Protein–RNA interactions for Protein: Q9NP72

RAB18, Ras-related protein Rab-18, humanhuman

Predictions only

Length 206 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB18Q9NP72 ZDHHC16-205ENST00000370846 1280 ntTSL 3 BASIC18.09■□□□□ 0.49
RAB18Q9NP72 NAA30-202ENST00000554703 795 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
RAB18Q9NP72 AL138724.1-201ENST00000606771 1088 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
RAB18Q9NP72 CNNM1-201ENST00000356713 5959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
RAB18Q9NP72 KCTD13-207ENST00000568000 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
RAB18Q9NP72 CDK5-204ENST00000485972 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
RAB18Q9NP72 AC064853.3-201ENST00000641801 1658 ntAPPRIS P1 BASIC18.09■□□□□ 0.49
RAB18Q9NP72 AC009102.2-201ENST00000606772 1639 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
RAB18Q9NP72 SPG21-202ENST00000416889 1533 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.49
RAB18Q9NP72 GOLGA2P6-201ENST00000340929 2049 ntBASIC18.08■□□□□ 0.49
RAB18Q9NP72 JAKMIP1-201ENST00000282924 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
RAB18Q9NP72 C20orf27-202ENST00000379772 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
RAB18Q9NP72 TBL1Y-202ENST00000355162 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
RAB18Q9NP72 EEF1D-246ENST00000532741 2387 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
RAB18Q9NP72 PYCARD-202ENST00000350605 696 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
RAB18Q9NP72 CDKN2A-206ENST00000494262 989 ntTSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.48
RAB18Q9NP72 AC142381.2-201ENST00000566120 298 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
RAB18Q9NP72 GMDS-202ENST00000380815 1752 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
RAB18Q9NP72 GPR143-203ENST00000467482 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
RAB18Q9NP72 ZNF652-202ENST00000430262 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
RAB18Q9NP72 AC007326.4-201ENST00000638240 1669 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
RAB18Q9NP72 P2RY2-203ENST00000393597 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
RAB18Q9NP72 MDFI-203ENST00000373051 1622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
RAB18Q9NP72 RBM42-203ENST00000588161 1609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
RAB18Q9NP72 ABLIM2-205ENST00000428004 2573 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
RAB18Q9NP72 CENPH-201ENST00000283006 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
RAB18Q9NP72 DOK3-202ENST00000357198 1729 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
RAB18Q9NP72 UROS-204ENST00000368797 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
RAB18Q9NP72 SLC30A5-201ENST00000380860 1317 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
RAB18Q9NP72 CBR3-201ENST00000290354 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
RAB18Q9NP72 ARHGDIA-217ENST00000584461 886 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
RAB18Q9NP72 AL355001.2-201ENST00000620617 1191 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
RAB18Q9NP72 PMPCA-203ENST00000399219 1987 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
RAB18Q9NP72 SOX17-201ENST00000297316 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
RAB18Q9NP72 EXOC3L2-202ENST00000413988 2964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
RAB18Q9NP72 FBXW7-202ENST00000281708 4976 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
RAB18Q9NP72 ZNF664-207ENST00000539644 5108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
RAB18Q9NP72 PFKFB4-202ENST00000383734 1491 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
RAB18Q9NP72 SHISA7-201ENST00000376325 6033 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
RAB18Q9NP72 GFRA3-201ENST00000274721 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
RAB18Q9NP72 RAVER2-201ENST00000294428 4398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
RAB18Q9NP72 ECE2-203ENST00000359140 3147 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
RAB18Q9NP72 AL117348.2-201ENST00000432920 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
RAB18Q9NP72 TUBA1A-201ENST00000295766 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
RAB18Q9NP72 PLEKHG4-201ENST00000360461 6782 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
RAB18Q9NP72 SHOX2-203ENST00000441443 3038 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
RAB18Q9NP72 C19orf60-201ENST00000358607 839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
RAB18Q9NP72 IL20RA-202ENST00000367746 1244 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
RAB18Q9NP72 CNPY3-202ENST00000394142 954 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
RAB18Q9NP72 C19orf60-202ENST00000450195 702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
RAB18Q9NP72 AL355987.3-201ENST00000456614 735 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.06■□□□□ 0.48
RAB18Q9NP72 AC092384.1-201ENST00000378347 1812 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
RAB18Q9NP72 GLT8D2-205ENST00000548660 1835 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
RAB18Q9NP72 CCDC85B-201ENST00000312579 1524 ntAPPRIS P1 BASIC18.06■□□□□ 0.48
RAB18Q9NP72 C17orf82-201ENST00000623772 1530 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
RAB18Q9NP72 CBWD1-203ENST00000377400 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
RAB18Q9NP72 ENTPD6-203ENST00000376652 2750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
RAB18Q9NP72 STK19-201ENST00000375331 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
RAB18Q9NP72 NEK3-208ENST00000618534 2414 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
RAB18Q9NP72 FMR1-204ENST00000370471 4125 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
RAB18Q9NP72 CBWD3-213ENST00000618217 1611 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
RAB18Q9NP72 OLA1-204ENST00000409546 2071 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
RAB18Q9NP72 T-202ENST00000366871 2250 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
RAB18Q9NP72 MIR222HG-202ENST00000602507 1758 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
RAB18Q9NP72 HHIPL1-202ENST00000357223 2241 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
RAB18Q9NP72 DISC1-205ENST00000366636 2224 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
RAB18Q9NP72 AC024257.2-201ENST00000549699 147 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
RAB18Q9NP72 STARD3-202ENST00000394250 1949 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
RAB18Q9NP72 NYAP1-202ENST00000454988 2777 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
RAB18Q9NP72 RHBDD2-201ENST00000006777 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
RAB18Q9NP72 NCKAP1-201ENST00000360982 4989 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
RAB18Q9NP72 SDSL-201ENST00000345635 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
RAB18Q9NP72 LINC01011-201ENST00000445000 2811 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
RAB18Q9NP72 KRT18P55-201ENST00000577198 1950 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
RAB18Q9NP72 LOXL1-201ENST00000261921 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
RAB18Q9NP72 CFAP97-205ENST00000514798 2895 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
RAB18Q9NP72 TLX3-201ENST00000296921 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
RAB18Q9NP72 LKAAEAR1-201ENST00000302096 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
RAB18Q9NP72 LKAAEAR1-202ENST00000308906 868 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
RAB18Q9NP72 STX10-202ENST00000343587 1128 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
RAB18Q9NP72 WDR86-AS1-204ENST00000489632 751 ntTSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
RAB18Q9NP72 AC099791.2-201ENST00000605725 427 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
RAB18Q9NP72 AC011298.3-201ENST00000615796 283 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
RAB18Q9NP72 BPTF-201ENST00000306378 9688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
RAB18Q9NP72 CCSAP-203ENST00000366687 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
RAB18Q9NP72 AP000662.2-202ENST00000530595 2790 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
RAB18Q9NP72 AC144652.1-201ENST00000609974 1624 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
RAB18Q9NP72 SIGLEC15-201ENST00000389474 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
RAB18Q9NP72 SERTAD3-201ENST00000322354 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
RAB18Q9NP72 PRKG2-207ENST00000628926 2623 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
RAB18Q9NP72 LRRC14-201ENST00000292524 5328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
RAB18Q9NP72 RAB1B-201ENST00000311481 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
RAB18Q9NP72 ST3GAL4-209ENST00000526727 1967 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
RAB18Q9NP72 HNRNPAB-201ENST00000355836 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
RAB18Q9NP72 DPYS-201ENST00000351513 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
RAB18Q9NP72 TUB-203ENST00000534099 1759 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
RAB18Q9NP72 SOX21-201ENST00000376945 2778 ntAPPRIS P1 BASIC18.03■□□□□ 0.48
RAB18Q9NP72 PLPP1-202ENST00000307259 1597 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
RAB18Q9NP72 GCH1-206ENST00000543643 1897 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
RAB18Q9NP72 AGMAT-201ENST00000375826 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.8 ms