Protein–RNA interactions for Protein: Q9H7L9

SUDS3, Sin3 histone deacetylase corepressor complex component SDS3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 328 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SUDS3Q9H7L9 UBE2E2-203ENST00000425792 1248 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
SUDS3Q9H7L9 CERS5-201ENST00000317551 2051 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
SUDS3Q9H7L9 PDLIM2-216ENST00000464275 1995 ntTSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
SUDS3Q9H7L9 RASGRP2-207ENST00000377497 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
SUDS3Q9H7L9 SLC29A1-207ENST00000393841 2485 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
SUDS3Q9H7L9 SH2D3A-201ENST00000245908 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
SUDS3Q9H7L9 RHOT1-205ENST00000545287 2516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
SUDS3Q9H7L9 GOLGA6L9-202ENST00000618348 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
SUDS3Q9H7L9 SMG7-AS1-201ENST00000421703 2220 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
SUDS3Q9H7L9 ITGB1BP1-203ENST00000359712 2126 ntTSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
SUDS3Q9H7L9 GJD3-201ENST00000578689 885 ntAPPRIS P1 BASIC21.78■■□□□ 1.08
SUDS3Q9H7L9 MYB-221ENST00000527615 2381 ntTSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
SUDS3Q9H7L9 FAM120B-204ENST00000625626 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
SUDS3Q9H7L9 NPAS1-202ENST00000449844 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
SUDS3Q9H7L9 FAM83D-201ENST00000619304 2475 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
SUDS3Q9H7L9 PLEKHF1-204ENST00000592810 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
SUDS3Q9H7L9 WWC2-AS2-201ENST00000578387 2183 ntBASIC21.77■■□□□ 1.08
SUDS3Q9H7L9 DTX4-201ENST00000227451 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
SUDS3Q9H7L9 KPTN-201ENST00000338134 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
SUDS3Q9H7L9 RPL8-201ENST00000262584 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
SUDS3Q9H7L9 AL161908.1-203ENST00000425370 506 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
SUDS3Q9H7L9 CCNYL1-202ENST00000339882 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
SUDS3Q9H7L9 TOP1MT-201ENST00000329245 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
SUDS3Q9H7L9 AC133065.2-201ENST00000573379 2147 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
SUDS3Q9H7L9 C11orf96-201ENST00000339446 1308 ntTSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.07
SUDS3Q9H7L9 ZNF584-203ENST00000593920 2187 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.07
SUDS3Q9H7L9 DECR2-201ENST00000219481 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
SUDS3Q9H7L9 FAM110A-206ENST00000541082 1614 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.77■■□□□ 1.07
SUDS3Q9H7L9 DYRK1B-204ENST00000593685 2724 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
SUDS3Q9H7L9 GNB2-201ENST00000303210 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
SUDS3Q9H7L9 FAIM-202ENST00000360570 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC21.76■■□□□ 1.07
SUDS3Q9H7L9 NDUFAF8-201ENST00000431388 615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
SUDS3Q9H7L9 AC011446.1-201ENST00000591825 458 ntTSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
SUDS3Q9H7L9 NEU4-203ENST00000404257 2352 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
SUDS3Q9H7L9 SSUH2-217ENST00000544814 1636 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
SUDS3Q9H7L9 LINC00454-202ENST00000430978 1327 ntTSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
SUDS3Q9H7L9 POTED-202ENST00000620442 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
SUDS3Q9H7L9 SHB-201ENST00000377707 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
SUDS3Q9H7L9 RALGPS1-207ENST00000394022 1672 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
SUDS3Q9H7L9 AC138028.2-201ENST00000440406 1539 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
SUDS3Q9H7L9 BCS1L-210ENST00000431802 2015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
SUDS3Q9H7L9 AFDN-202ENST00000351017 5823 ntTSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
SUDS3Q9H7L9 HES3-201ENST00000377898 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
SUDS3Q9H7L9 ANKHD1-205ENST00000394723 2135 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
SUDS3Q9H7L9 SSPN-204ENST00000535504 419 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
SUDS3Q9H7L9 HERC2P4-206ENST00000568097 1062 ntTSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
SUDS3Q9H7L9 MCRIP1-205ENST00000572645 1038 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
SUDS3Q9H7L9 MAIP1-201ENST00000295079 1495 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
SUDS3Q9H7L9 AC009506.1-201ENST00000418474 1494 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
SUDS3Q9H7L9 WAS-201ENST00000376701 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
SUDS3Q9H7L9 TRIM28-201ENST00000253024 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
SUDS3Q9H7L9 DIAPH1-203ENST00000389057 5762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
SUDS3Q9H7L9 MANEAL-203ENST00000397631 2327 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
SUDS3Q9H7L9 AC092053.2-201ENST00000640557 1818 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
SUDS3Q9H7L9 ARHGEF7-202ENST00000317133 4361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
SUDS3Q9H7L9 CNNM1-201ENST00000356713 5959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
SUDS3Q9H7L9 LBX2-202ENST00000377566 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
SUDS3Q9H7L9 IGHV3-19-201ENST00000521488 291 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
SUDS3Q9H7L9 HOMER3-206ENST00000594439 982 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
SUDS3Q9H7L9 AC010999.2-201ENST00000621974 596 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
SUDS3Q9H7L9 MIR6084-201ENST00000622012 110 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
SUDS3Q9H7L9 POMZP3-202ENST00000310842 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
SUDS3Q9H7L9 NOTUM-201ENST00000409678 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
SUDS3Q9H7L9 ZNF410-206ENST00000540593 1722 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
SUDS3Q9H7L9 MGEA5-205ENST00000439817 5043 ntTSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
SUDS3Q9H7L9 AC092490.1-203ENST00000514568 1972 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
SUDS3Q9H7L9 CACNB3-205ENST00000547392 2237 ntTSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
SUDS3Q9H7L9 VGLL3-201ENST00000383698 2475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
SUDS3Q9H7L9 KRTAP5-7-201ENST00000398536 1408 ntAPPRIS P1 BASIC21.73■■□□□ 1.07
SUDS3Q9H7L9 KCNK15-201ENST00000372861 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
SUDS3Q9H7L9 ANKRD19P-205ENST00000473204 2370 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
SUDS3Q9H7L9 PTP4A3-204ENST00000521578 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
SUDS3Q9H7L9 JTB-203ENST00000368589 1216 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
SUDS3Q9H7L9 TSPY4-201ENST00000383008 1143 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
SUDS3Q9H7L9 CCDC115-202ENST00000409127 1247 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
SUDS3Q9H7L9 AC026271.2-201ENST00000428091 497 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
SUDS3Q9H7L9 AICDA-202ENST00000537228 667 ntTSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
SUDS3Q9H7L9 AL359710.1-201ENST00000427039 1544 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
SUDS3Q9H7L9 CCM2-206ENST00000474617 1532 ntTSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
SUDS3Q9H7L9 ZFAND2B-202ENST00000409097 1765 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
SUDS3Q9H7L9 SOAT2-201ENST00000301466 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
SUDS3Q9H7L9 LAMC3-202ENST00000361069 6133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
SUDS3Q9H7L9 EXOG-203ENST00000422077 1317 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
SUDS3Q9H7L9 ALKAL2-204ENST00000403610 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
SUDS3Q9H7L9 HMGA2-205ENST00000425208 1444 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
SUDS3Q9H7L9 SMIM19-203ENST00000417410 1466 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
SUDS3Q9H7L9 HTATIP2-201ENST00000419348 1477 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
SUDS3Q9H7L9 GPR137B-202ENST00000366592 2042 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
SUDS3Q9H7L9 NME4-201ENST00000219479 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
SUDS3Q9H7L9 POLR3GL-201ENST00000369313 818 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
SUDS3Q9H7L9 AURKAIP1-204ENST00000378853 875 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
SUDS3Q9H7L9 NME4-202ENST00000382940 766 ntTSL 3 BASIC21.72■■□□□ 1.07
SUDS3Q9H7L9 TUNAR-203ENST00000554321 767 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.72■■□□□ 1.07
SUDS3Q9H7L9 NME4-211ENST00000620944 1193 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
SUDS3Q9H7L9 SLC18A3-201ENST00000374115 2420 ntAPPRIS P1 BASIC21.72■■□□□ 1.07
SUDS3Q9H7L9 TMEM165-201ENST00000381334 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
SUDS3Q9H7L9 BSN-AS2-201ENST00000421598 2603 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
SUDS3Q9H7L9 KHDRBS2-201ENST00000281156 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
SUDS3Q9H7L9 SLC35A3-204ENST00000427993 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
SUDS3Q9H7L9 SLCO3A1-202ENST00000424469 2705 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
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