Protein–RNA interactions for Protein: Q9NNX1

TUFT1, Tuftelin, humanhuman

Predictions only

Length 390 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TUFT1Q9NNX1 DUX4L1-201ENST00000627662 1275 ntBASIC23.91■■□□□ 1.42
TUFT1Q9NNX1 DUX4L8-201ENST00000629013 1275 ntBASIC23.91■■□□□ 1.42
TUFT1Q9NNX1 DUX4L3-201ENST00000630187 1275 ntBASIC23.91■■□□□ 1.42
TUFT1Q9NNX1 DUX4L7-201ENST00000630678 1275 ntBASIC23.91■■□□□ 1.42
TUFT1Q9NNX1 DUX4L5-201ENST00000630834 1275 ntBASIC23.91■■□□□ 1.42
TUFT1Q9NNX1 ASRGL1-202ENST00000415229 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
TUFT1Q9NNX1 AC079328.2-202ENST00000560903 1410 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
TUFT1Q9NNX1 SHMT1-202ENST00000352886 2437 ntTSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
TUFT1Q9NNX1 SPN-202ENST00000395389 1935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
TUFT1Q9NNX1 CLN6-201ENST00000249806 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
TUFT1Q9NNX1 PRR25-201ENST00000301698 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
TUFT1Q9NNX1 FXN-202ENST00000396364 980 ntTSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
TUFT1Q9NNX1 FRMD8-208ENST00000531296 366 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
TUFT1Q9NNX1 AL390816.2-201ENST00000554252 737 ntTSL 3 BASIC23.9■■□□□ 1.42
TUFT1Q9NNX1 SPATA2L-201ENST00000289805 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
TUFT1Q9NNX1 TSSK1B-201ENST00000390666 2478 ntAPPRIS P1 BASIC23.9■■□□□ 1.42
TUFT1Q9NNX1 ACSL1-205ENST00000504900 1583 ntTSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
TUFT1Q9NNX1 GGA2-211ENST00000567468 1713 ntTSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
TUFT1Q9NNX1 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
TUFT1Q9NNX1 C16orf58-209ENST00000567994 1845 ntTSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.42
TUFT1Q9NNX1 NFKBIL1-203ENST00000376148 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
TUFT1Q9NNX1 TMEM268-202ENST00000374049 4578 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.42
TUFT1Q9NNX1 MAGIX-207ENST00000615915 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.42
TUFT1Q9NNX1 PLK5-202ENST00000454744 1930 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.42
TUFT1Q9NNX1 AC026471.6-201ENST00000622954 1905 ntBASIC23.89■■□□□ 1.42
TUFT1Q9NNX1 ARX-201ENST00000379044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
TUFT1Q9NNX1 SLC35A2-205ENST00000376529 865 ntTSL 3 BASIC23.89■■□□□ 1.41
TUFT1Q9NNX1 AC079140.4-201ENST00000507448 529 ntBASIC23.89■■□□□ 1.41
TUFT1Q9NNX1 TPT1-AS1-211ENST00000520622 604 ntTSL 4 BASIC23.89■■□□□ 1.41
TUFT1Q9NNX1 DCAF8-211ENST00000475733 1426 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
TUFT1Q9NNX1 AP004608.1-201ENST00000531319 1402 ntTSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.41
TUFT1Q9NNX1 FDFT1-201ENST00000220584 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
TUFT1Q9NNX1 SMPD5-201ENST00000528912 1390 ntTSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
TUFT1Q9NNX1 PSMD7-201ENST00000219313 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
TUFT1Q9NNX1 CBWD3-202ENST00000377342 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
TUFT1Q9NNX1 GPSM1-201ENST00000291775 2114 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
TUFT1Q9NNX1 RBBP7-202ENST00000380084 2036 ntTSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
TUFT1Q9NNX1 TPSG1-201ENST00000234798 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
TUFT1Q9NNX1 ACYP2-201ENST00000303536 789 ntTSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
TUFT1Q9NNX1 HACD1-201ENST00000326961 773 ntTSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
TUFT1Q9NNX1 PLPP5-203ENST00000424479 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
TUFT1Q9NNX1 LINC01942-201ENST00000521373 513 ntTSL 4 BASIC23.88■■□□□ 1.41
TUFT1Q9NNX1 PYCARD-AS1-201ENST00000561916 1095 ntTSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
TUFT1Q9NNX1 GAS1-201ENST00000298743 2827 ntAPPRIS P1 BASIC23.88■■□□□ 1.41
TUFT1Q9NNX1 IFNGR2-203ENST00000405436 1684 ntTSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
TUFT1Q9NNX1 TRAM2-AS1-204ENST00000606714 2453 ntTSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
TUFT1Q9NNX1 NAA35-202ENST00000376040 1797 ntTSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
TUFT1Q9NNX1 NABP2-203ENST00000380198 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
TUFT1Q9NNX1 PROSER2-205ENST00000622831 1646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
TUFT1Q9NNX1 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
TUFT1Q9NNX1 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
TUFT1Q9NNX1 GCH1-206ENST00000543643 1897 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
TUFT1Q9NNX1 MIR31HG-201ENST00000304425 745 ntTSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
TUFT1Q9NNX1 AC019068.1-201ENST00000415226 552 ntTSL 4 BASIC23.87■■□□□ 1.41
TUFT1Q9NNX1 TMEM70-203ENST00000517439 617 ntTSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
TUFT1Q9NNX1 MIR5787-201ENST00000611784 55 ntBASIC23.87■■□□□ 1.41
TUFT1Q9NNX1 ACAA1-202ENST00000333167 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
TUFT1Q9NNX1 MEIS3-202ENST00000441740 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
TUFT1Q9NNX1 HLA-DPB1-211ENST00000418931 1560 ntAPPRIS P2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
TUFT1Q9NNX1 CHST7-201ENST00000276055 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
TUFT1Q9NNX1 ECHDC2-221ENST00000536120 1446 ntTSL 3 BASIC23.86■■□□□ 1.41
TUFT1Q9NNX1 CAPN12-212ENST00000601953 2381 ntTSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
TUFT1Q9NNX1 AC003102.1-202ENST00000563394 1796 ntBASIC23.86■■□□□ 1.41
TUFT1Q9NNX1 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
TUFT1Q9NNX1 MFF-207ENST00000409565 1548 ntTSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
TUFT1Q9NNX1 C6orf136-201ENST00000293604 1978 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
TUFT1Q9NNX1 TMEM25-205ENST00000411589 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
TUFT1Q9NNX1 LRP5L-203ENST00000444995 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
TUFT1Q9NNX1 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
TUFT1Q9NNX1 C16orf59-201ENST00000361837 1662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
TUFT1Q9NNX1 PFKFB3-216ENST00000625260 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
TUFT1Q9NNX1 SLC35A3-204ENST00000427993 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
TUFT1Q9NNX1 DNAJC25-201ENST00000313525 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
TUFT1Q9NNX1 NEU4-204ENST00000405370 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
TUFT1Q9NNX1 GZMM-201ENST00000264553 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
TUFT1Q9NNX1 AC092468.1-201ENST00000491321 562 ntTSL 4 BASIC23.85■■□□□ 1.41
TUFT1Q9NNX1 SFTPC-205ENST00000521315 1046 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
TUFT1Q9NNX1 CAPNS1-205ENST00000588780 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
TUFT1Q9NNX1 CERKL-204ENST00000374970 1392 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
TUFT1Q9NNX1 RAB28-208ENST00000630951 1679 ntTSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
TUFT1Q9NNX1 CTU2-202ENST00000453996 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
TUFT1Q9NNX1 PEX10-202ENST00000447513 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
TUFT1Q9NNX1 RUSC1-AS1-203ENST00000450199 1636 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
TUFT1Q9NNX1 LAMP5-AS1-201ENST00000443469 1928 ntTSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
TUFT1Q9NNX1 PACRGL-227ENST00000513459 1773 ntTSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
TUFT1Q9NNX1 BCKDHB-203ENST00000369760 743 ntTSL 3 BASIC23.84■■□□□ 1.41
TUFT1Q9NNX1 NDUFB2-207ENST00000465506 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
TUFT1Q9NNX1 BRD2-214ENST00000496118 735 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
TUFT1Q9NNX1 AP002748.1-201ENST00000504911 580 ntTSL 3 BASIC23.84■■□□□ 1.41
TUFT1Q9NNX1 SLC25A45-206ENST00000526432 894 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
TUFT1Q9NNX1 MIF4GD-211ENST00000580571 952 ntTSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
TUFT1Q9NNX1 ZGPAT-201ENST00000328969 1945 ntTSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
TUFT1Q9NNX1 SEPT8-207ENST00000378719 2889 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
TUFT1Q9NNX1 DACT2-203ENST00000607983 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
TUFT1Q9NNX1 SHMT1-201ENST00000316694 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
TUFT1Q9NNX1 ADCK2-203ENST00000476491 2092 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
TUFT1Q9NNX1 ZMYND11-210ENST00000403354 1664 ntTSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
TUFT1Q9NNX1 NOTUM-201ENST00000409678 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
TUFT1Q9NNX1 DISC1-205ENST00000366636 2224 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
TUFT1Q9NNX1 CCDC106-207ENST00000591578 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36 ms