Protein–RNA interactions for Protein: Q9HCU0

CD248, Endosialin, humanhuman

Predictions only

Length 757 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CD248Q9HCU0 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CD248Q9HCU0 RUNDC3B-207ENST00000493037 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CD248Q9HCU0 UBALD1-208ENST00000591401 1305 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
CD248Q9HCU0 AC062017.1-203ENST00000413029 455 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
CD248Q9HCU0 ATE1-AS1-201ENST00000437593 951 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
CD248Q9HCU0 BRD2-214ENST00000496118 735 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CD248Q9HCU0 GLI4-210ENST00000523522 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CD248Q9HCU0 TMEM218-207ENST00000528724 1117 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
CD248Q9HCU0 TMEM218-214ENST00000532156 954 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CD248Q9HCU0 AP2S1-203ENST00000593442 636 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
CD248Q9HCU0 CLN3-207ENST00000395653 1430 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
CD248Q9HCU0 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
CD248Q9HCU0 PICK1-202ENST00000404072 2164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
CD248Q9HCU0 HRK-201ENST00000257572 5789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CD248Q9HCU0 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CD248Q9HCU0 HS3ST3A1-201ENST00000284110 2527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CD248Q9HCU0 PACRGL-201ENST00000295290 1937 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
CD248Q9HCU0 DUSP7-202ENST00000495880 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CD248Q9HCU0 TCP1-202ENST00000392168 1878 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
CD248Q9HCU0 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CD248Q9HCU0 PPP1R3F-201ENST00000055335 3421 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
CD248Q9HCU0 RASGRP2-203ENST00000377486 667 ntTSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
CD248Q9HCU0 PRKCQ-AS1-202ENST00000445427 1133 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CD248Q9HCU0 ZNF837-202ENST00000597582 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
CD248Q9HCU0 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CD248Q9HCU0 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CD248Q9HCU0 BAZ1A-201ENST00000358716 5920 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CD248Q9HCU0 PTPRM-211ENST00000580170 5941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CD248Q9HCU0 PAQR9-201ENST00000340634 2452 ntAPPRIS P1 BASIC22.35■■□□□ 1.17
CD248Q9HCU0 TMEM44-204ENST00000392432 2490 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CD248Q9HCU0 SOS2-201ENST00000216373 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CD248Q9HCU0 B3GALNT2-202ENST00000366600 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CD248Q9HCU0 CELF5-201ENST00000292672 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CD248Q9HCU0 RAD21L1-202ENST00000402452 1707 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
CD248Q9HCU0 RAB24-201ENST00000303251 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CD248Q9HCU0 MPST-204ENST00000404393 1329 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
CD248Q9HCU0 COCH-201ENST00000216361 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CD248Q9HCU0 ANKHD1-221ENST00000616482 2064 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CD248Q9HCU0 EXOC3L2-202ENST00000413988 2964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
CD248Q9HCU0 DCTD-201ENST00000357067 1931 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CD248Q9HCU0 YIF1B-202ENST00000337679 1257 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CD248Q9HCU0 MOSPD3-202ENST00000379527 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
CD248Q9HCU0 NTF6G-201ENST00000591094 616 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
CD248Q9HCU0 DISC1-224ENST00000639374 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CD248Q9HCU0 SPRED3-204ENST00000587013 1539 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
CD248Q9HCU0 ASPSCR1-201ENST00000306729 2123 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
CD248Q9HCU0 CRTAC1-202ENST00000370591 2348 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
CD248Q9HCU0 MEF2A-207ENST00000558812 2186 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
CD248Q9HCU0 RASD1-202ENST00000579152 1404 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
CD248Q9HCU0 DYRK3-202ENST00000367108 2218 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
CD248Q9HCU0 ZNF517-207ENST00000531720 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
CD248Q9HCU0 MELTF-AS1-202ENST00000415244 951 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
CD248Q9HCU0 KRT18P61-201ENST00000585825 1298 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
CD248Q9HCU0 MRM1-203ENST00000612760 1284 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
CD248Q9HCU0 MXRA7-201ENST00000355797 5661 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
CD248Q9HCU0 ZNF688-201ENST00000223459 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
CD248Q9HCU0 PSPH-202ENST00000395471 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
CD248Q9HCU0 ZSCAN18-217ENST00000601144 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
CD248Q9HCU0 TRIM14-202ENST00000342043 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
CD248Q9HCU0 TBR1-202ENST00000410035 1454 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.16
CD248Q9HCU0 FAM72B-202ENST00000369390 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
CD248Q9HCU0 BRWD1-202ENST00000341322 2495 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
CD248Q9HCU0 DPEP2-204ENST00000572888 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
CD248Q9HCU0 TALDO1-201ENST00000319006 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CD248Q9HCU0 IMPA2-201ENST00000269159 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CD248Q9HCU0 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CD248Q9HCU0 BTBD17-201ENST00000375366 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CD248Q9HCU0 RELA-201ENST00000308639 2681 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CD248Q9HCU0 HSD17B14-201ENST00000263278 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CD248Q9HCU0 NDUFS3-201ENST00000263774 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CD248Q9HCU0 ME3-201ENST00000323418 1068 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
CD248Q9HCU0 HIST2H2AC-201ENST00000331380 390 ntAPPRIS P1 BASIC22.32■■□□□ 1.16
CD248Q9HCU0 RNF208-201ENST00000391553 1077 ntAPPRIS P1 BASIC22.32■■□□□ 1.16
CD248Q9HCU0 RNF208-202ENST00000392827 1135 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
CD248Q9HCU0 NT5C3AP1-201ENST00000394500 1012 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
CD248Q9HCU0 AC061979.1-201ENST00000532061 434 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
CD248Q9HCU0 SLC35A3-213ENST00000638988 1286 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
CD248Q9HCU0 TNFRSF11A-207ENST00000639222 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
CD248Q9HCU0 AC105233.4-201ENST00000642045 216 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
CD248Q9HCU0 GPR35-204ENST00000430267 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
CD248Q9HCU0 CBLN3-201ENST00000267406 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CD248Q9HCU0 CDX1-201ENST00000231656 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CD248Q9HCU0 ESR2-204ENST00000353772 2454 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CD248Q9HCU0 TTC9-201ENST00000256367 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CD248Q9HCU0 GSR-204ENST00000537535 1323 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CD248Q9HCU0 SLC25A39-201ENST00000225308 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CD248Q9HCU0 SPTBN4-203ENST00000392023 2419 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CD248Q9HCU0 IGF2-AS-201ENST00000381361 2063 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
CD248Q9HCU0 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
CD248Q9HCU0 SPAG7-205ENST00000573366 1668 ntTSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
CD248Q9HCU0 CD47-202ENST00000361309 1285 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CD248Q9HCU0 AC019068.1-201ENST00000415226 552 ntTSL 4 BASIC22.31■■□□□ 1.16
CD248Q9HCU0 AC080013.1-202ENST00000465477 674 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
CD248Q9HCU0 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
CD248Q9HCU0 C17orf49-202ENST00000546495 996 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
CD248Q9HCU0 LINC02136-201ENST00000567469 530 ntTSL 4 BASIC22.31■■□□□ 1.16
CD248Q9HCU0 SAP30L-201ENST00000297109 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CD248Q9HCU0 CLK3-202ENST00000395066 2621 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CD248Q9HCU0 OAZ2-201ENST00000326005 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
CD248Q9HCU0 FAM167A-204ENST00000528897 1620 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.9 ms