Protein–RNA interactions for Protein: Q9H6R3

ACSS3, Acyl-CoA synthetase short-chain family member 3, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 686 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACSS3Q9H6R3 HLA-C-201ENST00000376228 1536 ntAPPRIS P2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
ACSS3Q9H6R3 HSPB2-201ENST00000304298 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
ACSS3Q9H6R3 GLRX3-201ENST00000331244 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
ACSS3Q9H6R3 SPRN-201ENST00000414069 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
ACSS3Q9H6R3 DYM-203ENST00000442713 2147 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
ACSS3Q9H6R3 ADAP2-204ENST00000580525 1598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
ACSS3Q9H6R3 C10orf91-202ENST00000392630 1846 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
ACSS3Q9H6R3 AKR7A2-201ENST00000235835 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
ACSS3Q9H6R3 ECHDC1-203ENST00000368291 1354 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
ACSS3Q9H6R3 HAUS7-202ENST00000370211 1363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
ACSS3Q9H6R3 METTL1-202ENST00000324871 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
ACSS3Q9H6R3 MT1E-201ENST00000306061 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
ACSS3Q9H6R3 MEIS1-AS3-201ENST00000454167 707 ntTSL 4 BASIC21.53■■□□□ 1.04
ACSS3Q9H6R3 SLC25A39-203ENST00000537904 1274 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
ACSS3Q9H6R3 SLC22A17-202ENST00000354772 2238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
ACSS3Q9H6R3 CDC14A-203ENST00000370124 1883 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
ACSS3Q9H6R3 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
ACSS3Q9H6R3 AC091230.1-202ENST00000564823 5356 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
ACSS3Q9H6R3 HERC2P8-204ENST00000567073 1988 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
ACSS3Q9H6R3 FIP1L1-201ENST00000306932 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
ACSS3Q9H6R3 PTP4A3-203ENST00000520105 1866 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
ACSS3Q9H6R3 RCE1-202ENST00000524506 1379 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
ACSS3Q9H6R3 SNUPN-201ENST00000308588 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
ACSS3Q9H6R3 OXCT2P1-201ENST00000447263 1535 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
ACSS3Q9H6R3 AK3-203ENST00000447596 705 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
ACSS3Q9H6R3 AC087239.1-201ENST00000622671 572 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
ACSS3Q9H6R3 NAPEPLD-208ENST00000427257 1822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
ACSS3Q9H6R3 SLC9A3R1-201ENST00000262613 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
ACSS3Q9H6R3 DCTD-202ENST00000438320 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
ACSS3Q9H6R3 BASP1-201ENST00000322611 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
ACSS3Q9H6R3 RABL2B-206ENST00000395598 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
ACSS3Q9H6R3 LINC01521-201ENST00000504184 1943 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
ACSS3Q9H6R3 PTPRM-211ENST00000580170 5941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
ACSS3Q9H6R3 NYAP1-202ENST00000454988 2777 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
ACSS3Q9H6R3 ZNF668-207ENST00000535577 2396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
ACSS3Q9H6R3 EPHX3-201ENST00000221730 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
ACSS3Q9H6R3 NAXE-202ENST00000368234 901 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
ACSS3Q9H6R3 ACYP2-202ENST00000394666 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
ACSS3Q9H6R3 KRAS-204ENST00000557334 1052 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
ACSS3Q9H6R3 MIR3181-201ENST00000578512 73 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
ACSS3Q9H6R3 FIZ1-205ENST00000592585 489 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
ACSS3Q9H6R3 FAM3A-202ENST00000359889 1712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
ACSS3Q9H6R3 ALX3-201ENST00000369792 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
ACSS3Q9H6R3 CACNA1H-210ENST00000638323 8048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
ACSS3Q9H6R3 CENPS-CORT-201ENST00000400900 1469 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
ACSS3Q9H6R3 SMIM19-203ENST00000417410 1466 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
ACSS3Q9H6R3 NOS3-204ENST00000467517 2377 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
ACSS3Q9H6R3 PMS1-222ENST00000639501 2506 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
ACSS3Q9H6R3 ARFRP1-214ENST00000622789 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
ACSS3Q9H6R3 TTC39C-202ENST00000317571 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
ACSS3Q9H6R3 FARSA-201ENST00000314606 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
ACSS3Q9H6R3 NDUFAF3-202ENST00000326925 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
ACSS3Q9H6R3 MTMR14-206ENST00000420925 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
ACSS3Q9H6R3 NUDT16L1-204ENST00000586536 1406 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
ACSS3Q9H6R3 TNIP1-205ENST00000518977 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
ACSS3Q9H6R3 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
ACSS3Q9H6R3 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
ACSS3Q9H6R3 C14orf80-211ENST00000450383 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
ACSS3Q9H6R3 AC010141.3-201ENST00000456659 717 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
ACSS3Q9H6R3 CHTF8-205ENST00000519520 856 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
ACSS3Q9H6R3 CAMK2B-216ENST00000440254 2097 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
ACSS3Q9H6R3 ERLEC1-203ENST00000405123 1756 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
ACSS3Q9H6R3 TIMM50-201ENST00000314349 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
ACSS3Q9H6R3 DLX2-201ENST00000234198 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
ACSS3Q9H6R3 C16orf59-201ENST00000361837 1662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
ACSS3Q9H6R3 GATM-206ENST00000558336 1522 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
ACSS3Q9H6R3 JPT1-206ENST00000476258 2289 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
ACSS3Q9H6R3 CAPG-201ENST00000263867 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
ACSS3Q9H6R3 KIRREL2-201ENST00000262625 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
ACSS3Q9H6R3 SMPD2-201ENST00000258052 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
ACSS3Q9H6R3 ACHE-203ENST00000411582 2179 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
ACSS3Q9H6R3 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
ACSS3Q9H6R3 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
ACSS3Q9H6R3 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
ACSS3Q9H6R3 C10orf55-202ENST00000412307 2360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
ACSS3Q9H6R3 AC009014.1-201ENST00000607574 1667 ntAPPRIS P1 BASIC21.49■■□□□ 1.03
ACSS3Q9H6R3 ARHGEF4-202ENST00000355771 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
ACSS3Q9H6R3 TRMT2A-204ENST00000439169 2473 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
ACSS3Q9H6R3 TBX1-203ENST00000359500 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
ACSS3Q9H6R3 HEY2-201ENST00000368364 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
ACSS3Q9H6R3 VEGFA-204ENST00000372064 2909 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
ACSS3Q9H6R3 DUSP7-202ENST00000495880 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
ACSS3Q9H6R3 MTMR9LP-204ENST00000441044 2624 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
ACSS3Q9H6R3 PRKG2-207ENST00000628926 2623 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
ACSS3Q9H6R3 SLC35A3-208ENST00000638336 2438 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
ACSS3Q9H6R3 DISC1-213ENST00000537876 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
ACSS3Q9H6R3 AL122058.1-201ENST00000412321 1166 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
ACSS3Q9H6R3 NDUFAF8-201ENST00000431388 615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
ACSS3Q9H6R3 GATA2-AS1-201ENST00000464242 1163 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
ACSS3Q9H6R3 AC019163.1-201ENST00000512634 610 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
ACSS3Q9H6R3 CCDC189-211ENST00000545825 1046 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
ACSS3Q9H6R3 DNAJB5-201ENST00000312316 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
ACSS3Q9H6R3 MAG-201ENST00000361922 2426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
ACSS3Q9H6R3 TMEM129-201ENST00000303277 2678 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
ACSS3Q9H6R3 GAS2-202ENST00000454584 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
ACSS3Q9H6R3 FNDC10-201ENST00000422725 2085 ntAPPRIS P1 BASIC21.48■■□□□ 1.03
ACSS3Q9H6R3 HAUS4-201ENST00000206474 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
ACSS3Q9H6R3 TPM1-204ENST00000334895 1637 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
ACSS3Q9H6R3 B3GALT4-204ENST00000451237 1694 ntAPPRIS P1 BASIC21.47■■□□□ 1.03
ACSS3Q9H6R3 WT1-210ENST00000639563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.7 ms