00000574253 1139 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
ASCL3Q9NQ33 PTGIR-205ENST00000597185 775 ntTSL 3 BASIC20.16■□□□□ 0.82
ASCL3Q9NQ33 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
ASCL3Q9NQ33 SPR-201ENST00000234454 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
ASCL3Q9NQ33 CDCA4-202ENST00000392590 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
ASCL3Q9NQ33 KCNA2-206ENST00000638477 1524 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
ASCL3Q9NQ33 DPP7-201ENST00000371579 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
ASCL3Q9NQ33 IFNGR2-203ENST00000405436 1684 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
ASCL3Q9NQ33 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
ASCL3Q9NQ33 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
ASCL3Q9NQ33 C16orf74-201ENST00000284245 906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
ASCL3Q9NQ33 CBY3-201ENST00000376974 785 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
ASCL3Q9NQ33 GTF2A2-203ENST00000396061 758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
ASCL3Q9NQ33 GAS7-202ENST00000396115 929 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 53.5 ms