Protein–RNA interactions for Protein: Q9NP55

BPIFA1, BPI fold-containing family A member 1, humanhuman

Predictions only

Length 256 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BPIFA1Q9NP55 TLE3-216ENST00000559191 1575 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
BPIFA1Q9NP55 FAM219A-202ENST00000379078 770 ntTSL 3 BASIC21.46■■□□□ 1.03
BPIFA1Q9NP55 ZGPAT-201ENST00000328969 1945 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
BPIFA1Q9NP55 PLK5-202ENST00000454744 1930 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
BPIFA1Q9NP55 TSPAN3-202ENST00000346495 1647 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
BPIFA1Q9NP55 SERBP1-202ENST00000370990 1621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
BPIFA1Q9NP55 FOXJ1-201ENST00000322957 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
BPIFA1Q9NP55 FAM72A-202ENST00000367128 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
BPIFA1Q9NP55 FAM72D-201ENST00000400889 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
BPIFA1Q9NP55 PPT2-244ENST00000324816 2053 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
BPIFA1Q9NP55 GMDS-202ENST00000380815 1752 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
BPIFA1Q9NP55 LINC00969-219ENST00000453324 1439 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
BPIFA1Q9NP55 HOXA10-201ENST00000283921 2541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
BPIFA1Q9NP55 OXCT2-201ENST00000327582 1826 ntAPPRIS P1 BASIC21.45■■□□□ 1.03
BPIFA1Q9NP55 FAM102B-201ENST00000370035 5600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
BPIFA1Q9NP55 ADCK2-203ENST00000476491 2092 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
BPIFA1Q9NP55 MPST-202ENST00000397225 2116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
BPIFA1Q9NP55 NMRAL1-202ENST00000404295 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
BPIFA1Q9NP55 AL355877.1-204ENST00000451482 1078 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
BPIFA1Q9NP55 A1BG-201ENST00000263100 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
BPIFA1Q9NP55 ILDR2-205ENST00000526687 2299 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
BPIFA1Q9NP55 ZDHHC7-203ENST00000564466 1488 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
BPIFA1Q9NP55 SLC29A1-207ENST00000393841 2485 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
BPIFA1Q9NP55 GPSM1-201ENST00000291775 2114 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
BPIFA1Q9NP55 MBNL3-202ENST00000370844 1643 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
BPIFA1Q9NP55 SERTAD3-201ENST00000322354 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
BPIFA1Q9NP55 C16orf58-209ENST00000567994 1845 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
BPIFA1Q9NP55 CYC1-201ENST00000318911 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
BPIFA1Q9NP55 KRTAP17-1-201ENST00000334202 779 ntAPPRIS P1 BASIC21.44■■□□□ 1.02
BPIFA1Q9NP55 CCDC28B-201ENST00000373602 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
BPIFA1Q9NP55 PRKCQ-AS1-202ENST00000445427 1133 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
BPIFA1Q9NP55 AES-207ENST00000586839 942 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
BPIFA1Q9NP55 TRAPPC6A-205ENST00000592647 514 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
BPIFA1Q9NP55 MRM1-203ENST00000612760 1284 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
BPIFA1Q9NP55 CDIPT-210ENST00000570016 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
BPIFA1Q9NP55 PRR7-201ENST00000323249 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
BPIFA1Q9NP55 DISC1-205ENST00000366636 2224 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
BPIFA1Q9NP55 ME2-206ENST00000638410 2289 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
BPIFA1Q9NP55 ME2-210ENST00000639255 2262 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
BPIFA1Q9NP55 GGA2-211ENST00000567468 1713 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
BPIFA1Q9NP55 FAM129C-211ENST00000600871 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
BPIFA1Q9NP55 PPP3CC-202ENST00000289963 2135 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
BPIFA1Q9NP55 FARP2-223ENST00000627550 2122 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
BPIFA1Q9NP55 AKT2-206ENST00000392038 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
BPIFA1Q9NP55 PCSK6-215ENST00000611967 3336 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
BPIFA1Q9NP55 ZNF707-222ENST00000532158 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
BPIFA1Q9NP55 PCSK1N-201ENST00000218230 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
BPIFA1Q9NP55 NXT1-201ENST00000254998 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
BPIFA1Q9NP55 LBX2-202ENST00000377566 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
BPIFA1Q9NP55 ANKRD63-201ENST00000434396 1143 ntAPPRIS P1 BASIC21.43■■□□□ 1.02
BPIFA1Q9NP55 AL034346.1-201ENST00000568244 1277 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
BPIFA1Q9NP55 FAM222B-213ENST00000583522 556 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
BPIFA1Q9NP55 AL138963.3-201ENST00000610057 588 ntTSL 4 BASIC21.43■■□□□ 1.02
BPIFA1Q9NP55 SP2-202ENST00000613139 908 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
BPIFA1Q9NP55 ACBD4-216ENST00000619916 1276 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
BPIFA1Q9NP55 CITED2-202ENST00000536159 1797 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.43■■□□□ 1.02
BPIFA1Q9NP55 CITED2-203ENST00000537332 1780 ntTSL 3 BASIC21.43■■□□□ 1.02
BPIFA1Q9NP55 NEU4-204ENST00000405370 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
BPIFA1Q9NP55 MRGPRF-203ENST00000441623 2282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
BPIFA1Q9NP55 IRX4-207ENST00000613726 2403 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
BPIFA1Q9NP55 HAUS4-201ENST00000206474 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
BPIFA1Q9NP55 PSMD7-201ENST00000219313 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
BPIFA1Q9NP55 AK1-201ENST00000223836 736 ntTSL 3 BASIC21.42■■□□□ 1.02
BPIFA1Q9NP55 PGF-201ENST00000238607 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.42■■□□□ 1.02
BPIFA1Q9NP55 MOSPD3-202ENST00000379527 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
BPIFA1Q9NP55 SLC26A5-209ENST00000393735 1947 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
BPIFA1Q9NP55 SMG7-AS1-201ENST00000421703 2220 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
BPIFA1Q9NP55 AC011446.1-201ENST00000591825 458 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
BPIFA1Q9NP55 MAGIX-207ENST00000615915 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
BPIFA1Q9NP55 ELL3-201ENST00000319359 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
BPIFA1Q9NP55 FBXW4P1-201ENST00000426721 2239 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
BPIFA1Q9NP55 RBBP7-202ENST00000380084 2036 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
BPIFA1Q9NP55 PEX10-202ENST00000447513 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
BPIFA1Q9NP55 GCH1-206ENST00000543643 1897 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
BPIFA1Q9NP55 SOCS7-202ENST00000613678 1827 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
BPIFA1Q9NP55 C1QL1-201ENST00000253407 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
BPIFA1Q9NP55 ORAI3-202ENST00000562699 628 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
BPIFA1Q9NP55 SMURF1-201ENST00000361125 5737 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
BPIFA1Q9NP55 IRX4-201ENST00000231357 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
BPIFA1Q9NP55 NEIL1-206ENST00000564784 2019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
BPIFA1Q9NP55 YY1AP1-214ENST00000407221 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
BPIFA1Q9NP55 C19orf68-201ENST00000328759 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
BPIFA1Q9NP55 RAB24-202ENST00000303270 1385 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
BPIFA1Q9NP55 AC010542.4-201ENST00000563151 1910 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
BPIFA1Q9NP55 FAM219A-205ENST00000379084 893 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
BPIFA1Q9NP55 AC027612.3-201ENST00000413684 1047 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
BPIFA1Q9NP55 BCAP29-209ENST00000465919 942 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
BPIFA1Q9NP55 ABCG4-204ENST00000615496 2459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
BPIFA1Q9NP55 ACAA1-202ENST00000333167 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
BPIFA1Q9NP55 SH2D3A-201ENST00000245908 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
BPIFA1Q9NP55 ZSCAN18-217ENST00000601144 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
BPIFA1Q9NP55 SLC12A5-AS1-202ENST00000535913 1957 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.02
BPIFA1Q9NP55 AC009237.3-201ENST00000393279 1427 ntBASIC21.39■■□□□ 1.02
BPIFA1Q9NP55 TDRKH-205ENST00000368827 2318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
BPIFA1Q9NP55 RHBDD2-201ENST00000006777 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
BPIFA1Q9NP55 CIDEB-201ENST00000258807 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
BPIFA1Q9NP55 PHACTR3-202ENST00000359926 2252 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.02
BPIFA1Q9NP55 LSR-202ENST00000354900 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
BPIFA1Q9NP55 PPCS-202ENST00000372560 793 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
BPIFA1Q9NP55 CEP104-201ENST00000378223 1121 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.6 ms